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基于Web信息自动获取构建生物信息二级数据库被引量：8: 1; 作者王攀鲁强 +2 位作者曾绍群赵元弟骆清铭《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2004年第5期28-31,共4页; 提出并实现了一种具有较高自动化程度的生物信息二级数据库构建方法。其中，通过代理程序自动获取Web信息，实现数据库的数据收集和自动更新；采用XML描述核酸和蛋白质数据，方便对语义的机器解析。; 关键词 Web 生物信息学二级数据库代理程序 XML 数据收集; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于Web视图模型构建生物信息二级数据库被引量：2: 2; 作者陆枫卢正鼎肖奕《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2006年第3期492-496,共5页; 提出采用带根连通有向图来描述生物信息二级数据库的Web视图模型,以结合生物信息背景知识设计特定的生物信息Web视图及其间的相关关系.通过常量、静态和动态三类视图构成的Web视图模型解决了生物信息计算与数据资源共享的统一概念抽象.... 展开更多; 关键词生物信息二级数据库 WEB视图带根连通有向图对象视图; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于XML构建生物信息二级数据库被引量：1: 3; 作者王攀王敏《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期281-285,共5页; 提出并实现了一种生物信息二级数据库的构建方法。该方法采用NCBI维护的一级数据库作为核酸和蛋白质序列数据来源，以Oraele9i作为后台软件，所有的应用程序基于Java开发。通过代理程序自动获取Web数据，并以XML作为中间格式保存，然后... 展开更多; 关键词生物信息学二级数据库可扩展标记语言; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于拟比对CNN方法的人类p53癌症基因二级数据库构建及分析被引量：2: 4; 作者王丹丹李晨鸿 +2 位作者徐海阳蔡蓉朱平《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期15-20,共6页; 以NCBI维护的一级数据库为数据源建立人类癌症p53核苷酸序列二级数据库,该数据库设计主要包括4个方面:癌症信息、p53序列信息、样本信息和参考文献信息。以XML格式为中间格式保存一级数据库数据,并通过解析提交到二级数据库,初步实现数... 展开更多; 关键词二级数据库癌症 p53基因序列细胞神经网络序列比对; 在线阅读下载PDF 职称材料

致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建被引量：1: 5; 作者许三岗庄永龙 +3 位作者郝志勇单广良杨啸林王恒《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期882-888,共7页; 为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fis... 展开更多; 关键词疟原虫功能注释二级数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

数据库建设:教材研究的一项基础工程——以教育部重点课题“国外中小学教材有关中国内容的研究”为例: 6; 作者韦志榕任长松丁朝蓬《课程．教材．教法》 CSSCI 北大核心 2013年第4期14-19,共6页; 古今中外的教材卷帙浩繁,进行教材研究是一项浩大的工程,将教材碎片化并加以编码而形成的数据库为教材研究增加了可检索性、客观性和可积累性。数据库建设的确艰苦繁重,但以数据库为依据开展教材研究,可以提高教材研究的科学性水平。数... 展开更多; 关键词教材研究教材数据基础数据库二级数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于多层结构模型的生物信息分析平台研究被引量：2: 7; 作者赵友杰张剑峰 +1 位作者曹永忠陆王红《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2007年第11期55-56,59,共3页; 针对生物信息分析平台的构建,给出一种复合C/S、B/S的多层体系结构模型——BIOCMSM,并以构建新城疫病毒(NDV)生物信息分析平台为例,研究了该多层结构模型的实现过程。实验证明,BIOCMSM较好地解决了生物数据更新、数据集成、应用集成等... 展开更多; 关键词二级数据库多层体系结构代理程序数据处理层; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于Web信息自动获取构建生物信息二级数据库被引量：8: 1; 作者王攀鲁强曾绍群赵元弟骆清铭; 机构华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室武汉; 出处《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2004年第5期28-31,共4页; 文摘提出并实现了一种具有较高自动化程度的生物信息二级数据库构建方法。其中，通过代理程序自动获取Web信息，实现数据库的数据收集和自动更新；采用XML描述核酸和蛋白质数据，方便对语义的机器解析。; 关键词 Web 生物信息学二级数据库代理程序 XML 数据收集; 分类号 Q-33 [生物学] TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于Web视图模型构建生物信息二级数据库被引量：2: 2; 作者陆枫卢正鼎肖奕; 机构华中科技大学计算机学院华中科技大学物理系; 出处《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2006年第3期492-496,共5页; 基金国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2001AA231071)资助国家自然科学基金项目(30370354)资助.; 文摘提出采用带根连通有向图来描述生物信息二级数据库的Web视图模型,以结合生物信息背景知识设计特定的生物信息Web视图及其间的相关关系.通过常量、静态和动态三类视图构成的Web视图模型解决了生物信息计算与数据资源共享的统一概念抽象.据此构建的硒蛋白相关生物信息二级数据库不仅可提供常规的数据管理和发布服务,并且将各类基因序列、蛋白质序列等生物信息数据的发布、蛋白质结构观察等Web计算有机地联系起来,符合分子生物学中信息流的观点.; 关键词生物信息二级数据库 WEB视图带根连通有向图对象视图; Keywords bioinformatics secondary database Web view rooted connected directed graph object view; 分类号 TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于XML构建生物信息二级数据库被引量：1: 3; 作者王攀王敏; 机构中南民族大学电子信息工程学院; 出处《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期281-285,共5页; 文摘提出并实现了一种生物信息二级数据库的构建方法。该方法采用NCBI维护的一级数据库作为核酸和蛋白质序列数据来源，以Oraele9i作为后台软件，所有的应用程序基于Java开发。通过代理程序自动获取Web数据，并以XML作为中间格式保存，然后通过解析提交到二级数据库中，同时转换成便于Web发布的HTML格式。该方法既方便对语义的机器解析，又有效地保证入库信息的完整性，显著提高了二级数据库的开发效率。; 关键词生物信息学二级数据库可扩展标记语言; Keywords bioinformatics, secondary database, XML; 分类号 TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论] S435.111.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于拟比对CNN方法的人类p53癌症基因二级数据库构建及分析被引量：2: 4; 作者王丹丹李晨鸿徐海阳蔡蓉朱平; 机构江南大学理学院; 出处《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期15-20,共6页; 基金国家自然科学基金项目(11271163); 文摘以NCBI维护的一级数据库为数据源建立人类癌症p53核苷酸序列二级数据库,该数据库设计主要包括4个方面:癌症信息、p53序列信息、样本信息和参考文献信息。以XML格式为中间格式保存一级数据库数据,并通过解析提交到二级数据库,初步实现数据的检索、链接和统计分析等功能。本文提出一种拟比对CNN方法对p53癌症基因序列进行比对分析,通过改善传统CNN相似度评估公式,增强两序列全局比对相似度的敏感性和可靠性。结果表明,将改进的序列比对算法应用于乳腺癌和非小细胞肺癌p53外显子基因序列比对,发现外显子5突变后序列比对结果存在较大差异,可以作为区别这两种癌症的参考。此外,通过将一级数据库以XML形式转化成二级数据库,实现了网络数据与本地数据的动态交换。; 关键词二级数据库癌症 p53基因序列细胞神经网络序列比对; Keywords secondary database cancer p53 gene sequence cellular neural network sequence alignment; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建被引量：1: 5; 作者许三岗庄永龙郝志勇单广良杨啸林王恒; 机构中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院; 出处《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期882-888,共7页; 基金科技部国家科技基础条件平台科学数据共享工程重大项目基础医学科学数据中心(2005DKA32402); 文摘为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher's精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述。致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pathway及蛋白质相互作用注释信息以图形化界面直观显示。该数据库为疟原虫致病分子机制研究提供良好的高通量数据分析工具,可有效促进疟原虫基因功能、信号通路及疟疾疫苗抗原筛选等方面的研究。; 关键词疟原虫功能注释二级数据库; Keywords plasmodium molecular functional annotation secondary database; 分类号 R318 [医药卫生—生物医学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名数据库建设:教材研究的一项基础工程——以教育部重点课题“国外中小学教材有关中国内容的研究”为例: 6; 作者韦志榕任长松丁朝蓬; 机构人民教育出版社; 出处《课程．教材．教法》 CSSCI 北大核心 2013年第4期14-19,共6页; 基金全国教育科学"十一五"规划2007年度教育部重点课题"国外中小学教材有关中国内容的研究"(课题批准号:DHA070163 课题负责人:韦志榕)的研究成果之一; 文摘古今中外的教材卷帙浩繁,进行教材研究是一项浩大的工程,将教材碎片化并加以编码而形成的数据库为教材研究增加了可检索性、客观性和可积累性。数据库建设的确艰苦繁重,但以数据库为依据开展教材研究,可以提高教材研究的科学性水平。数据的来源、数据的切分与编码、基础数据库的建设以及二级数据库中主题的建构均是教材数据库建设中的关键问题。; 关键词教材研究教材数据基础数据库二级数据库; Keywords textbook research textbook data basic database secondary database; 分类号 G423.3 [文化科学—课程与教学论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于多层结构模型的生物信息分析平台研究被引量：2: 7; 作者赵友杰张剑峰曹永忠陆王红; 机构扬州大学信息工程学院扬州大学科研处; 出处《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2007年第11期55-56,59,共3页; 基金国家科技部资助项目江苏省动物预防医学重点实验室开放课题资助项目(K04005); 文摘针对生物信息分析平台的构建,给出一种复合C/S、B/S的多层体系结构模型——BIOCMSM,并以构建新城疫病毒(NDV)生物信息分析平台为例,研究了该多层结构模型的实现过程。实验证明,BIOCMSM较好地解决了生物数据更新、数据集成、应用集成等问题。; 关键词二级数据库多层体系结构代理程序数据处理层; Keywords secondary database multi-tier architecture agent program data process layer; 分类号 TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于Web信息自动获取构建生物信息二级数据库	王攀鲁强曾绍群赵元弟骆清铭	《高技术通讯》 EI CAS CSCD	2004	8	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于Web视图模型构建生物信息二级数据库	陆枫卢正鼎肖奕	《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心	2006	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于XML构建生物信息二级数据库	王攀王敏	《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心	2006	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于拟比对CNN方法的人类p53癌症基因二级数据库构建及分析	王丹丹李晨鸿徐海阳蔡蓉朱平	《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建	许三岗庄永龙郝志勇单广良杨啸林王恒	《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	数据库建设:教材研究的一项基础工程——以教育部重点课题“国外中小学教材有关中国内容的研究”为例	韦志榕任长松丁朝蓬	《课程．教材．教法》 CSSCI 北大核心	2013	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	基于多层结构模型的生物信息分析平台研究	赵友杰张剑峰曹永忠陆王红	《计算机应用研究》 CSCD 北大核心	2007	2	在线阅读下载PDF 职称材料