脑梗塞的He-Ne激光血管内照射治疗的信息生物学分析

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作者 陈英华 池景泉 +1 位作者 刘承宜 李艳玲 《激光杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期76-78,共3页

脑梗塞患者血浆cAMP水平比对照组低 ,可以应用高剂量He-Ne激光血管内照射和药物联合作用提高cAMP的水平 ,达到改善血液流变学特性、提高细胞免疫功能和清热解毒的效果。本文应用刘承宜等人提出的低强度激光的生物信息假说总结了有关方... 脑梗塞患者血浆cAMP水平比对照组低 ,可以应用高剂量He-Ne激光血管内照射和药物联合作用提高cAMP的水平 ,达到改善血液流变学特性、提高细胞免疫功能和清热解毒的效果。本文应用刘承宜等人提出的低强度激光的生物信息假说总结了有关方面的基础与临床研究 ,阐述了低强度激光治疗脑梗塞的细胞机理 ,为临床应用提供了理论依据。 展开更多

关键词 脑梗塞 HE-NE激光 血管内照射 激光疗法 信息生物学

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马乳源性生物活性肽生物学信息及其抗肺癌作用靶点探索 被引量：4

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作者 古丽巴哈尔·卡吾力 马建宝 +2 位作者 卡丽比努尔·艾尔肯 徐志伟 高晓黎 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2024年第1期17-21,64,共6页

在前期研究基础上通过在线软件对已知氨基酸组成的马乳源性活性肽生物学信息和关键靶蛋白进行分析并进行分子对接,探索马乳源性活性肽抗肺癌作用靶点。结果表明马乳源的活性肽为不稳定、带正电荷的亲水性多肽,是没有跨膜区和信号肽,也... 在前期研究基础上通过在线软件对已知氨基酸组成的马乳源性活性肽生物学信息和关键靶蛋白进行分析并进行分子对接,探索马乳源性活性肽抗肺癌作用靶点。结果表明马乳源的活性肽为不稳定、带正电荷的亲水性多肽,是没有跨膜区和信号肽,也没有糖基化和磷酸化位点的细胞膜外多肽,二级结构主要以无规则卷曲为主,与肺癌相关的核心靶点即CTNNB1、FGFR2、FOXF1、KRAS、NKX2-1、TGFBR2具有很好的结合亲和力,为深入研究马乳源活性肽的生物学功能奠定了基础。 展开更多

关键词 抗氧化肽 生物学信息 分子对接 肺癌 NKX2-1 CTNNB1

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生物学信息数据库简介 被引量：6

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作者 廖志华 谌容 +1 位作者 陈敏 杨春贤 《生物学教学》 北大核心 2006年第1期61-62,共2页

生物学信息数据库是生物信息学教学和学习最重要的资料和数据来源。本文介绍以GenBank为代表的核酸数据库、以SWISS-PROT为代表的蛋白质数据库和以PBD为代表的蛋白质结构数据库。

关键词 生物学信息数据库 GENBANK SWISS-PROT PDB 数据来源 蛋白质

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陕西省猪流行性腹泻病毒S基因克隆与生物学信息分析

4

作者 朱小甫 吴旭锦 +2 位作者 郑红青 尹宝英 熊忙利 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第2期1-10,21,共11页

【目的】分析2014-2021年陕西省猪群猪流行性腹泻病毒(PEDV)主要毒力基因的生物学信息特征,揭示陕西省PEDV流行毒株基因变异情况,为防控猪流行性腹泻提供理论参考。【方法】参考PEDV全基因序列设计4对引物,采用RT-PCR方法分段扩增10株... 【目的】分析2014-2021年陕西省猪群猪流行性腹泻病毒(PEDV)主要毒力基因的生物学信息特征,揭示陕西省PEDV流行毒株基因变异情况,为防控猪流行性腹泻提供理论参考。【方法】参考PEDV全基因序列设计4对引物,采用RT-PCR方法分段扩增10株陕西省PEDV流行毒株S基因。利用生物信息分析软件,将获得的PEDV流行毒株S基因与GenBank中公开的57株PEDV序列进行比对分析。【结果】获得了10株陕西省PEDV流行毒株S基因全序列,长度为4149~4167 bp。将序列上传GenBank,获得相应的登录号为OL855978~OL855987。系统进化树分析显示,67个PEDV毒株分为G1a、G1b、G2a和G2b 4个亚群,10株PEDV流行毒株均属于G2b亚群,且遗传距离较近,与我国多个省区近年流行毒株亲缘关系较近。同源性分析结果表明,10株流行毒株之间S基因核苷酸序列同源性为95.4%~98.3%,氨基酸同源性为91.0%~98.1%;10株流行毒株与疫苗毒株S基因核苷酸序列同源性为91.7%~98.5%,氨基酸同源性为87.8%~98.5%。与G1a亚群的SD-M、CV777疫苗毒株核苷酸、氨基酸相比同源性均较低,而与G2b亚群的AJ1102、LNCT2、LW/L、XJ-DB2疫苗毒株核苷酸、氨基酸相比同源性均较高。与CV777 S蛋白相比较,共有88个氨基酸位点出现变异,变异位点占总位点数的6.36%(88/1383),其中在59~62位氨基酸有7株毒株出现了QGVN插入,在140位氨基酸有8株毒株出现N插入,在160~161位氨基酸有7株毒株出现DG缺失。S蛋白主要的中和表位、抗原表位和单抗识别表位出现多个变异位点。二级结构预测发现,与CV777相比较,多数流行毒株S蛋白的α螺旋、无规则卷曲占比稍有增加,β转角、延伸占比有所下降。S蛋白糖基化位点预测结果表明,与CV777株相比,流行毒株有多个引入或缺失的糖基化位点。【结论】陕西省PEDV流行毒株S蛋白抗原性发生了较大变化,推测疫苗免疫保护效果下降与此密切相关。 展开更多

关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 基因序列分析 生物学信息 陕西省

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副猪嗜血杆菌OmpP2基因的克隆及生物学信息分析

5

作者 陶政 曾文斌 +4 位作者 刘悦欣 左明开 幸文定 白帅州 王萍 《动物医学进展》 北大核心 2015年第5期19-24,共6页

为了研究副猪嗜血杆菌外膜蛋白OmpP2基因的结构特征及编码蛋白的功能,根据GenBank中HPS OmpP2基因的DNA序列设计引物,以HPS血清13型江西分离株的基因组为DNA模板,利用PCR扩增OmpP2基因,并将其克隆到pMD18-T载体,进行测序及生物信息学分... 为了研究副猪嗜血杆菌外膜蛋白OmpP2基因的结构特征及编码蛋白的功能,根据GenBank中HPS OmpP2基因的DNA序列设计引物,以HPS血清13型江西分离株的基因组为DNA模板,利用PCR扩增OmpP2基因,并将其克隆到pMD18-T载体,进行测序及生物信息学分析。结果表明,此序列编码364个氨基酸,与GenBank上登录的OmpP2序列核苷酸同源性为98.7%~100%,其中与湖北F641株的同源性最高,达到100%;蛋白质的分子理论值为39.14ku,理论等电点为9.14;第1位~第20位氨基酸残基组成信号肽,属于分泌型蛋白;所编码的蛋白属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主。研究获得了HPS OmpP2基因,为今后研究此基因的生物学功能奠定了基础。 展开更多

关键词 副猪嗜血杆菌 OmpP2基因 克隆 生物学信息分析

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生物学信息分析题的编制与运用

6

作者 李秋石 郭丽媛 《生物学教学》 北大核心 2016年第10期61-62,共2页

本文从情景认知理论出发，从资料的搜集与筛选、考点的挖掘与确立、资料的加工与分类、问题的设置与评价4个方面阐述了生物学信息分析题的编制过程。

关键词 生物学信息分析题 编制 运用

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整合生物学先验信息的全基因组选择方法及其在家畜育种中的应用进展 被引量：10

7

作者 袁泽湖 葛玲 +2 位作者 李发弟 乐祥鹏 孙伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3323-3334,共12页

相较于传统的育种方法,全基因组选择(genomic selection,GS)通过对拟留种的个体进行早期选择和增加选择的准确性进而加快育种的遗传进展。通过改进GS方法无法再缩短育种的世代间隔,因而如何提高GS的准确性以获得额外的遗传进展一直是GS... 相较于传统的育种方法,全基因组选择(genomic selection,GS)通过对拟留种的个体进行早期选择和增加选择的准确性进而加快育种的遗传进展。通过改进GS方法无法再缩短育种的世代间隔,因而如何提高GS的准确性以获得额外的遗传进展一直是GS研究的核心问题。当前,各种组学技术不断成熟,从公开的资料或前期的研究积累获取生物学先验信息已比较容易。因而,如何在GS模型中整合已知的先验信息进而提高GS的准确性以获得额外的遗传进展成为当前育种研究的热点问题。本文对生物学先验信息的类型以及整合先验信息的GS方法进行综述,探讨了这些方法在家畜育种中的应用和前景,以期为家畜育种中开展整合生物学先验信息的GS研究提供借鉴与参考。 展开更多

关键词 生物学先验信息 全基因组选择 家畜育种 多组学

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中西太平洋镰状真鲨的生物学信息初步研究 被引量：1

8

作者 丁朋朋 戴小杰 +2 位作者 高春霞 吴峰 王腾 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期33-40,共8页

镰状真鲨(Carcharhinus falciformis)是金枪鱼(Thunnus)延绳钓渔业中常见的兼捕鱼种之一,位于海洋食物链的顶端,对海洋物种多样性和生态系统的稳定性有重要意义,2017年10月1日作为濒危物种被正式列入濒危野生动植物种国际贸易公约附录... 镰状真鲨(Carcharhinus falciformis)是金枪鱼(Thunnus)延绳钓渔业中常见的兼捕鱼种之一,位于海洋食物链的顶端,对海洋物种多样性和生态系统的稳定性有重要意义,2017年10月1日作为濒危物种被正式列入濒危野生动植物种国际贸易公约附录Ⅱ中。作者根据中国金枪鱼渔业科学观察员在中西太平洋海域(7°S^9°N,149°E^150°W)采集的1 150尾镰状真鲨样本,对其叉长、体质量、繁殖和摄食等生物学信息进行初步研究与分析。结果表明:雌、雄镰状真鲨的优势叉长范围分别为80~180 cm和60~150 cm,雌性叉长均值显著大于雄性;雌、雄的叉长和体质量关系无显著性差异(ANCOVA,P>0.05),叉长和体质量的幂函数关系为:W_R=9×10–6×L_F^(2.9712);雌、雄性比符合1︰1比例;镰状真鲨的鳍脚长度与叉长呈显著正相关性,其线性关系为L_C=0.1492×L_F–6.5;镰状真鲨的怀仔数为4~15尾,平均怀仔数为8尾,子宫内雌雄胚胎长度范围为24~56 cm;摄食等级以空胃率为主,其次为1级,分别为51.77%、35.07%。 展开更多

关键词 镰状真鲨 生物学信息 中西太平洋

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溶藻弧菌胱硫醚-β-合成酶基因cbs的克隆、生物学信息分析及原核表达 被引量：2

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作者 陈树河 常云胜 +2 位作者 刘晖晖 周维 丁燏 《广东海洋大学学报》 CAS 2016年第3期20-28,共9页

提取溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的总DNA,克隆溶藻弧菌胱硫醚-β-合成酶基因cbs,对其进行生物信息学分析。结果表明,所克隆溶藻弧菌cbs基因的开放阅读框为1 095 bp,编码364个氨基酸。氨基酸序列比对发现,溶藻弧菌的CBS蛋白与其他弧... 提取溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的总DNA,克隆溶藻弧菌胱硫醚-β-合成酶基因cbs,对其进行生物信息学分析。结果表明,所克隆溶藻弧菌cbs基因的开放阅读框为1 095 bp,编码364个氨基酸。氨基酸序列比对发现,溶藻弧菌的CBS蛋白与其他弧菌的CBS相似性极高,与副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)CBS氨基酸序列相似性达98%;CBS蛋白质的二级结构为典型的"α+β"折叠模式,无跨膜结构及信号肽。构建cbs基因表达载体(p GEX-cbs)以表达重组蛋白,结果显示,cbs基因在大肠杆菌BL21中高效表达,可表达出分子质量约为66.4 ku的融合蛋白。对表达条件进行优化,发现在37℃、IPTG浓度0.6 mmol/L的条件下诱导5 h后,CBS蛋白的表达量较多,该蛋白主要以包涵体形式存在。 展开更多

关键词 溶藻弧菌 胱硫醚-Β-合成酶 基因克隆 生物学信息分析 原核表达

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“生物学科技信息”栏目在教学中的应用

10

作者 李朝红 《生物学教学》 北大核心 2004年第6期58-58,共1页

《生物学教学》的“生物学科技信息”栏目能很好地为教学服务，我在利用这些科技信息时收到了意外的效果，原因在于这些信息能很好地调动学生的学习积极性，激发学生的好奇心与探索欲。工作之余，根据教学需要我把这些信息分类给学生做... 《生物学教学》的“生物学科技信息”栏目能很好地为教学服务，我在利用这些科技信息时收到了意外的效果，原因在于这些信息能很好地调动学生的学习积极性，激发学生的好奇心与探索欲。工作之余，根据教学需要我把这些信息分类给学生做简略介绍： 展开更多

关键词 “生物学科技信息” 《生物学教学》 中学 生物 学生

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创设生物学信息结构图 强化长时记忆

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作者 袁毅红 《生物学教学》 北大核心 2017年第11期32-33,共2页

通过创设生物学信息结构图,包括环形脑图、问题导引式知识结构图等,将知识梳理成环状分支,直观、形象地展示知识的内在联系,构建知识框架模型,再现趣味化学习情景,可强化学生的长时记忆,提高生物学知识的学习效率。

关键词 生物学信息 信息结构图 环形脑图 导引式知识结构图 长时记忆

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白羽王鸽泛素(UB)基因的生物信息学分析 被引量：5

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作者 张青峰 高鹏飞 王钦德 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第26期12545-12546,12571,共3页

[目的]对白羽王鸽泛素基因的cDNA序列进行相关分析。[方法]运用相关生物信息学软件对该基因cDNA序列进行分析和预测,编码蛋白的理化性质及二级结构。[结果]生物信息学分析结果表明,白羽王鸽泛素基因编码区长度为1 037 bp,编码的多肽由7... [目的]对白羽王鸽泛素基因的cDNA序列进行相关分析。[方法]运用相关生物信息学软件对该基因cDNA序列进行分析和预测,编码蛋白的理化性质及二级结构。[结果]生物信息学分析结果表明,白羽王鸽泛素基因编码区长度为1 037 bp,编码的多肽由76个氨基酸残基组成,相对分子质量为34.368 kD,理论等电点为6.94,二级结构中α-螺旋占24.6%,无规则卷曲占43.3%,β延伸链占32.1%。[结论]通过白羽王鸽泛素基因相关生物学信息分析,为进一步研究泛素基因在白羽王鸽机体内的作用奠定了基础。 展开更多

关键词 白羽王鸽 泛素基因 生物学信息 分析

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柯萨奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息学分析 被引量：14

13

作者 刘洪波 阳广菲 +1 位作者 欧维琳 沈关心 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期536-541,共6页

目的：预测柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法：应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行... 目的：预测柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法：应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果：CVA6 VP1为一亲水性蛋白,其相对分子量为33.6 k D,等电点为7.92,含有24个可能的磷酸化位点,没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点;其二级结构中以无规则卷曲居多,有48.52%的氨基酸残基暴露于溶液界面;该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位,其中的155～165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论：成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位,为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。 展开更多

关键词 柯萨奇病毒A组6型 VP1蛋白 生物学信息 B细胞表位 理化性质

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多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析 被引量：1

14

作者 刘晓妹 蒲金基 +4 位作者 张欣 漆艳香 谢艺贤 张贺 郑服丛 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期168-172,共5页

采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA。生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基... 采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA。生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI)6.43。从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域。推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等。 展开更多

关键词 多主棒孢菌 蛋白激酶 克隆 生物学信息

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利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的研究

15

作者 张丽 董冰莹 +1 位作者 袁小丽 陈小斌 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期465-469,共5页

目的:利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的可能机制,为临床化疗提供有效的依据。方法:①通过GEO在线GEO2R工具从两组数据库(GSE15372和GSE33482)中,分别比较对顺铂耐药的A2780与对顺铂敏感的A2780中的基因表达差... 目的:利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的可能机制,为临床化疗提供有效的依据。方法:①通过GEO在线GEO2R工具从两组数据库(GSE15372和GSE33482)中,分别比较对顺铂耐药的A2780与对顺铂敏感的A2780中的基因表达差异,并筛选出高表达基因和低表达基因;使用维恩图确定两组数据库中耐药的高表达共同差异基因和低表达的共同差异基因。②利用GO分析和KEGG通路富集分析耐药基因的生物学功能。③利用蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络及Cytoscape软件筛选出A2780对顺铂耐药核心靶基因。④利用Kaplan-Meier Plotter工具对Hub基因进行总生存期分析。结果:①两组数据集的高表达共同耐药基因共37个,低表达共同耐药基因共2个。②GO分析结果显示:生物学过程(BP)分析结果表明,耐药基因主要参与着细胞间信号传导、趋化作用等;细胞组成(CC)分析表明,耐药基因主要位于细胞外区域、细胞间隙、细胞表面;分子功能(MF)分析表明,耐药基因参与着趋化因子相结合等作用。KEGG通路富集分析显示,耐药基因主要在细胞因子与细胞因子受体相互作用的信号通路、趋化因子信号通路上发挥作用。③PPI网络及Hub基因筛选结果显示:CCR5、POSTN、LOX、DACT1、RTN1、CCR1、CXCL6、PITX2、SNCA、AREG是核心耐药基因。④Hub基因中POSTN、LOX、DACT1、RTN1、PITX2的高表达与卵巢癌的不良预后有关(P<0.05)。结论:人卵巢癌细胞株A2780中顺铂耐药基因的异常表达,在卵巢癌化疗耐药中发挥着重要的作用,需要进一步的体外实验研究来证实其在临床化疗耐药中的作用。 展开更多

关键词 卵巢癌 细胞株A2780 顺铂 耐药基因 生物学信息技术

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杉木NAC基因家族基因的鉴定及生物信息学分析 被引量：6

16

作者 高文杰 刘娇 +1 位作者 马祥庆 帅鹏 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期108-118,共11页

【目的】为了完善杉木NAC基因家族的生信机制以及探索基因潜在功能,促进杉木基因改良育种与提高生产效率。【方法】本研究从搜集到的杉木转录组测序数据库中筛选鉴定得到杉木NAC基因,并对其进行生物信息学分析,具体包括蛋白的理化性质... 【目的】为了完善杉木NAC基因家族的生信机制以及探索基因潜在功能,促进杉木基因改良育种与提高生产效率。【方法】本研究从搜集到的杉木转录组测序数据库中筛选鉴定得到杉木NAC基因,并对其进行生物信息学分析,具体包括蛋白的理化性质、结构域预测、基因进化树分析和cln-miR164靶基因的预测分析等。【结果】杉木NAC转录因子家族含有45个成员,将其命名为Cl-NAC1~Cl-NAC45,预测所得CDS序列长度在156~3033 bp之间,由51~1010个氨基酸残基构成,结构域分析得出Cl-NACs蛋白除了长度不足的序列,所有的NAC蛋白都具有A、B、C、D、E 5个亚结构域,并且位置一致。保守域预测可得不同亚家族7个保守结构域的位置和长度有所不同。大部分Cl-NACs基因与挪威云杉NAC基因序列相似度明显大于拟南芥。通过进化树分析,不同Cl-NACs蛋白分布在10个亚家族中ATAF亚家族中的Cl-NAC45可能与逆境胁迫相关,NAM亚家族中的Cl-NAC1、Cl-NAC33、Cl-NAC34和Cl-NAC35基因都有可能具有调节杉木生长发育的作用;此外通过psRNATarget预测Cl-NAC33和Cl-NAC35为cln-miR164的靶基因,可能受其调控,参与非生物胁迫响应途径。【结论】杉木NAC基因鉴定获得45个,共可分为10个亚家族,不同的亚家族具有不同的理化性质、蛋白质结构、进化模式。对不同亚家族的基因功能进行初步推测,上述7个基因可能为杉木生长发育中的关键基因,需进一步研究验证其功能,为后续研究Cl-NACs基因对杉木生长发育、抗逆性功能奠定了基础。 展开更多

关键词 杉木 NAC基因家族 鉴定 生物学信息分析

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牛支原体deoC蛋白多抗的制备及生物信息学分析

17

作者 蔡伟 胡永浩 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第3期23-32,共10页

【目的】研究牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)武威株脱氧核糖磷酸醛缩酶(Deoxyribose-phosphate aldolase protein,DERA)基因序列特征及其分布位置,对免疫原性做初步探究。【方法】参照GenBank PG45菌株deoC基因(登录号:CP002188.1... 【目的】研究牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)武威株脱氧核糖磷酸醛缩酶(Deoxyribose-phosphate aldolase protein,DERA)基因序列特征及其分布位置,对免疫原性做初步探究。【方法】参照GenBank PG45菌株deoC基因(登录号:CP002188.1)设计引物PCR扩增deoC基因全长,构建原核表达载体pET-deoC。经感受态BL21转化IPTG诱导后纯化蛋白免疫新西兰兔制备多抗血清,应用Western blot与间接ELISA检测对其免疫原性和细胞内的分布进行初步研究。【结果】deoC基因全长为669 bp,重组蛋白为可溶性形式;Western blot与间接ELISA结果具有较高的免疫原性,在细胞质中分布多于细胞膜。与地方株同源性均为95.4%,亲水性蛋白,无信号肽和跨膜结构,存在磷酸化位点和糖基化位点,混合型二级结构。【结论】deoC具有良好的免疫原性,为研究牛支原体抗原提供了一定的理论基础依据。 展开更多

关键词 牛支原体 deoC基因 基因克隆 生物学信息分析

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熊猫EST序列的生物信息学分析

18

作者 张帅团 邵俊红 +7 位作者 白俊艳 樊红灯 陈梦柯 牛程炜 王龙威 李静云 王新乐 王亮 《当代畜禽养殖业》 2021年第5期29-31,共3页

熊猫是我国的国宝,是生物界的“活化石”。但是由于种种原因,熊猫的数量逐渐减少,其中繁殖率低是一个很重要的因素。所以通过各种方法提高熊猫的繁殖率就显得尤为重要,而熊猫基因组序列图谱的绘制不失为解决这一问题的好办法之一。本文... 熊猫是我国的国宝,是生物界的“活化石”。但是由于种种原因,熊猫的数量逐渐减少,其中繁殖率低是一个很重要的因素。所以通过各种方法提高熊猫的繁殖率就显得尤为重要,而熊猫基因组序列图谱的绘制不失为解决这一问题的好办法之一。本文运用生物信息学方法分析了公共数据库中熊猫EST序列,以期为熊猫基因组学研究提供科学依据。研究结果表明:从NCBIdbEST数据库中获得709条熊猫的EST,并对其预处理、拼接和聚类,获得46条Contig和527条singlets。利用在线软件SSRIT对636条EST进行SSR筛选分析,共获得150个SSR,出现频率26.17%,平均每1.79 kb就出现一个SSR。熊猫EST—SSR中二核苷酸SSR最多为124条,比例为82.67%;其次是三核苷酸,共有21条,比例为14%;四核苷酸共有5条,比例为3.33%;不包含五、六核苷酸。熊猫EST—SSR一共有31种重复基元,其中出现最多的是AT/AT和AG/CT。在筛选出的150条SSR中,重复数为4次的SSR有117个,重复数为5次的有19个,6次的有8个,7次的有1个,8次的有3个,9次的有2个。对部分含有SSR的EST序列进行了开放阅读框查找和理化性质分析,其中除6条未能找到开放阅读框外,其他的EST都能找到开放阅读框,最大的开放阅读框为561 bp,最小的为75 bp。 展开更多

关键词 熊猫 EST SSR 生物学信息

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长足大竹象取食胁迫下慈竹bZIP转录因子的鉴定及生物信息学分析

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作者 张鑫月 蒋筱蝶 +2 位作者 李沅秋 罗朝兵 唐昊 《现代园艺》 2020年第19期21-24,共4页

植物b ZIP转录因子在多个生命过程中起着重要的调控功能。基于长足大竹象取食胁迫下慈竹笋转录组测序结果及bZIP转录因子系统进化树和基因表达模式的分析,鉴定出10个慈竹bZIP转录因子,并推测慈竹中的b ZIP转录因子(comp8738_seq0、comp1... 植物b ZIP转录因子在多个生命过程中起着重要的调控功能。基于长足大竹象取食胁迫下慈竹笋转录组测序结果及bZIP转录因子系统进化树和基因表达模式的分析,鉴定出10个慈竹bZIP转录因子,并推测慈竹中的b ZIP转录因子(comp8738_seq0、comp10711_seq0、comp4125_seq0)的过量表达可能通过调控细胞内内质网的应激反应来应对虫害的取食胁迫。 展开更多

关键词 慈竹 长足大竹象 bzip转录因子 生物学信息分析

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昆虫性信息素研究应用进展 被引量：31

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作者 向玉勇 杨茂发 《湖北农业科学》 北大核心 2006年第2期250-256,共7页

较系统地概述了昆虫性信息素的概念及其生物学、化学及应用等方面的研究进展,并对其研究前景进行了展望。

关键词 性信息素 生物学 化学 应用 前景展望

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