期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
基于全转录组测序探讨褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的机制
1
作者 徐丽 陈秀娇 +4 位作者 郑伟男 毛馨琳 林丽彬 谢群 金清东 《中国药理学通报》 CAS 北大核心 2025年第1期163-170,共8页
目的全转录组测序检测神经胶质瘤细胞非编码RNA(ncRNA)表达谱并构建ceRNA网络,揭示ncRNA参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制。方法0、2、4、6、8 mmol·L^(-1)褪黑素干预神经胶质瘤细胞24、48、72 h,CCK-8检测褪黑素对细... 目的全转录组测序检测神经胶质瘤细胞非编码RNA(ncRNA)表达谱并构建ceRNA网络,揭示ncRNA参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制。方法0、2、4、6、8 mmol·L^(-1)褪黑素干预神经胶质瘤细胞24、48、72 h,CCK-8检测褪黑素对细胞增殖的抑制作用;0、4 mmol·L^(-1)褪黑素干预U251细胞24h后,全转录组测序检测差异表达miRNA(DEmiRNA)、lncRNA(DElncRNA)、mRNA(DEmRNA),对DEmRNA进行GO和KEGG富集分析;构建ceRNA网络,采用qRT-PCR验证ceRNA关键基因表达。结果褪黑素呈时间-剂量依赖性抑制神经胶质瘤细胞增殖;全转录组测序筛选出0 mmol·L^(-1)与4 mmol·L^(-1)褪黑素组DEmRNA 5049个、DElncRNA 635个、DEmiRNA 146个;DEmRNA主要富集在铁死亡、mTOR信号通路、FoxO信号通路、细胞周期等癌症相关信号通路;ceRNA网络包含4个lncRNA、3个miRNA和48个mRNA,qRT-PCR验证U251细胞hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p、LINC00707和SLC16A1-AS1表达与测序结果一致,U87细胞的基因表达与测序结果基本一致。结论褪黑素通过ncRNA差异表达,影响癌症相关信号通路,进而抑制神经胶质瘤细胞增殖;LINC00707、SLC16A1-AS1、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-362-5p构成的ceRNA网络可能参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制。 展开更多
关键词 褪黑素 神经胶质瘤 全转录组测序 ceRNA网络 hsa-miR-129-5p hsa-miR-362-5p
在线阅读 下载PDF
全转录组测序在儿童急性B淋巴细胞白血病中的应用
2
作者 邹品力 廖欣 肖剑文 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1700-1707,共8页
目的:探索儿童急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的分子遗传学特点及全转录组测序(RNA-seq)在儿童B-ALL中的应用价值。方法:收集并分析2015年5月-2020年4月重庆医科大学附属儿童医院血液肿瘤中心收治的初诊B-ALL患儿的临床及实验室检查资料,... 目的:探索儿童急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的分子遗传学特点及全转录组测序(RNA-seq)在儿童B-ALL中的应用价值。方法:收集并分析2015年5月-2020年4月重庆医科大学附属儿童医院血液肿瘤中心收治的初诊B-ALL患儿的临床及实验室检查资料,所有患儿均经骨髓形态学及组织化学染色、流式细胞术确诊,且完善染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)、逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及RNA-seq检测。结果:129例初诊B-ALL患儿中男71例,女58例,中位年龄50(8-190)个月,99例患儿检出融合基因阳性,阳性率76.7%,86例检测出白血病相关及可能相关基因突变阳性,阳性率约为66.7%。ETV6-RUNX1、BCR-ABL1、TCF3-PBX1、KMT2A重排检出率在FISH、RT-PCR、RNA-seq中无明显差异,此外RNA-seq检出较多罕见的融合,包括KMT2A-USP2 1例、Ph样相关融合基因4例、MEF2D重排5例、PAX5重排5例、ZNF384重排3例等,以及意义暂不明确或尚未在白血病患儿中报道的融合基因若干。其中ETV6-RUNX1融合基因阳性患儿诱导缓解治疗反应好,BCR-ABL1及ZNF384重排阳性患儿诱导反应差,微小残留病缓解率与其他类型的患儿比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:全转录组测序不仅能检测出已知的融合基因,同时能发现新的及罕见的融合基因及基因突变,其应用对B-ALL患儿危险度分级及精准靶向治疗有重要指导意义。 展开更多
关键词 急性B淋巴细胞白血病 全转录组测序 二代测序 融合基因 儿童
在线阅读 下载PDF
肺癌的下一代测序技术 被引量：1
3
作者 Kehua Wu R Stephanie Huang +3 位作者 Larry House William Chi Cho 南娟 曹志成 《中国肺癌杂志》 CAS 北大核心 2014年第1期I0003-I0014,共12页
肺癌在生物学上具有侵袭性,并且是癌症相关死亡的主要原因。根据临床特征、预后、对治疗的反应和耐受性,每一例肺癌患者的进展均是独特的。传统上基于毛细管的单基因测序的第一代技术(如Sanger测序法)已被允许大量平行测序且成本更低、... 肺癌在生物学上具有侵袭性,并且是癌症相关死亡的主要原因。根据临床特征、预后、对治疗的反应和耐受性,每一例肺癌患者的进展均是独特的。传统上基于毛细管的单基因测序的第一代技术(如Sanger测序法)已被允许大量平行测序且成本更低、通量更高的下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)所替代。与传统方法相比,NGS技术取得显著进步。我们希望这些方法可全面地解释癌症全球图谱,并提供更多信息以满足个体化用药的需求。本综述包括对不同NGS技术的简要说明,NGS在肺癌研究进展中的应用和重要发现的总结,包括对已知靶基因(EGFR、ALK和KRAS)的进一步探索、其它肺癌突变的鉴定和癌症基因组研究的全局协调。 展开更多
关键词 肺癌 下一代测序 全外显子组测序 全基因组测序 全转录组测序
在线阅读 下载PDF
高度近视白内障患者晶状体前囊膜中circRNAs的差异性表达
4
作者 韩圆圆 孙凤 +5 位作者 刘艳 徐梦月 许澈 李娜 李娟 王剑锋 《南方医科大学学报》 北大核心 2025年第9期1997-2005,共9页
目的分析高度近视白内障(HMC)患者晶状体前囊膜组织中circRNAs的差异性表达及其生物学功能,探讨circRNA在高度近视白内障中的作用。方法通过白内障手术术中获取36例年龄相关性白内障(ARC)和36例HMC患者晶状体前囊膜标本,两组中各选取18... 目的分析高度近视白内障(HMC)患者晶状体前囊膜组织中circRNAs的差异性表达及其生物学功能,探讨circRNA在高度近视白内障中的作用。方法通过白内障手术术中获取36例年龄相关性白内障(ARC)和36例HMC患者晶状体前囊膜标本,两组中各选取18例进行全转录组测序和生物学分析。余下36例采用RT-qPCR对circPDGFRA、circFOXJ3、hsa_circ_0004767、hsa_circ_0007528、ciCRIM1、circMAN1A2、circSLC5A3、circPTK2进行临床验证。随后选择hsa_circ_0007528进行细胞实验,检测hsa_circ_0007528对晶状体上皮细胞(LECs)增殖、迁移和凋亡的影响。结果两组患者标本中共检测出16192个circRNAs,其中62个circRNAs差异性表达(29个上调、33个下调)。GO和KEGG分析检测,差异性表达的circRNAs多集中在细胞质、核质和内质网中,参与Gap junction、PI3K-Akt signaling pathway、NF-kappa B signaling pathway、Jak-STAT signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、MAPK signaling pathway等信号通路(P<0.05)。ceRNA网络预测多个靶基因。RT-qPCR验证与测序结果一致(P<0.01)。CCK-8、Transwell结果显示,hsa_circ_0007528上调抑制了细胞增殖(P<0.001)和迁移(P<0.01)。流式细胞术显示hsa_circ_0007528上调促进了细胞的凋亡(P<0.0001)。结论HMC患者晶状体前囊膜中circRNAs的表达谱与ARC存在差异。hsa_circ_0007528上调抑制LECs的增殖、迁移、促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 高度近视白内障 circRNA谱 全转录组测序 hsa_circ_0007528 晶状体上皮细胞
在线阅读 下载PDF
盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化相关lncRNA-miRNA-mRNA共表达及关键基因网络构建预测 被引量：1
5
作者 李艳霞 李益萍 王肖龙 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期3812-3818,共7页
目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE^(-/-)小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均给予高脂饲料。造模的同时可定组、盾叶组分别灌胃给予瑞舒... 目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE^(-/-)小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均给予高脂饲料。造模的同时可定组、盾叶组分别灌胃给予瑞舒伐他汀钙片0.76 mg/kg、盾叶冠心宁片146 mg/kg。12周后,对主动脉窦进行HE染色、油红O染色、Masson染色。全基因转录组测序技术对空白组、模型组、盾叶组筛选差异基因进行聚类分析、WGCNA及STEM分析重叠基因、GO和KEGG功能通路分析,同时构建相关网络。结果病理染色结果显示,与模型组比较,可定组、盾叶组主动脉窦处的斑块面积及油红面积占比减少(P<0.05),同时胶原纤维增加(P<0.05);与可定组比较,盾叶组主动脉窦斑块面积增加(P<0.05),而油红面积占比和斑块内胶原纤维占比无明显差异(P>0.05)。测序共得到了1623个差异基因;聚类分析可以有效区分不同的组别;WGCNA及STEM分析得到156个重叠基因;经GO和KEGG分析显示盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化作用主要与脂质代谢有关。结论盾叶冠心宁片对ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化具有一定干预作用,其机制可能与脂质代谢有关,如脂肪酸代谢、脂质代谢过程、脂类生物合成、PPAR信号通路。 展开更多
关键词 盾叶冠心宁片 动脉粥样硬化 全基因转录组测序 脂质代谢
在线阅读 下载PDF
非编码RNA及其在畜禽中的应用研究进展 被引量：3
6
作者 尚方正 韩文静 +4 位作者 吴志红 海尔汗 马荣 张燕军 李金泉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第1期235-247,共13页
在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,nc... 在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,ncRNA在生物领域的多个方面具有重要作用,如在人类肿瘤、非肿瘤等方面的疾病治疗,在动物胚胎发育、肌肉生长、脂肪沉积、免疫应答及皮肤毛囊调控等领域都有了很大的进展。作者主要综述了全转录组测序技术、ncRNA分类、主要作用机制和ncRNA在畜禽中的应用,为探究ncRNA在动物中的调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 非编码RNA(ncRNA) 全转录组测序 畜禽 应用
在线阅读 下载PDF
基于RNA-seq技术的单眼形觉剥夺模型大鼠视皮层差异基因筛选、鉴定及功能分析 被引量：2
7
作者 孙娅玲 严兴科 刘安国 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期210-215,共6页
目的借助全转录组测序(RNA-seq)技术对右眼形觉剥夺模型大鼠视皮层差异表达基因进行筛选和生物学功能分析。方法将18只14日龄SD幼鼠按照随机数字表法随机分为空白对照组和单眼形觉剥夺组,每组9只。其中单眼形觉剥夺组幼鼠采用右眼眼睑... 目的借助全转录组测序(RNA-seq)技术对右眼形觉剥夺模型大鼠视皮层差异表达基因进行筛选和生物学功能分析。方法将18只14日龄SD幼鼠按照随机数字表法随机分为空白对照组和单眼形觉剥夺组,每组9只。其中单眼形觉剥夺组幼鼠采用右眼眼睑缝合方法制作单眼形觉剥夺模型,连续14 d。分别于造模前和造模后14 d记录各组大鼠右眼图形视觉诱发电位P 100波的潜伏期和振幅。分别提取各组大鼠双侧视皮质组织,通过RNA-seq技术,筛选出弱视相关发病基因,利用基因本体论(GO)富集分析对上述基因进行生物学功能描述,并进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果与空白对照组相比,单眼形觉剥夺组P 100波潜伏期明显延长,振幅明显下降(均P<0.05),表明造模成功。共筛选出左侧视皮质差异表达基因40个,右侧视皮质差异表达基因63个,其中9个基因重叠。GO富集分析表明,差异表达基因主要参与转录DNA模板化、谷氨酸分泌、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、蛋白磷酸化等生物学过程,参与DNA结合、ATP结合、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性、钙离子结合、锌离子结合、磷脂酶A 2活性、核酸绑定等分子功能,参与细胞内、内质网的膜等细胞组分。其中,Grm2、Pla2g2a基因的异常表达可能与视功能损伤改变过程密切相关,Grm2基因主要参与谷氨酸突触、长时程增强(LTP)、长时程抑制(LTD)等视觉信号通路过程,Pla2g2a基因主要参与α-亚麻酸代谢通路和花生四烯酸代谢通路。结论单眼形觉剥夺大鼠视觉发育敏感期内存在双侧视皮质基因的异常表达,导致视觉信号传导功能异常。基于特定响应基因调控的代谢通路改变可能是弱视发病的重要的分子生物学机制之一。 展开更多
关键词 全转录组测序 大鼠模型 图形视觉诱发电位 形觉剥夺 生物信息学
在线阅读 下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
关于我们 | 版权声明 | 联系我们 | 帮助中心| 意见反馈
主办单位：上海市教育委员会
技术支持：重庆维普资讯有限公司
渝公网安备 50019002500403号
使用帮助 返回顶部