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丝状真菌全局性调控因子LaeA的生物信息学分析
1
作者
刘惠怡
刘主
+3 位作者
陈庆泽
许喜佳
陈凯
康林芝
《现代农业科技》
2025年第7期145-149,共5页
通过应用生物信息学分析方法,对丝状真菌中的全局性调控因子LaeA进行结构与功能预测,旨在为揭示其在丝状真菌次级代谢过程中的作用提供科学依据。结果表明:丝状真菌全局性调控因子LaeA是亲水蛋白,无跨膜区且无信号肽;在氨基酸序列第250~...
通过应用生物信息学分析方法,对丝状真菌中的全局性调控因子LaeA进行结构与功能预测,旨在为揭示其在丝状真菌次级代谢过程中的作用提供科学依据。结果表明:丝状真菌全局性调控因子LaeA是亲水蛋白,无跨膜区且无信号肽;在氨基酸序列第250~275位之间可能存在卷曲结构;二级结构中,α-螺旋所占比例为29.84%,β-折叠占15.59%,β-转角占4.30%,无规则卷曲占50.27%;在第138~226位之间有1个结构域Methyltransf_25 domain;预测结果显示,该蛋白氨基酸序列不能够得到较为理想的蛋白质三维结构模型;LaeA蛋白具有翻译途径tRNA甲基化酶以及Ⅰ类SAM依赖性甲基转移酶的作用。
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关键词
丝状真菌
全局性调控因子
LAEA
生物信息学
疏水性
结构域
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职称材料
细菌全局性调控蛋白CsrA的结构与功能
被引量：
1
2
作者
郑丽平
赵振芳
冯永君
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期711-718,共8页
碳存储调控因子A(carbon storage regulator,CsrA)是一种RNA结合蛋白,在细菌的碳代谢、生物被膜形成、运动性、病原菌毒力、群体感应、环二鸟苷酸信号合成、应激感应等多种生理过程中具有重要调节功能,是全局性调控蛋白.它通过与靶标mRN...
碳存储调控因子A(carbon storage regulator,CsrA)是一种RNA结合蛋白,在细菌的碳代谢、生物被膜形成、运动性、病原菌毒力、群体感应、环二鸟苷酸信号合成、应激感应等多种生理过程中具有重要调节功能,是全局性调控蛋白.它通过与靶标mRNA的特异结合,抑制其翻译或增强其稳定性来调控下游基因的表达,属于转录后调控因子的范畴.CsrA蛋白的表达与活性受碳存储调控(Csr)系统本身多个自主调节回路的精密控制:一些小的非编码RNA(snmRNAs,如CsrB/C)作为拮抗因子与CsrA二聚体结合并抑制其活性;而这些snmRNAs在体内又可在CsrD的辅助下被核糖核酸内切酶E和多核苷酸磷酸化酶降解,释放CsrA的活性.当前,对于Csr系统的调节作用、调控通路与机制的研究是细菌学研究的热点,本文综述了该蛋白及Csr系统的结构、功能和作用机制的最新研究进展.
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关键词
碳存储
调控
因子
A
全局性调控因子
非编码小RNA
转录后调节
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职称材料
题名
丝状真菌全局性调控因子LaeA的生物信息学分析
1
作者
刘惠怡
刘主
陈庆泽
许喜佳
陈凯
康林芝
机构
韶关学院生物与农业学院
韶关学院食品学院
韶关市星河生物科技有限公司
出处
《现代农业科技》
2025年第7期145-149,共5页
基金
广东省韶关学院大学生创新创业训练计划项目(S202210576063)
广东省韶关学院科研重点项目(SZ2018KJ07)
+1 种基金
广东省普通高校青年创新人才类项目(2021KQNCX086)
广东省教育厅普通高校重点项目(2022ZDZX2058)。
文摘
通过应用生物信息学分析方法,对丝状真菌中的全局性调控因子LaeA进行结构与功能预测,旨在为揭示其在丝状真菌次级代谢过程中的作用提供科学依据。结果表明:丝状真菌全局性调控因子LaeA是亲水蛋白,无跨膜区且无信号肽;在氨基酸序列第250~275位之间可能存在卷曲结构;二级结构中,α-螺旋所占比例为29.84%,β-折叠占15.59%,β-转角占4.30%,无规则卷曲占50.27%;在第138~226位之间有1个结构域Methyltransf_25 domain;预测结果显示,该蛋白氨基酸序列不能够得到较为理想的蛋白质三维结构模型;LaeA蛋白具有翻译途径tRNA甲基化酶以及Ⅰ类SAM依赖性甲基转移酶的作用。
关键词
丝状真菌
全局性调控因子
LAEA
生物信息学
疏水性
结构域
Keywords
filamentous fungus
global regulatory factor
LaeA
bioinformatics
hydrophobicity
domain
分类号
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
细菌全局性调控蛋白CsrA的结构与功能
被引量：
1
2
作者
郑丽平
赵振芳
冯永君
机构
北京理工大学生命科学学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期711-718,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.31170035
No.31271636)~~
文摘
碳存储调控因子A(carbon storage regulator,CsrA)是一种RNA结合蛋白,在细菌的碳代谢、生物被膜形成、运动性、病原菌毒力、群体感应、环二鸟苷酸信号合成、应激感应等多种生理过程中具有重要调节功能,是全局性调控蛋白.它通过与靶标mRNA的特异结合,抑制其翻译或增强其稳定性来调控下游基因的表达,属于转录后调控因子的范畴.CsrA蛋白的表达与活性受碳存储调控(Csr)系统本身多个自主调节回路的精密控制:一些小的非编码RNA(snmRNAs,如CsrB/C)作为拮抗因子与CsrA二聚体结合并抑制其活性;而这些snmRNAs在体内又可在CsrD的辅助下被核糖核酸内切酶E和多核苷酸磷酸化酶降解,释放CsrA的活性.当前,对于Csr系统的调节作用、调控通路与机制的研究是细菌学研究的热点,本文综述了该蛋白及Csr系统的结构、功能和作用机制的最新研究进展.
关键词
碳存储
调控
因子
A
全局性调控因子
非编码小RNA
转录后调节
Keywords
carbon storage regulator A （CsrA）
global regulatory protein
small non-messenger RNA（snmRNA）
transcriptional regulatory
分类号
Q74 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
丝状真菌全局性调控因子LaeA的生物信息学分析
刘惠怡
刘主
陈庆泽
许喜佳
陈凯
康林芝
《现代农业科技》
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
细菌全局性调控蛋白CsrA的结构与功能
郑丽平
赵振芳
冯永君
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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职称材料
已选择
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