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杜仲基因密码子使用模式分析
被引量：
11
1
作者
王艳
赵懿琛
赵德刚
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期274-282,共9页
为了解杜仲基因密码子使用模式,该文以杜仲基因组密码子为研究对象,运用CodonW软件对杜仲的320个蛋白编码基因进行同义密码子相对使用频率(RSCU)分析、ENC-GC3s关联分析编码基因的密码子ENC值、PR2-plot偏倚分析编码基因的密码子碱基使...
为了解杜仲基因密码子使用模式,该文以杜仲基因组密码子为研究对象,运用CodonW软件对杜仲的320个蛋白编码基因进行同义密码子相对使用频率(RSCU)分析、ENC-GC3s关联分析编码基因的密码子ENC值、PR2-plot偏倚分析编码基因的密码子碱基使用频率,并运用CUSP软件与Codon Usage Database软件对杜仲基因密码子的GC含量、使用频率与代表性物种烟草、拟南芥、大肠杆菌和酿酒酵母的密码子GC含量和使用频率进行比较。结果表明:杜仲基因密码子的RSCU>1的密码子有30个,其中18个以G/C结尾、12个以A/U结尾,说明杜仲基因密码子偏好以G/C结尾,且偏好性较强;有效密码子数(ENC)范围为30~60,该范围内的密码子距离标准曲线较远,其ENC值小,偏好性较强;PR2-plot偏倚分析碱基使用频率显示,G>C、U>A;杜仲与代表性物种的GC含量分析显示,杜仲的GC12、GC3以及平均GC含量均高于代表性物种;杜仲与代表性物种的密码子使用频率分析显示,杜仲与烟草、酿酒酵母的密码子偏好较为接近,杜仲与拟南芥、大肠杆菌的密码子偏好差距较大。杜仲是我国特有的珍贵中药材,对其进行密码子使用模式分析,并研究其密码子偏好规律,为杜仲植物基因工程中外源基因的改良及表达提供了理论基础。
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关键词
杜仲基因
密码子
偏好性
使用模式
代表
性
物种
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职称材料
浙江大盘山国家级自然保护区乡土色叶植物资源调查与开发利用研究
被引量：
2
2
作者
周钰鸿
刘亚
+2 位作者
王盼
陈江芳
陈子林
《林业调查规划》
2018年第5期109-113,共5页
通过野外调查与民间走访、查阅相关参考文献资料,分析总结大盘山国家级自然保护区色叶植物资源特点和开发利用现状。结果表明,区内植物种类较丰富,有色叶植物251种(含变种),隶属60科131属;从形态分类看,以乔木居多,有99种,占39.44%;从...
通过野外调查与民间走访、查阅相关参考文献资料,分析总结大盘山国家级自然保护区色叶植物资源特点和开发利用现状。结果表明,区内植物种类较丰富,有色叶植物251种(含变种),隶属60科131属;从形态分类看,以乔木居多,有99种,占39.44%;从属的地理分布类型看,以温带分布型最为丰富,其次是泛热带分布型;根据叶片变色阶段和叶色分布特征将区内色叶植物分为常色叶类、斑叶类、双色叶类、新叶有色类与秋色叶类等5种类型,其中以秋色叶类最丰富,有166种,占区内色叶植物总种数的66.14%;区内储量丰富的40种色叶植物中有31种处于少量应用或未利用状态。提出注重资源保护和开发利用之间的关系、开展资源利用价值评估、发掘利用潜力等开发利用建议。
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关键词
乡土色叶植物
资源调查
地理分布类型
代表物种
开发利用
浙江大盘国家级山自然保护区
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职称材料
题名
杜仲基因密码子使用模式分析
被引量：
11
1
作者
王艳
赵懿琛
赵德刚
机构
贵州大学生命科学学院茶学院
贵州省农业科学研究院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期274-282,共9页
基金
国家自然科学基金(31660076)
贵州省教育厅青年人才成长项目(黔教科KY[2016]126)
贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2017]5788,[2017]5788-72号)。
文摘
为了解杜仲基因密码子使用模式,该文以杜仲基因组密码子为研究对象,运用CodonW软件对杜仲的320个蛋白编码基因进行同义密码子相对使用频率(RSCU)分析、ENC-GC3s关联分析编码基因的密码子ENC值、PR2-plot偏倚分析编码基因的密码子碱基使用频率,并运用CUSP软件与Codon Usage Database软件对杜仲基因密码子的GC含量、使用频率与代表性物种烟草、拟南芥、大肠杆菌和酿酒酵母的密码子GC含量和使用频率进行比较。结果表明:杜仲基因密码子的RSCU>1的密码子有30个,其中18个以G/C结尾、12个以A/U结尾,说明杜仲基因密码子偏好以G/C结尾,且偏好性较强;有效密码子数(ENC)范围为30~60,该范围内的密码子距离标准曲线较远,其ENC值小,偏好性较强;PR2-plot偏倚分析碱基使用频率显示,G>C、U>A;杜仲与代表性物种的GC含量分析显示,杜仲的GC12、GC3以及平均GC含量均高于代表性物种;杜仲与代表性物种的密码子使用频率分析显示,杜仲与烟草、酿酒酵母的密码子偏好较为接近,杜仲与拟南芥、大肠杆菌的密码子偏好差距较大。杜仲是我国特有的珍贵中药材,对其进行密码子使用模式分析,并研究其密码子偏好规律,为杜仲植物基因工程中外源基因的改良及表达提供了理论基础。
关键词
杜仲基因
密码子
偏好性
使用模式
代表
性
物种
Keywords
Eucommia ulmoides gene
codon
preference
usage pattern
representative species
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
浙江大盘山国家级自然保护区乡土色叶植物资源调查与开发利用研究
被引量：
2
2
作者
周钰鸿
刘亚
王盼
陈江芳
陈子林
机构
浙江大盘山国家级自然保护区管理局
磐安县风景旅游管理局
磐安县林业局
出处
《林业调查规划》
2018年第5期109-113,共5页
文摘
通过野外调查与民间走访、查阅相关参考文献资料,分析总结大盘山国家级自然保护区色叶植物资源特点和开发利用现状。结果表明,区内植物种类较丰富,有色叶植物251种(含变种),隶属60科131属;从形态分类看,以乔木居多,有99种,占39.44%;从属的地理分布类型看,以温带分布型最为丰富,其次是泛热带分布型;根据叶片变色阶段和叶色分布特征将区内色叶植物分为常色叶类、斑叶类、双色叶类、新叶有色类与秋色叶类等5种类型,其中以秋色叶类最丰富,有166种,占区内色叶植物总种数的66.14%;区内储量丰富的40种色叶植物中有31种处于少量应用或未利用状态。提出注重资源保护和开发利用之间的关系、开展资源利用价值评估、发掘利用潜力等开发利用建议。
关键词
乡土色叶植物
资源调查
地理分布类型
代表物种
开发利用
浙江大盘国家级山自然保护区
Keywords
local color-leafed plants
resources investigation
representative species of geographic distri- bution types
development and utilization
Dapanshan National Nature Reserve of Zhejiang
分类号
S759.93 [农业科学—森林经理学]
S718.521.2 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜仲基因密码子使用模式分析
王艳
赵懿琛
赵德刚
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2021
11
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下载PDF
职称材料
2
浙江大盘山国家级自然保护区乡土色叶植物资源调查与开发利用研究
周钰鸿
刘亚
王盼
陈江芳
陈子林
《林业调查规划》
2018
2
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职称材料
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