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ALOX5可作为与免疫细胞浸润相关的非小细胞肺癌预后生物标志物
被引量：
5
1
作者
赵倩倩
孙之
+3 位作者
潘月眉
荆琪
李伟
王传玺
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期311-322,共12页
目的:肺癌免疫治疗疗效与免疫细胞浸润密切相关。花生四烯酸5-脂氧合酶(arachidonic acid 5-lipoxygenase,ALOX5)可激活炎症反应并触发各种细胞死亡模式;然而,ALOX5与肺癌免疫细胞浸润的相关性尚不清楚。本研究利用在线数据库分析ALOX5...
目的:肺癌免疫治疗疗效与免疫细胞浸润密切相关。花生四烯酸5-脂氧合酶(arachidonic acid 5-lipoxygenase,ALOX5)可激活炎症反应并触发各种细胞死亡模式;然而,ALOX5与肺癌免疫细胞浸润的相关性尚不清楚。本研究利用在线数据库分析ALOX5在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达,探讨其与NSCLC免疫细胞浸润的相关性及其与预后的关系。方法:分析TIMER、GEPIA和UALCAN等在线数据库中NSCLC和正常组织ALOX5 mRNA和蛋白表达的差异;应用Kaplan-Meier数据库探讨ALOX5的预后价值,GeneMANIA和String网站探索与ALOX5基因表达相关联的基因及蛋白质;对TCGA数据库挖掘出的差异基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;应用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)软件预测ALOX5可能参与的信号通路,TIMER数据库分析ALOX5对免疫细胞浸润水平的影响。结果:与正常肺组织相比,ALOX5在NSCLC组织中呈低表达(P<0.05),且影响NSCLC患者预后。基因互作网络分析发现:与ALOX5基因相互作用的基因主要有毛状样蛋白(coactosin like protein 1,COTL1)、白三烯C4合酶(leukotriene C4 synthase,LTC4S)和环加氧酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS2)等脂质氧化和促炎介质生成的相关基因,蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析结果与之一致。GO、KEGG富集分析发现:ALOX5基因参与多种免疫细胞功能活化的生物过程,并参与免疫反应功能通路。GSEA结果显示ALOX5可能通过影响细胞因子与细胞因子受体的相互作用、自然杀伤细胞介导的细胞毒性和T细胞受体等信号通路,从而激活免疫反应,介导与免疫相关的预后。肺腺癌及肺鳞状细胞癌中ALOX5 mRNA表达与肿瘤浸润性免疫细胞(B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞等)浸润水平均呈正相关(均P<0.05),并且与经典的T细胞免疫检查点抑制剂基因标志物呈正相关(P<0.001)。结论:ALOX5基因在NSCLC中表达显著下调,可影响NSCLC预后和肿瘤免疫细胞浸润水平。ALOX5基因可能是潜在的与免疫细胞浸润相关的NSCLC预后生物标志物。
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关键词
花生四烯酸5-脂氧合酶
非小
细胞
肺癌
预后生物标志物
免疫细胞浸润水平
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题名
ALOX5可作为与免疫细胞浸润相关的非小细胞肺癌预后生物标志物
被引量：
5
1
作者
赵倩倩
孙之
潘月眉
荆琪
李伟
王传玺
机构
山东大学齐鲁医学院医学融合与实践中心
山东省立医院医学影像科
出处
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期311-322,共12页
基金
国家自然科学基金(82172672)
山东省自然科学基金(ZR2021MH379)。
文摘
目的:肺癌免疫治疗疗效与免疫细胞浸润密切相关。花生四烯酸5-脂氧合酶(arachidonic acid 5-lipoxygenase,ALOX5)可激活炎症反应并触发各种细胞死亡模式;然而,ALOX5与肺癌免疫细胞浸润的相关性尚不清楚。本研究利用在线数据库分析ALOX5在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达,探讨其与NSCLC免疫细胞浸润的相关性及其与预后的关系。方法:分析TIMER、GEPIA和UALCAN等在线数据库中NSCLC和正常组织ALOX5 mRNA和蛋白表达的差异;应用Kaplan-Meier数据库探讨ALOX5的预后价值,GeneMANIA和String网站探索与ALOX5基因表达相关联的基因及蛋白质;对TCGA数据库挖掘出的差异基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;应用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)软件预测ALOX5可能参与的信号通路,TIMER数据库分析ALOX5对免疫细胞浸润水平的影响。结果:与正常肺组织相比,ALOX5在NSCLC组织中呈低表达(P<0.05),且影响NSCLC患者预后。基因互作网络分析发现:与ALOX5基因相互作用的基因主要有毛状样蛋白(coactosin like protein 1,COTL1)、白三烯C4合酶(leukotriene C4 synthase,LTC4S)和环加氧酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS2)等脂质氧化和促炎介质生成的相关基因,蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析结果与之一致。GO、KEGG富集分析发现:ALOX5基因参与多种免疫细胞功能活化的生物过程,并参与免疫反应功能通路。GSEA结果显示ALOX5可能通过影响细胞因子与细胞因子受体的相互作用、自然杀伤细胞介导的细胞毒性和T细胞受体等信号通路,从而激活免疫反应,介导与免疫相关的预后。肺腺癌及肺鳞状细胞癌中ALOX5 mRNA表达与肿瘤浸润性免疫细胞(B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞等)浸润水平均呈正相关(均P<0.05),并且与经典的T细胞免疫检查点抑制剂基因标志物呈正相关(P<0.001)。结论:ALOX5基因在NSCLC中表达显著下调,可影响NSCLC预后和肿瘤免疫细胞浸润水平。ALOX5基因可能是潜在的与免疫细胞浸润相关的NSCLC预后生物标志物。
关键词
花生四烯酸5-脂氧合酶
非小
细胞
肺癌
预后生物标志物
免疫细胞浸润水平
Keywords
arachidonic acid 5-lipoxygenase
non-small cell lung cancer
prognostic biomarkers
immune cell infiltration level
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ALOX5可作为与免疫细胞浸润相关的非小细胞肺癌预后生物标志物
赵倩倩
孙之
潘月眉
荆琪
李伟
王传玺
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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