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基于Illumina MiSeq测序和传统可培养方法的洪湖鲊广椒乳酸菌多样性研究
被引量：
10
1
作者
李娜
崔梦君
+3 位作者
马佳佳
雷炎
郭壮
张振东
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期110-115,122,共7页
为明确洪湖鲊广椒的乳酸菌多样性,从湖北省荆州市洪湖市采集了7份鲊广椒样品,分别采用传统可培养方法与Illumina MiSeq高通量技术对其进行多样性评价。高通量测序结果表明,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Ba...
为明确洪湖鲊广椒的乳酸菌多样性,从湖北省荆州市洪湖市采集了7份鲊广椒样品,分别采用传统可培养方法与Illumina MiSeq高通量技术对其进行多样性评价。高通量测序结果表明,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)是鲊广椒样品中的优势细菌门,平均相对含量分别为77.78%、18.09%、1.74%和1.51%;优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus),海洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus),盐单胞菌属(Halomonas),平均相对含量分别为67.97%,3.88%,3.47%。在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,有12个平均相对含量>1.0%的OTU,其中9个隶属于乳杆菌属。由此可见,该地区鲊广椒中主要含乳酸杆菌属。基于传统可培养分离方法表明,从鲊广椒样品中分离到的29株乳酸菌被鉴定为3个属和8个种,其中植物乳杆菌(L.plantarum)和福莱乳杆菌(L.futsaii)分别有10株与8株,是优势菌。与其他地区不一样的是,洪湖鲊广椒中除了植物乳杆菌,还含有较多的福莱乳杆菌。
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关键词
鲊广椒
高通量测序
传统可培养方法
乳酸菌
多样性
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职称材料
题名
基于Illumina MiSeq测序和传统可培养方法的洪湖鲊广椒乳酸菌多样性研究
被引量：
10
1
作者
李娜
崔梦君
马佳佳
雷炎
郭壮
张振东
机构
湖北文理学院食品科学技术学院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期110-115,122,共7页
基金
湖北文理学院教师科研能力培育基金项目(2017kypy051)。
文摘
为明确洪湖鲊广椒的乳酸菌多样性,从湖北省荆州市洪湖市采集了7份鲊广椒样品,分别采用传统可培养方法与Illumina MiSeq高通量技术对其进行多样性评价。高通量测序结果表明,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)是鲊广椒样品中的优势细菌门,平均相对含量分别为77.78%、18.09%、1.74%和1.51%;优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus),海洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus),盐单胞菌属(Halomonas),平均相对含量分别为67.97%,3.88%,3.47%。在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,有12个平均相对含量>1.0%的OTU,其中9个隶属于乳杆菌属。由此可见,该地区鲊广椒中主要含乳酸杆菌属。基于传统可培养分离方法表明,从鲊广椒样品中分离到的29株乳酸菌被鉴定为3个属和8个种,其中植物乳杆菌(L.plantarum)和福莱乳杆菌(L.futsaii)分别有10株与8株,是优势菌。与其他地区不一样的是,洪湖鲊广椒中除了植物乳杆菌,还含有较多的福莱乳杆菌。
关键词
鲊广椒
高通量测序
传统可培养方法
乳酸菌
多样性
Keywords
Zha-chili
high-throughput sequencing
traditional culture method
lactic acid bacteria
diversity
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于Illumina MiSeq测序和传统可培养方法的洪湖鲊广椒乳酸菌多样性研究
李娜
崔梦君
马佳佳
雷炎
郭壮
张振东
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021
10
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