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鲫鱼低氧相关基因差减cDNA文库的构建与分析
被引量:
4
1
作者
钟雪萍
王丹
+1 位作者
张义兵
桂建芳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期113-118,共6页
鲫鱼对低氧具有极强的耐受性。在低氧状态下鲫鱼鳃瓣表面积增加,无氧代谢增强,能量消耗降低。但是人们对鲫鱼产生这些低氧反应的分子机理还缺乏了解。本研究以1%低氧处理24h的鲫鱼囊胚细胞(CAB)作为检测子(Tester),常氧条件下培养的CAB...
鲫鱼对低氧具有极强的耐受性。在低氧状态下鲫鱼鳃瓣表面积增加,无氧代谢增强,能量消耗降低。但是人们对鲫鱼产生这些低氧反应的分子机理还缺乏了解。本研究以1%低氧处理24h的鲫鱼囊胚细胞(CAB)作为检测子(Tester),常氧条件下培养的CAB细胞作为驱赶子(Driver),分别提取总RNA,利用SMART cDNA技术合成双链cDNA,经差减杂交和抑制性PCR扩增获得差减PCR产物。然后将差减PCR产物连接到pGEM-T载体上,构建差减cDNA文库。以管家基因β-actin作为指标检测差减效率,发现该文库差减效率达28倍。随机挑选阳性克隆进行PCR检测,显示差减片段在0.1—2kb之间。挑取含有插入片段的1300个克隆进行测序,通过生物信息学分析获得267个基因序列(e≤0.001;Identity>40%)。该差减cDNA文库的成功构建对克隆鱼类耐低氧相关基因和深入认识鱼类耐受低氧的分子机制有非常重要的意义。
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关键词
鲫鱼囊胚细胞
低氧相关基因
抑制性差减杂交
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职称材料
蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因的比较
被引量:
4
2
作者
牛廷献
王红义
+4 位作者
郭晓宇
陆璐
申健
肖攀
冯小明
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017年第4期9-13,共5页
目的研究蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因表达量的差异。方法采用Taq Man探针实时定量PCR(real-time quantitative PCR)技术,检测蕨麻猪与巴马小型猪心、肝、脾、肺、肾低氧反应基因表达量的变化。结果蕨麻猪的肾脏、脾脏指...
目的研究蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因表达量的差异。方法采用Taq Man探针实时定量PCR(real-time quantitative PCR)技术,检测蕨麻猪与巴马小型猪心、肝、脾、肺、肾低氧反应基因表达量的变化。结果蕨麻猪的肾脏、脾脏指数低于巴马小型猪,蕨麻猪的心脏、肺脏指数高于巴马小型猪。蕨麻猪血管内皮细胞生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)与低氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor 1,HIF-1α)在肺、肾中的表达量明显比普通猪高(P<0.05或P<0.01);促红细胞生成素(erythropoietin,EPO)只在肺中比巴马小型猪高(P<0.05)。结论不同物种脏器指数可能是物种对物质环境、能量环境、外界病原体、能量代谢需求等综合因素进化适应的结果。蕨麻猪低氧相关基因明显比巴马小型猪高,揭示在基因方面蕨麻猪具有较强的高原适应性。
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关键词
蕨麻猪
巴马小型猪
脏器指数
低氧相关基因
比较
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职称材料
急性低氧胁迫对翘嘴鳜抗氧化酶、呼吸相关酶活性及相关基因表达的影响
被引量:
9
3
作者
徐畅
丁炜东
+4 位作者
曹哲明
邴旭文
张晨光
谷心池
刘雨
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期686-694,共9页
【目的】从酶活性和基因表达水平分析低氧胁迫对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)应激的生理响应过程,为其健康养殖及耐低氧品种选育提供科学依据。【方法】选取体表无损伤、体重450±20 g/尾、体长24.0±0.7 cm的健康翘嘴鳜进行低氧...
【目的】从酶活性和基因表达水平分析低氧胁迫对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)应激的生理响应过程,为其健康养殖及耐低氧品种选育提供科学依据。【方法】选取体表无损伤、体重450±20 g/尾、体长24.0±0.7 cm的健康翘嘴鳜进行低氧(溶解氧含量2.8±0.2 mg/L)胁迫,设常氧(溶解氧含量6.5±0.2 mg/L)为对照组,分别在低氧胁迫0、6、12、24、48和96 h时采集翘嘴鳜的肝脏和鳃组织样品,进行抗氧化酶、呼吸相关酶活性及低氧诱导反应相关基因表达测定。【结果】在整个急性低氧胁迫过程中,翘嘴鳜肝脏过氧化氢酶(CAT)活性、还原型谷胱甘肽(GSH)含量及谷丙转氨酶(GPT)活性均呈先升高后降低的变化趋势,GSH含量从低氧胁迫6 h起显著高于对照组(P<0.05,下同),CAT和GPT活性从低氧胁迫12 h起显著高于对照组。鳃组织乳酸脱氢酶(LDH)活性先升高后降低再升高,在胁迫6 h时达最高值(849.67 U/mg),显著高于对照组;超微量总ATP酶(ATPase)活性呈降低—升高—降低的变化趋势,且显著低于对照组。低氧胁迫组翘嘴鳜肝脏HIF-1α基因的相对表达量在胁迫48 h后显著上调;EPO基因的相对表达量先升高后降低,在胁迫12 h时显著上调;HSP90α基因的相对表达量在胁迫6和48 h分别出现峰值,其他时间点与对照组持平。【结论】急性低氧胁迫对翘嘴鳜肝脏抗氧化酶、鳃组织呼吸相关酶及低氧诱导反应相关基因表达均产生显著影响。虽然翘嘴鳜能通过自我调节抗氧化酶和呼吸相关酶活性及上调低氧诱导反应相关基因表达,促使机体适应低氧环境,但溶解氧降至2.8 mg/L以下即对其产生不利影响,因此在实际养殖过程中须密切关注养殖水体溶解氧变化。
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关键词
翘嘴鳜
低氧
胁迫
抗氧化酶
呼吸
相关
酶
低氧
诱导反应
相关
基因
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职称材料
植物对水淹胁迫响应的研究进展
被引量:
16
4
作者
宋鹏华
曾其伟
+3 位作者
商敬哲
马赑
向仲怀
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期160-165,共6页
水淹胁迫指植物处于周期或长期厌氧或缺氧环境下,其有氧呼吸和维持生命活动所需能量产生受到限制,是植物常遭受的非生物胁迫之一。为适应水淹胁迫环境,植物体一方面感知能量、胞质pH、内源激素等变化而形成一系列形态、生理适应性特征;...
水淹胁迫指植物处于周期或长期厌氧或缺氧环境下,其有氧呼吸和维持生命活动所需能量产生受到限制,是植物常遭受的非生物胁迫之一。为适应水淹胁迫环境,植物体一方面感知能量、胞质pH、内源激素等变化而形成一系列形态、生理适应性特征;另一方面,通过体内产生的乙烯响应因子(ethylene response factors,ERFs)感应低氧信号并启动低氧相关基因的表达以调节抵抗能力。本文就近年来对植物体响应水淹胁迫的适应性特征及感应信号通路的研究进展进行简要阐述,旨在为研究桑树耐涝机制提供借鉴。
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关键词
水淹胁迫
植物
形态
生理
乙烯响应因子
低氧相关基因
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职称材料
题名
鲫鱼低氧相关基因差减cDNA文库的构建与分析
被引量:
4
1
作者
钟雪萍
王丹
张义兵
桂建芳
机构
中国科学院水生生物研究所
华中师范大学生命科学学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期113-118,共6页
基金
科技部973项目(2004CB117403)
国家自然科学基金(300500375)资助
文摘
鲫鱼对低氧具有极强的耐受性。在低氧状态下鲫鱼鳃瓣表面积增加,无氧代谢增强,能量消耗降低。但是人们对鲫鱼产生这些低氧反应的分子机理还缺乏了解。本研究以1%低氧处理24h的鲫鱼囊胚细胞(CAB)作为检测子(Tester),常氧条件下培养的CAB细胞作为驱赶子(Driver),分别提取总RNA,利用SMART cDNA技术合成双链cDNA,经差减杂交和抑制性PCR扩增获得差减PCR产物。然后将差减PCR产物连接到pGEM-T载体上,构建差减cDNA文库。以管家基因β-actin作为指标检测差减效率,发现该文库差减效率达28倍。随机挑选阳性克隆进行PCR检测,显示差减片段在0.1—2kb之间。挑取含有插入片段的1300个克隆进行测序,通过生物信息学分析获得267个基因序列(e≤0.001;Identity>40%)。该差减cDNA文库的成功构建对克隆鱼类耐低氧相关基因和深入认识鱼类耐受低氧的分子机制有非常重要的意义。
关键词
鲫鱼囊胚细胞
低氧相关基因
抑制性差减杂交
Keywords
Carassius auratus blastulae embryonic cells
Hypoxia-related gene
Suppression subtrative hybridization
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因的比较
被引量:
4
2
作者
牛廷献
王红义
郭晓宇
陆璐
申健
肖攀
冯小明
机构
兰州军区兰州总医院动物实验科
出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017年第4期9-13,共5页
基金
甘肃省自然科学基金项目(1308RJZA178)
文摘
目的研究蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因表达量的差异。方法采用Taq Man探针实时定量PCR(real-time quantitative PCR)技术,检测蕨麻猪与巴马小型猪心、肝、脾、肺、肾低氧反应基因表达量的变化。结果蕨麻猪的肾脏、脾脏指数低于巴马小型猪,蕨麻猪的心脏、肺脏指数高于巴马小型猪。蕨麻猪血管内皮细胞生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)与低氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor 1,HIF-1α)在肺、肾中的表达量明显比普通猪高(P<0.05或P<0.01);促红细胞生成素(erythropoietin,EPO)只在肺中比巴马小型猪高(P<0.05)。结论不同物种脏器指数可能是物种对物质环境、能量环境、外界病原体、能量代谢需求等综合因素进化适应的结果。蕨麻猪低氧相关基因明显比巴马小型猪高,揭示在基因方面蕨麻猪具有较强的高原适应性。
关键词
蕨麻猪
巴马小型猪
脏器指数
低氧相关基因
比较
Keywords
Juema minipig
Bama minipig
Organ coefficient
Hypoxia-related gene
High plateau
分类号
R-33 [医药卫生]
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职称材料
题名
急性低氧胁迫对翘嘴鳜抗氧化酶、呼吸相关酶活性及相关基因表达的影响
被引量:
9
3
作者
徐畅
丁炜东
曹哲明
邴旭文
张晨光
谷心池
刘雨
机构
南京农业大学无锡渔业学院
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
江西省宜春市农业科学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期686-694,共9页
基金
江苏省农业自主创新基金项目[CX(17)3005]
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心基本科研业务费专项(2019JBFZ01)。
文摘
【目的】从酶活性和基因表达水平分析低氧胁迫对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)应激的生理响应过程,为其健康养殖及耐低氧品种选育提供科学依据。【方法】选取体表无损伤、体重450±20 g/尾、体长24.0±0.7 cm的健康翘嘴鳜进行低氧(溶解氧含量2.8±0.2 mg/L)胁迫,设常氧(溶解氧含量6.5±0.2 mg/L)为对照组,分别在低氧胁迫0、6、12、24、48和96 h时采集翘嘴鳜的肝脏和鳃组织样品,进行抗氧化酶、呼吸相关酶活性及低氧诱导反应相关基因表达测定。【结果】在整个急性低氧胁迫过程中,翘嘴鳜肝脏过氧化氢酶(CAT)活性、还原型谷胱甘肽(GSH)含量及谷丙转氨酶(GPT)活性均呈先升高后降低的变化趋势,GSH含量从低氧胁迫6 h起显著高于对照组(P<0.05,下同),CAT和GPT活性从低氧胁迫12 h起显著高于对照组。鳃组织乳酸脱氢酶(LDH)活性先升高后降低再升高,在胁迫6 h时达最高值(849.67 U/mg),显著高于对照组;超微量总ATP酶(ATPase)活性呈降低—升高—降低的变化趋势,且显著低于对照组。低氧胁迫组翘嘴鳜肝脏HIF-1α基因的相对表达量在胁迫48 h后显著上调;EPO基因的相对表达量先升高后降低,在胁迫12 h时显著上调;HSP90α基因的相对表达量在胁迫6和48 h分别出现峰值,其他时间点与对照组持平。【结论】急性低氧胁迫对翘嘴鳜肝脏抗氧化酶、鳃组织呼吸相关酶及低氧诱导反应相关基因表达均产生显著影响。虽然翘嘴鳜能通过自我调节抗氧化酶和呼吸相关酶活性及上调低氧诱导反应相关基因表达,促使机体适应低氧环境,但溶解氧降至2.8 mg/L以下即对其产生不利影响,因此在实际养殖过程中须密切关注养殖水体溶解氧变化。
关键词
翘嘴鳜
低氧
胁迫
抗氧化酶
呼吸
相关
酶
低氧
诱导反应
相关
基因
Keywords
Siniperca chuatsi
hypoxia stress
antioxidant enzymes
respiratory related enzymes
hypoxia-induced response genes
分类号
S965.127 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
植物对水淹胁迫响应的研究进展
被引量:
16
4
作者
宋鹏华
曾其伟
商敬哲
马赑
向仲怀
何宁佳
机构
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期160-165,共6页
基金
重庆市杰出青年基金项目(No.cstc2011jjjq0010)
文摘
水淹胁迫指植物处于周期或长期厌氧或缺氧环境下,其有氧呼吸和维持生命活动所需能量产生受到限制,是植物常遭受的非生物胁迫之一。为适应水淹胁迫环境,植物体一方面感知能量、胞质pH、内源激素等变化而形成一系列形态、生理适应性特征;另一方面,通过体内产生的乙烯响应因子(ethylene response factors,ERFs)感应低氧信号并启动低氧相关基因的表达以调节抵抗能力。本文就近年来对植物体响应水淹胁迫的适应性特征及感应信号通路的研究进展进行简要阐述,旨在为研究桑树耐涝机制提供借鉴。
关键词
水淹胁迫
植物
形态
生理
乙烯响应因子
低氧相关基因
Keywords
Waterlogging stress
Plant
Morphology
Physiology
Ethylene response factor
Hypoxia-related gene
分类号
Q945.78 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲫鱼低氧相关基因差减cDNA文库的构建与分析
钟雪萍
王丹
张义兵
桂建芳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
4
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职称材料
2
蕨麻猪与巴马小型猪脏器指数及低氧相关基因的比较
牛廷献
王红义
郭晓宇
陆璐
申健
肖攀
冯小明
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017
4
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职称材料
3
急性低氧胁迫对翘嘴鳜抗氧化酶、呼吸相关酶活性及相关基因表达的影响
徐畅
丁炜东
曹哲明
邴旭文
张晨光
谷心池
刘雨
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
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职称材料
4
植物对水淹胁迫响应的研究进展
宋鹏华
曾其伟
商敬哲
马赑
向仲怀
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
16
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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