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题名牛乳腺EST分析和牛基因索引功能的注释
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作者
TedS Sonstegard
姚平
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
2003年第1期55-55,共1页
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文摘
乳腺功能基因组学研究需要收集一些合适的c DNA序列来对各种亚细胞不同发育和运作阶段的基因表达形式进行评估。为了更好的捕捉基因表达的范围 ,我们用混合的牛乳腺细胞建立了 1个标准化的 c DNA文库 ,产生了 2 3 2 0 2个 EST,存放在基因库中。这些在牛基因索引中带有序列的 EST集形成当前 2 3 883个试验性分析序列中的 5 75 1个。 5 75 1个中的 87%仅含有 1～ 3个乳腺来源 EST。相反 ,1 8%的乳腺 EST有 1 2个基因与 TC序列相似。这些结果说明标准化文库仅有部分作用。因为EST中 ,能在泌乳过程中大量转录的基因的减少可能是由于合并引起的。为了更好的评价乳腺文库中的新内容 ,并把它们增加到现存的注释中 (包括牛序列元件、基因一致性序列和人类基因组序列 ) ,我们对人和鼠基因诱变和在 TOGA的基因非线性化进行测试。并把其结果增加到现有 Bt GI注释中。 3 5 0 0 0多个牛元件明显超过了人类基因组序列 ,而且一些与人类表达序列相关的排列 (3 %)的位置是独立的。由于 3 44 5 TC序列与任何数据无明显相似性 ,代表这些元件中的 2 3种乳腺来源 c DNA克隆被进一步进行分析用于表达和新异。其中仅有一个克隆符合标准 ,这个相应基因是一个分化的异端或表达对牛来说是特异的。结果说明 。
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关键词
牛乳腺EST分析
CDNA文库
乳腺功能基因组学
基因表达
反刍动物
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分类号
S823.2
[农业科学—畜牧学]
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