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全自动核酸提取仪对不同类型ASFV、PEDV样品的提取效果
1
作者
陈秀萍
蒋叶林
+5 位作者
周丽雯
凌勇
陈永贵
张蓉
吴有林
丁能水
《现代畜牧兽医》
2024年第1期21-24,共4页
研究以非洲猪瘟病毒(ASFV)的各类型阳性样品以及流行性腹泻病毒(PEDV)阳性样品为检测对象,评测全自动核酸提取仪对DNA和RNA核酸的提取效果,旨在帮助动物疫病检测实验室了解如何评测全自动核酸提取仪是否满足检测需求。试验选用已经过检...
研究以非洲猪瘟病毒(ASFV)的各类型阳性样品以及流行性腹泻病毒(PEDV)阳性样品为检测对象,评测全自动核酸提取仪对DNA和RNA核酸的提取效果,旨在帮助动物疫病检测实验室了解如何评测全自动核酸提取仪是否满足检测需求。试验选用已经过检测结果为阳性的不同类型ASFV样本和PEDV阳性的粪便拭子样品,进行10倍梯度稀释并将检测结果与已知的检测原值进行对比。结果显示,试验使用的核酸提取仪的稳定性满足需求,但敏感性较差,可能存在环境、人员、车辆等病毒含量低的样品被漏检。在抗干扰方面,试验使用的核酸提取仪对咽喉拭子的核酸提取结果存在假阴性的情况;该仪器对肛门拭子和环境样品的抗干扰性不佳,也可能出现假阴性结果;该仪器不会受样品影响而检测出假阳性结果。
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关键词
病毒检测
DNA病毒
RNA病毒
全自动核酸提取仪
稳定性
敏感性
抗干扰性
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职称材料
不同全自动核酸提取仪对ASFV、PEDV提取效果的比较
2
作者
黄丽娜
陈秀萍
+2 位作者
甘跃灵
谢璐娜
王雪妹
《今日养猪业》
2024年第3期1-3,共3页
【目的】以倍比稀释的ASFV(非洲猪瘟病毒)阳性对照样品以及PEDV(猪流行性腹泻病毒)阳性对照样品为检测对象,对比3款全自动核酸提取仪对DNA和RNA的提取效果,旨在帮助猪场配备的实验室筛选合适、可靠的全自动核酸提取仪。【方法】倍比稀...
【目的】以倍比稀释的ASFV(非洲猪瘟病毒)阳性对照样品以及PEDV(猪流行性腹泻病毒)阳性对照样品为检测对象,对比3款全自动核酸提取仪对DNA和RNA的提取效果,旨在帮助猪场配备的实验室筛选合适、可靠的全自动核酸提取仪。【方法】倍比稀释好的ASFV、PEDV阳性对照样品,每个梯度设置3个平行重复,诺维赞核酸提取仪(VNP-32P)为处理1,西安天隆核酸提取仪(NP968-C)为处理2,博日核酸提取仪(NPA-32P)为处理3,根据3款全自动核酸提取仪及提取试剂盒的说明书将对应阳性样品进行核酸提取,再根据英迪康的virotype?非洲猪瘟病毒2.0 PCR检测试剂盒以及世纪元亨的流行性腹泻病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的说明书进行体系配制、上样、程序设置,进行核酸扩增。【结果】同一浓度梯度的ASFV、PEDV阳性对照样品,处理3所提核酸的扩增结果 CT值较处理1和处理2的低,而处理1和处理2提取效果不相上下。【结论】3款核酸提取仪的稳定性都满足需求;博日核酸提取仪(NPA-32P)的提取效果优于另外2款,诺维赞核酸提取仪(VNP-32P)和西安天隆核酸提取仪(NP968-C)的提取效果接近。
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关键词
全自动核酸提取仪
ASFV
PEDV
稳定性效果
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职称材料
全自动核酸提取仪与手动提取组织DNA的效率比较
被引量:
5
3
作者
林丹义
张科平
+3 位作者
许洁
颜黎栩
骆新兰
刘艳辉
《临床与实验病理学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第12期1398-1399,共2页
近年,随着众多与疾病诊断、预后及治疗相关的分子标志物的出现,以石蜡组织DNA为材料进行分子水平的基因检测及筛查已成为临床诊断及相关研究的常规手段。对于各种基因分析而言,重要的是能够获得足够纯度和数量的DNA。DNA提取是分子...
近年,随着众多与疾病诊断、预后及治疗相关的分子标志物的出现,以石蜡组织DNA为材料进行分子水平的基因检测及筛查已成为临床诊断及相关研究的常规手段。对于各种基因分析而言,重要的是能够获得足够纯度和数量的DNA。DNA提取是分子生物学研究的一项基础技术,其提取的质量好坏及数量的多少直接影响到分子生物学实验的开展。
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关键词
DNA
提取
全自动核酸提取仪
手动
提取
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职称材料
全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学中的应用
被引量:
2
4
作者
李淑侠
沈金建
+1 位作者
曹佩军
李志超
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021年第2期220-224,共5页
目的探讨全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学DNA提取中的应用价值。方法采集人外周静脉血稀释成40、80、120、160、200、240、280和320倍的梯度样本,并对每一梯度的样本分别进行无抑制剂、加黑机油、加铁锈、加果酸、加锡纸、加靛...
目的探讨全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学DNA提取中的应用价值。方法采集人外周静脉血稀释成40、80、120、160、200、240、280和320倍的梯度样本,并对每一梯度的样本分别进行无抑制剂、加黑机油、加铁锈、加果酸、加锡纸、加靛蓝6种处理。应用全自动核酸提取仪对上述样本进行DNA纯化提取,提取后的DNA洗脱液取6μL直接进行扩增,剩余部分使用真空浓缩仪进行浓缩,浓缩前后的DNA均使用Investigator 26plex QS试剂盒进行扩增、检测。结果添加果酸的梯度样本仅在40倍稀释时获得完整STR分型结果,另外5种方式处理的梯度样本在40~160倍稀释时均获得完整的STR分型。DNA浓缩后的STR分型结果显示,平均峰高和基因座检出率均有一定程度的提高,但是效果并不明显。结论全自动核酸提取仪具有高效的抑制剂去除能力和DNA提取效率,真空浓缩仪可在一定程度上浓缩DNA,两者联合使用可提高法医学检材的检验成功率。
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关键词
法医遗传学
DNA
提取
微量DNA
STR分型
抑制剂
全自动核酸提取仪
真空浓缩
仪
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职称材料
题名
全自动核酸提取仪对不同类型ASFV、PEDV样品的提取效果
1
作者
陈秀萍
蒋叶林
周丽雯
凌勇
陈永贵
张蓉
吴有林
丁能水
机构
福建傲农生物科技集团股份有限公司、农业农村部华南生猪育种重点实验室
福建傲芯生物科技集团有限公司
福建省生猪营养与饲料重点实验室
福建省漳州市畜牧技术服务站
江西农业大学、猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室
出处
《现代畜牧兽医》
2024年第1期21-24,共4页
文摘
研究以非洲猪瘟病毒(ASFV)的各类型阳性样品以及流行性腹泻病毒(PEDV)阳性样品为检测对象,评测全自动核酸提取仪对DNA和RNA核酸的提取效果,旨在帮助动物疫病检测实验室了解如何评测全自动核酸提取仪是否满足检测需求。试验选用已经过检测结果为阳性的不同类型ASFV样本和PEDV阳性的粪便拭子样品,进行10倍梯度稀释并将检测结果与已知的检测原值进行对比。结果显示,试验使用的核酸提取仪的稳定性满足需求,但敏感性较差,可能存在环境、人员、车辆等病毒含量低的样品被漏检。在抗干扰方面,试验使用的核酸提取仪对咽喉拭子的核酸提取结果存在假阴性的情况;该仪器对肛门拭子和环境样品的抗干扰性不佳,也可能出现假阴性结果;该仪器不会受样品影响而检测出假阳性结果。
关键词
病毒检测
DNA病毒
RNA病毒
全自动核酸提取仪
稳定性
敏感性
抗干扰性
Keywords
Virus detection
DNA virus
RNA virus
Fully automated nucleic acid extractor
Stability
Sensitivity
Interference resistance
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
不同全自动核酸提取仪对ASFV、PEDV提取效果的比较
2
作者
黄丽娜
陈秀萍
甘跃灵
谢璐娜
王雪妹
机构
漳州市龙海区动物疫病预防控制中心
福建傲农生物科技集团股份有限公司
漳州市龙海区白水畜牧兽医站
龙岩市动物疫病预防控制中心
出处
《今日养猪业》
2024年第3期1-3,共3页
文摘
【目的】以倍比稀释的ASFV(非洲猪瘟病毒)阳性对照样品以及PEDV(猪流行性腹泻病毒)阳性对照样品为检测对象,对比3款全自动核酸提取仪对DNA和RNA的提取效果,旨在帮助猪场配备的实验室筛选合适、可靠的全自动核酸提取仪。【方法】倍比稀释好的ASFV、PEDV阳性对照样品,每个梯度设置3个平行重复,诺维赞核酸提取仪(VNP-32P)为处理1,西安天隆核酸提取仪(NP968-C)为处理2,博日核酸提取仪(NPA-32P)为处理3,根据3款全自动核酸提取仪及提取试剂盒的说明书将对应阳性样品进行核酸提取,再根据英迪康的virotype?非洲猪瘟病毒2.0 PCR检测试剂盒以及世纪元亨的流行性腹泻病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的说明书进行体系配制、上样、程序设置,进行核酸扩增。【结果】同一浓度梯度的ASFV、PEDV阳性对照样品,处理3所提核酸的扩增结果 CT值较处理1和处理2的低,而处理1和处理2提取效果不相上下。【结论】3款核酸提取仪的稳定性都满足需求;博日核酸提取仪(NPA-32P)的提取效果优于另外2款,诺维赞核酸提取仪(VNP-32P)和西安天隆核酸提取仪(NP968-C)的提取效果接近。
关键词
全自动核酸提取仪
ASFV
PEDV
稳定性效果
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
全自动核酸提取仪与手动提取组织DNA的效率比较
被引量:
5
3
作者
林丹义
张科平
许洁
颜黎栩
骆新兰
刘艳辉
机构
广东省人民医院广东省医学科学院病理科
出处
《临床与实验病理学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第12期1398-1399,共2页
基金
国家临床重点专科建设项目
文摘
近年,随着众多与疾病诊断、预后及治疗相关的分子标志物的出现,以石蜡组织DNA为材料进行分子水平的基因检测及筛查已成为临床诊断及相关研究的常规手段。对于各种基因分析而言,重要的是能够获得足够纯度和数量的DNA。DNA提取是分子生物学研究的一项基础技术,其提取的质量好坏及数量的多少直接影响到分子生物学实验的开展。
关键词
DNA
提取
全自动核酸提取仪
手动
提取
分类号
R394-3 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学中的应用
被引量:
2
4
作者
李淑侠
沈金建
曹佩军
李志超
机构
平湖市公安局
上海市公安局奉贤分局
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021年第2期220-224,共5页
文摘
目的探讨全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学DNA提取中的应用价值。方法采集人外周静脉血稀释成40、80、120、160、200、240、280和320倍的梯度样本,并对每一梯度的样本分别进行无抑制剂、加黑机油、加铁锈、加果酸、加锡纸、加靛蓝6种处理。应用全自动核酸提取仪对上述样本进行DNA纯化提取,提取后的DNA洗脱液取6μL直接进行扩增,剩余部分使用真空浓缩仪进行浓缩,浓缩前后的DNA均使用Investigator 26plex QS试剂盒进行扩增、检测。结果添加果酸的梯度样本仅在40倍稀释时获得完整STR分型结果,另外5种方式处理的梯度样本在40~160倍稀释时均获得完整的STR分型。DNA浓缩后的STR分型结果显示,平均峰高和基因座检出率均有一定程度的提高,但是效果并不明显。结论全自动核酸提取仪具有高效的抑制剂去除能力和DNA提取效率,真空浓缩仪可在一定程度上浓缩DNA,两者联合使用可提高法医学检材的检验成功率。
关键词
法医遗传学
DNA
提取
微量DNA
STR分型
抑制剂
全自动核酸提取仪
真空浓缩
仪
Keywords
forensic genetics
DNA extraction
trace DNA
STR typing
inhibitor
automatic nucleic acid extractor
vacuum concentrator
分类号
DF795.2 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全自动核酸提取仪对不同类型ASFV、PEDV样品的提取效果
陈秀萍
蒋叶林
周丽雯
凌勇
陈永贵
张蓉
吴有林
丁能水
《现代畜牧兽医》
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
不同全自动核酸提取仪对ASFV、PEDV提取效果的比较
黄丽娜
陈秀萍
甘跃灵
谢璐娜
王雪妹
《今日养猪业》
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
全自动核酸提取仪与手动提取组织DNA的效率比较
林丹义
张科平
许洁
颜黎栩
骆新兰
刘艳辉
《临床与实验病理学杂志》
CSCD
北大核心
2017
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
全自动核酸提取仪联合真空浓缩仪在法医学中的应用
李淑侠
沈金建
曹佩军
李志超
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021
2
在线阅读
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职称材料
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