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蜜蜂残翼病病毒PCR检测及5′-UTR基因序列分析
被引量：
1
1
作者
郑言
宋战昀
+5 位作者
杨倩
王向辉
隋佳辰
张健
王振国
李敏思
《动物医学进展》
北大核心
2015年第5期52-55,共4页
从吉林省某蜂场疑似蜜蜂残翼病病料中分离到一株蜜蜂残翼病病毒（DWV）,命名为DWVJL1,提取该分离株的总RNA,采用RT-PCR技术扩增其基因组的5′-UTR并测序。测序结果与GenBank公布道的DWV 5′-UTR序列同源性在95%~99%之间。将测序结果与Ge...
从吉林省某蜂场疑似蜜蜂残翼病病料中分离到一株蜜蜂残翼病病毒（DWV）,命名为DWVJL1,提取该分离株的总RNA,采用RT-PCR技术扩增其基因组的5′-UTR并测序。测序结果与GenBank公布道的DWV 5′-UTR序列同源性在95%~99%之间。将测序结果与GenBank上公布的9个相关序列进行系统遗传进化树分析,证实其与JX878304同源性最近,而与GU109335、KJ437447同源性最远。
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关键词
蜜蜂残翼病病毒
5′-UTR
克隆和测序分析
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职称材料
汉族人群中22个HLA-Cw等位基因全长序列单核苷酸多态性分析
被引量：
3
2
作者
曾健强
徐筠娉
+3 位作者
王大明
高素青
邹红岩
邓志辉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期473-479,共7页
为探讨HLA-Cw(Human leukocyte antigen-Cw)基因全长序列分子遗传多态性,文章对28个HLA-Cw基因型已知的汉族个体样本,采用长距离PCR技术和高保真性的Pfu酶,扩增HLA-Cw基因全长序列4.5kb,进行分子克隆和单倍体测序。采用群体遗传学研究...
为探讨HLA-Cw(Human leukocyte antigen-Cw)基因全长序列分子遗传多态性,文章对28个HLA-Cw基因型已知的汉族个体样本,采用长距离PCR技术和高保真性的Pfu酶,扩增HLA-Cw基因全长序列4.5kb,进行分子克隆和单倍体测序。采用群体遗传学研究方法分析了HLA-Cw等位基因全长序列中各亚区的单核苷酸多态性。结果表明:在28个样本中共检测出22种等位基因,序列均已提交GenBank和国际IMGT/HLA数据库并获得了认可;其中Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201的全长序列为首次报道,尤其是Cw*0706内含子序列的获得,能够重新设计对该等位基因测序分型的引物,避免测序分型中可能对这一等位基因的漏检。将28个样本的56条单倍体序列用Clustal软件进行序列排比,输入到DnaSP4.0进行多态性分析,共发现244个SNPs,10处插入/缺失多态性。对HLA-Cw等位基因各亚区多态性的分析,发现第4内含子及以前并没有受到关注的第5外显子受到平衡选择的作用,在进化中受到了选择压力,预示着它们在免疫系统的进化过程中可能扮演着重要的角色。
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关键词
人类白细胞抗原
HLA-Cw基因
基因组全长
序
列
克隆和测序分析
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
蜜蜂残翼病病毒PCR检测及5′-UTR基因序列分析
被引量：
1
1
作者
郑言
宋战昀
杨倩
王向辉
隋佳辰
张健
王振国
李敏思
机构
吉林农业大学
吉林出入境检验检疫局
甘肃农业大学
出处
《动物医学进展》
北大核心
2015年第5期52-55,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31001065)
质检总局科技项目(2013IK033)
文摘
从吉林省某蜂场疑似蜜蜂残翼病病料中分离到一株蜜蜂残翼病病毒（DWV）,命名为DWVJL1,提取该分离株的总RNA,采用RT-PCR技术扩增其基因组的5′-UTR并测序。测序结果与GenBank公布道的DWV 5′-UTR序列同源性在95%~99%之间。将测序结果与GenBank上公布的9个相关序列进行系统遗传进化树分析,证实其与JX878304同源性最近,而与GU109335、KJ437447同源性最远。
关键词
蜜蜂残翼病病毒
5′-UTR
克隆和测序分析
Keywords
Deformed wing virus
5 r-UTR
cloning and sequence analysis
分类号
S895.9 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
汉族人群中22个HLA-Cw等位基因全长序列单核苷酸多态性分析
被引量：
3
2
作者
曾健强
徐筠娉
王大明
高素青
邹红岩
邓志辉
机构
深圳市血液中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期473-479,共7页
基金
深圳市科技计划项目(编号:200802116)
广东省科技计划项目(编号:2008B030301277)
广东省自然科学基金项目(编号:9451803501004124)资助
文摘
为探讨HLA-Cw(Human leukocyte antigen-Cw)基因全长序列分子遗传多态性,文章对28个HLA-Cw基因型已知的汉族个体样本,采用长距离PCR技术和高保真性的Pfu酶,扩增HLA-Cw基因全长序列4.5kb,进行分子克隆和单倍体测序。采用群体遗传学研究方法分析了HLA-Cw等位基因全长序列中各亚区的单核苷酸多态性。结果表明:在28个样本中共检测出22种等位基因,序列均已提交GenBank和国际IMGT/HLA数据库并获得了认可;其中Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201的全长序列为首次报道,尤其是Cw*0706内含子序列的获得,能够重新设计对该等位基因测序分型的引物,避免测序分型中可能对这一等位基因的漏检。将28个样本的56条单倍体序列用Clustal软件进行序列排比,输入到DnaSP4.0进行多态性分析,共发现244个SNPs,10处插入/缺失多态性。对HLA-Cw等位基因各亚区多态性的分析,发现第4内含子及以前并没有受到关注的第5外显子受到平衡选择的作用,在进化中受到了选择压力,预示着它们在免疫系统的进化过程中可能扮演着重要的角色。
关键词
人类白细胞抗原
HLA-Cw基因
基因组全长
序
列
克隆和测序分析
单核苷酸多态性
Keywords
human leukocyte antigen（HLA）
HLA-Cw gene
genomic full length
cloning and sequencing analysis
single nucleotide polymorphisms（SNPs）
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蜜蜂残翼病病毒PCR检测及5′-UTR基因序列分析
郑言
宋战昀
杨倩
王向辉
隋佳辰
张健
王振国
李敏思
《动物医学进展》
北大核心
2015
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
汉族人群中22个HLA-Cw等位基因全长序列单核苷酸多态性分析
曾健强
徐筠娉
王大明
高素青
邹红岩
邓志辉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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