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暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps1的克隆及表达分析
被引量：
7
1
作者
乌木提·巴合提别克
唐玉倩
+2 位作者
王淑婷
李亚伟
邹莉
《森林工程》
北大核心
2021年第4期33-39,46,共8页
倍半萜(Sesquiterpenes)在动植物及微生物体内广泛存在,且具有重要的生理调节功能。本研究从暴马桑黄转录组数据库中筛选出1个编码暴马桑黄萜类合酶的基因,命名为SbTps1,并对其进行克隆及表达分析,经测序该基因全长1281 bp,编码426个氨...
倍半萜(Sesquiterpenes)在动植物及微生物体内广泛存在,且具有重要的生理调节功能。本研究从暴马桑黄转录组数据库中筛选出1个编码暴马桑黄萜类合酶的基因,命名为SbTps1,并对其进行克隆及表达分析,经测序该基因全长1281 bp,编码426个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为48.17 ku。SDS-PAGE分析结果表明,在相对分子质量69.17 ku(包含21 ku标签蛋白)附近出现与预期大小一致的蛋白条带。系统发育进化树分析表明,暴马桑黄SbTps1蛋白和嗜蓝孢孔菌Tps蛋白同源性最高;荧光定量分析结果表明,SbTps1基因转录水平在不同发育阶段有差异性,并且在菌丝发酵培养第14天时SbTps1基因转录水平达到最高状态,该结果与鲍姆纤孔菌(Inonotus baumii)倍半萜合酶基因的转录水平变化趋势相似,因此可以推测SbTps1与倍半萜合成有关,初步鉴定该基因为倍半萜合酶基因,为后续暴马桑黄倍半萜合酶基因功能的研究奠定理论基础。
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关键词
暴马桑黄
倍半萜
倍半萜合酶基因
基因
克隆与序列分析
原核表达
荧光定量
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职称材料
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2克隆及其响应茉莉酸甲酯的表达分析
2
作者
乌木提·巴合提别克
李亚伟
+2 位作者
佟鑫宇
朱丽颖
邹莉
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期158-167,共10页
【目的】对参与暴马桑黄Sanghuangporus baumii倍半萜合成途径的关键基因SbTps2及其启动子进行克隆和生物信息学分析,并解析不同浓度MeJA对该基因表达的影响。【方法】利用PCR扩增技术克隆暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2 cDNA全长和启动...
【目的】对参与暴马桑黄Sanghuangporus baumii倍半萜合成途径的关键基因SbTps2及其启动子进行克隆和生物信息学分析,并解析不同浓度MeJA对该基因表达的影响。【方法】利用PCR扩增技术克隆暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2 cDNA全长和启动子序列;用SWISS-MODEL、SignalP-3.0和SOPMA等软件对SbTps2基因和SbTps2启动子序列进行生物信息学分析;以暴马桑黄为试验材料,利用实时荧光定量技术,对不同浓度MeJA诱导下SbTps2基因相对表达量进行了比较分析。【结果】经测序,SbTps2基因全长1227 bp,编码407个氨基酸,蛋白分子量为45.73 kDa。根据暴马桑黄基因组已知的序列,并结合SbTps2基因cDNA测序结果分析基因的外显子和内含子表明,SbTps2基因包含3个外显子(核苷酸0~527 bp、592~898 bp和953~1348 bp)和两个内含子(528~591 bp和899~952 bp);SbTps2蛋白无跨膜结构与信号肽,该蛋白为亲水性不稳定蛋白。系统发育进化树分析结果表明,SbTps2蛋白与已报道的倍半萜合酶基因聚为一支;SbTps2启动子(1220 bp)生物信息学分析结果表明,它含有典型的启动子元件,如CAAT-box、TATA-box和MeJA等其他反应元件。荧光定量分析结果表明,SbTps2基因转录水平在不同浓度MeJA诱导时有差异性,并且在MeJA诱导浓度为200μM时SbTps2基因转录水平达到最高状态。【结论】通过对SbTps2基因的克隆与表达分析,为后续暴马桑黄倍半萜合酶基因功能的研究奠定了基础。
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关键词
暴马桑黄
倍半萜合酶基因
基因
克隆
启动子克隆
MEJA
诱导表达
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职称材料
题名
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps1的克隆及表达分析
被引量：
7
1
作者
乌木提·巴合提别克
唐玉倩
王淑婷
李亚伟
邹莉
机构
东北林业大学林学院
出处
《森林工程》
北大核心
2021年第4期33-39,46,共8页
基金
中央财政林业科技推广项目(黑[2021]TG14号)。
文摘
倍半萜(Sesquiterpenes)在动植物及微生物体内广泛存在,且具有重要的生理调节功能。本研究从暴马桑黄转录组数据库中筛选出1个编码暴马桑黄萜类合酶的基因,命名为SbTps1,并对其进行克隆及表达分析,经测序该基因全长1281 bp,编码426个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为48.17 ku。SDS-PAGE分析结果表明,在相对分子质量69.17 ku(包含21 ku标签蛋白)附近出现与预期大小一致的蛋白条带。系统发育进化树分析表明,暴马桑黄SbTps1蛋白和嗜蓝孢孔菌Tps蛋白同源性最高;荧光定量分析结果表明,SbTps1基因转录水平在不同发育阶段有差异性,并且在菌丝发酵培养第14天时SbTps1基因转录水平达到最高状态,该结果与鲍姆纤孔菌(Inonotus baumii)倍半萜合酶基因的转录水平变化趋势相似,因此可以推测SbTps1与倍半萜合成有关,初步鉴定该基因为倍半萜合酶基因,为后续暴马桑黄倍半萜合酶基因功能的研究奠定理论基础。
关键词
暴马桑黄
倍半萜
倍半萜合酶基因
基因
克隆与序列分析
原核表达
荧光定量
Keywords
Sanghuangporus baumii
sesquiterpene
sesquiterpene synthase gene
gene cloning and sequence analysis
prokaryotic expression
quantitative real-time PCR
分类号
S567.3 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2克隆及其响应茉莉酸甲酯的表达分析
2
作者
乌木提·巴合提别克
李亚伟
佟鑫宇
朱丽颖
邹莉
机构
东北林业大学林学院
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期158-167,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32171792)。
文摘
【目的】对参与暴马桑黄Sanghuangporus baumii倍半萜合成途径的关键基因SbTps2及其启动子进行克隆和生物信息学分析,并解析不同浓度MeJA对该基因表达的影响。【方法】利用PCR扩增技术克隆暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2 cDNA全长和启动子序列;用SWISS-MODEL、SignalP-3.0和SOPMA等软件对SbTps2基因和SbTps2启动子序列进行生物信息学分析;以暴马桑黄为试验材料,利用实时荧光定量技术,对不同浓度MeJA诱导下SbTps2基因相对表达量进行了比较分析。【结果】经测序,SbTps2基因全长1227 bp,编码407个氨基酸,蛋白分子量为45.73 kDa。根据暴马桑黄基因组已知的序列,并结合SbTps2基因cDNA测序结果分析基因的外显子和内含子表明,SbTps2基因包含3个外显子(核苷酸0~527 bp、592~898 bp和953~1348 bp)和两个内含子(528~591 bp和899~952 bp);SbTps2蛋白无跨膜结构与信号肽,该蛋白为亲水性不稳定蛋白。系统发育进化树分析结果表明,SbTps2蛋白与已报道的倍半萜合酶基因聚为一支;SbTps2启动子(1220 bp)生物信息学分析结果表明,它含有典型的启动子元件,如CAAT-box、TATA-box和MeJA等其他反应元件。荧光定量分析结果表明,SbTps2基因转录水平在不同浓度MeJA诱导时有差异性,并且在MeJA诱导浓度为200μM时SbTps2基因转录水平达到最高状态。【结论】通过对SbTps2基因的克隆与表达分析,为后续暴马桑黄倍半萜合酶基因功能的研究奠定了基础。
关键词
暴马桑黄
倍半萜合酶基因
基因
克隆
启动子克隆
MEJA
诱导表达
Keywords
Sanghuangporus baumii
sesquiterpene synthase gene
gene cloning
promoter cloning
MeJA
induced expression
分类号
S718.81 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps1的克隆及表达分析
乌木提·巴合提别克
唐玉倩
王淑婷
李亚伟
邹莉
《森林工程》
北大核心
2021
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2克隆及其响应茉莉酸甲酯的表达分析
乌木提·巴合提别克
李亚伟
佟鑫宇
朱丽颖
邹莉
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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