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CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
被引量:
1
1
作者
周雨薇
岳鹏
黄健
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期659-666,共8页
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已...
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。
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关键词
交叉相互作用
可开发性
自身
相互作用
支持向量机
治疗性抗体
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职称材料
水溶液中氨基酸与二甲脲的混合焓及焓对相互作用
被引量:
5
2
作者
邵爽
林瑞森
《浙江大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
2001年第3期269-275,共7页
用 L KB- 2 2 77精密微热量计测定了 2 98.15K时甘氨酸、L-丙氨酸、L -丝氨酸、L -缬氨酸、L -苏氨酸和 L-脯氨酸 6种α-氨基酸分别与二甲脲分子在水溶液中混合过程焓变及这些溶质分子在水溶液中的稀释焓 ,根据 Mc Millan- Mayer理论关...
用 L KB- 2 2 77精密微热量计测定了 2 98.15K时甘氨酸、L-丙氨酸、L -丝氨酸、L -缬氨酸、L -苏氨酸和 L-脯氨酸 6种α-氨基酸分别与二甲脲分子在水溶液中混合过程焓变及这些溶质分子在水溶液中的稀释焓 ,根据 Mc Millan- Mayer理论关联得到各级交叉焓相互作用系数 .重点讨论了不同氨基酸与二甲脲分子的相互作用机制 .结果表明 ,氨基酸的两性离子部分、α-碳上的非极性脂肪侧基、极性的羟基侧基和五元吡咯环结构对交叉焓对作用系数 hxy具有不同贡献 .与尿素相比 ,二甲脲分子中 -
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关键词
Α-氨基酸
二甲脲
交叉
焓
相互作用
热力学
混合焓
相互作用
机制
水溶液
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职称材料
题名
CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
被引量:
1
1
作者
周雨薇
岳鹏
黄健
机构
电子科技大学生命科学与技术学院
成都东软学院健康医疗科技学院
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期659-666,共8页
基金
国家自然科学基金(62071099)。
文摘
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。
关键词
交叉相互作用
可开发性
自身
相互作用
支持向量机
治疗性抗体
Keywords
cross-interaction
developability
self-interaction
support vector machine
therapeutic antibody
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
水溶液中氨基酸与二甲脲的混合焓及焓对相互作用
被引量:
5
2
作者
邵爽
林瑞森
机构
浙江教育学院化学系
浙江大学化学系
出处
《浙江大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
2001年第3期269-275,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目!(2 0 0 730 39)
文摘
用 L KB- 2 2 77精密微热量计测定了 2 98.15K时甘氨酸、L-丙氨酸、L -丝氨酸、L -缬氨酸、L -苏氨酸和 L-脯氨酸 6种α-氨基酸分别与二甲脲分子在水溶液中混合过程焓变及这些溶质分子在水溶液中的稀释焓 ,根据 Mc Millan- Mayer理论关联得到各级交叉焓相互作用系数 .重点讨论了不同氨基酸与二甲脲分子的相互作用机制 .结果表明 ,氨基酸的两性离子部分、α-碳上的非极性脂肪侧基、极性的羟基侧基和五元吡咯环结构对交叉焓对作用系数 hxy具有不同贡献 .与尿素相比 ,二甲脲分子中 -
关键词
Α-氨基酸
二甲脲
交叉
焓
相互作用
热力学
混合焓
相互作用
机制
水溶液
Keywords
α-amino acid
1,3 dimethylurea (DMU)
cross enthalpic pairwise interaction
分类号
O642.1 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
周雨薇
岳鹏
黄健
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
水溶液中氨基酸与二甲脲的混合焓及焓对相互作用
邵爽
林瑞森
《浙江大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
2001
5
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职称材料
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