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鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落组成和代谢功能的比较分析
被引量：
15
1
作者
程三红
汤海青
+3 位作者
欧昌荣
张梦思
昝春兰
李亚敏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第19期218-225,共8页
为研究鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能的差异,采用Illumina MiSeq测序技术和PICRUSt工具对鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能进行比较分析。结果表明:鲐鱼体表细菌群落的丰富度随冷藏时间的延长而增加,多样性却...
为研究鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能的差异,采用Illumina MiSeq测序技术和PICRUSt工具对鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能进行比较分析。结果表明:鲐鱼体表细菌群落的丰富度随冷藏时间的延长而增加,多样性却下降;大黄鱼体表细菌群落的丰富度和多样性变化均不显著。嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和希瓦氏菌属(Shewanella)分别是鲐鱼和大黄鱼体表的优势菌,且其相对丰度分别与鲐鱼(r=0.709,P<0.001)和大黄鱼(r=0.600,P=0.008)挥发性盐基氮含量显著正相关;因此,它们可能分别是鲐鱼和大黄鱼体表的特定腐败菌。鲐鱼体表细菌的蛋氨酸、酪氨酸和组氨酸等参与氨基酸代谢的相关基因的相对丰度显著高于同一冷藏时期的大黄鱼(P<0.05),这在一定程度上从细菌代谢水平解释了鲐鱼比大黄鱼更易腐败的原因。研究结果可为不同水产品采取针对性的贮藏保鲜策略提供参考。
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关键词
鲐鱼
大黄鱼
体表细菌
群落
代谢功能
ILLUMINA
MiSeq测序
PICRUSt
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职称材料
不同养殖场家蝇成虫体表携带细菌的分离与鉴定
被引量：
7
2
作者
陈丹
庄桂芬
+5 位作者
黄振东
薛志静
刘婧
李妍
张瑞玲
张忠
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期951-955,共5页
目的研究不同养殖场内家蝇成虫体表携带细菌数量和类别。方法采用网捕法对不同养殖场的家蝇进行采样,利用振荡洗脱法分离其体表细菌,对获得细菌的16SrDNA基因扩增后进行分离分子鉴定。结果不同养殖场内家蝇密度、体表携带细菌数量和种...
目的研究不同养殖场内家蝇成虫体表携带细菌数量和类别。方法采用网捕法对不同养殖场的家蝇进行采样,利用振荡洗脱法分离其体表细菌,对获得细菌的16SrDNA基因扩增后进行分离分子鉴定。结果不同养殖场内家蝇密度、体表携带细菌数量和种类有统计学差异,且家蝇密度与体表携带细菌数量和携带的细菌属数呈线性相关关系。在养殖场内分离到的家蝇体表携带细菌中,葡萄球菌属、克雷伯氏菌属、埃希菌属、沙雷氏菌属分布较广,同时分离的细菌中多为条件致病菌,存在疾病传播风险。结论养殖场家蝇密度反映出养殖场的整体管理水平;养殖场孳生的家蝇可机械性携带条件致病菌,存在将细菌传播给人类的风险,需要进一步加强对养殖场蝇类防控及携带细菌的监控。
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关键词
家蝇
养殖场
体表细菌
机会致病
细菌
蝇传疾病
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职称材料
大头金蝇3龄幼虫细菌多样性分析及其分离菌株分解纤维素的应用研究
3
作者
王一
谢桂林
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期52-61,共10页
Illumina高通量测序平台Novaseq,对大头金蝇(Chrysomya megacephala)3龄幼虫体表与体内细菌进行测序分析。大头金蝇3龄幼虫体表与体内贮存细菌样本中共注释396 OTUs,共注释到13门19纲49目82科137属119种细菌。体内贮存细菌的优势菌属为...
Illumina高通量测序平台Novaseq,对大头金蝇(Chrysomya megacephala)3龄幼虫体表与体内细菌进行测序分析。大头金蝇3龄幼虫体表与体内贮存细菌样本中共注释396 OTUs,共注释到13门19纲49目82科137属119种细菌。体内贮存细菌的优势菌属为克雷伯氏菌属(Klebsiella,57.87%),通过纤维素筛选培养基培养,纯化后得到单一菌落,经鉴定为密歇根克雷伯氏菌(Klebsiella michiganensis),制成菌液后进行室内、外模拟秸秆分解试验,室内秸秆平均分解效率为87.31%,室外模拟农田中的秸秆平均分解率为88.52%,进一步对其施用于农业废弃物搭建的人工模拟土壤中,模拟土壤肥力增加,在泥土:麦麸:锯末:豆饼的比例为10:2:2:1和10:2.5:2.5:1时种子发芽指数较高,种子平均发芽指数分别达到80.25%和78.45%。结果表明,大头金蝇3龄幼虫体表携带细菌与体内贮存菌的组成结构及多样性复杂,为其分解纤维素能力及土壤改良等提供理论依据。
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关键词
大头金蝇3龄幼虫
体表
携带
细菌
体内贮存菌
高通量测序
秸秆分解
种子发芽指数
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职称材料
题名
鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落组成和代谢功能的比较分析
被引量：
15
1
作者
程三红
汤海青
欧昌荣
张梦思
昝春兰
李亚敏
机构
宁波大学海洋学院
浙江医药高等专科学校食品学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第19期218-225,共8页
基金
国家自然科学基金面上项目(31271890)
国家自然科学基金青年科学基金项目(31501519)
+4 种基金
浙江省公益研究项目(GN18C200033)
"水产"浙江省重中之重学科开放基金项目(xkzsc1428)
宁波市市科学技术局农业重大择优委托项目(2012C10024)
宁波市科技局富民项目(2017C10029)
宁波大学科研基金项目(xkzsc1524)
文摘
为研究鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能的差异,采用Illumina MiSeq测序技术和PICRUSt工具对鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落和代谢功能进行比较分析。结果表明:鲐鱼体表细菌群落的丰富度随冷藏时间的延长而增加,多样性却下降;大黄鱼体表细菌群落的丰富度和多样性变化均不显著。嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和希瓦氏菌属(Shewanella)分别是鲐鱼和大黄鱼体表的优势菌,且其相对丰度分别与鲐鱼(r=0.709,P<0.001)和大黄鱼(r=0.600,P=0.008)挥发性盐基氮含量显著正相关;因此,它们可能分别是鲐鱼和大黄鱼体表的特定腐败菌。鲐鱼体表细菌的蛋氨酸、酪氨酸和组氨酸等参与氨基酸代谢的相关基因的相对丰度显著高于同一冷藏时期的大黄鱼(P<0.05),这在一定程度上从细菌代谢水平解释了鲐鱼比大黄鱼更易腐败的原因。研究结果可为不同水产品采取针对性的贮藏保鲜策略提供参考。
关键词
鲐鱼
大黄鱼
体表细菌
群落
代谢功能
ILLUMINA
MiSeq测序
PICRUSt
Keywords
mackerel
large yellow croaker
surface bacterial community
metabolic functions
Illumina MiSeq sequencing
PICRUSt
分类号
TS254.4 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
不同养殖场家蝇成虫体表携带细菌的分离与鉴定
被引量：
7
2
作者
陈丹
庄桂芬
黄振东
薛志静
刘婧
李妍
张瑞玲
张忠
机构
泰山医学院新发传染病溯源及防控协同创新中心
泰山医学院基础医学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期951-955,共5页
基金
国家自然科学基金(Nos.81401693
81572028
+1 种基金
81271874)
山东省科技发展计划项目(No.2014GSF121007)联合资助~~
文摘
目的研究不同养殖场内家蝇成虫体表携带细菌数量和类别。方法采用网捕法对不同养殖场的家蝇进行采样,利用振荡洗脱法分离其体表细菌,对获得细菌的16SrDNA基因扩增后进行分离分子鉴定。结果不同养殖场内家蝇密度、体表携带细菌数量和种类有统计学差异,且家蝇密度与体表携带细菌数量和携带的细菌属数呈线性相关关系。在养殖场内分离到的家蝇体表携带细菌中,葡萄球菌属、克雷伯氏菌属、埃希菌属、沙雷氏菌属分布较广,同时分离的细菌中多为条件致病菌,存在疾病传播风险。结论养殖场家蝇密度反映出养殖场的整体管理水平;养殖场孳生的家蝇可机械性携带条件致病菌,存在将细菌传播给人类的风险,需要进一步加强对养殖场蝇类防控及携带细菌的监控。
关键词
家蝇
养殖场
体表细菌
机会致病
细菌
蝇传疾病
Keywords
Musca domestica
livestock farms
bacteria on the body surface of house flies
opportunistic bacteria
fly borne diseases
分类号
R384 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
大头金蝇3龄幼虫细菌多样性分析及其分离菌株分解纤维素的应用研究
3
作者
王一
谢桂林
机构
东北农业大学生命科学学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期52-61,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1500801)
黑龙江省博士后资助基金项目(LBHQ16028)。
文摘
Illumina高通量测序平台Novaseq,对大头金蝇(Chrysomya megacephala)3龄幼虫体表与体内细菌进行测序分析。大头金蝇3龄幼虫体表与体内贮存细菌样本中共注释396 OTUs,共注释到13门19纲49目82科137属119种细菌。体内贮存细菌的优势菌属为克雷伯氏菌属(Klebsiella,57.87%),通过纤维素筛选培养基培养,纯化后得到单一菌落,经鉴定为密歇根克雷伯氏菌(Klebsiella michiganensis),制成菌液后进行室内、外模拟秸秆分解试验,室内秸秆平均分解效率为87.31%,室外模拟农田中的秸秆平均分解率为88.52%,进一步对其施用于农业废弃物搭建的人工模拟土壤中,模拟土壤肥力增加,在泥土:麦麸:锯末:豆饼的比例为10:2:2:1和10:2.5:2.5:1时种子发芽指数较高,种子平均发芽指数分别达到80.25%和78.45%。结果表明,大头金蝇3龄幼虫体表携带细菌与体内贮存菌的组成结构及多样性复杂,为其分解纤维素能力及土壤改良等提供理论依据。
关键词
大头金蝇3龄幼虫
体表
携带
细菌
体内贮存菌
高通量测序
秸秆分解
种子发芽指数
Keywords
3rd instar larvae of Chrysomya megacephala
the body surface carring bacteria
storage bacteria in body
high-throughput sequencing
straw decomposition
seed germination index
分类号
Q5393 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲐鱼和大黄鱼冷藏期间体表细菌群落组成和代谢功能的比较分析
程三红
汤海青
欧昌荣
张梦思
昝春兰
李亚敏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
15
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
不同养殖场家蝇成虫体表携带细菌的分离与鉴定
陈丹
庄桂芬
黄振东
薛志静
刘婧
李妍
张瑞玲
张忠
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
大头金蝇3龄幼虫细菌多样性分析及其分离菌株分解纤维素的应用研究
王一
谢桂林
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
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