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沉默CDC25A基因后肝癌裸鼠移植瘤组织中差异表达基因的筛选
1
作者
陈思
唐艳萍
+4 位作者
李科志
杨春
黄小青
陈秀娟
曹骥
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期123-128,共6页
目的:探讨应用基因芯片技术筛选出可能受细胞分裂周期因子25A(cell division cycle 25A,CDC25A)调控的基因,阐明并验证CDC25A对肝癌相关基因的表达具有调控作用。方法:本课题组前期通过siRNA干扰技术沉默人肝癌HepG2细胞中CDC25A的表达...
目的:探讨应用基因芯片技术筛选出可能受细胞分裂周期因子25A(cell division cycle 25A,CDC25A)调控的基因,阐明并验证CDC25A对肝癌相关基因的表达具有调控作用。方法:本课题组前期通过siRNA干扰技术沉默人肝癌HepG2细胞中CDC25A的表达并成功构建了肝癌裸鼠移植瘤模型。基于上述研究成果,在本研究中应用Affymetrix基因表达谱芯片技术进一步筛选沉默CDC25A后肝癌移植瘤组织中的差异表达基因,并进行GO及KEGG分析,应用qPCR对部分差异表达基因进行验证。结果:通过芯片技术筛选出沉默CDC25A基因的肝癌移植组织中的差异表达基因188个,其中上调基因78个、下调基因110个。这些差异表达基因主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、蛋白复合物结合、细胞外间隙等方面,参与黏着斑、细胞外基质(extracellular matrix,ECM)受体相互作用等通路的改变。q PCR对部分差异表达基因验证的结果显示,HIPK2 mRNA表达上调,微纤丝关联蛋白5(microfibrillar-associated protein 5,MFAP5)和细胞周期蛋白D1(cyclin D1,CCND1)mRNA表达下调,与芯片检测结果一致。结论:应用人基因表达谱芯片技术成功筛选出沉默CDC25A后肝癌裸鼠移植瘤组织中的差异表达基因,为探究CDC25A影响肝癌细胞生长提供了支持线索。
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关键词
肝癌
细胞分裂周期因子25A
人基因表达谱芯片
移植瘤
GO分析
KEGG分析
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题名
沉默CDC25A基因后肝癌裸鼠移植瘤组织中差异表达基因的筛选
1
作者
陈思
唐艳萍
李科志
杨春
黄小青
陈秀娟
曹骥
机构
广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期123-128,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81260080)
广西自然科学基金资助项目(No.2017GXNSFBA198003)
广西壮族自治区中青年教师基础能力提升项目资助(No.2017KY0102)。
文摘
目的:探讨应用基因芯片技术筛选出可能受细胞分裂周期因子25A(cell division cycle 25A,CDC25A)调控的基因,阐明并验证CDC25A对肝癌相关基因的表达具有调控作用。方法:本课题组前期通过siRNA干扰技术沉默人肝癌HepG2细胞中CDC25A的表达并成功构建了肝癌裸鼠移植瘤模型。基于上述研究成果,在本研究中应用Affymetrix基因表达谱芯片技术进一步筛选沉默CDC25A后肝癌移植瘤组织中的差异表达基因,并进行GO及KEGG分析,应用qPCR对部分差异表达基因进行验证。结果:通过芯片技术筛选出沉默CDC25A基因的肝癌移植组织中的差异表达基因188个,其中上调基因78个、下调基因110个。这些差异表达基因主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、蛋白复合物结合、细胞外间隙等方面,参与黏着斑、细胞外基质(extracellular matrix,ECM)受体相互作用等通路的改变。q PCR对部分差异表达基因验证的结果显示,HIPK2 mRNA表达上调,微纤丝关联蛋白5(microfibrillar-associated protein 5,MFAP5)和细胞周期蛋白D1(cyclin D1,CCND1)mRNA表达下调,与芯片检测结果一致。结论:应用人基因表达谱芯片技术成功筛选出沉默CDC25A后肝癌裸鼠移植瘤组织中的差异表达基因,为探究CDC25A影响肝癌细胞生长提供了支持线索。
关键词
肝癌
细胞分裂周期因子25A
人基因表达谱芯片
移植瘤
GO分析
KEGG分析
Keywords
liver cancer
cell division cycle 25A(CDC25A)
human gene expression chip
xenograft tumor
GO analysis
KEGG analysis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
沉默CDC25A基因后肝癌裸鼠移植瘤组织中差异表达基因的筛选
陈思
唐艳萍
李科志
杨春
黄小青
陈秀娟
曹骥
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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