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题名二甲烯丙基色氨酸合成酶的生物信息学分析
被引量：1
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作者
蔡垚
李朝晖
虞蔚岩
任源浩
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机构
南京晓庄学院生物化工与环境工程学院
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出处
《湖北农业科学》
2015年第13期3273-3279,共7页
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基金
江苏省生态学重点学科项目
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文摘
以二甲烯丙基色氨酸合成酶(DMATS)为研究对象,通过生物信息学方法共检索到37种微生物中的77条DMATS蛋白质序列。使用MEGA v4.0软件构建DMATS系统进化树发现,这些同源序列可分为两大簇,在第一簇中全为真菌的聚类,而第二簇中是细菌和真菌的聚类,初步分析可能是由于细菌和真菌的进化速度不同或DMATS基因是一个独立复制事件。在进行DMATS的信号肽结构预测时发现,只有Ajellomyces capsulata的DMATS(登录号:C6HC16)含有信号肽结构,由此可知,Ajellomyces capsulata(C6HC16)的DMATS可能是分泌蛋白质。通过使用MEME v4.9进行分析,最终得到了7条保守的motifs序列,这些motifs可能对DMATS发挥功能具有重要作用。
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关键词
二甲烯丙基色氨酸合成酶(dmats)
系统发育
MOTIF
生物信息学
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Keywords
dimethylallyl tryptophan synthetase （dmats）
phylogenetic
motif
bioinformatics
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分类号
Q559
[生物学—生物化学]
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