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基于PCR检测和基因测序分析的鹿源副结核分枝杆菌鉴定及亚型分型 被引量:4
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作者 王娜 朱广艺 +4 位作者 艾克拜尔.热合曼 崔鑫 胡建军 张莹钰 张婉琪 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期85-90,共6页
目的快捷、准确地鉴定马鹿副结核分枝杆菌基因型和亚型,为马鹿副结核病防控工作提供理论依据。方法从疑似感染副结核病马鹿的病料样品中提取其DNA,参照副结核分枝杆菌插入序列IS900鉴定引物、亚型分型引物,PCR扩增、测序及GenBank中BLAS... 目的快捷、准确地鉴定马鹿副结核分枝杆菌基因型和亚型,为马鹿副结核病防控工作提供理论依据。方法从疑似感染副结核病马鹿的病料样品中提取其DNA,参照副结核分枝杆菌插入序列IS900鉴定引物、亚型分型引物,PCR扩增、测序及GenBank中BLAST比对。结果所测2份病例与副结核分枝杆菌核苷酸同源性均在99%以上,属于副结核分枝杆菌,采用亚型分型鉴定,属于Ⅱ型(牛型)副结核分枝杆菌。结论结合发病马鹿的临床症状、病理变化、抗酸性染色,证实该马鹿感染牛型副结核病。 展开更多
关键词 马鹿 副结核病 副结核分枝杆菌 亚型分型
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人乳头瘤病毒多基因亚型与病毒载量同步检测在子宫颈病理诊断中的应用 被引量:10
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作者 张丽芳 欧阳小娟 +3 位作者 余英豪 曲利娟 黄惠娟 王旭洲 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期350-353,共4页
目的探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)多亚型分型与病毒载量同步检测及DNA浓度在子宫颈癌筛查中的应用。方法收集子宫颈相关疾病1247例患者的临床病理资料,采用液基细胞学检查(liquid-based cytologic test,LCT)、HPV多亚... 目的探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)多亚型分型与病毒载量同步检测及DNA浓度在子宫颈癌筛查中的应用。方法收集子宫颈相关疾病1247例患者的临床病理资料,采用液基细胞学检查(liquid-based cytologic test,LCT)、HPV多亚型分型与病毒载量检测及组织学检查,分析子宫颈脱落细胞提取DNA浓度与HPV多亚型检测值及其病毒载量的相关性。结果LCT诊断无上皮内病变或恶性病变(negative for intraepithelial lesion or malignancy,NILM)[包含有意义不明确的非典型鳞状细胞(atypical squamous cells of undetermined significance,ASC-US)和念珠菌/滴虫感染]878例(70.40%);炎性抹片中有ASC-US,类似湿疣病变175例(14.03%);低级别鳞状上皮内病变(low-grade squamous intraepithelial lesion,LSIL)/湿疣病变126例(10.10%);高级别鳞状上皮内病变(high-grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)/不排除鳞状细胞癌68例(5.45%),其阳性率随病变程度增加而升高;LCT提示炎性抹片中有ASC-US,类似湿疣病变、LSIL/湿疣病变及HSIL/不排除鳞状细胞癌的369例患者用三种方法检测,LCT联合HPV多亚型分型与病毒载量检测共同阳性244例,符合率为66.12%(244/369);LCT联合HPV多亚型分型与病毒载量检测方法诊断炎性抹片中有ASC-US、LISL/湿疣病变及以上病变与组织学结果比较,符合率96.69%(146/151),低于HPV多亚型分型与病毒载量检测与LCT结果的阳性符合率98.01%(148/151),两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论LCT与HPV多亚型分型与病毒载量检测联合应用及控制其DNA检测浓度,可提高子宫颈癌及癌前病变筛查的准确率,为诊治提供可靠依据。 展开更多
关键词 子宫颈病变 液基细胞 HPV 病毒多亚型分型与病毒载量检测 DNA浓度控制
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陕西扶风某生猪养殖场肠球菌分型与毒力基因检测 被引量:2
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作者 廉鲁昕 牛沁雅 +5 位作者 曹晨阳 盛焕精 李伟 施春雷 史贤明 杨保伟 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2021年第4期10-18,共9页
[目的]分析分离自陕西扶风某生猪养殖场的肠球菌的亚型及毒力基因携带情况,为保障猪肉食品安全和临床感染治疗提供依据。[方法]采用PCR方法,对从陕西省扶风县某养殖场生猪鼻腔、粪便及其养殖场环境样品中分离到的87株肠球菌进行粪肠球菌... [目的]分析分离自陕西扶风某生猪养殖场的肠球菌的亚型及毒力基因携带情况,为保障猪肉食品安全和临床感染治疗提供依据。[方法]采用PCR方法,对从陕西省扶风县某养殖场生猪鼻腔、粪便及其养殖场环境样品中分离到的87株肠球菌进行粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum)特异性基因的扩增,根据凝胶成像中条带位置对其进行分型,检测其ace、cylA、cylB、cylM、cylL1、efaA、esp、gelE、AS、asal和hyl等11种毒力基因的携带情况。[结果]87株肠球菌中,粪肠球菌、屎肠球菌、鸡肠球菌和其他类型肠球菌(Other Enterococcus)的检出率分别为57.5%,10.3%,4.6%和27.6%;5种毒力基因asal、gelE、cylL1、ace和esp的平均检出率分别为50.6%,27.6%,19.5%,18.4%和1.2%,在猪舍地面菌株中均有检出。粪肠球菌中的asal检出率显著高于其他4种毒力基因(P<0.05),各毒力基因在未定型的其他亚型肠球菌中的检出率无显著差异(P>0.05)。在生猪育肥前期和后期,所有源菌株中毒力基因ace、cylL1、esp、gelE和asal的总检出率分别为93.7%和6.3%,82.3%和17.7%,100.0%和0%,75.0%和25.0%及84.1%和15.9%。[结论]扶风县某生猪养殖场中流行的肠球菌主要为粪肠球菌,其次为屎肠球菌和鸡肠球菌。不同来源菌株中毒力基因检出率不同,生猪育肥后期菌株中各毒力基因的检出率均有所降低。 展开更多
关键词 生猪养殖场 肠球菌 亚型分型 毒力基因
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新疆奶牛副结核分枝杆菌的分离鉴定 被引量:15
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作者 吴建勇 李建军 +5 位作者 王登峰 杨学云 王蒴 刘丽娅 季新成 王治才 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期250-252,共3页
为进一步确定新疆某规模化牛场疑似奶牛副结核病病原,本研究从PCR检测阳性牛粪便样本中共分离获得4株细菌,对其进行菌落形态观察、抗酸染色镜检以及16S r RNA、IS900特异性基因及亚型分型基因的扩增、序列测定与分析。结果显示,所分离的... 为进一步确定新疆某规模化牛场疑似奶牛副结核病病原,本研究从PCR检测阳性牛粪便样本中共分离获得4株细菌,对其进行菌落形态观察、抗酸染色镜检以及16S r RNA、IS900特异性基因及亚型分型基因的扩增、序列测定与分析。结果显示,所分离的4株细菌为抗酸染色阳性菌,对其IS900基因及亚型分型基因检测均为阳性,它们的16S r RNA、IS900基因及亚型分型基因之间同源性为100%,与Gen Bank中登录的副结核分支杆菌序列同源性在99%以上,从而确定所分离的4株菌株均为Ⅱ型(牛型)副结核分枝杆菌。 展开更多
关键词 副结核分枝杆菌 分离鉴定 亚型分型 奶牛
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