-
题名距离约束和二面角优化的蛋白质结构预测方法
- 1
-
-
作者
李亭
刘俊
周晓根
张贵军
-
机构
浙江工业大学信息工程学院
密歇根大学计算医学与生物信息学系
-
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2022年第1期203-209,共7页
-
基金
国家自然科学基金项目(61773346)资助
浙江省自然科学基金重点项目(LZ20F030002)资助
浙江省教育厅一般科研项目(工程硕士专项)(Y201941849)资助。
-
文摘
预测蛋白质三维结构对了解其生物功能、疾病发病机理研究、药物研发等具有重大意义.为了提高蛋白质结构预测的精度,提出了一种基于距离约束和二面角优化的蛋白质结构预测方法(Distance Constraint and Dihedral Angle Optimized Protein Structure Prediction Method, DCDA).首先,对预测的残基间距离分布图进行筛选,进而构建基于残基间距离分布的构象评估模型,指导构象选择;然后,在片段组装大范围搜索构象空间的基础上,利用基于二面角差分进化采样策略增强结构灵活的Loop区域采样,进一步提高拓扑结构的精度,增强近天然态构象采样能力.在15个测试蛋白的预测结果表明,DCDA能够达到较高的预测精度,是一种有效的蛋白质结构预测方法.
-
关键词
蛋白质结构预测
距离约束
二面角优化
进化算法
片段组装
-
Keywords
protein structure prediction
distance constraint
dihedral angle optimization
evolutionary algorithm
fragment assembly
-
分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
-
