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猪圆环病毒2型分离毒株全基因组克隆与序列分析
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作者 罗玉均 张桂红 +4 位作者 陈建红 杨林 廖明 任涛 罗开健 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第5期14-16,共3页
关键词 猪圆环病毒2型 分离毒株 全基因组克隆 序列分析 断奶猪多系统衰竭综合征 PCV2 DNA病毒 细胞培养物
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BVDV Singer_Arg株全基因组克隆及其感染性RNA制备 被引量:1
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作者 秦春雪 宋现梅 +3 位作者 王洪梅 丁乃峥 何洪彬 何成强 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第5期43-49,共7页
克隆牛病毒性腹泻病毒Singer_Arg株全长cDNA,并获得其感染性RNA。将病毒基因组分段克隆后再拼接成全长cDNA;通过巨细胞病毒即早期启动子控制病毒cDNA转录,5'-UTR上游的锤头状核酶和3'-UTR下游的丁肝病毒核酶控制转录产物5'-... 克隆牛病毒性腹泻病毒Singer_Arg株全长cDNA,并获得其感染性RNA。将病毒基因组分段克隆后再拼接成全长cDNA;通过巨细胞病毒即早期启动子控制病毒cDNA转录,5'-UTR上游的锤头状核酶和3'-UTR下游的丁肝病毒核酶控制转录产物5'-UTR和3'-UTR的完整性和准确性,以获得不经体外转录,直接转染细胞产生病毒感染性RNA的反向遗传操作系统;并通过Western blot、RT-PCR技术、免疫荧光等方法对子代病毒进行了一系列鉴定与遗传稳定性分析。获得了Singer_Arg株全基因组序列并通过反向遗传拯救出该毒株。成功构建了基于Singer_Arg株的BVDV反向遗传操作系统,为BVDV疫苗研发和基础研究提供了技术平台。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 反向遗传学 全基因组克隆
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1株圆环病毒3型美国毒株全基因组克隆与遗传演化分析 被引量:1
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作者 郑晶 郝桂英 +8 位作者 谢礼 安微 杨苗 陈瑛琪 张婧 郑巧 陈溪 陈孝宇 林华 《中国动物检疫》 CAS 2022年第1期116-123,共8页
为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV... 为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV3美国毒株(命名为PCV3_USA2021,GenBank登录号OL799306)全基因组序列长度约为2000 bp,与国内外不同地区的38个PCV3参考毒株同源性为98.7%~99.8%。其中,PCV3_USA2021株开放阅读框ORF1和ORF2与国内外38个参考毒株同源性分别为99.1%~99.9%和98.0%~100%。构建的全基因组系统进化树显示,该毒株为PCV3a亚型,与美国毒株(PCV3-US_SD2016)亲缘关系最近。本研究为PCV3的遗传变异、流行病学分析提供了参考,也为相关疫苗的研制打下了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 全基因组克隆 遗传演化分析 CAP蛋白 美国毒株
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IBDV全基因组克隆、反向遗传系统的建立及基因缺失疫苗研究
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《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期229-229,共1页
传染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus,IBDV)是传染性法氏囊病的病原,该病是目前危害世界养禽业的主要传染病之一。
关键词 全基因组克隆 基因缺失疫苗 IBDV 遗传系统 传染性法氏囊病病毒 virus 传染病 养禽业
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九株猪圆环病毒Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析
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作者 秦春圃 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第2期217-217,共1页
广西大学动物科技学院严业师、黄伟坚和屈素洁等科研工作者参考GenBank发表的猪圆环病毒Ⅱ型Porcine circovirus2.PCV2全基因组序列.设计一对引物.通过反向PCR技术扩增出9株PCV2流行株的全基因,并进行了序列测定与分析。结果发现9株... 广西大学动物科技学院严业师、黄伟坚和屈素洁等科研工作者参考GenBank发表的猪圆环病毒Ⅱ型Porcine circovirus2.PCV2全基因组序列.设计一对引物.通过反向PCR技术扩增出9株PCV2流行株的全基因,并进行了序列测定与分析。结果发现9株PCV2的基因组全长为1768bp或1767bp,同源性比较发现.这9株PCV2之间的核苷酸同源性为95.6%~100%, 展开更多
关键词 猪圆环病毒Ⅱ型 全基因组克隆 序列分析 流行毒株 GENBANK PCV2 动物科技学院 基因组序列
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山东烟区首次发现番茄斑萎病毒侵染 被引量:8
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作者 张万红 冯佳 +10 位作者 ALI Kamran 罗健达 杨举田 王术科 宗浩 申莉莉 李莹 王凤龙 张石飞 杨金广 金轲 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2020年第5期87-91,共5页
为确定番茄斑萎病毒(TSWV)在山东烟草上的侵染,基于GenBank中已有的TSWV基因组序列设计该病毒特异性引物,通过总RNA提取,RT-PCR扩增,全基因组序列测定和拼接分析等,结果表明,山东临沂疑似病样中含有TSWV,该TSWV分离物具有3条RNA链,大小... 为确定番茄斑萎病毒(TSWV)在山东烟草上的侵染,基于GenBank中已有的TSWV基因组序列设计该病毒特异性引物,通过总RNA提取,RT-PCR扩增,全基因组序列测定和拼接分析等,结果表明,山东临沂疑似病样中含有TSWV,该TSWV分离物具有3条RNA链,大小分别为8911、4773和2971bp,与国内已报道的其他TSWV分离物核酸序列同源性均在99.0%以上,蛋白氨基酸序列同源性均在98.0%以上。系统进化分析结果显示,该分离物与已报道的TSWV云南分离物聚类到同一分支中,推测山东烟区中的TSWV可能由云南烟区通过带毒介体的迁入而传入。该研究为山东烟区TSWV的发生流行溯源和该危险性病毒病的精准测报及防控提供科学依据。 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒(TSWV) 全基因组克隆 系统发育树
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我国部分地区猪圆环病毒2型分离株的遗传变异分析
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《今日畜牧兽医》 2010年第1期68-68,共1页
为了解我国猪圆环病毒2型(PCV2)流行毒株遗传变异情况,本研究对本实验室分离到的19株PCV2分离株通过病毒全基因组克隆和测序分析,将其分为2个大基因群和3个亚群,其基因组分别为1766nt、1767nt和1768nt,各占15.8%、73.7%和10.... 为了解我国猪圆环病毒2型(PCV2)流行毒株遗传变异情况,本研究对本实验室分离到的19株PCV2分离株通过病毒全基因组克隆和测序分析,将其分为2个大基因群和3个亚群,其基因组分别为1766nt、1767nt和1768nt,各占15.8%、73.7%和10.5%。以1767nt毒株为基准,其基因组第39或1039位有1个碱基缺失后突变成1766nt毒株:第1040位有1个碱基插入后突变成1768nt毒株。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 遗传变异分析 分离株 全基因组克隆 流行毒株 测序分析 PCV2 实验室
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