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基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
1
作者
姜雪
于巍
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第2期20-23,共4页
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和...
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。
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关键词
蛋白质
βαβ模体
离散增量
优化
的参量
优化位点氨基酸
识别精度
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职称材料
题名
基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
1
作者
姜雪
于巍
机构
沈阳工业大学辽阳校区基础部
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第2期20-23,共4页
基金
辽宁省教育厅教学改革立项(编号:2012411)
文摘
选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。
关键词
蛋白质
βαβ模体
离散增量
优化
的参量
优化位点氨基酸
识别精度
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析
姜雪
于巍
《江苏农业科学》
北大核心
2015
0
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