猪内源性逆转录病毒检测的三重PCR方法的建立及其在五指山猪组织样品检测中的初步应用

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作者 瑞雪 张云航 +7 位作者 李杨 谭晨 蔡艺菲 刘园园 曹宗喜 张艳 孙瑞萍 刘光亮 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第7期3548-3554,共7页

本研究旨在建立可同时检测猪基因组中的猪内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus,PERV)并鉴别PERV-A、PERV-B、PERV-C三种亚型PERV的三重PCR检测方法。根据PERV不同亚型囊膜(env)基因设计特异性引物,经反应条件和反应体系优... 本研究旨在建立可同时检测猪基因组中的猪内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus,PERV)并鉴别PERV-A、PERV-B、PERV-C三种亚型PERV的三重PCR检测方法。根据PERV不同亚型囊膜(env)基因设计特异性引物,经反应条件和反应体系优化后对该方法进行特异性、敏感性及重复性试验验证。结果表明:本研究建立的三重PCR检测方法特异性强,可特异性扩增三种亚型PERV目的基因,对猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒扩增结果呈阴性;该方法的敏感性较好,对PERV-A、PERV-B、PERV-C质粒标准品的检测下限分别为1×10^(2)、1×10^(3)和1×10^(2)拷贝·μL^(-1);采用建立的三重PCR方法检测103份组织样品,其中PERV-A的阳性率为100%(103/103),PERV-B的阳性率为100%(103/103),PERV-C的阳性率为54%(56/103),与经典单重PCR方法进行比较,符合率分别为100%、100%、96.6%。本研究成功建立了一种特异性强、敏感性较好、快速简便的三重PCR方法,可用于PERV三种亚型同时检测的鉴别诊断,为筛选无PERV的猪源供体器官提供技术支撑。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 囊膜基因 三重PCR检测方法 组织样品

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湖南沙子岭猪内源性逆转录病毒的研究 被引量：12

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作者 邢晓为 薛立群 +2 位作者 黄生强 黎淑娟 王维 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期799-804,共6页

为评价从猪到人异种移植的生物安全性提供依据,从湖南沙子岭猪的保种群内随机采集31头个体的耳样组织,应用PCR和RT-PCR技术分别检测这些组织中内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus,PERV)的前病毒DNA和mRNA,并对PCR扩增的灵... 为评价从猪到人异种移植的生物安全性提供依据,从湖南沙子岭猪的保种群内随机采集31头个体的耳样组织,应用PCR和RT-PCR技术分别检测这些组织中内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus,PERV)的前病毒DNA和mRNA,并对PCR扩增的灵敏性进行评估。多组织RT-PCR检测3头沙子岭猪肾、心、肝、肺、脾等组织中PERV的表达情况,了解其在各组织中的分布情况;最后,扩增、测序该猪种的env基因,结果用NCBI中的BLAST软件进行分析。PCR和RT-PCR结果表明,所检测的31头沙子岭猪均带有PERV前病毒DNA,耳样组织中均有PERV mRNA表达,其中有2头个体携带env-A、env-B、env-C3种囊膜蛋白基因,而其余的29头个体只带有env-Ae、nv-B两种囊膜蛋白基因,未检测到env-C基因。多组织RT-PCR扩增结果表明,3头沙子岭猪的肾、心、肝、肺、脾等组织中,pol、gage、nv-A、env-B基因均有表达,未检测到env-C基因表达。测序沙子岭猪的env基因,结果发现,沙子岭猪env-B和env-C基因与其他猪种序列比较分别存在2和10个碱基的差异,而env-A基因序列没有差异,说明不同的猪种之间env基因存在多态性。以上结果表明,沙子岭猪种群携带PERV,其亚型主要以PERV-A,B为主;PERV在该猪种肾、心、肝、肺、脾等多种组织中的分布没有明显组织特异性,且93.5%(29/31)个体表现为env-C基因缺失,提示沙子岭猪作为候选猪种可能在异种移植中具有较好的应用前景。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 亚型 沙子岭猪 异种移植 组织分布

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湖南大围子猪内源性逆转录病毒的研究 被引量：6

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作者 邢晓为 薛立群 +2 位作者 莫朝辉 黄生强 王维 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期838-842,共5页

目的:研究湖南大围子猪携带的内源性逆转录病毒(porcineendogenousretrovirus,PERV),为评价从猪到人异种移植的生物安全性提供依据。方法:从湖南大围子猪的保种群内随机采集42头个体的耳样组织,应用PCR和RT-PCR技术分别检测这些组织中P... 目的:研究湖南大围子猪携带的内源性逆转录病毒(porcineendogenousretrovirus,PERV),为评价从猪到人异种移植的生物安全性提供依据。方法:从湖南大围子猪的保种群内随机采集42头个体的耳样组织,应用PCR和RT-PCR技术分别检测这些组织中PERV前病毒DNA和mRNA,并对PCR扩增的灵敏性进行评估。扩增、测序大围子猪的PERVenv基因,结果用美国生物信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)的BLAST软件进行分析。结果:所检测的42头大围子猪均带有PERV前病毒DNA,耳样组织中均有PERVmRNA表达,所有个体携带env-A,env-B和env-C3种囊膜蛋白基因。测序结果表明,大围子猪env-A和env-C与GenBank登录其他猪种序列(AY288779,AY534304)相比分别存在1和8个碱基的差异,而env-B基因没有碱基差异。结论:大围子猪种群携带PERV,而且均具有转录活性,亚型主要为PERV-ABC;大围子猪的PERVenv-A,env-C存在基因多态性,从生物安全性方面考虑,该猪种不宜作为异种移植供体。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 大围子猪 亚型 异种移植

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人内源性逆转录病毒K包膜蛋白在乳腺肿瘤组织中的表达及意义 被引量：1

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作者 耿姗姗 赵晶 +2 位作者 顾林 许旭 刘红 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2010年第22期1286-1289,共4页

目的:检测人内源性逆转录病毒K(HERV-K)包膜蛋白(env蛋白)在不同乳腺肿瘤组织中的表达,分析其表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的相关性,探讨HERV-K env蛋白的表达与乳腺癌预后的关系。方法:免疫组织化学法检测HERV-Kenv蛋白在95例乳... 目的:检测人内源性逆转录病毒K(HERV-K)包膜蛋白(env蛋白)在不同乳腺肿瘤组织中的表达,分析其表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的相关性,探讨HERV-K env蛋白的表达与乳腺癌预后的关系。方法:免疫组织化学法检测HERV-Kenv蛋白在95例乳腺癌组织、30例乳腺良性肿瘤组织中的表达情况,x^2检验用于分析HERV-K env蛋白的表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的相关性。结果:免疫组织化学结果显示,HERV-K env蛋白的阳性表达主要位于细胞浆,该蛋白在乳腺癌组织中多呈强阳性或中度阳性表达,而在乳腺良性肿瘤组织中多呈阴性或弱阳性表达。HERV-K env蛋白在乳腺癌组织中的阳性表达率(88.4%)明显高于乳腺良性肿瘤组织(40.0%),差异具有统计学意义(P<0.001)。HERV-K env蛋白的表达水平与乳腺癌的某些预后因素存在相关性。在HERV-K env蛋白表达阳性的乳腺癌患者中,该蛋白的表达水平与肿瘤大小、临床分期、腋窝淋巴结转移数目之间存在正相关关系,与ER的表达状况之间存在负相关关系(P均<0.05),而与患者的年龄、组织学分级以及PR的表达状况无相关性(P均>0.05)。结论:HERV-K env蛋白在乳腺良性肿瘤中多为阴性表达,而在乳腺癌中多呈阳性表达,并且可能与乳腺癌的发展及预后相关,该蛋白在乳腺癌中的表达水平可能是一种判断乳腺癌预后的指标。 展开更多

关键词 人内源性逆转录病毒(herv-k) 乳腺肿瘤包膜(env)蛋白 免疫组织化学法

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山羊地方性鼻内腺瘤病毒和内源性逆转录病毒gag变异区的克隆与分析 被引量：5

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作者 王小玉 冯迎春 +5 位作者 颜其贵 张国俊 陈瑜 韩国全 任玉鹏 郭万柱 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第1期29-32,共4页

根据病毒gag变异区的两端设计引物,PCR扩增ENTV及ERVs的gag变异区,TA克隆并测序,经比对分析发现,在ERVs的783位~803位的＂CCT＂重复序列,编码多聚脯氨酸＂PPPPPPP＂,对应在ENTV gag中存在缺失突变和点突变,编码氨基酸为＂PSL＂,生物信... 根据病毒gag变异区的两端设计引物,PCR扩增ENTV及ERVs的gag变异区,TA克隆并测序,经比对分析发现,在ERVs的783位~803位的＂CCT＂重复序列,编码多聚脯氨酸＂PPPPPPP＂,对应在ENTV gag中存在缺失突变和点突变,编码氨基酸为＂PSL＂,生物信息学预测该区域的变异位于一个重要的抗原决定簇中,对gag在ENTV和ERVs中的功能有较大影响,为进一步研究gag的抗原性及相关免疫学检测方法的建立奠定基础。 展开更多

关键词 山羊 鼻内肿瘤 山羊地方性鼻内肿瘤病毒 羊源内源性逆转录病毒 GAG

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湖南沙子岭猪内源性逆转录病毒的检测及亚型分析 被引量：4

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作者 黎淑娟 邢晓为 +3 位作者 薛立群 黄生强 袁洪 王维 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期530-534,共5页

为探明湖南沙子岭猪内源性逆转录病毒携带情况及病毒亚型分布,应用gag,pol特异性引物,对31头湖南沙子岭猪耳部组织的DNA,RNA样品进行了PCR,RT-PCR检测,依据env基因表型env-A,env-B,env-C,鉴定了每头猪携带PERV亚型.结果表明,在所检31头... 为探明湖南沙子岭猪内源性逆转录病毒携带情况及病毒亚型分布,应用gag,pol特异性引物,对31头湖南沙子岭猪耳部组织的DNA,RNA样品进行了PCR,RT-PCR检测,依据env基因表型env-A,env-B,env-C,鉴定了每头猪携带PERV亚型.结果表明,在所检31头个体中,93.5%的个体基因组中同时有PERV的A,B 2种亚型(记为env-AB),另外6.5%的个体基因组中则同时有PERV的A,B,C 3种亚型(记为env-ABC),所有个体的耳样组织中均未检测到单独存在的PERV的A,B或C亚型.说明湖南沙子岭猪中存在PERV序列,且能以mRNA的形式表达,病毒亚型以env-AB为主. 展开更多

关键词 异种移植 猪内源性逆转录病毒 病毒亚型 湖南沙子岭猪

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猪内源性逆转录病毒在家猪细胞中的检测 被引量：1

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作者 冯瑞兵 王健 +2 位作者 段钟平 赵军 刘青 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期470-473,共4页

目的研究家猪(大白猪×杜洛克猪)体内猪内源性逆转录病毒(PERV)的存在和表达。方法采用PCR方法检测猪外周血单个核细胞、肝细胞中PERV前病毒序列;用RT-PCR方法检测家猪血清中PERVRNA序列。结果PCR方法测定猪外周血单个核细胞、肝细... 目的研究家猪(大白猪×杜洛克猪)体内猪内源性逆转录病毒(PERV)的存在和表达。方法采用PCR方法检测猪外周血单个核细胞、肝细胞中PERV前病毒序列;用RT-PCR方法检测家猪血清中PERVRNA序列。结果PCR方法测定猪外周血单个核细胞、肝细胞阳性率分别为40%、100%,RT-PCR方法测定家猪血清阳性率为33.3%。结论家猪体内有PERV的存在和表达,但其外周血单个核细胞、血清PERV的阳性率分别较中国实验用小型猪、大白猪为低,说明不同猪种之间PERV的存在和表达存在较大差异,筛选PERV基因拷贝数低甚至无PERV存在和表达的猪种是今后猪器官细胞医学应用的一个方向。 展开更多

关键词 家猪 猪内源性逆转录病毒 聚合酶链反应 逆转录-聚合酶链反应

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姜曲海猪内源性逆转录病毒及亚型的检测与分析 被引量：1

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作者 高勤学 杨晓志 +3 位作者 周俊 陶勇 周春宝 谈永松 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第4期247-249,共3页

为异种器官移植和抗病育种提供依据,观察猪内源性逆转录病毒(PERV)在姜曲海猪基因组中的分布情况及遗传特性。从姜曲海猪保种群中随机选择30头母猪,采集耳组织样品,应用PCR和RT-PCR技术分别检测PERV前病毒DNA和mRNA,根据env基因亚型env-... 为异种器官移植和抗病育种提供依据,观察猪内源性逆转录病毒(PERV)在姜曲海猪基因组中的分布情况及遗传特性。从姜曲海猪保种群中随机选择30头母猪,采集耳组织样品,应用PCR和RT-PCR技术分别检测PERV前病毒DNA和mRNA,根据env基因亚型env-A、env-B、env-C,鉴定每头猪携带的PERV亚型;同时,对PERV的env基因亚型进行扩增、克隆、测序。结果表明,所检测的30头姜曲海猪均带有PERV前病毒DNA,耳组织中均有PERV表达。所有个体均携带env-A、env-B、env-C等3种亚型,姜曲海猪env-A、env-B、env-C与其他猪种分别存在1、0和8个碱基差异;2个个体有2种基因型表达,28个个体有env-ABC基因型表达。说明姜曲海猪种群携带PERV,而且均具有转录活性,亚型全部是env-ABC;姜曲海猪2种亚型存在基因多态性,从生物安全角度考虑,该猪种不适宜作为异种移植供体。 展开更多

关键词 内源性逆转录病毒 姜曲海猪 亚型 抗病育种 异种移植

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新的人内源性逆转录病毒NP9基因的分子克隆与病毒蛋白表达 被引量：1

9

作者 任跃忠 戴巧定 徐荣臻 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 2005年第4期361-364,371,共5页

目的:研究新近发现的人内源性逆转录病毒NP9基因与自身免疫性疾病的相关性及其可能的作用机制,构建该基因的蛋白表达系统。方法:提取自身免疫性疾病患者外周血单个核细胞(PBMCs)的总RNA,利用RT-PCR技术,扩增NP9基因,然后将该片段进行T-... 目的:研究新近发现的人内源性逆转录病毒NP9基因与自身免疫性疾病的相关性及其可能的作用机制,构建该基因的蛋白表达系统。方法:提取自身免疫性疾病患者外周血单个核细胞(PBMCs)的总RNA,利用RT-PCR技术,扩增NP9基因,然后将该片段进行T-A克隆并测序鉴定,纯化回收后亚克隆于原核表达载体pQE30中,然后提取质粒,酶切鉴定;最后经IPTG诱导,原核表达重组子在M15宿主菌进行表达,并进行SDS-PAGE与Western印迹分析与鉴定。结果:应用RT-PCR技术,从系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞的总RNA中扩增到一条大小约为250bp的片段,经T-A克隆与测序鉴定,证实此片段为NP9基因,具有一个完整的开放阅读框架;将pQE30-NP9重组子转化入宿主菌,用IPTG诱导菌体表达NP9重组蛋白,经SDS-PAGE电泳和Western印迹技术鉴定证实:在相对分子量约9kD处见明显的病毒特异性的高表达条带。结论:已成功克隆了新的人内源性逆转录病毒NP9基因,并经IPTG诱导,在M15宿主菌中表达了相应的病毒蛋白,为进一步研究该逆转录病毒与自身免疫性疾病的相关性奠定基础。 展开更多

关键词 内源性逆转录病毒 基因 病毒 病毒NP9基因 克隆 分子 病毒蛋白表达

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壳聚糖纳米纤维支架对猪肝细胞分泌猪内源性逆转录病毒的影响

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作者 韩冰 施晓雷 +5 位作者 肖江强 张悦 褚薛慧 顾劲扬 顾忠泽 丁义涛 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期609-614,共6页

探讨壳聚糖纳米纤维支架对肝细胞的PERV分泌量以及其感染性的影响。将新鲜分离的猪肝细胞接种于壳聚糖纳米纤维支架或普通条件下连续培养7 d,分为实验组(Nano组)和对照组(Hep组)。每天收集培养液检测逆转录酶(RT)活性,并通过RT-PCR和实... 探讨壳聚糖纳米纤维支架对肝细胞的PERV分泌量以及其感染性的影响。将新鲜分离的猪肝细胞接种于壳聚糖纳米纤维支架或普通条件下连续培养7 d,分为实验组(Nano组)和对照组(Hep组)。每天收集培养液检测逆转录酶(RT)活性,并通过RT-PCR和实时定量PCR测定PERV RNA水平。通过western blot检测细胞裂解液中PERV gag 30蛋白含量。细胞培养液体外孵育HEK293细胞以测定其感染性。结果表明:实时定量PCR、RT活性以及western blot具有相似的变化趋势。在体外培养10 h和2 d出现PERV分泌高峰然后逐渐下降。除第6 dPERV RNA水平和第5 d蛋白水平实验组明显高于对照组外,其余均无明显差异。体外感染实验无HEK293细胞感染。壳聚糖纳米纤维支架会延长猪肝细胞的PERV分泌时间但对分泌量以及体外感染性并无明显影响,可安全用于生物人工肝。 展开更多

关键词 壳聚糖纳米纤维支架 猪肝细胞 猪内源性逆转录病毒 生物人工肝

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四种小型猪内源性逆转录病毒基因研究

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作者 李金泽 岳敏 +2 位作者 张建明 王玉珏 顾为望 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第10期82-82,共1页

目的检测中国四种小型猪在PERV拷贝数上的差异,试图找出不含或含有较低拷贝数的一个个体或一个品种。方法采用半定量PCR方法检测了我国四种小型猪内源性逆转录病毒基因的拷贝数。结果贵州小型猪、五指山猪、西藏小型猪、巴马小型猪的PER... 目的检测中国四种小型猪在PERV拷贝数上的差异,试图找出不含或含有较低拷贝数的一个个体或一个品种。方法采用半定量PCR方法检测了我国四种小型猪内源性逆转录病毒基因的拷贝数。结果贵州小型猪、五指山猪、西藏小型猪、巴马小型猪的PERV的拷贝数分别是34.12±16.96,29.38±13.83,28.71±14.11,27.12±14.43(F=0.614,P=0.609),EnvA的拷贝数分别是9.78±5.48,10.06±5.34,10.23±5.71,10.51±6.23(F=0.044,P=0.988),EnvB的拷贝数分别是24.14±11.26,20.72±8.36,18.35±8.50,17.60±8.65(F=1.512,P=0.221)。尚不能认为四个猪种间PERV、EnvA、EnvB的拷贝数之间的差异具有统计学意义。结论与已报道的其它猪种相比,四种常用的小型猪内源病毒负载量较低,充分证明了其用于异种器官移植研究的可行性。 展开更多

关键词 小型猪 猪内源性逆转录病毒 拷贝数 半定量PCR

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中国两头乌猪品种内源性逆转录病毒基因研究 被引量：7

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作者 王亚楠 刘静 +1 位作者 刘榜 张庆德 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2013年第3期70-74,共5页

目的对5个中国两头乌猪品种(通城猪、东山猪、沙子岭猪、赣西两头乌猪和金华猪)及3个国外品种(大白猪、长白猪和杜洛克猪)猪内源性逆转录病毒(PERV)的核心蛋白(gag)基因、多聚酶(pol)基因、囊膜(env)基因的3个亚型A、B、C,分别从DNA和RN... 目的对5个中国两头乌猪品种(通城猪、东山猪、沙子岭猪、赣西两头乌猪和金华猪)及3个国外品种(大白猪、长白猪和杜洛克猪)猪内源性逆转录病毒(PERV)的核心蛋白(gag)基因、多聚酶(pol)基因、囊膜(env)基因的3个亚型A、B、C,分别从DNA和RNA水平上进行研究,以发现中国两头乌猪品种在异种器官移植中的资源优势。方法利用PCR方法在DNA水平上对PERV基因的三个亚型进行鉴定,并通过半定量PCR方法在RNA水平上检测通城猪和大白猪PERV各亚型在心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪、淋巴和脑组织中的表达谱。结果4个华中两头乌猪种中env-AB型为主要PERV亚型,分别占被测总数的92%～100%。在这4个品种中均没有检测到C亚型,金华猪以及3个国外猪种中均检测到了C亚型,病毒亚型种类也更丰富。半定量PCR实验结果显示gag、pol基因在两个品种9个组织中广泛表达,env-A在通城猪的心、肝、肺、脂肪和淋巴组织中表达量较低,env-B在通城猪的心脏和淋巴组织中表达量较低,而env-B在大白猪的肾脏中表达很低,其他所测8个组织中表达量都较高。结论通城猪、东山猪、赣西两头乌猪和沙子岭猪可以做为较佳的异种移植候选供体,具有良好的应用前景。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 华中两头乌 金华猪 基因 组织表达谱

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内源性逆转录病毒的转录表达与宿主功能关系的研究进展 被引量：4

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作者 白少川 张乐超 +3 位作者 葛琳涵 郭艳丽 王德贺 李兰会 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2107-2114,共8页

内源性逆转录病毒(ERVs)是几百万年前感染并整合进宿主基因组中,通过孟德尔规律进行遗传的逆转录病毒的遗留物。ERVs具有重要的生物学功能,对宿主表型、生产性能、胚胎发育及免疫调节等方面发挥重要作用。本文对内源性逆转录病毒的基因... 内源性逆转录病毒(ERVs)是几百万年前感染并整合进宿主基因组中,通过孟德尔规律进行遗传的逆转录病毒的遗留物。ERVs具有重要的生物学功能,对宿主表型、生产性能、胚胎发育及免疫调节等方面发挥重要作用。本文对内源性逆转录病毒的基因组结构、表观修饰和整合位点效应的活性调控及其与宿主胚胎发育、免疫调控等进行综述,为深入了解内源性逆转录病毒在基因组的功能及其对宿主的影响与进化提供参考。 展开更多

关键词 内源性逆转录病毒 转录调控 整合位点 免疫

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版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒序列拷贝数分析 被引量：1

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作者 黄晓洁 陈苹 +3 位作者 曾嵘 马康涛 曾养志 周春燕 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期370-374,共5页

目的:检测分析版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒(porc ine endogenous retrovirus,PERV)序列的拷贝数,从而为猪源移植物的异种移植筛选理想供者。方法:用PERV的pol,env各亚型基因及envA/C重组体的特异性引物,对4个近交系亚系... 目的:检测分析版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒(porc ine endogenous retrovirus,PERV)序列的拷贝数,从而为猪源移植物的异种移植筛选理想供者。方法:用PERV的pol,env各亚型基因及envA/C重组体的特异性引物,对4个近交系亚系共50头以及5头欧洲大白猪的外周血单核细胞(peripheral b lood mononuc learcell,PBMC)的基因组DNA进行了实时定量/半定量PCR检测及普通PCR检测。结果:所有版纳猪基因组中可特异扩增出pol,envA,envB片段,其平均拷贝数分别为(24.2±9.4),(13.1±8.4)和(16.4±9.8)个,但近交系不同亚系之间各片段扩增产物量比较差异具有统计学意义(P<0.01)。所有样品中无法扩增出envC片段以及envA/C重组体。结论:版纳微型猪近交系基因组内,PERV的envA、envB和pol序列拷贝数在近交系不同亚系间比较差异有统计学意义,不存在envC和envA/C重组体序列。 展开更多

关键词 猪 内源性逆转录病毒 动物 近交系 聚合酶链反应 序列分析

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四川山鹧鸪基因组中内源性逆转录病毒的分析 被引量：1

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作者 郑帅 周闯 +3 位作者 范振鑫 李静 岳碧松 孟杨 《四川动物》 北大核心 2019年第5期521-525,共5页

内源性逆转录病毒(ERV)是插入到宿主基因组中的、可以稳定遗传的病毒基因组,能够在宿主体内表达和复制,调节插入位点附近的基因表达,以及抑制同源病毒的感染。从四川山鹧鸪Arborophila rufipectus基因组中确定了3 962个全长ERV拷贝,其中... 内源性逆转录病毒(ERV)是插入到宿主基因组中的、可以稳定遗传的病毒基因组,能够在宿主体内表达和复制,调节插入位点附近的基因表达,以及抑制同源病毒的感染。从四川山鹧鸪Arborophila rufipectus基因组中确定了3 962个全长ERV拷贝,其中4个具有完整的结构,72个具有自我复制的能力,554个含有gag、pol或env基因所编码的蛋白质结构域。根据逆转录酶序列的相似性,确定了7个ERV家族,并依据与其他物种的相似性对家族进行了命名。其中,AruERV-L包含122个ERV拷贝,为拷贝数最多的家族。7个ERV家族的年龄分布在0~12百万年,其中AruERV-K1是最年轻的家族,其约86%的拷贝年龄在1百万年以内。 展开更多

关键词 四川山鹧鸪 基因组 内源性逆转录病毒 内源性逆转录病毒家族 内源性逆转录病毒年龄

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猪内源性逆转录病毒在3种不同品系猪中的分布及序列特征研究 被引量：1

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作者 冯天悦 Kamal Shah +4 位作者 张文立 付利芝 李昌文 王玉娥 陈洪岩 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1141-1148,1168,共9页

为研究猪内源性逆转录病毒(PERV)在不同猪种中的分布情况、序列结构、遗传变异、表达特性等特征,本研究选取大白猪、荣昌猪、五指山小型猪3种常见猪种为研究对象,分别设计特异性引物,检测各猪种肺组织中PERV 3种亚型(PERV-A、PERV-B、PE... 为研究猪内源性逆转录病毒(PERV)在不同猪种中的分布情况、序列结构、遗传变异、表达特性等特征,本研究选取大白猪、荣昌猪、五指山小型猪3种常见猪种为研究对象,分别设计特异性引物,检测各猪种肺组织中PERV 3种亚型(PERV-A、PERV-B、PERV-C)的分布情况。结果显示,PERV在3种猪种中均有分布,其中PERV-A分布最广泛。进一步分段扩增3种猪的PERV-A全基因组序列并测序分析。全基因组序列进化树与囊膜(env)基因进化树分析均显示,东北地区的大白猪与荣昌猪PERV-A归为同一分支,亲缘关系较近;对测序结果进行生物信息学分析和蛋白二级结构预测,结果显示,PERV-A Gag蛋白和Pol蛋白的变异程度较大,有多种结构,但Env蛋白保守性较高,结构较为单一。采用荧光定量PCR法检测SPF大白猪不同组织中的PERV-A,结果显示从SPF大白猪心、肝、脾、肺、肾、扁桃体、淋巴结等7种组织中均检测出PERV-A,且在扁桃体等免疫器官组织中的转录水平最高。本研究共获得了5条不同猪种的PERV-A全基因组序列,首次鉴定了荣昌猪PERV全基因组序列,提示东北地区大白猪的引种来源可能与韩国猪种存在一定同源性,且五指山小型猪与荣昌猪、大白猪亲缘关系较远,有助于PERV分子特性的研究,并为评估不同猪种PERV在异种移植中的安全性并筛选合适猪种提供参考。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 序列分析 囊膜基因 遗传进化分析

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猪内源性逆转录病毒对异种组织器官移植影响的研究进展 被引量：1

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作者 邱玉涛 龚海燕 袁静 《动物医学进展》 CSCD 2006年第2期41-45,共5页

猪内源性逆转录病毒(Porcine en-dogenous retrovirus,PERV)是新发现的对人细胞具有感染性的且存在于正常猪体内的病毒,在异种组织器官移植过程中可能向人传播,直接威胁到接受移植者的健康甚至生命,这是异种组织器官移植首要克服的难题... 猪内源性逆转录病毒(Porcine en-dogenous retrovirus,PERV)是新发现的对人细胞具有感染性的且存在于正常猪体内的病毒,在异种组织器官移植过程中可能向人传播,直接威胁到接受移植者的健康甚至生命,这是异种组织器官移植首要克服的难题。由于PERV近年来才受到广泛关注,所以人们对PERV的分类,对人类和其他动物的危害性及病原的检测均不能完全确定。文章旨在提供上述几方面的研究现状,以期为PERV的深入研究奠定基础。PERV能影响移植受体的生殖,抑制受体免疫体系;对其他物种的细胞或活体都可能产生体外和体内感染性;目前有多种PERV检测方法,为受体和供体的病毒监控提供了依据。 展开更多

关键词 猪内源性逆转录病毒 异种移植 生物安全性 检测方法

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异种移植中猪内源性逆转录病毒的传播 被引量：3

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作者 余一凡 宋佳华 +4 位作者 宋相钦 李涛 江建 白云昊 王毅 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期754-759,共6页

器官移植是治疗各类终末期疾病最有效的手段,为了解决器官移植中供体短缺的问题,人们开始探究异种移植的可能。猪是异种器官移植常见的供体来源之一,猪器官作为连接两个物种间的桥梁,其携带的病毒有可能在物种间传播并存在引起人畜共患... 器官移植是治疗各类终末期疾病最有效的手段,为了解决器官移植中供体短缺的问题,人们开始探究异种移植的可能。猪是异种器官移植常见的供体来源之一,猪器官作为连接两个物种间的桥梁,其携带的病毒有可能在物种间传播并存在引起人畜共患病的风险。猪内源性逆转录病毒(PERV)整合在基因组中,是一种跨物种传播的逆转录病毒。本文介绍了PERV传播特性的影响因素、PERV及其重组病毒的传播风险以及异种移植试验中PERV的检测与传播风险评估,以期为缓解器官移植供体严重短缺的现状,推动异种移植技术的发展提供参考。 展开更多

关键词 异种移植 猪内源性逆转录病毒 器官短缺 转基因 传播特性 人畜共患病 免疫缺陷 感染

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人源细胞对猪内源性逆转录病毒易感性的初步研究

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作者 张立 步宏 +3 位作者 李幼平 程惊秋 李胜富 于萍 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期22-24,103,共4页

目的　对 6种人源细胞对猪内源性逆转录病毒 (PERV)的易感性进行研究。方法　用PERV病毒上清感染培养中的 6种人源细胞后 ,用PCR和RT -PCR法研究PERV是否感染这 6种人源细胞。结果　张氏肝细胞和人胚软骨细胞对PERV不易感 ,其余 4种人... 目的　对 6种人源细胞对猪内源性逆转录病毒 (PERV)的易感性进行研究。方法　用PERV病毒上清感染培养中的 6种人源细胞后 ,用PCR和RT -PCR法研究PERV是否感染这 6种人源细胞。结果　张氏肝细胞和人胚软骨细胞对PERV不易感 ,其余 4种人源细胞对PERV易感。 展开更多

关键词 人源细胞 猪内源性逆转录病毒 易感性 研究 器官移植 异种移植

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小菜蛾基因组中内源性逆转录病毒元件PxERV的发现与特征分析

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作者 王月 卢丛 +2 位作者 刘天生 陈韶萍 尤民生 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期817-824,共8页

【目的】内源性逆转录病毒(endogenous retroviruses,ERVs)是一类在宿主基因组中世代留存的有类似病毒结构的序列元件。本研究在通过前期小菜蛾Plutella xylostella精巢转录组分析发现一个小菜蛾内源性逆转录病毒元件PxERV的基础上,探... 【目的】内源性逆转录病毒(endogenous retroviruses,ERVs)是一类在宿主基因组中世代留存的有类似病毒结构的序列元件。本研究在通过前期小菜蛾Plutella xylostella精巢转录组分析发现一个小菜蛾内源性逆转录病毒元件PxERV的基础上,探究该逆转录病毒元件的序列特征及侵染活性,为探明内源性逆转录病毒对小菜蛾的影响奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析鉴定了PxERV在小菜蛾基因组上的序列及结构特点,并用基因克隆和测序得到PxERV的env基因序列;进一步通过MEGA6软件构建了昆虫env基因编码的氨基酸序列与核型多角体病毒包膜糖蛋白的系统发育树。利用qPCR技术检测了env基因在小菜蛾G88品系不同发育时期虫体和精巢中的表达模式及FZ品系成虫和G88品系的成虫和幼虫中env基因拷贝数的变化。利用CRISPR/Cas9介导小菜蛾G88品系中env基因突变,检测PxERV的独立复制活性。【结果】PxERV有LTR-pol-env-LTR结构,其env基因与果蝇Drosophila buzzatii逆转座子osvaldo和粉纹夜蛾Trichoplusia ni内源性逆转录病毒Ted的env基因进化关系较近。PxERV的env基因在小菜蛾G88品系雄成虫精巢中特异性高表达,env基因的拷贝数在小菜蛾FZ品系中的低于在G88品系中的,但在不同发育时期的G88品系中没有差异。G88品系多代自交,突变型env基因在小菜蛾基因组上不断减少,直至完全恢复野生型env基因。【结论】内源性逆转录病毒元件PxERV在小菜蛾世代间存在独立复制活性,但在小菜蛾发育过程中不会独立复制。这种病毒元件可能通过小菜蛾雄性生殖系统实现侵染活性,但侵染机理还需进一步探究。 展开更多

关键词 小菜蛾 基因组 内源性逆转录病毒 ENV基因 系统发育 qPCR

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