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MMP14在胰腺癌中的表达及其与肿瘤免疫微环境特征的相关性研究
被引量:
3
1
作者
许静轩
杜少倩
+2 位作者
曹源
王红霞
黄伟翼
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期312-322,共11页
目的·探究基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase 14,MMP14)在胰腺癌组织中的表达及其与临床特征的相关性,并分析其与胰腺癌肿瘤免疫微环境特征的相关性。方法·通过GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analys...
目的·探究基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase 14,MMP14)在胰腺癌组织中的表达及其与临床特征的相关性,并分析其与胰腺癌肿瘤免疫微环境特征的相关性。方法·通过GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)数据平台分析MMP家族成员在30种常见肿瘤组织中的表达情况。通过R语言整合GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库中167例胰腺正常组织和TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中178例胰腺癌组织及4例配对癌旁组织的转录组数据,比较MMP14在胰腺癌与正常组织及癌旁组织中的表达差异。使用GEPIA数据平台对不同MMP14表达水平胰腺癌患者进行生存分析。从TCGA数据库中下载178例胰腺癌患者的相关临床信息,应用Perl和R语言分析MMP14的表达与临床特征的相关性。应用R语言和GSEA v3.0进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析。采用CIBERSORT反卷积算法计算胰腺癌免疫微环境中各类免疫细胞亚群比例,分析MMP14的表达与各免疫细胞亚群比例的相关性。收集6例新鲜胰腺癌组织和配对癌旁组织,流式细胞术检测各类免疫细胞亚群;通过t-SNE降维与统计学分析,描述胰腺癌免疫微环境的特征。利用胰腺癌组织芯片进行多色荧光免疫组织化学实验,检测MMP14的表达与免疫细胞亚群的比例,验证生物信息学分析结果。结果·在生物信息学数据库中,与MMP家族其他成员相比,MMP14在多种肿瘤中高表达,且胰腺癌中MMP14的表达水平高于其他肿瘤;MMP14在胰腺癌中表达水平显著高于胰腺正常组织和癌旁组织(P=0.000),TNM分期Ⅱ期肿瘤MMP14表达水平显著高于Ⅰ期(P=0.012),病理组织学分级G2和G3期肿瘤MMP14显著高于G1期(均P=0.000)。MMP14低表达组患者生存预后显著优于高表达组(P=0.033)。KEGG和GO分析结果显示MMP14主要富集在胰腺癌和免疫相关通路。MMP14的表达水平与CD8+T细胞、单核细胞的比例呈负相关(均P<0.05),与巨噬细胞的比例呈正相关(P=0.000)。流式细胞实验结果提示胰腺癌肿瘤微环境呈现免疫抑制性。多色荧光免疫组织化学实验结果显示,MMP14在肿瘤组织中表达水平显著高于癌旁组织(P=0.000),TNM分期较晚及病理组织学分级较高的肿瘤MMP14的表达水平也相对较高(均P<0.05)。在MMP14高表达的肿瘤组织中,CD8+T细胞比例降低(P=0.001),巨噬细胞比例升高(P=0.000),与生物信息学分析结果一致。结论·与正常胰腺组织和癌旁组织相比,MMP14在胰腺癌中的表达显著升高且与患者不良预后相关;MMP14高表达的胰腺癌组织中CD8+T细胞比例降低,巨噬细胞比例升高;高表达MMP14的胰腺癌肿瘤微环境呈现高度免疫抑制性。
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关键词
胰腺癌
基质金属蛋白酶14
肿瘤
免疫
微环境
生物信息学分析
流式细胞术
多
色
荧光
免疫
组织化学
法
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职称材料
表皮细胞生长因子治疗创面出现干细胞岛现象的方法学鉴别研究
被引量:
10
2
作者
付小兵
孙同柱
+1 位作者
孙晓庆
盛志勇
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期390-391,共2页
为从方法学和不同染色角度进一步确证在再生表皮的棘细胞层出现的“干细胞岛” ,采用与发现干细胞岛相似的组织学切片 ,用CD87染色法和基底膜染色对“干细胞岛”进一步鉴别。结果发现 ,CD87染色在再生表皮的基底膜呈阳性 ,基底膜染色在...
为从方法学和不同染色角度进一步确证在再生表皮的棘细胞层出现的“干细胞岛” ,采用与发现干细胞岛相似的组织学切片 ,用CD87染色法和基底膜染色对“干细胞岛”进一步鉴别。结果发现 ,CD87染色在再生表皮的基底膜呈阳性 ,基底膜染色在正常和再生表皮基底膜可以着色 ,而在发现干细胞岛的部位基底膜染色呈阴性。
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关键词
创伤
损伤
皮肤溃疡
免疫组织化学色
表皮细胞生长因子
创面修复
治疗
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职称材料
题名
MMP14在胰腺癌中的表达及其与肿瘤免疫微环境特征的相关性研究
被引量:
3
1
作者
许静轩
杜少倩
曹源
王红霞
黄伟翼
机构
上海交通大学医学院附属第一人民医院肿瘤中心
出处
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期312-322,共11页
基金
国家自然科学基金(82073269)。
文摘
目的·探究基质金属蛋白酶14(matrix metalloproteinase 14,MMP14)在胰腺癌组织中的表达及其与临床特征的相关性,并分析其与胰腺癌肿瘤免疫微环境特征的相关性。方法·通过GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)数据平台分析MMP家族成员在30种常见肿瘤组织中的表达情况。通过R语言整合GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库中167例胰腺正常组织和TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中178例胰腺癌组织及4例配对癌旁组织的转录组数据,比较MMP14在胰腺癌与正常组织及癌旁组织中的表达差异。使用GEPIA数据平台对不同MMP14表达水平胰腺癌患者进行生存分析。从TCGA数据库中下载178例胰腺癌患者的相关临床信息,应用Perl和R语言分析MMP14的表达与临床特征的相关性。应用R语言和GSEA v3.0进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析。采用CIBERSORT反卷积算法计算胰腺癌免疫微环境中各类免疫细胞亚群比例,分析MMP14的表达与各免疫细胞亚群比例的相关性。收集6例新鲜胰腺癌组织和配对癌旁组织,流式细胞术检测各类免疫细胞亚群;通过t-SNE降维与统计学分析,描述胰腺癌免疫微环境的特征。利用胰腺癌组织芯片进行多色荧光免疫组织化学实验,检测MMP14的表达与免疫细胞亚群的比例,验证生物信息学分析结果。结果·在生物信息学数据库中,与MMP家族其他成员相比,MMP14在多种肿瘤中高表达,且胰腺癌中MMP14的表达水平高于其他肿瘤;MMP14在胰腺癌中表达水平显著高于胰腺正常组织和癌旁组织(P=0.000),TNM分期Ⅱ期肿瘤MMP14表达水平显著高于Ⅰ期(P=0.012),病理组织学分级G2和G3期肿瘤MMP14显著高于G1期(均P=0.000)。MMP14低表达组患者生存预后显著优于高表达组(P=0.033)。KEGG和GO分析结果显示MMP14主要富集在胰腺癌和免疫相关通路。MMP14的表达水平与CD8+T细胞、单核细胞的比例呈负相关(均P<0.05),与巨噬细胞的比例呈正相关(P=0.000)。流式细胞实验结果提示胰腺癌肿瘤微环境呈现免疫抑制性。多色荧光免疫组织化学实验结果显示,MMP14在肿瘤组织中表达水平显著高于癌旁组织(P=0.000),TNM分期较晚及病理组织学分级较高的肿瘤MMP14的表达水平也相对较高(均P<0.05)。在MMP14高表达的肿瘤组织中,CD8+T细胞比例降低(P=0.001),巨噬细胞比例升高(P=0.000),与生物信息学分析结果一致。结论·与正常胰腺组织和癌旁组织相比,MMP14在胰腺癌中的表达显著升高且与患者不良预后相关;MMP14高表达的胰腺癌组织中CD8+T细胞比例降低,巨噬细胞比例升高;高表达MMP14的胰腺癌肿瘤微环境呈现高度免疫抑制性。
关键词
胰腺癌
基质金属蛋白酶14
肿瘤
免疫
微环境
生物信息学分析
流式细胞术
多
色
荧光
免疫
组织化学
法
Keywords
pancreatic cancer
matrix metalloproteinase 14(MMP14)
tumor immune microenvironment
bioinformatics analysis
flow cytometry
multiplex immunohistochemistry(mIHC)
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
表皮细胞生长因子治疗创面出现干细胞岛现象的方法学鉴别研究
被引量:
10
2
作者
付小兵
孙同柱
孙晓庆
盛志勇
机构
解放军第
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期390-391,共2页
基金
国家重大基础研究规划项目 (编号G1 9990 542 0 4 )
国家杰出青年科学基金 (编号 3952 50 2 4 )
国家自然科学基金 (编号 30 1 70 966)
文摘
为从方法学和不同染色角度进一步确证在再生表皮的棘细胞层出现的“干细胞岛” ,采用与发现干细胞岛相似的组织学切片 ,用CD87染色法和基底膜染色对“干细胞岛”进一步鉴别。结果发现 ,CD87染色在再生表皮的基底膜呈阳性 ,基底膜染色在正常和再生表皮基底膜可以着色 ,而在发现干细胞岛的部位基底膜染色呈阴性。
关键词
创伤
损伤
皮肤溃疡
免疫组织化学色
表皮细胞生长因子
创面修复
治疗
Keywords
wounds and injuries
skin ulcer
stem cell
immunohistochemicy
分类号
R641 [医药卫生—外科学]
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MMP14在胰腺癌中的表达及其与肿瘤免疫微环境特征的相关性研究
许静轩
杜少倩
曹源
王红霞
黄伟翼
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
表皮细胞生长因子治疗创面出现干细胞岛现象的方法学鉴别研究
付小兵
孙同柱
孙晓庆
盛志勇
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002
10
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职称材料
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