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吲哚衍生物类VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的从头设计
被引量：
5
1
作者
康从民
赵绪浩
+1 位作者
于玉琪
吕英涛
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期550-554,共5页
以血管内皮生长因子受体-2(VEGFR-2)酪氨酸激酶的晶体结构为基础,采用从头药物设计方法,设计了一系列吲哚类化合物,并用类药性和分子对接进行了筛选,最后得到10个对接能量较低的化合物分子,对具有最低结合能的化合物与VEGFR-2酪氨酸激...
以血管内皮生长因子受体-2(VEGFR-2)酪氨酸激酶的晶体结构为基础,采用从头药物设计方法,设计了一系列吲哚类化合物,并用类药性和分子对接进行了筛选,最后得到10个对接能量较低的化合物分子,对具有最低结合能的化合物与VEGFR-2酪氨酸激酶的复合物进行了10 ns的分子动力学模拟,并对其结合模式进行了分析.这些化合物结构新颖,可能作为抗肿瘤的先导化合物或候选药物.本文结果为VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的进一步改造、设计及合成提供了理论基础,并有助于开发高活性和高选择性的抗肿瘤药物.
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关键词
血管内皮生长因子受体-2
酪氨酸激酶抑制剂
从头药物设计
类药性
分子对接
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职称材料
HIV-1 gp41蛋白与其抑制剂NB-2的结合模式
2
作者
王存新
丛肖静
+2 位作者
孔韧
谭建军
陈慰祖
《北京工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期1118-1123,共6页
为了设计以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂,采用分子对接、分子动力学模拟及自由能计算方法研究了gp41与其抑制剂NB-2的结合模式,利用从头药物设计方法,通过改造NB-2的结构,设计了有效的gp41选择性抑制剂,并用分子对接方法评价了这些...
为了设计以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂,采用分子对接、分子动力学模拟及自由能计算方法研究了gp41与其抑制剂NB-2的结合模式,利用从头药物设计方法,通过改造NB-2的结构,设计了有效的gp41选择性抑制剂,并用分子对接方法评价了这些新化合物的结合模式和能力.从分子对接结果得到2种主要的NB-2与gp41的结合模式.分子动力学模拟和自由能计算结果表明,结合模式1优于模式2,所以模式1是比较合理的结合模式.从结合模式1出发设计了103个新的化合物,这些化合物具有已知gp41抑制剂所没有的结构特征且大部分化合物比NB-2与gp41的结合自由能低.得到的结合模式合理解释了NB-2与gp41的相互作用.
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关键词
HIV-1
GP41
抑制剂
结合模式
分子模拟
从头药物设计
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职称材料
题名
吲哚衍生物类VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的从头设计
被引量：
5
1
作者
康从民
赵绪浩
于玉琪
吕英涛
机构
青岛科技大学化工学院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期550-554,共5页
基金
国家自然科学基金(批准号:21072111
21272131)
山东省自然科学基金(批准号:ZR2011BM015)资助~~
文摘
以血管内皮生长因子受体-2(VEGFR-2)酪氨酸激酶的晶体结构为基础,采用从头药物设计方法,设计了一系列吲哚类化合物,并用类药性和分子对接进行了筛选,最后得到10个对接能量较低的化合物分子,对具有最低结合能的化合物与VEGFR-2酪氨酸激酶的复合物进行了10 ns的分子动力学模拟,并对其结合模式进行了分析.这些化合物结构新颖,可能作为抗肿瘤的先导化合物或候选药物.本文结果为VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的进一步改造、设计及合成提供了理论基础,并有助于开发高活性和高选择性的抗肿瘤药物.
关键词
血管内皮生长因子受体-2
酪氨酸激酶抑制剂
从头药物设计
类药性
分子对接
Keywords
Vascular endothelial growth factor receptor-2 （VEGFR-2）
Tyrosine kinase inhibitor
De novo drug design
Absorption, distribution, metabolism, excretion and toxicity（ADMET）
Molecular docking
分类号
O621 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
HIV-1 gp41蛋白与其抑制剂NB-2的结合模式
2
作者
王存新
丛肖静
孔韧
谭建军
陈慰祖
机构
北京工业大学生命科学与生物工程学院
出处
《北京工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期1118-1123,共6页
基金
国家'九七三'计划资助项目(2009CB930200)
国家自然科学基金资助项目(30500429)
+2 种基金
北京市自然科学基金资助项目(5072002
7082006)
博士科研启动基金资助项目(X0015001200801)
文摘
为了设计以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂,采用分子对接、分子动力学模拟及自由能计算方法研究了gp41与其抑制剂NB-2的结合模式,利用从头药物设计方法,通过改造NB-2的结构,设计了有效的gp41选择性抑制剂,并用分子对接方法评价了这些新化合物的结合模式和能力.从分子对接结果得到2种主要的NB-2与gp41的结合模式.分子动力学模拟和自由能计算结果表明,结合模式1优于模式2,所以模式1是比较合理的结合模式.从结合模式1出发设计了103个新的化合物,这些化合物具有已知gp41抑制剂所没有的结构特征且大部分化合物比NB-2与gp41的结合自由能低.得到的结合模式合理解释了NB-2与gp41的相互作用.
关键词
HIV-1
GP41
抑制剂
结合模式
分子模拟
从头药物设计
Keywords
HIV-1 gp41
inhibitor
binding mode
molecular modeling
de novo drug design
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
吲哚衍生物类VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的从头设计
康从民
赵绪浩
于玉琪
吕英涛
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
HIV-1 gp41蛋白与其抑制剂NB-2的结合模式
王存新
丛肖静
孔韧
谭建军
陈慰祖
《北京工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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职称材料
已选择
0
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