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白菜型油菜分枝角度主基因+多基因混合遗传模型分析
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作者 裴大妹 赵洪平 +3 位作者 王龙 李华欣 赵志 肖麓 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第4期745-753,共9页
分枝角度是决定油菜株型的重要性状之一,与油菜产量密切相关。为揭示白菜型油菜(Brassica rapa L.)分枝角度的遗传规律,本研究选用青海大黄为母本,浩油11和No.952为父本分别配置杂交组合,采用主基因+多基因混合遗传模型分析的方法对2个... 分枝角度是决定油菜株型的重要性状之一,与油菜产量密切相关。为揭示白菜型油菜(Brassica rapa L.)分枝角度的遗传规律,本研究选用青海大黄为母本,浩油11和No.952为父本分别配置杂交组合,采用主基因+多基因混合遗传模型分析的方法对2个组合各世代(P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2))单株的顶端连续3个分枝的夹角进行遗传分析。结果表明:西宁组合Ⅰ分枝角度的最适模型为2MG-EAD模型(2对完全显性主基因模型),主基因遗传率为84.61%,组合Ⅱ分枝角度的最适模型为2MG-A(2对加性主基因模型),主基因遗传率为80.71%;云南组合Ⅰ的最适模型为2MG-EA(2对等加性主基因模型),组合Ⅱ的最适模型为2MG-EAD(2对完全显性主基因模型),主基因遗传率均为86.05%。以上结果表明,白菜型油菜分枝角度明显受2对主基因遗传因素控制,且主基因间具有加性效应或显性效应;2个组合具有较高的主基因遗传力,说明油菜在分枝角度调控过程中,受多基因与环境因素影响较小,所以应在早期群体里进行选择。同时,这些结果可以为理想株型的构建和后续分枝角度数量性状基因座(QTL)定位和育种提供理论指导。 展开更多
关键词 白菜型油菜 遗传效应 基因+多基因 分枝角度 基因遗传
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花生熟性性状的主基因+多基因遗传模型分析
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作者 吴炫漫 吕建伟 +6 位作者 成良强 胡廷会 饶庆琳 姜敏 王金花 王军 彭忠华 《花生学报》 北大核心 2025年第4期368-373,共6页
花生的熟性性状在进一步挖掘我国高海拔、高纬度区域花生扩种潜力中发挥着无可替代的生产价值,其遗传机制解析对于深化花生熟性遗传改良具有重要意义。本研究以早熟品种黔花生五号与晚熟品种关岭花生两个亲本及其杂交构建的包含167个家... 花生的熟性性状在进一步挖掘我国高海拔、高纬度区域花生扩种潜力中发挥着无可替代的生产价值,其遗传机制解析对于深化花生熟性遗传改良具有重要意义。本研究以早熟品种黔花生五号与晚熟品种关岭花生两个亲本及其杂交构建的包含167个家系的F_(5)重组自交系(RIL)群体为研究材料,调查记载播种至始花天数、播种至成熟天数及始花至成熟天数等熟性性状表型值,利用描述性统计、相关性分析及主基因+多基因混合遗传模型等方法分析性状表型变异、性状间相互关系以及性状遗传规律。相关性分析结果显示,播种至始花天数与始花至成熟天数呈极显著负相关(r=-0.688),表明开花晚的植株经历了较短的荚果充实和成熟阶段。主基因+多基因遗传模型分析结果表明,播种至始花天数的最优模型为4MG-AI(4对主基因加性-上位性),主基因遗传率为73.05%;播种至成熟天数的最优模型为2MG-AI(2对主基因加性-上位性),主基因遗传率为64.65%;始花至成熟天数的最优模型为2MG-EA(2对主基因等加性),主基因遗传率为64.97%,以上性状的表达均在不同程度上受到了环境因素的影响。本研究初步探明了熟性性状的相互关系及遗传规律,为今后开展花生熟性性状改良与遗传解析提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 花生 熟性 基因 遗传模型
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2021—2023年安徽省肉羊主产区羊口疮病毒感染情况调查及流行毒株B2L和F1L基因的遗传演化分析
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作者 张留君 陈佳乐 +7 位作者 冯星 陈威振 邓亚飞 王波 左国林 贺绍君 辛洪雷 刘德义 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期697-703,共7页
目的为明确安徽省肉羊主产区羊口疮病毒(ORFV)感染情况及流行毒株的遗传演变特征。方法使用荧光定量PCR(qPCR)对2021—2023年从安徽省主要肉羊养殖地市采集的303份临床样本进行ORFV检测;采用常规PCR扩增阳性样本中ORFV的全长B2L和F1L基... 目的为明确安徽省肉羊主产区羊口疮病毒(ORFV)感染情况及流行毒株的遗传演变特征。方法使用荧光定量PCR(qPCR)对2021—2023年从安徽省主要肉羊养殖地市采集的303份临床样本进行ORFV检测;采用常规PCR扩增阳性样本中ORFV的全长B2L和F1L基因,并通过测序后进行遗传演化分析。结果qPCR检测显示,本次临床样本ORFV总阳性率为48.8%(148/303)。序列多重比对分析显示,本次56株样本毒株B2L基因间DNA和氨基酸序列相似性分别为96.7%~100.0%和97.4%~100.0%。同时,本次56株样本毒株F1L基因间DNA和氨基酸序列相似性分别为95.1%~100.0%和95.0%~100.0%。根据B2L基因DNA序列构建的遗传进化树结果显示,山羊源样本毒株FY-TYA与甘肃人源参考毒株Gansu位于同一小分支,而山羊源样本毒株FY-XQC与国内疫苗参考毒株China Vaccine和国内山羊源参考毒株OV-HLJ-04位于同一小分支。同时,根据F1L基因DNA序列构建的遗传进化树显示,山羊源样本毒株FY-XQA和FY-XQC均与新疆绵羊源参考毒株Xinjiang位于同一小分支。结论安徽省主要肉羊养殖地区ORFV感染较为普遍,且当前流行毒株B2L和F1L基因DNA及氨基酸序列均存在不同程度的遗传变异,其中F1L基因变异程度较大。此外,部分山羊源样本毒株与人源、疫苗及绵羊源参考毒株亲缘关系较近。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 B2L基因 F1L基因 遗传演化分析
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薄皮甜瓜茎粗和节间长性状主基因+多基因遗传分析
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作者 陈英达 孙浩 +6 位作者 于文慧 刘瑞梅 荣维瑞 韩靖漪 潘玉朋 刘振宁 张宁 《江西农业大学学报》 北大核心 2025年第4期922-931,共10页
【目的】旨在探究薄皮甜瓜茎粗和节间长性状的遗传基础,为甜瓜茎粗和节间长性状的遗传改良提供理论指导,为培育甜瓜理想株型品种提供理论依据。【方法】以薄皮甜瓜高代自交系M125和M30为试验材料,构建六世代群体,利用遗传模型分析软件... 【目的】旨在探究薄皮甜瓜茎粗和节间长性状的遗传基础,为甜瓜茎粗和节间长性状的遗传改良提供理论指导,为培育甜瓜理想株型品种提供理论依据。【方法】以薄皮甜瓜高代自交系M125和M30为试验材料,构建六世代群体,利用遗传模型分析软件包对茎粗及节间长进行遗传模型的分析,并计算24种模型的极大似然函数值(MLV)和赤池信息量(AIC),采用AIC最小原则进行模型初选,各性状分别选择3个模型作为备选模型。对备选模型进行适合性检验,选取差异显著量最少的备选模型作为最优模型,并计算出最优模型的一阶和二阶遗传参数。【结果】统计分析表明,F_(1)植株茎粗及节间长均值均介于两亲本之间,且明显偏向于母本。由F2群体植株茎粗及节间长频次分布可知,2个性状均呈现连续变异,且为偏态分布。薄皮甜瓜植株茎粗符合2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因遗传模型,其一阶遗传参数表明,2对主基因的加性效应值均为1.51,第1对主基因的显性效应值为-0.39,第2对主基因的显性效应值为0.06,2对主基因的显性度(|h_(a)/d_(a)|、|h_(b)/d_(b)|)分别为0.26和0.04,表明2对主基因呈部分显性作用;2对主基因加性效应绝对值之和大于显性效应绝对值之和,表明甜瓜茎粗性状的遗传以加性正向效应为主,并具有增效作用。二阶遗传参数表明,F2群体的主基因遗传率为82.27%,多基因遗传率为3.21%,B_(1)和B_(2)的主基因遗传率分别为83.75%和52.13%,多基因遗传率分别为7.27%和0。节间长符合2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因遗传模型,其一阶遗传参数表明,2对主基因的加性效应值均为13.26,第1对主基因的显性效应值为-17.17,第2对主基因的显性效应值为4.38,2对主基因的显性度分别为1.29和0.33,表明第1对主基因呈超显性作用;第2对主基因呈部分显性作用,2对主基因加性效应绝对值之和大于显性效应绝对值之和,表明甜瓜茎节间长性状的遗传以加性正向效应为主,且加性效应强于显性效应。二阶遗传参数表明,F2群体的主基因遗传率为84.26%,多基因遗传率为8.93%,B_(1)和B_(2)的主基因遗传率分别为77.76%和89.99%,多基因遗传率分别为14.58%和0。【结论】薄皮甜瓜植株茎粗和节间长性状的主基因遗传率较高,且主基因的加性效应均强于显性效应。因此,甜瓜育种过程中对茎粗和节间长性状的选择适宜在早期世代进行。 展开更多
关键词 薄皮甜瓜 茎粗 节间长 数量性状 基因+多基因 遗传分析
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花生主要生化品质性状主基因+多基因混合遗传模型分析
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作者 樊美玉 王成永 +5 位作者 梁风建 李进 姜春姣 孙昊杰 张明君 王传堂 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第1期157-163,共7页
以普通油酸高油品种HFLS与高油酸品种(系)花育665、花育668和FB4为亲本配置杂交组合,通过数量性状主基因+多基因混合遗传模型方法分析4个组合F2代群体的花生含油量、蛋白质、脂肪酸含量等品质性状的遗传规律。结果显示,大部分组合的F2... 以普通油酸高油品种HFLS与高油酸品种(系)花育665、花育668和FB4为亲本配置杂交组合,通过数量性状主基因+多基因混合遗传模型方法分析4个组合F2代群体的花生含油量、蛋白质、脂肪酸含量等品质性状的遗传规律。结果显示,大部分组合的F2代群体在不同生化品质性状上均表现出广泛的遗传变异,其中含油量、蛋白质、长链饱和脂肪酸含量的变异系数较小,在4.1%~10.4%之间;油酸、棕榈酸、不饱和脂肪酸含量的变异系数在13.9%~36.6%之间,6个生化品质性状均呈连续分布,符合数量性状分布特征。经遗传分析可知,不同组合的F2代群体在不同生化品质性状上遗传模型不尽相同,但都由2对主基因控制,且含油量均表现为加性效应;组合C2108在含油量上,主基因遗传率最高,为97.42%;在蛋白质含量上,组合C2105、C2106、C2108的主基因遗传率较高,皆在90.56%以上;对于油酸、棕榈酸、长链饱和脂肪酸、不饱和脂肪酸含量,多数组合的F2代群体最适遗传模型为2MG-ADI,即2对主基因-加性-显性-上位性效应,表现为部分显性且主基因间均有互作,主基因遗传率在80.97%~97.22%之间。 展开更多
关键词 花生 基因+多基因 含油量 蛋白质 脂肪酸 遗传模型
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春玉米籽粒脱水速率主基因+多基因混合遗传模型分析
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作者 卢佳锋 曹凯 +7 位作者 周雅楠 曲隽永 陆明玥 芦春光 付新尧 黄洋 王诗瑶 包海柱 《安徽农业科学》 2025年第20期18-21,共4页
[目的]探究春玉米籽粒脱水速率的遗传效应。[方法]使用脱水速率差异大的2个品种NP118和MO17为亲本正反交构建的P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、B_(1)和B_(2)6个世代群体,通过主基因+多基因混合遗传模型分析方法,对籽粒脱水速率进行遗传模... [目的]探究春玉米籽粒脱水速率的遗传效应。[方法]使用脱水速率差异大的2个品种NP118和MO17为亲本正反交构建的P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、B_(1)和B_(2)6个世代群体,通过主基因+多基因混合遗传模型分析方法,对籽粒脱水速率进行遗传模型分析。[结果]正反交中F_(1)代平均脱水速率最快,F_(2)代群体均呈连续性的近似正态分布,符合数量性状的特征,春玉米籽粒脱水速率的最佳遗传模型是加性-显性-上位性(PG-ADI)多基因遗传模型,非加性效应起主要作用,在各分离世代稳定遗传,环境因素影响较小。[结论]该研究为进一步定位和挖掘控制春玉米籽粒脱水速率性状的关键基因,选育适宜机械化收获新品种奠定了重要理论基础。 展开更多
关键词 春玉米 籽粒脱水速率 六个世代 基因+多基因遗传分析
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4个水稻谷粒性状的主基因+多基因遗传分析
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作者 卢超 唐小美 +6 位作者 周娟 李柱 龚立华 鲁方华 彭元群 操成波 王中美 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第2期157-165,共9页
谷粒性状是决定水稻产量和米质的重要性状。为阐明水稻谷粒性状的遗传规律及创制长粒高产型水稻育种材料提供遗传信息,分别以复粒稻、老挝常规稻为母本,太空小农占2号、美香占2号和R3189为父本配制了复粒稻/太空小农占2号(C1)、复粒稻/... 谷粒性状是决定水稻产量和米质的重要性状。为阐明水稻谷粒性状的遗传规律及创制长粒高产型水稻育种材料提供遗传信息,分别以复粒稻、老挝常规稻为母本,太空小农占2号、美香占2号和R3189为父本配制了复粒稻/太空小农占2号(C1)、复粒稻/美香占2号(C2)、复粒稻/R3189(C3)和老挝常规稻/美香占2号(C4)4个不同类型的杂交组合,调查4个组合P_(1)、P_(2)、F_(1)和F_(2)群体粒长、粒宽、长宽比和千粒重4个谷粒相关性状,分析4个性状间的相关性,同时利用SEA软件包对4个谷粒性状进行主基因+多基因混合遗传分析。结果表明,水稻谷粒长宽比与粒长、粒宽间的相关性均达到极显著水平,分别表现出正相关和负相关,千粒重与粒长、粒宽间的相关性均为正向极显著相关,4个组合中表现一致;除C1、C3中的粒长和C4中的粒长、长宽比和千粒重表现出受1对主基因控制外,其余组合中的谷粒性状均表现出受2对主基因控制,但主基因间的作用方式不尽相同。4个组合的4个谷粒性状均表现为主基因遗传,可采用杂交、回交和复交的方法,对粒长、粒宽、长宽比和千粒重4个谷粒性状进行遗传改良。 展开更多
关键词 水稻 谷粒性状 基因+多基因模型 遗传分析
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上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒流行株HN基因遗传进化和生物信息学分析
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作者 刘健 周锦萍 +8 位作者 徐卫兵 白艺兰 杨显超 桂亚萍 夏琦琦 徐锋 沈莉萍 刘佩红 王建 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第11期5371-5380,共10页
【目的】了解上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1)流行株HN基因遗传进化情况,探讨PPMV-1免疫失败的原因,为研发PPMV-1新型疫苗和抗病毒药物提供技术支持。【方法】采集临床送检疑似PPMV-1感染鸽样品(脑、气管、肺脏、肝脏、胰腺和脾脏),应用... 【目的】了解上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1)流行株HN基因遗传进化情况,探讨PPMV-1免疫失败的原因,为研发PPMV-1新型疫苗和抗病毒药物提供技术支持。【方法】采集临床送检疑似PPMV-1感染鸽样品(脑、气管、肺脏、肝脏、胰腺和脾脏),应用RT-PCR方法进行PPMV-1鉴定,阳性样品进行HN基因测序和遗传进化分析,并通过生物信息学在线软件对HN蛋白结构功能进行分析。【结果】送检鸽鉴定为PPMV-1阳性,其HN基因全长为2002 bp,编码区全长1716 bp,编码571个氨基酸,与PPMV-1国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013核苷酸相似性最高,为99.8%,与新城疫(NDV)疫苗株La Sota和Mukteswar核苷酸相似性分别只有83.6%和85.5%。遗传进化分析显示,流行株属于NDV ClassⅡ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型,与NDV国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013和pigeon/Ningxia/2068/2016同处一个分支,与La Sota和Mukteswar处于不同分支。HN蛋白为亲水性蛋白,分子质量约为62.71 ku,理论等电点(pI)为7.88,半衰期为30 h,不稳定系数为30.44,脂肪系数为85.48;该蛋白主要分布在线粒体和细胞质中,无信号肽,含有1个跨膜结构、5个潜在的N-糖基化位点、105个O-糖基化位点、13个半胱氨酸残基和75个磷酸化位点。HN蛋白二级结构、三级结构预测以无规则卷曲占比最高,其次为β-折叠和α-螺旋;B细胞抗原表位预测显示,HN蛋白含有10个抗原表位(氨基酸长度≥7)。【结论】上海地区PPMV-1流行株属于NDV强毒株的ClassⅡ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型,其HN蛋白具有较好的抗原表位,可作为PPMV-1疫苗研制和抗病毒治疗的靶蛋白。本研究结果为PPMV-1 HN基因遗传进化、蛋白表达、新型疫苗研发和抗病毒药物的筛选等提供理论依据。 展开更多
关键词 鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1) HN基因 遗传进化分析 生物信息学分析
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小麦小旗叶突变性状基因定位与遗传分析
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作者 杨思杰 杜启迪 +6 位作者 柴守玺 熊宏春 谢永盾 赵林姝 古佳玉 郭会君 刘录祥 《作物学报》 北大核心 2025年第6期1548-1557,共10页
叶片形态作为株型结构的核心特征,对光合作用效率、作物产量及胁迫响应等具有重要影响。旗叶是小麦进行光合作用的重要功能器官,其光合效率直接影响小麦产量,深入挖掘旗叶发育调控基因有助于培育高产小麦品种。本研究以小麦品种京411为... 叶片形态作为株型结构的核心特征,对光合作用效率、作物产量及胁迫响应等具有重要影响。旗叶是小麦进行光合作用的重要功能器官,其光合效率直接影响小麦产量,深入挖掘旗叶发育调控基因有助于培育高产小麦品种。本研究以小麦品种京411为野生型,经诱变获得了表型稳定的小旗叶突变体je0261。该突变体表现旗叶变窄变短,旗叶叶长减小38.9%,叶宽减少29.3%,叶面积减小56.7%。根据突变体与野生型的F2和F3代表型数据分析表明,旗叶宽窄和长短性状分别受1对主效隐性基因控制。采用混合群体分离分析法(BSA),结合测序所得SNP位点,在7A染色体上开发了7个KASP标记,将控制叶长、叶宽的目标基因同时定位在7A染色体长臂1.18 cM遗传区段内,对应中国春参考基因组8.08 Mb的物理区间。2个基因之间的遗传距离为1.00 cM,推断是2个新的控制旗叶宽度和长度的主效基因。本研究所鉴定的小麦旗叶大小和宽窄调控区段有助于深入解析小麦旗叶叶面积形成的遗传基础,为进一步改良小麦叶型提供新基因源。 展开更多
关键词 小麦 旗叶叶长 旗叶叶宽 遗传分析 基因定位
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辣椒白粉病抗性主基因+多基因混合遗传分析 被引量:1
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作者 张涛 马正宝 +6 位作者 张茹 汪来田 王永富 黄立娟 郭娜纳 李伟 魏兵强 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1122-1130,共9页
辣椒白粉病是一种常见的真菌病害,该病严重影响辣椒生产。以辣椒白粉病高抗材料(NSR和NVD)为母本,高感材料(20c89、20c93)为父本,分别构建两组P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)四世代遗传群体(2021组和2022组),通过调查统计辣椒不同世代群体... 辣椒白粉病是一种常见的真菌病害,该病严重影响辣椒生产。以辣椒白粉病高抗材料(NSR和NVD)为母本,高感材料(20c89、20c93)为父本,分别构建两组P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)四世代遗传群体(2021组和2022组),通过调查统计辣椒不同世代群体内单株的白粉病病情指数,利用植物数量性状主基因+多基因混合遗传分析法对辣椒白粉病抗性进行遗传分析。结果表明:两组群体辣椒白粉病抗性遗传均受两对加性-显性上位性主基因+加性-显性多基因控制,并且基因遗传效应和遗传力等参数在两组群体中表现出较高的一致性。2021组第1对主基因加性效应和显性效应值分别为12.7065和-34.7107,第2对主基因加性效应和显性效应值分别为-9.1706和-16.9432,主基因遗传率为86.11%;2022组第1对主基因加性效应和显性效应值分别为20.0431和-18.0682,第2对主基因加性效应和显性效应值分别为-1.0668和-6.0904,主基因遗传率为97.16%。 展开更多
关键词 辣椒 白粉病 抗性 基因+多基因 遗传分析
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鸽圆环病毒全基因组测序及遗传进化分析
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作者 王仲浩 田野 +5 位作者 袁小远 李桂明 陈书民 刘明超 王传文 孟凯 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第11期5414-5421,共8页
【目的】了解华东部分地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)基因组特征及遗传变异规律。【方法】无菌采集58只病死鸽的肺脏、脾脏、肝脏组织,利用PCR扩增进行病原检测。对PiCV阳性样本通过PCR扩增病毒基因组全长并进行TA克隆... 【目的】了解华东部分地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)基因组特征及遗传变异规律。【方法】无菌采集58只病死鸽的肺脏、脾脏、肝脏组织,利用PCR扩增进行病原检测。对PiCV阳性样本通过PCR扩增病毒基因组全长并进行TA克隆。阳性质粒测序结果通过DNAStar和Mega 11.0软件进行全基因组序列拼接以及核苷酸、氨基酸序列比对,并构建系统进化树。利用RDP 5.42和Simplot 3.5.2软件对分离株进行重组分析并鉴定。【结果】PCR检测结果显示,58只病死鸽中检出30只PiCV阳性,且其他病毒未检出。测序结果显示,成功获得5株PiCV全基因组序列,分别命名为SD02、SD040、JS091、AH056和AH529,序列长度分别为2037、2034、2039、2039和2041 bp。相似性比对结果显示,5株PiCV分离株与国内外参考株核苷酸序列相似性为83.2%~100%,与国内的分离株亲缘关系更近。遗传进化分析结果显示,5株PiCV分离株属于不同亚型,分离株SD040、SD02、JZ091、AH056、AH529分别属于B、A、C、G和H亚型。氨基酸序列分析表明,5株PiCV分离株与标准株jz1相比,Cap蛋白氨基酸出现不同程度的突变、替换和缺失,Rep蛋白存在3个氨基酸位点缺失和1个氨基酸位点突变。重组分析表明,5株PiCV分离株有2个重组事件被鉴定,其中分离株AH056是由GX6株和JS2株重组产生,重组断点位于161 bp处。【结论】本研究分离获得5株不同亚型PiCV全基因组序列。病毒重组及关键蛋白突变为其多样性和复杂性的重要成因。本研究丰富了对PiCV基因组特征及遗传演化规律的认识,为华东地区PiCV的防控提供了重要参考依据。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒 基因组测序 遗传进化分析
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西葫芦种子无壳性状遗传分析及无壳基因Cphl初步定位
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作者 董晨晨 刘泽慧 +3 位作者 曹嫒婉 许小勇 雷逢进 刘庆华 《华北农学报》 北大核心 2025年第2期40-48,共9页
西葫芦的裸仁种子在籽用西葫芦的加工中具有很大的天然优势。为探究西葫芦种子无壳性状的遗传机制,以西葫芦高代自交系种子有壳17pu10(P_(1))和种子无壳17pu08(P_(2))为亲本,构建F1(P_(1)×P_(2))、F_(2)和BC_(1)群体,对后代群体的... 西葫芦的裸仁种子在籽用西葫芦的加工中具有很大的天然优势。为探究西葫芦种子无壳性状的遗传机制,以西葫芦高代自交系种子有壳17pu10(P_(1))和种子无壳17pu08(P_(2))为亲本,构建F1(P_(1)×P_(2))、F_(2)和BC_(1)群体,对后代群体的西葫芦种子性状进行鉴定。结果发现,后代群体的西葫芦有壳种子与无壳种子的数目比例符合3∶1分离比,表明西葫芦种子无壳性状受到单基因调控,且种子无壳基因表现为隐性。利用籽用西葫芦BC_(1)群体对无壳基因进行初步定位,结果表明,籽用西葫芦无壳基因定位于标记InDel3157329和InDel3724121之间,遗传距离分别为1.4,2.6 cM,该区间物理距离为0.6 Mb。对该区间内的24个基因进行注释和功能分析发现,有4个基因直接或间接参与细胞壁、纤维素和木质素的生物合成;进一步分析这4个基因表达量的差异,发现只有Cp4.1LG12g04350、Cp4.1LG12g04370在种子发育时期表达量存在显著差异。由此推测,Cp4.1LG12g04350或Cp4.1LG12g04370为控制无壳性状的候选基因。此外,还开发出与无壳基因连锁的InDel标记,可作为西葫芦无壳性状鉴定的标记,以加快优质西葫芦种子无壳品种的选育。 展开更多
关键词 西葫芦 无壳基因 遗传分析 基因定位 基因连锁 INDEL标记
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PKHD1基因变异致先天性肝内胆管扩张症一家系遗传学分析
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作者 刘谨 刘风勋 +2 位作者 袁媛 杨嫚 周炳喜 《郑州大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期433-435,共3页
目的:分析PKHD1基因变异致先天性肝内胆管扩张症一家系的临床表现及遗传学病因。方法:选取2019年4月就诊于河南省人民医院消化内科的一PKHD1基因变异致先天性肝内胆管扩张症的家系为研究对象。收集患儿及其父母的外周血样,采用全外显子... 目的:分析PKHD1基因变异致先天性肝内胆管扩张症一家系的临床表现及遗传学病因。方法:选取2019年4月就诊于河南省人民医院消化内科的一PKHD1基因变异致先天性肝内胆管扩张症的家系为研究对象。收集患儿及其父母的外周血样,采用全外显子组测序分析先证者致病基因,确定可疑变异后对家系成员行Sanger测序验证,并对候选变异进行致病性分析。结果与结论:患儿为14岁女性,临床表现为食管静脉曲张、消化道出血、肝硬化。全外显子组测序发现其携带PKHD1基因复合杂合变异c.4922A>T(p.D1641V)和c.6097A>G(p.R2033G),分别遗传自表型正常的母亲与父亲,均被评估为致病性变异,明确了先证者的遗传学病因。 展开更多
关键词 PKHD1基因 先天性肝内胆管扩张症 遗传分析
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陆地棉GhHB51基因克隆·生物信息学分析及遗传转化
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作者 黄秦 左东云 +4 位作者 王巧连 吕丽敏 程海亮 陈全家 宋国立 《安徽农业科学》 2025年第10期103-110,共8页
研究陆地棉GhHB51基因在生长发育中的潜在功能,培育转基因棉花,为后续深入研究GhHB51基因功能及筛选棉花优异新种质奠定基础。利用陆地棉遗传标准系“TM-1”克隆GhHB51基因,并进行生物信息学、转录组数据及组织特异性分析,构建基因编辑... 研究陆地棉GhHB51基因在生长发育中的潜在功能,培育转基因棉花,为后续深入研究GhHB51基因功能及筛选棉花优异新种质奠定基础。利用陆地棉遗传标准系“TM-1”克隆GhHB51基因,并进行生物信息学、转录组数据及组织特异性分析,构建基因编辑载体,利用农杆菌介导法转化棉花。该基因编码区长534 bp,编码177个氨基酸,含有Homedomain和HALZ结构域;启动子区内含有多个与逆境应答和生长发育相关的顺式调控元件,干旱胁迫下显著表达,构建基因编辑载体成功转化棉花,初步得到12株转基因植株。 展开更多
关键词 棉花 GhHB51基因 生物信息学分析 遗传转化
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基于全基因组关联分析和遗传多样性的大豆裂荚性状解析 被引量:1
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作者 宋英培 王灿 +3 位作者 周会汶 孔可可 许孟歌 王瑞凯 《生物技术通报》 北大核心 2025年第2期97-106,共10页
【目的】探究抗裂荚分子机制,挖掘抗裂荚大豆种质资源,可为揭示大豆裂荚性遗传和驯化机理、加速南方大豆抗裂荚新品种的选育提供依据。【方法】结合全基因组关联分析定位和野生栽培大豆群体遗传多样性分析,探寻大豆裂荚性相关基因。使用... 【目的】探究抗裂荚分子机制,挖掘抗裂荚大豆种质资源,可为揭示大豆裂荚性遗传和驯化机理、加速南方大豆抗裂荚新品种的选育提供依据。【方法】结合全基因组关联分析定位和野生栽培大豆群体遗传多样性分析,探寻大豆裂荚性相关基因。使用302份大豆材料进行2年表型测定,借助95744个单核苷酸多态性标记进行全基因组关联分析。使用包括1308份栽培大豆和203份野生大豆的重测序数据进行QTL区段序列的遗传多样性分析。【结果】通过全基因组关联分析检测到3个表型变异解释率大于10%的QTL位点,分别为qPdh-Chr08(Gm08:3048312)、qPdh-Chr15(Gm15:312814)和qPdh-Chr16(Gm16:29951529)。其中qPdh-Chr16是已知基因pdh1(Pod dehiscence habit 1)。结合野生和栽培大豆重测序数据发现,qPdh-Chr08和qPdh-Chr15内存在人工选择导致的群体分化序列,发现2个重要候选基因Glyma.08G038600和Glyma.15G003600。根据功能注释发现,这两个基因参与生长素和木质素的代谢。【结论】使用2年数据检测到大豆裂荚性2个新的QTL位点qPdh-Chr08和qPdh-Chr15,并在QTL区域内鉴定野生栽培大豆分化基因,最终筛选到2个重要候选基因。 展开更多
关键词 大豆 裂荚性 基因组关联分析 遗传多样性 作物驯化
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天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株ORF5基因的克隆及遗传变异分析
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作者 李文忠 荣新利 +4 位作者 刘野 吴庆东 张乐 孙英峰 于海 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期156-164,共9页
为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况,收集2021-2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果显示:PRRSV阳性样品总检出率为37.3%(78/209),并从阳性样本中选择15... 为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况,收集2021-2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果显示:PRRSV阳性样品总检出率为37.3%(78/209),并从阳性样本中选择15个不同地区来源具有代表性样品进行ORF5基因克隆序列。序列及遗传进化分析显示:该15株PRRSV毒株均属于美洲型,其中8条PRRSV毒株的ORF5基因与以HuN4为代表的类HP-PRRSV毒株同源性较高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为89.4%~97.3%和80.6%~95.5%,而与NADC30、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为77.1%~87.1%和77.1%~86.6%;6条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC30为代表的类NADC30毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为91.9%-92.7%和91.5%-93.0%,而与HuN4、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为83.6%-87.8%和79.6%~86.6%;1条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC34为代表的类NADC34毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性为96.4%和95.5%,而与NADC30、HuN4、VR2332等毒株的同源性为86.7%~89.9%和86.6%~92.0%。结果表明,2021-2022年天津地区以类HP-PRRSV、类NADC30 PRRSV为主要流行毒株,同时出现类NADC34毒株的流行,存在明显的遗传多样性。研究结果可为天津地区PRRS的防控提供理论依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒 ORF5基因 序列分析 遗传变异 同源性分析
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UMOD基因变异所致常染色体显性肾小管间质性肾病的遗传学分析
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作者 张营营 李楠楠 +3 位作者 卢敏 雷雨萌 张开倩 刘纪实 《中南大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期724-730,共7页
常染色体显性肾小管间质性肾病(autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease,ADTKD)是一种罕见的常染色体显性小管间质性遗传性疾病,表现为高尿酸血症、痛风、尿浓缩功能受损和进行性肾衰竭。该病主要由尿调素(uromodulin,UM... 常染色体显性肾小管间质性肾病(autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease,ADTKD)是一种罕见的常染色体显性小管间质性遗传性疾病,表现为高尿酸血症、痛风、尿浓缩功能受损和进行性肾衰竭。该病主要由尿调素(uromodulin,UMOD)基因变异引起。本文报告1个ADTKD家系,全外显子测序和Sanger测序鉴定先证者及其他患病亲属均携带UMOD基因错义变异c.761A>C(p.H254P)。美国医学遗传学和基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)变异致病性分级评估该变异为疑似致病。该变异导致编码蛋白质的氨基酸序列发生改变,可能导致UMOD蛋白错误折叠和细胞内运输受损。UMOD变异与ADTKD相关,基因检测可为ADTKD早期临床诊断和治疗提供依据,在诊断罕见肾病中具有重要意义。 展开更多
关键词 常染色体显性肾小管间质性肾病 UMOD基因 全外显子测序 错义变异 遗传分析
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对1例黄牛急性死亡病例的病原宏基因组检测及遗传进化分析
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作者 马烁 傅国璋 +4 位作者 沈雪鹰 孙兴南 韩永川 杜春红 童贻刚 《中国动物检疫》 2025年第10期36-41,共6页
为找出2023年3月—2024年3月云南省腾冲市黄牛急性死亡的病因,采集1例死亡病例的心、肺、脑等组织样品,在排除相关病原体感染后,进行病原宏基因组测序(mNGS),基于mNGS结果设计PCR扩增引物,通过PCR扩增获取病原全基因组序列,开展系统发... 为找出2023年3月—2024年3月云南省腾冲市黄牛急性死亡的病因,采集1例死亡病例的心、肺、脑等组织样品,在排除相关病原体感染后,进行病原宏基因组测序(mNGS),基于mNGS结果设计PCR扩增引物,通过PCR扩增获取病原全基因组序列,开展系统发育分析。结果显示:在组织样品中检测到牛腺病毒7型(BAdV-7)序列,经PCR扩增获得1条全长30006 bp的完整基因组序列(YN-BAdV7);该序列与2022年德国参考株(OM677816.1)、2021年美国参考株(MN901942.2)核苷酸序列相似性为99.6%,与欧美流行株聚于同一进化分支,明显区别于其他型腺病毒。结果表明,云南省腾冲市存在BAdV-7流行,流行毒株与欧美流行株存在紧密遗传关联,该病原很可能导致了当地黄牛的急性死亡。应进一步加强对该病毒的溯源调查及其感染的防控,降低养殖户损失。 展开更多
关键词 基因组学检测 牛腺病毒7型 遗传进化分析 黄牛
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花椰菜“坐球高度”性状的主基因+多基因遗传分析 被引量:3
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作者 蔡诗怡 虞慧芳 +4 位作者 王建升 祝彪 沈钰森 顾宏辉 盛小光 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期527-533,共7页
“坐球高度”是评价花椰菜品种是否适合机械化采收的重要农艺性状之一。为了解析花椰菜“坐球高度”性状的遗传规律,使用早熟、紧实型花椰菜F 7代自交系ZAASC4101与芥蓝F_(6)代自交系ZAASJ1401为亲本构建了包括P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_... “坐球高度”是评价花椰菜品种是否适合机械化采收的重要农艺性状之一。为了解析花椰菜“坐球高度”性状的遗传规律,使用早熟、紧实型花椰菜F 7代自交系ZAASC4101与芥蓝F_(6)代自交系ZAASJ1401为亲本构建了包括P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、B_(1)、B_(2)的6个联合世代群体,利用主茎高度(六世代群体)和叶痕间距(F_(2)群体)两个指标来锚定“坐球高度”性状。研究结果表明,F_(2)群体中主茎高度与叶痕间距数值呈极显著相关(相关系数为0.652),并且这两个指标均为连续性的近似正态分布,符合数量遗传的特征;主茎高度的六世代群体遗传分析和叶痕间距的F_(2)群体遗传分析结果均表明,花椰菜“坐球高度”性状的最适遗传模型为:两对加性显性上位性主基因+加性显性上位性多基因遗传模型,表明该性状主要受两对主基因+多个微效基因的控制,并且遗传率达到97.84%。因此,可以利用连锁分子标记在早期世代对花椰菜“坐球高度”性状进行辅助选择和遗传改良。综上,本研究结果为进一步定位和挖掘控制花椰菜“坐球高度”性状的关键基因,最终利用生物技术手段育成适宜机械化采收的花椰菜新品种奠定了前期研究基础。 展开更多
关键词 花椰菜 坐球高度 六世代群体 基因+多基因遗传分析 数量性状
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2株新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及全基因组遗传进化分析
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作者 李长乐 姚鑫炎 +2 位作者 王明月 肖毅 张雪莲 《家畜生态学报》 北大核心 2025年第3期96-102,共7页
为了解广东地区鸭呼肠孤病毒的序列信息,对广东省佛山市和肇庆市疑似呼肠孤病毒感染的病鸭进行检测、分离、鉴定及全基因组测序分析。通过对疑似样本进行剖检发现,病鸭肝脏呈现不规则出血斑块,脾脏和法氏囊出现严重出血、坏死。使用实... 为了解广东地区鸭呼肠孤病毒的序列信息,对广东省佛山市和肇庆市疑似呼肠孤病毒感染的病鸭进行检测、分离、鉴定及全基因组测序分析。通过对疑似样本进行剖检发现,病鸭肝脏呈现不规则出血斑块,脾脏和法氏囊出现严重出血、坏死。使用实验室建立好的检测方法对其进行检测,并利用LMH细胞对新型鸭呼肠孤病毒(Novel Duck reovirus,NDRV)进行分离,同时对分离的毒株进行全基因测序及分析。结果显示,在第3代的LMH细胞上出现典型的细胞病变,经检测确定为NDRV。全长扩增显示,所分离的2株NDRV全长均为23419 bp,可分为10个片段,分别为L1~L3、M1~M3和S1~S4。核苷酸同源性与氨基酸同源性分析显示,与国内的NDRV同源性最高,与番鸭呼肠孤病毒(Muscovy Duck reovirus,MDRV)和禽呼肠孤病毒(Avain revirus,ARV)同源性较低。遗传进化关系显示,所分离的2株毒株的10个片段均分布于NDRV大分支,由此表明,分离的2株毒株均为NDRV。该研究丰富了NDRV的序列信息,为广东地区NDRV的防控及特异性生物制品的研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 新型鸭呼肠孤病毒 分离鉴定 基因组测序 遗传进化分析
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