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综合生物信息学分析阐明免疫血栓形成的分子特性与诊疗潜力
1
作者
王雅芬
吴晓双
+4 位作者
刘志新
李欣蕾
陈要臻
安宁
胡兴斌
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025年第3期228-235,共8页
目的 本研究旨在探讨免疫血栓形成的共同分子特征,以期深入理解由免疫炎症反应所诱发的血栓形成过程,为发掘潜在的诊疗靶点提供重要依据。方法 对系统性红斑狼疮(SLE)和静脉血栓栓塞症(VTE)数据集进行差异表达基因鉴定和功能富集分析,...
目的 本研究旨在探讨免疫血栓形成的共同分子特征,以期深入理解由免疫炎症反应所诱发的血栓形成过程,为发掘潜在的诊疗靶点提供重要依据。方法 对系统性红斑狼疮(SLE)和静脉血栓栓塞症(VTE)数据集进行差异表达基因鉴定和功能富集分析,随后与中性粒细胞外陷阱(NET)的差异表达基因取交集,得到SLE-NET和VTE-NET的串扰基因(CG)。对这些CG进行功能富集和蛋白质互作(PPI)网络分析,以识别中枢(hub)基因。使用维恩图和受试者工作特征(ROC)曲线分析筛选最佳共享诊断CG,并在移植物抗宿主病(GVHD)数据集中进行了验证。结果 SLE和VTE的差异表达基因分别富集于不同的生物学过程,而SLE-NET-CG和VTE-NET-CG则共同涉及白细胞迁移、炎症反应和免疫反应等途径。通过PPI网络分析,识别出多个hub基因,其中基质金属蛋白酶9(MMP9)和S100钙结合蛋白A12(S100A12)被鉴定为SLE[ROC曲线下的面积(AUC)分别为0.936和0.832]和VTE(AUC分别为0.719和0.759)的最佳共享诊断CG。在GVHD数据集中,也证实MMP9具有较好的诊断效能(AUC:0.696)。结论 本研究揭示了SLE、 VTE和NET的共同分子特征,筛选出MMP9和S100A12作为最佳共享诊断CG,为免疫血栓形成的诊疗策略提供了重要依据。同时,MMP9在GVHD中的表达验证了其在免疫系统疾病VTE风险中的关键作用。
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关键词
免疫血栓形成
系统性红斑狼疮(SLE)
静脉
血栓
栓塞症(VTE)
中性粒细胞外陷阱(NET)
移植物抗宿主病(GVHD)
生物信息学分析
基质金属蛋白酶9(MMP9)
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职称材料
2019冠状病毒病相关血栓形成的研究进展
被引量:
3
2
作者
沈国民
沈滟
杨海平
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2286-2292,共7页
新型冠状病毒肺炎(2019冠状病毒病,coronavirus disease 2019,COVID-19)是由新型冠状病毒(严重急性呼吸综合征冠状病毒2,severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2;简称新冠病毒)引起的一种呼吸系统传染病,是目前...
新型冠状病毒肺炎(2019冠状病毒病,coronavirus disease 2019,COVID-19)是由新型冠状病毒(严重急性呼吸综合征冠状病毒2,severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2;简称新冠病毒)引起的一种呼吸系统传染病,是目前人类面临的最大的公共卫生问题。
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关键词
新型冠状病毒肺炎/2019冠状病毒病
新型冠状病毒
免疫血栓形成
固有
免疫
血栓
并发症
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职称材料
题名
综合生物信息学分析阐明免疫血栓形成的分子特性与诊疗潜力
1
作者
王雅芬
吴晓双
刘志新
李欣蕾
陈要臻
安宁
胡兴斌
机构
空军军医大学第一附属医院输血科
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025年第3期228-235,共8页
基金
陕西省自然科学基础研究计划(2024JC-YBQN-0890)。
文摘
目的 本研究旨在探讨免疫血栓形成的共同分子特征,以期深入理解由免疫炎症反应所诱发的血栓形成过程,为发掘潜在的诊疗靶点提供重要依据。方法 对系统性红斑狼疮(SLE)和静脉血栓栓塞症(VTE)数据集进行差异表达基因鉴定和功能富集分析,随后与中性粒细胞外陷阱(NET)的差异表达基因取交集,得到SLE-NET和VTE-NET的串扰基因(CG)。对这些CG进行功能富集和蛋白质互作(PPI)网络分析,以识别中枢(hub)基因。使用维恩图和受试者工作特征(ROC)曲线分析筛选最佳共享诊断CG,并在移植物抗宿主病(GVHD)数据集中进行了验证。结果 SLE和VTE的差异表达基因分别富集于不同的生物学过程,而SLE-NET-CG和VTE-NET-CG则共同涉及白细胞迁移、炎症反应和免疫反应等途径。通过PPI网络分析,识别出多个hub基因,其中基质金属蛋白酶9(MMP9)和S100钙结合蛋白A12(S100A12)被鉴定为SLE[ROC曲线下的面积(AUC)分别为0.936和0.832]和VTE(AUC分别为0.719和0.759)的最佳共享诊断CG。在GVHD数据集中,也证实MMP9具有较好的诊断效能(AUC:0.696)。结论 本研究揭示了SLE、 VTE和NET的共同分子特征,筛选出MMP9和S100A12作为最佳共享诊断CG,为免疫血栓形成的诊疗策略提供了重要依据。同时,MMP9在GVHD中的表达验证了其在免疫系统疾病VTE风险中的关键作用。
关键词
免疫血栓形成
系统性红斑狼疮(SLE)
静脉
血栓
栓塞症(VTE)
中性粒细胞外陷阱(NET)
移植物抗宿主病(GVHD)
生物信息学分析
基质金属蛋白酶9(MMP9)
Keywords
immunothrombosis
systemic lupus erythematosus(SLE)
venous thromboembolism(VTE)
neutrophil extracellular traps(NET)
graft-versus-host disease(GVHD)
bioinformatics analysis
matrix metalloproteinase 9(MMP9)
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
R593.241 [医药卫生—内科学]
R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]
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职称材料
题名
2019冠状病毒病相关血栓形成的研究进展
被引量:
3
2
作者
沈国民
沈滟
杨海平
机构
河南科技大学基础医学院
河南科技大学第一附属医院血液科
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2286-2292,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81770140,No.82170133)
河南省科技攻关项目(No.212102310629,No.212102310877)。
文摘
新型冠状病毒肺炎(2019冠状病毒病,coronavirus disease 2019,COVID-19)是由新型冠状病毒(严重急性呼吸综合征冠状病毒2,severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2;简称新冠病毒)引起的一种呼吸系统传染病,是目前人类面临的最大的公共卫生问题。
关键词
新型冠状病毒肺炎/2019冠状病毒病
新型冠状病毒
免疫血栓形成
固有
免疫
血栓
并发症
Keywords
Coronavirus disease 2019
SARS-CoV-2
Immunothrombosis
Innate immunity
Thrombotic complications
分类号
R563.14 [医药卫生—呼吸系统]
R363 [医药卫生—病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
综合生物信息学分析阐明免疫血栓形成的分子特性与诊疗潜力
王雅芬
吴晓双
刘志新
李欣蕾
陈要臻
安宁
胡兴斌
《细胞与分子免疫学杂志》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
2019冠状病毒病相关血栓形成的研究进展
沈国民
沈滟
杨海平
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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