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亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态被引量：6: 1; 作者汪艳杰龙鸿姚家玲《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期134-139,共6页; 建立了适用于水稻基因组特定基因甲基化检测的亚硫酸氢钠测序法,并利用此方法对FIE2A基因CpG岛部分片段的甲基化差异进行了研究。采用CTAB法提取水稻叶片和胚乳细胞的基因组DNA,经亚硫酸氢钠化学修饰后,针对已修饰的FIE基因序列设计特... 展开更多; 关键词亚硫酸氢钠测序法 DNA甲基化水稻 FIE基因 CPG岛; 在线阅读下载PDF 职称材料

改进的亚硫酸氢钠测序法检测HepG2 RASSF1A基因CpG岛甲基化状态被引量：4: 2; 作者张莉君王先良 +1 位作者孙晞徐顺清《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期411-412,415,共3页; 目的改进亚硫酸氢钠测序法,并检验改进后方法在甲基化检测中的可行性。方法提取人肝癌细胞株HepG2基因组DNA,亚硫酸氢钠化学修饰,针对修饰后Ras相关家族1A基因(RASSF1A)启动子序列设计特异引物并结合沉降PCR扩增,T-A载体克隆、测序。结... 展开更多; 关键词亚硫酸氢钠测序法甲基化聚合酶链反应 Ras相关家族1A基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

甲基化抑制剂5-杂氮胞苷对T淋巴细胞株程序性死亡受体-1基因启动子区域甲基化水平及其表达的影响被引量：2: 3; 作者张旻肖新强 +4 位作者梁云生彭敏源蒋永芳许允龚国忠《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1163-1169,共7页; 目的:以T淋巴细胞株Molt-4细胞为模型,探讨甲基化抑制剂5-杂氮胞苷(5-azacytidine,5-Zac)对淋巴细胞表面程序性死亡受体-1(programmed death receptor 1,PD-1)基因启动子的去甲基化作用及其诱导的PD-1基因表达的改变,并进一步研究去甲... 展开更多; 关键词程序性死亡受体-1 去甲基化 5-杂氮胞苷亚硫酸氢钠测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

5羟色胺转运体启动子区CpG岛甲基化与精神分裂症的相关研究被引量：3: 4; 作者董燕程宇琪 +2 位作者徐健许秀峰白燕《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期631-634,共4页; 目的探讨5羟色胺转运体(5-HTT)启动子区CpG岛甲基化水平与精神分裂症的相关性。方法纳入符合美国精神障碍诊断与统计手册第Ⅳ版(DSM-IV)诊断标准的首发精神分裂症患者30例和正常对照30名,采用亚硫酸氢钠测序法测定受试者的5-HTT基因启... 展开更多; 关键词 DNA甲基化精神分裂症 5-羟色胺转运体亚硫酸氢钠测序法; 在线阅读下载PDF 职称材料

5-杂氮胞苷对成人T淋巴细胞穿孔素基因启动子区域甲基化水平的影响被引量：2: 5; 作者肖嵘丁艳 +7 位作者陆前进李亚萍李勇坚杨心洁苏玉文梁云生张桂英文海泉《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期843-847,共5页; 目的:研究DNA低甲基化对穿孔素基因mRNA和蛋白表达的影响。方法:密度梯度离心分离正常成人的外周血淋巴细胞,磁珠分离CD4和CD8细胞后进行细胞培养,DNA甲基化抑制剂5-杂氮胞苷(5-azaC)处理。分别提取DNA、RNA和蛋白质。亚硫酸氢钠处理DNA... 展开更多; 关键词穿孔素甲基化亚硫酸氢钠测序 5-杂氮胞苷; 在线阅读下载PDF 职称材料

食管鳞状细胞癌survivin表达与其CpG岛甲基化的研究被引量：16: 6; 作者胡华梅杨晓亚 +3 位作者熊刚王凯陈雪丹白云《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期13-15,共3页; 目的探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)肿瘤组织survivin基因的表达与其CpG岛甲基化状态的关系。方法采用RT-PCR的方法检测ESCC细胞株、ESCC肿瘤组织及对应的远癌组织中的sur-vivin基因mRNA的表达;采用亚硫... 展开更多; 关键词 survivin基因食管鳞状细胞癌甲基化亚硫酸氢钠修饰后测序法(BSP); 在线阅读下载PDF 职称材料

题名亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态被引量：6: 1; 作者汪艳杰龙鸿姚家玲; 机构华中农业大学生命科学技术学院; 出处《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期134-139,共6页; 基金国家重点基础研究发展计划(973计划:2007CB108704) 国家自然科学基金项目(30971551); 文摘建立了适用于水稻基因组特定基因甲基化检测的亚硫酸氢钠测序法,并利用此方法对FIE2A基因CpG岛部分片段的甲基化差异进行了研究。采用CTAB法提取水稻叶片和胚乳细胞的基因组DNA,经亚硫酸氢钠化学修饰后,针对已修饰的FIE基因序列设计特异引物并结合巢式PCR扩增,TA载体克隆、测序,最后对测序结果进行分析。结果表明巢式PCR能够增加特异性产物的产生,FIE基因CpG岛在对称的CG和CNG位点甲基化水平较高,而在非对称CNN位点甲基化水平最低,此外在叶片中的平均甲基化水平较高。由此表明本研究建立的亚硫酸氢钠测序法适用于水稻基因组特定基因甲基化状态的检测。; 关键词亚硫酸氢钠测序法 DNA甲基化水稻 FIE基因 CPG岛; Keywords Bisulfite sequencing DNA methylation Rice FIE CpG island; 分类号 Q944.46 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名改进的亚硫酸氢钠测序法检测HepG2 RASSF1A基因CpG岛甲基化状态被引量：4: 2; 作者张莉君王先良孙晞徐顺清; 机构华中科技大学同济医学院公共卫生学院环境医学研究所; 出处《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期411-412,415,共3页; 基金国家自然科学基金资助项目(No.20407011); 文摘目的改进亚硫酸氢钠测序法,并检验改进后方法在甲基化检测中的可行性。方法提取人肝癌细胞株HepG2基因组DNA,亚硫酸氢钠化学修饰,针对修饰后Ras相关家族1A基因(RASSF1A)启动子序列设计特异引物并结合沉降PCR扩增,T-A载体克隆、测序。结果HepG2细胞RASSF1A基因启动子CpG岛的16个CpG位点均被甲基化。结论改进后亚硫酸氢钠测序法能明显减少非特异性扩增,提高PCR效率,更适于基因甲基化状态的检测。; 关键词亚硫酸氢钠测序法甲基化聚合酶链反应 Ras相关家族1A基因; Keywords bisulfite sequencing methylation polymerase chain reaction Ras association domain family 1A gene; 分类号 Q343.1 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甲基化抑制剂5-杂氮胞苷对T淋巴细胞株程序性死亡受体-1基因启动子区域甲基化水平及其表达的影响被引量：2: 3; 作者张旻肖新强梁云生彭敏源蒋永芳许允龚国忠; 机构中南大学湘雅二医院感染科中南大学湘雅二医院表观遗传学研究中心中南大学湘雅医院血液科; 出处《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1163-1169,共7页; 基金十一五国家科技重大专项(2008ZX10202) 国家自然科学基金(30901269)~~; 文摘目的:以T淋巴细胞株Molt-4细胞为模型,探讨甲基化抑制剂5-杂氮胞苷(5-azacytidine,5-Zac)对淋巴细胞表面程序性死亡受体-1(programmed death receptor 1,PD-1)基因启动子的去甲基化作用及其诱导的PD-1基因表达的改变,并进一步研究去甲基化作用与PD-1基因表达之间的关系。方法:以不同浓度的5-Zac分组(0μmol/L组、5μmol/L组、10μmol/L组)作用于体外培养的Molt-4细胞72 h,流式细胞仪(flow cy-tometry,FCM)检测细胞表面表达PD-1的Molt-4细胞比例和细胞凋亡率;反转录-聚合酶链反应(reverse tran-scription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测5-Zac作用后PD-1基因mRNA的转录水平;亚硫酸氢钠处理各组Molt-4细胞DNA,PCR扩增PD-1启动子基因片段,转化感受态大肠杆菌,挑克隆测序,检测扩增的PD-1启动子片段甲基化状态。结果:0μmol/L组、5μmol/L组、10μmol/L组的5-Zac作用于Molt-4细胞72 h后,PD-1在细胞表面的表达率分别为(1.13±0.01)%,(18.96±1.87)%和(63.09±6.25)%,并呈现浓度依赖性;PD-1基因mRNA表达量显著增加;细胞凋亡检测结果显示:与0μmol/L组相比,5μmol/L组、10μmol/L组5-Zac处理72 h后Molt-4细胞的凋亡率显著增加,0μmol/L组、5μmol/L组、10μmol/L组凋亡率分别为(1.9±0.06)%,(8.98±1.36)%和(24.5±3.68)%,差异有统计学意义(P<0.01);上述3组DNA亚硫酸氢钠测序结果表明:加入甲基化抑制剂5-Zac处理后,PD-1启动子上-601 bp和-553 bp CpG点去甲基化程度明显增高。结论:甲基化抑制剂5-Zac可导致体外培养的T淋巴细胞系Molt-4细胞表面PD-1 mRNA表达显著增加,细胞凋亡率增高,这种增高可能与PD-1基因启动子区域出现的去甲基化有关。; 关键词程序性死亡受体-1 去甲基化 5-杂氮胞苷亚硫酸氢钠测序; Keywords programmed death receptor 1 demethylation 5-azacytidine bisulfite genomic sequencing; 分类号 R363 [医药卫生—病理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名5羟色胺转运体启动子区CpG岛甲基化与精神分裂症的相关研究被引量：3: 4; 作者董燕程宇琪徐健许秀峰白燕; 机构昆明医学院第一附属医院精神科临汾市第四人民医院心理咨询科昆明医学院第一附属医院风湿免疫科; 出处《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期631-634,共4页; 文摘目的探讨5羟色胺转运体(5-HTT)启动子区CpG岛甲基化水平与精神分裂症的相关性。方法纳入符合美国精神障碍诊断与统计手册第Ⅳ版(DSM-IV)诊断标准的首发精神分裂症患者30例和正常对照30名,采用亚硫酸氢钠测序法测定受试者的5-HTT基因启动子区CpG岛甲基化水平。结果患者组和正常对照组间5-HTT基因启动子区CpG岛甲基化水平的差异无统计学意义(2=0.25,P>0.05);以两组的平均年龄27岁分层后再比较,患者组和对照组相同年龄段的5-HTT基因启动子区CpG岛甲基化水平差异亦无统计学意义(P>0.05),按性别分组后比较,患者组和对照组间的差异也无统计学意义(P>0.05)。结论本研究未发现5-HTT基因启动子区CpG岛甲基化水平与精神分裂症相关。; 关键词 DNA甲基化精神分裂症 5-羟色胺转运体亚硫酸氢钠测序法; 分类号 R749.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名5-杂氮胞苷对成人T淋巴细胞穿孔素基因启动子区域甲基化水平的影响被引量：2: 5; 作者肖嵘丁艳陆前进李亚萍李勇坚杨心洁苏玉文梁云生张桂英文海泉; 机构中南大学湘雅二医院皮肤科中南大学湘雅二医院医学试验中心; 出处《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期843-847,共5页; 基金国家自然科学基金(30371297); 文摘目的:研究DNA低甲基化对穿孔素基因mRNA和蛋白表达的影响。方法:密度梯度离心分离正常成人的外周血淋巴细胞,磁珠分离CD4和CD8细胞后进行细胞培养,DNA甲基化抑制剂5-杂氮胞苷(5-azaC)处理。分别提取DNA、RNA和蛋白质。亚硫酸氢钠处理DNA,巢式PCR进行扩增、转化入大肠杆菌,挑取克隆测序。实时定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测穿孔素mRNA的表达,Western印迹检测穿孔素蛋白量的变化。结果:5-azaC处理后的CD4细胞和CD8细胞穿孔素mRNA和蛋白表达显著高于未处理的CD4和CD8细胞组(P<0.05)。测序结果显示5-azaC处理后的CD4细胞和CD8细胞DNA穿孔素启动子区域的甲基化水平降低,与未处理的CD4和CD8细胞组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:5-azaC处理后CD4和CD8细胞穿孔素mRNA的表达和蛋白的表达都有显著的增高,这种增高与CD4和CD8细胞穿孔素基因启动子区域出现的低甲基化有关。; 关键词穿孔素甲基化亚硫酸氢钠测序 5-杂氮胞苷; Keywords perforin methylation bisulfite genomic sequencing 5- azaC; 分类号 Q75 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名食管鳞状细胞癌survivin表达与其CpG岛甲基化的研究被引量：16: 6; 作者胡华梅杨晓亚熊刚王凯陈雪丹白云; 机构第三军医大学基础医学部医学遗传学教研室第三军医大学西南医院胸心外科; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期13-15,共3页; 基金国家自然科学基金(30872549) 重庆市自然科学基金(CSTC2009BA5013)~~; 文摘目的探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)肿瘤组织survivin基因的表达与其CpG岛甲基化状态的关系。方法采用RT-PCR的方法检测ESCC细胞株、ESCC肿瘤组织及对应的远癌组织中的sur-vivin基因mRNA的表达;采用亚硫酸氢钠修饰后测序法(BSP)检测survivin基因CpG岛甲基化状态。结果ESCC肿瘤组织survivin mRNA表达阳性率为65.5%,而绝大部分远癌组织表达阴性;20例survivin表达阳性的肿瘤组织、survivin表达阴性的远癌组织及5株ESCC细胞所扩增片段中的CpG位点均呈非甲基化状态。结论ESCC组织中survivin的表达与否与其CpG岛的甲基化状态无关,提示该区域的甲基化修饰未参与调控survivin基因的转录。; 关键词 survivin基因食管鳞状细胞癌甲基化亚硫酸氢钠修饰后测序法(BSP); Keywords survivin esophageal carcinoma bisulfite sequencing PCR; 分类号 R735.1 [医药卫生—肿瘤] R730.23 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态	汪艳杰龙鸿姚家玲	《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2011	6	在线阅读下载PDF 职称材料
2	改进的亚硫酸氢钠测序法检测HepG2 RASSF1A基因CpG岛甲基化状态	张莉君王先良孙晞徐顺清	《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2006	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	甲基化抑制剂5-杂氮胞苷对T淋巴细胞株程序性死亡受体-1基因启动子区域甲基化水平及其表达的影响	张旻肖新强梁云生彭敏源蒋永芳许允龚国忠	《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2011	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	5羟色胺转运体启动子区CpG岛甲基化与精神分裂症的相关研究	董燕程宇琪徐健许秀峰白燕	《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心	2010	3	在线阅读下载PDF 职称材料
5	5-杂氮胞苷对成人T淋巴细胞穿孔素基因启动子区域甲基化水平的影响	肖嵘丁艳陆前进李亚萍李勇坚杨心洁苏玉文梁云生张桂英文海泉	《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2006	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	食管鳞状细胞癌survivin表达与其CpG岛甲基化的研究	胡华梅杨晓亚熊刚王凯陈雪丹白云	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2010	16	在线阅读下载PDF 职称材料