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亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
王中娜
商海红
+12 位作者
陈婷婷
巩万奎
刘爱英
李俊文
石玉真
龚举武
葛群
王琳
李伟
李鹏涛
白志川
于杰
袁有禄
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期52-64,共13页
基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量...
基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异。利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长c DNA,将其命名为Ga NAC20、Ga NAC09和Ga NAC69,初步的生物信息学分析发现Ga NAC20和Ga NAC09基因均含有3个外显子和2个内含子,Ga NAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础。
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关键词
亚洲
棉
(
g
.arboreum
L.)
棉
纤维
NAC转录因子
序列分析
结构分析
表达模式
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职称材料
题名
亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
王中娜
商海红
陈婷婷
巩万奎
刘爱英
李俊文
石玉真
龚举武
葛群
王琳
李伟
李鹏涛
白志川
于杰
袁有禄
机构
西南大学园艺园林学院
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期52-64,共13页
基金
国家自然科学基金(31000732)
国家高技术研究发展计划(863计划)(2012AA101108)
+1 种基金
中国农业科学院科技创新工程
河南省基础与前沿技术研究计划(142300413202)
文摘
基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异。利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长c DNA,将其命名为Ga NAC20、Ga NAC09和Ga NAC69,初步的生物信息学分析发现Ga NAC20和Ga NAC09基因均含有3个外显子和2个内含子,Ga NAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础。
关键词
亚洲
棉
(
g
.arboreum
L.)
棉
纤维
NAC转录因子
序列分析
结构分析
表达模式
Keywords
g.
arboreum
L.
cotton fiber
NAC transcription factors
sequence analysis
structural analysis
expression patterns
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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被引量
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1
亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析
王中娜
商海红
陈婷婷
巩万奎
刘爱英
李俊文
石玉真
龚举武
葛群
王琳
李伟
李鹏涛
白志川
于杰
袁有禄
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016
4
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