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题名亲水作用色谱法测定组织中全基因组DNA甲基化水平
被引量：2
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作者
张良滔
张立坚
张俊杰
刘春安
蔡春
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机构
广东医学院
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期342-345,共4页
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基金
广东医学院博士基金
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文摘
建立了亲水作用色谱（HILIC）测定组织中全基因组DNA甲基化水平的方法。采用苯酚-氯仿提取组织中的DNA,提取的DNA用88%甲酸在140℃下裂解,经N2吹干后,加乙腈-水（9∶1,v/v）溶解,用Waters BEH HILIC柱进行分离,在277nm波长下检测胞嘧啶（Cyt）及5-甲基胞嘧啶（5-mCyt）含量。结果表明,以乙腈-10mmol/L甲酸铵溶液（94∶6,v/v）为流动相,流速为0.5mL/min,Cyt与5-mCyt分离较好,保留时间分别为2.6与3.1min。胞嘧啶的线性范围为1~900μmol/L,相关系数为0.999 9;5-甲基胞嘧啶的线性范围为1~64μmol/L,相关系数为0.999 8。胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的检出限为54nmol/L（柱中为0.54pmol）,定量限为250nmol/L（柱中为2.5pmol）;在5~900μmol/L的添加水平下,胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的平均加标回收率为94.7%~100.5%,相对标准偏差小于1.48%。用该方法检测了结肠癌组织中DNA甲基化水平,结果显示该癌组织中全基因组的DNA甲基化均值为4.0%。该方法快速、简单,稳定性好,灵敏度较高,能满足全基因组DNA甲基化的检测要求。
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关键词
亲水作用色谱
全基因组dna甲基化
组织
结肠癌
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Keywords
hydrophilic interaction liquid chromatography（HILIC）
global dna methylation
tissues
colon cancer
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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题名葡萄孢菌全基因组DNA遗传多态性RAPD分析
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作者
吴德喜
王扬
王学英
张立新
黄国品
孔令平
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机构
云南农业大学
云南省林业科学院
云南省烟草鲁甸县公司
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出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2000年第3期282-283,共2页
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关键词
葡萄孢菌
RPAD分析
全基因组dna
遗传多态性
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分类号
Q949.331.3
[生物学—植物学]
Q75
[生物学—分子生物学]
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