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乙型肝炎病毒PreS1蛋白与初期多肽相关复合体α亚单位特异性结合的研究
被引量：
1
1
作者
李丹
丁健
+1 位作者
林纳
王小众
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第23期2315-2318,共4页
目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)PreS1蛋白与人类初期多肽相关复合体α亚单位(nascent-polypeptide-asso-ciated complex alpha polypeptide,NACA)之间的结合作用。方法采用交合实验验证PreS1蛋白和NACA在酵母细胞内的结合作用,利用离体结合...
目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)PreS1蛋白与人类初期多肽相关复合体α亚单位(nascent-polypeptide-asso-ciated complex alpha polypeptide,NACA)之间的结合作用。方法采用交合实验验证PreS1蛋白和NACA在酵母细胞内的结合作用,利用离体结合实验证实二者在体外的结合作用,免疫共沉淀实验证实二者在哺乳动物细胞中的特异性结合。结果携带NACA基因的酵母同携带preS1基因的酵母交合后发生反应,LacZ活性检测菌落呈现蓝色,离体结合实验Western印迹中出现特异性结合活性反应条带,提示PreS1蛋白和NACA在体外存在直接相互作用,免疫共沉淀实验在13×103处出现蛋白条带,提示在哺乳动物细胞水平仍能检测到PreS1蛋白和NACA的特异结合。结论NACA与PreS1蛋白在酵母细胞和哺乳动物细胞中均存在特异性结合,推测NACA可能通过与PreS1蛋白的结合影响病毒黏附及反式激活等过程。
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关键词
肝炎病毒
乙型
PRES1蛋白
初期多肽相关复合体α亚单位
离体结合
实验
免疫共沉淀实验
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职称材料
转录因子THAP1在人肺泡Ⅱ型上皮细胞中结合靶基因的谱系分析
被引量：
2
2
作者
丁蓉
胡毓华
+1 位作者
何思思
陆超
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期1200-1204,1215,共6页
目的 :确定转录因子THAP1的靶基因,为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。方法 :利用THAP1抗体进行染色质免疫共沉淀实验(chromatin immuno-precipitation,Ch IP),将富集到肺泡Ⅱ型上皮细胞来源的肺腺癌细胞A549上的DNA样品进行高通量测序,...
目的 :确定转录因子THAP1的靶基因,为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。方法 :利用THAP1抗体进行染色质免疫共沉淀实验(chromatin immuno-precipitation,Ch IP),将富集到肺泡Ⅱ型上皮细胞来源的肺腺癌细胞A549上的DNA样品进行高通量测序,对得到的核苷酸序列进行生物信息学分析。结果:共得到20 417个THAP1结合位点的核苷酸序列片段,对应9 688个结合的靶基因,THAP1结合的主要区域分布在基因间区、内含子区和启动子区。其中包含1 051个基因的启动子区。将THAP1结合于启动子区的基因进行基因功能(gene ontology,GO)注释,表明THAP1参与包括蛋白质二聚化、同源蛋白质结合、蛋白质磷酸化调节、类固醇激素受体的激活等多种细胞生物学过程。THAP1结合的基因主要涉及9个代谢路径,以胞吞作用、多糖降解、硫酸软骨素或硫酸皮肤素的生物合成等路径为主。结论:初步确定了转录因子THAP1在肺泡Ⅱ型上皮细胞中的靶基因结合序列,提示THAP1广泛参与了多种生物学过程,为研究THAP1的功能及作用机制研究提供了线索,从而为新生儿肺损伤的治疗奠定了基础。
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关键词
高通量测序
A549细胞
THAP1
染色质
免疫共沉淀实验
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职称材料
题名
乙型肝炎病毒PreS1蛋白与初期多肽相关复合体α亚单位特异性结合的研究
被引量：
1
1
作者
李丹
丁健
林纳
王小众
机构
福建医科大学附属协和医院消化研究室
福建医科大学附属第一医院消化内科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第23期2315-2318,共4页
基金
国家自然科学基金(30770979)
福建省自然科学基金(C0310018)~~
文摘
目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)PreS1蛋白与人类初期多肽相关复合体α亚单位(nascent-polypeptide-asso-ciated complex alpha polypeptide,NACA)之间的结合作用。方法采用交合实验验证PreS1蛋白和NACA在酵母细胞内的结合作用,利用离体结合实验证实二者在体外的结合作用,免疫共沉淀实验证实二者在哺乳动物细胞中的特异性结合。结果携带NACA基因的酵母同携带preS1基因的酵母交合后发生反应,LacZ活性检测菌落呈现蓝色,离体结合实验Western印迹中出现特异性结合活性反应条带,提示PreS1蛋白和NACA在体外存在直接相互作用,免疫共沉淀实验在13×103处出现蛋白条带,提示在哺乳动物细胞水平仍能检测到PreS1蛋白和NACA的特异结合。结论NACA与PreS1蛋白在酵母细胞和哺乳动物细胞中均存在特异性结合,推测NACA可能通过与PreS1蛋白的结合影响病毒黏附及反式激活等过程。
关键词
肝炎病毒
乙型
PRES1蛋白
初期多肽相关复合体α亚单位
离体结合
实验
免疫共沉淀实验
Keywords
hepatitis B virus
PreS1 protein
nascent-polypeptide-associated complex alpha polypeptide
in vitro binding assay
coimmunoprecipitation
分类号
R341 [医药卫生—基础医学]
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
转录因子THAP1在人肺泡Ⅱ型上皮细胞中结合靶基因的谱系分析
被引量：
2
2
作者
丁蓉
胡毓华
何思思
陆超
机构
南京医科大学第一附属医院儿科
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期1200-1204,1215,共6页
基金
国家自然科学基金(81170487)
江苏省妇幼系统重点学科项目(FXK 201212)
文摘
目的 :确定转录因子THAP1的靶基因,为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。方法 :利用THAP1抗体进行染色质免疫共沉淀实验(chromatin immuno-precipitation,Ch IP),将富集到肺泡Ⅱ型上皮细胞来源的肺腺癌细胞A549上的DNA样品进行高通量测序,对得到的核苷酸序列进行生物信息学分析。结果:共得到20 417个THAP1结合位点的核苷酸序列片段,对应9 688个结合的靶基因,THAP1结合的主要区域分布在基因间区、内含子区和启动子区。其中包含1 051个基因的启动子区。将THAP1结合于启动子区的基因进行基因功能(gene ontology,GO)注释,表明THAP1参与包括蛋白质二聚化、同源蛋白质结合、蛋白质磷酸化调节、类固醇激素受体的激活等多种细胞生物学过程。THAP1结合的基因主要涉及9个代谢路径,以胞吞作用、多糖降解、硫酸软骨素或硫酸皮肤素的生物合成等路径为主。结论:初步确定了转录因子THAP1在肺泡Ⅱ型上皮细胞中的靶基因结合序列,提示THAP1广泛参与了多种生物学过程,为研究THAP1的功能及作用机制研究提供了线索,从而为新生儿肺损伤的治疗奠定了基础。
关键词
高通量测序
A549细胞
THAP1
染色质
免疫共沉淀实验
Keywords
high-throughput sequencing
A549 cells
THAP1
Ch IP
分类号
R393 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙型肝炎病毒PreS1蛋白与初期多肽相关复合体α亚单位特异性结合的研究
李丹
丁健
林纳
王小众
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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下载PDF
职称材料
2
转录因子THAP1在人肺泡Ⅱ型上皮细胞中结合靶基因的谱系分析
丁蓉
胡毓华
何思思
陆超
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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