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纤维连接蛋白1在胃癌中的表达及临床意义 被引量:6
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作者 孙阳 赵春临 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第6期629-633,共5页
目的纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚。文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制。方法采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载 GSE54129、GSE29272 ... 目的纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚。文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制。方法采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载 GSE54129、GSE29272 和 TCGA 数据分析胃癌与癌旁组织 FN1 的表达。根据 TCGA 表达谱数据及 FN1 表达分为:低表达(<-0.475)、中表达(-0.475~1.036)、高表达(>1.036)。分析 FN1在胃癌组织中的表达和临床病理关系;应用 TCGA数据和Kaplan Meier在线分析FN1的表达水平与胃癌患者的预后关系;TCGA数据采用基因集富集分析(GSEA)方法预测FN1的相关通路。结果 FN1低、中、高表达的中位生存时间分别为 63.5、55.7和 39.4个月,低表达和高表达者中位生存时间差异具有统计学意义(P<0.01)。Kaplan-Meier Plotter 在线数据集分析结果显示,FN1 高表达者中位生存时间短于低表达者(P< 0.01),即FN1表达越高,预后越差。FN1的表达是胃癌患者的独立预后因素(HR=0.480,95%CI:0.336~0.686)。FN1高表达样本富集到KRAS(FDR=0.0025)、P53(FDR=0.0052)、TGF-β(FDR=0.0052)、细胞黏附(FDR=0.0)、细胞外基质(FDR=0.0043)、骨架蛋白调控(FDR=0.0057)等基因集(P均<0.01)。结论 FN1的高表达是胃癌预后不良的因素,可作为预测胃癌转移和预后的有效生物标志物。FN1高表达导致KRAS、P53、TGF-β、ECM、细胞黏附和细胞骨架蛋白调节通路异常可能是其作用机制。 展开更多
关键词 胃癌 人类肿瘤相关基因表达汇编数据库 癌症基因组图谱数据库 纤维连接蛋白1 预后 基因
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LRP8在胃癌中的表达及其在胃癌发生过程中的作用 被引量:4
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作者 刘斌 郑鹏远 +4 位作者 米阳 任飞飞 高爽 刘传 李发展 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期285-293,共9页
背景与目的:低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在肝癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤发生中起重要作用,分析LRP8在胃癌中的表达及其意义,探讨LRP8作为胃癌生物治疗新靶点的可... 背景与目的:低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在肝癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤发生中起重要作用,分析LRP8在胃癌中的表达及其意义,探讨LRP8作为胃癌生物治疗新靶点的可能性。方法:利用人类癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库分析LRP8在胃癌组织中的表达;对胃癌中与LRP8共表达的基因进行基因本体(GeneOntology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;利用RNA干扰技术及细胞功能实验,测定LRP8表达对胃癌细胞系AGS增殖和迁移能力的影响,并检测LRP8敲低对Wnt信号通路活性的影响。利用Kaplan-Meier plotter数据库分析LRP8高低表达与胃癌患者预后的相关性;分析TCGA数据库中240例和郑州大学第五附属医院2018年8月—2019年7月行全胃切除术或部分切除术的25例胃癌患者LRP8表达及其与临床病理学特征之间的关系。结果:TCGA数据库中胃癌组织中LRP8表达高于正常胃黏膜,差异有统计学意义(P<0.000 1),GEO数据库中3项研究结果一致(P<0.05)。细胞功能实验表明,AGS细胞系中沉默LRP8表达后,相比对照组,si-LRP8组AGS细胞在体外增殖率和迁移率下降(P<0.05),且Wnt通路下游关键靶点β-catenin、LRP5、POU5F1、CCND1、AXIN2表达下调(P<0.05);KaplanMeier plotter数据库中两项芯片的生存分析显示,LRP8高表达患者预后不良(均P<0.05);TCGA数据库中分析显示,LRP8高表达与胃癌患者年龄呈正相关(P<0.001);回顾性分析显示LRP8高表达与胃癌分期正相关(P=0.034)。结论:LRP8在胃癌中高表达,并通过影响Wnt/β-catenin信号转导通路促进胃癌细胞恶性行为。LRP8的高表达与胃癌患者的远期生存率下降相关,有望成为胃癌患者治疗或预后的生物学标志物。 展开更多
关键词 胃癌 低密度脂蛋白受体相关蛋白8 人类癌症基因组图谱 基因表达汇编 Kaplan-Meier plotter 细胞功能实验 WNT信号通路
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