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棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析
被引量：
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作者
王艳情
郑杰
+8 位作者
许艳超
蔡小彦
周忠丽
侯宇清
王坤波
王玉红
陈浩东
刘方
李志坤
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021年第6期469-481,共13页
【目的】组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析。【方法】利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行...
【目的】组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析。【方法】利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、系统发育关系、基因结构进行系统分析。利用实时荧光定量聚合酶链式反应分析了黄萎病菌诱导下瑟伯氏棉HADC基因的表达模式。【结果】陆地棉、亚洲棉和瑟伯氏棉基因组中分别包括30、15和13个HDAC基因。棉花HDAC分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2三个亚族,同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序。棉花HDACs基因启动子中含有大量的激素应答、胁迫响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件。瑟伯氏棉GthHDAC基因响应乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导;在黄萎病菌胁迫下,多数GthHDAC基因上调表达,表明该基因家族可能通过乙烯/茉莉酸和水杨酸等信号通路调控棉花黄萎病抗性。【结论】本研究从全基因组水平上鉴定了亚洲棉、陆地棉和瑟伯氏棉中58个HDAC家族基因,并明确了瑟伯氏棉HDAC家族成员在黄萎病菌胁迫下的表达模式。黄萎病菌处理后,大部分GthHDAC基因在叶片中上调表达,并且受到乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导。
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关键词
棉花
HDAC
抗黄萎病
全基因组家族鉴定
基因
表达
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题名
棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析
被引量：
1
1
作者
王艳情
郑杰
许艳超
蔡小彦
周忠丽
侯宇清
王坤波
王玉红
陈浩东
刘方
李志坤
机构
河北农业大学/华北作物改良与调控国家重点实验室
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021年第6期469-481,共13页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610162021039,16101620201050,1610162021017)
湖南省自然科学基金青年基金(2019JJ50307)。
文摘
【目的】组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析。【方法】利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、系统发育关系、基因结构进行系统分析。利用实时荧光定量聚合酶链式反应分析了黄萎病菌诱导下瑟伯氏棉HADC基因的表达模式。【结果】陆地棉、亚洲棉和瑟伯氏棉基因组中分别包括30、15和13个HDAC基因。棉花HDAC分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2三个亚族,同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序。棉花HDACs基因启动子中含有大量的激素应答、胁迫响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件。瑟伯氏棉GthHDAC基因响应乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导;在黄萎病菌胁迫下,多数GthHDAC基因上调表达,表明该基因家族可能通过乙烯/茉莉酸和水杨酸等信号通路调控棉花黄萎病抗性。【结论】本研究从全基因组水平上鉴定了亚洲棉、陆地棉和瑟伯氏棉中58个HDAC家族基因,并明确了瑟伯氏棉HDAC家族成员在黄萎病菌胁迫下的表达模式。黄萎病菌处理后,大部分GthHDAC基因在叶片中上调表达,并且受到乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导。
关键词
棉花
HDAC
抗黄萎病
全基因组家族鉴定
基因
表达
Keywords
cotton
HDAC
Verticillium wilt resistance
genome-wide gene family identification
gene expression
分类号
S435.621 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析
王艳情
郑杰
许艳超
蔡小彦
周忠丽
侯宇清
王坤波
王玉红
陈浩东
刘方
李志坤
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021
1
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