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高原鼠兔肠道微生物中丰富及稀有类群的季节性特征
被引量:
2
1
作者
范超
张良志
+7 位作者
付海波
刘传发
李文靖
张贺
唐显江
程琪
沈文娟
张堰铭
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期617-630,共14页
气候及食物是驱动植食性小哺乳动物肠道菌群产生季节性变化的重要因素。然而,此类研究很少涉及肠道丰富及稀有微生物类群。本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,通过16S rRNA基因测序和分析,探讨丰富及稀有肠道微生物类群的结构...
气候及食物是驱动植食性小哺乳动物肠道菌群产生季节性变化的重要因素。然而,此类研究很少涉及肠道丰富及稀有微生物类群。本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,通过16S rRNA基因测序和分析,探讨丰富及稀有肠道微生物类群的结构组成、多样性指数及功能在春、夏、秋、冬四季的变化特征。结果显示,丰富类群对菌群主要门和功能的季节性变异贡献大于稀有类群,稀有类群对菌群OTU和alpha多样性的变异贡献大于丰富类群。丰富类群和稀有类群的香农指数均在冬季显著高于其他季节;丰富类群的ACE指数在秋季显著低于其他季节,而稀有类群的ACE指数则在冬季显著高于春季和夏季。丰富类群中拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度在冬季和秋季显著高于春季和夏季,但在稀有类群中,夏季和秋季的相对丰度显著高于冬季和春季。丰富类群中氨基酸代谢通路的相对丰度在冬季显著高于春季和夏季,而在稀有类群中,其相对丰度在春季显著高于夏季和秋季。气温、降水量和植被中的营养物质与肠道菌群中丰富类群和稀有类群的变化均显著相关,环境变量对丰富类群和稀有类群变化的总解释率分别为18%(气温:3%;降水:4%;植被营养成分:10%;联合:1%)和9%(气温:1%;降水:2%;植被营养成分:5%;联合:1%)。以上结果表明肠道微生物中的丰富和稀有类群具有不同的分布模式和季节性特征,二者对整体菌群变异的贡献存在差异,环境因素更多地影响丰富类群,反映了肠道微生物不同类群对季节变化响应的非一致性。本研究增进了我们对哺乳动物肠道菌群季节性变化过程及环境适应性的认识。
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关键词
肠道微生物
16S
rRNA基因
丰富和稀有类群
季节性特征
高原鼠兔
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职称材料
安徽铜陵水木冲尾矿库不同分层铜尾矿细菌群落特征研究
2
作者
蔡思思
张明珠
+3 位作者
董玉飞
张琴
肖紫文
田胜尼
《环境科学与技术》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1-10,共10页
为研究铜尾矿剖面的氧化酸化过程中形成的不同分层细菌群落特征及其驱动因素,文章选择安徽铜陵水木冲尾矿库剖面氧化酸化程度不同的3个深度分层,对其理化性质、重金属含量及细菌群落结构进行研究。结果表明,尾矿pH值随深度递增,氮、磷...
为研究铜尾矿剖面的氧化酸化过程中形成的不同分层细菌群落特征及其驱动因素,文章选择安徽铜陵水木冲尾矿库剖面氧化酸化程度不同的3个深度分层,对其理化性质、重金属含量及细菌群落结构进行研究。结果表明,尾矿pH值随深度递增,氮、磷元素分别在表、底层集中,重金属Cu、Pb含量随深度递减,Zn、Mn含量随深度递增,低重金属、高有机质含量提高了中层尾矿细菌多样性。良好的重金属抗性使变形菌门、厚壁菌门与绿弯菌门在尾矿中占主导地位,假单孢杆菌属、不动杆菌属、厌氧芽孢杆菌属作为营养循环的重要组成部分而成为优势菌属。尾矿表层各类群菌属分布均衡,稀有类群菌属富集在中层,稀有、普通类群菌属富集底层。pH驱动细菌稀有类群变化,而Mn和总磷则主导了普通类群变化。
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关键词
酸化氧化尾矿
深层尾矿剖面
尾矿分层
丰富和稀有类群
重金属
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职称材料
题名
高原鼠兔肠道微生物中丰富及稀有类群的季节性特征
被引量:
2
1
作者
范超
张良志
付海波
刘传发
李文靖
张贺
唐显江
程琪
沈文娟
张堰铭
机构
中国科学院西北高原生物研究所
中国科学院大学
青海大学青海省畜牧兽医科学院
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期617-630,共14页
基金
国家自然科学基金(31670394)
第二次青藏高原科考研究计划(2019 QZKK0501)
青海省科技厅重大专项“三江源国家公园动物基因组计划”。
文摘
气候及食物是驱动植食性小哺乳动物肠道菌群产生季节性变化的重要因素。然而,此类研究很少涉及肠道丰富及稀有微生物类群。本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,通过16S rRNA基因测序和分析,探讨丰富及稀有肠道微生物类群的结构组成、多样性指数及功能在春、夏、秋、冬四季的变化特征。结果显示,丰富类群对菌群主要门和功能的季节性变异贡献大于稀有类群,稀有类群对菌群OTU和alpha多样性的变异贡献大于丰富类群。丰富类群和稀有类群的香农指数均在冬季显著高于其他季节;丰富类群的ACE指数在秋季显著低于其他季节,而稀有类群的ACE指数则在冬季显著高于春季和夏季。丰富类群中拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度在冬季和秋季显著高于春季和夏季,但在稀有类群中,夏季和秋季的相对丰度显著高于冬季和春季。丰富类群中氨基酸代谢通路的相对丰度在冬季显著高于春季和夏季,而在稀有类群中,其相对丰度在春季显著高于夏季和秋季。气温、降水量和植被中的营养物质与肠道菌群中丰富类群和稀有类群的变化均显著相关,环境变量对丰富类群和稀有类群变化的总解释率分别为18%(气温:3%;降水:4%;植被营养成分:10%;联合:1%)和9%(气温:1%;降水:2%;植被营养成分:5%;联合:1%)。以上结果表明肠道微生物中的丰富和稀有类群具有不同的分布模式和季节性特征,二者对整体菌群变异的贡献存在差异,环境因素更多地影响丰富类群,反映了肠道微生物不同类群对季节变化响应的非一致性。本研究增进了我们对哺乳动物肠道菌群季节性变化过程及环境适应性的认识。
关键词
肠道微生物
16S
rRNA基因
丰富和稀有类群
季节性特征
高原鼠兔
Keywords
Gut microbiota
16S rRNA gene
Abundant and rare taxa
Seasonality
Plateau pika(Ochotona curzoniae)
分类号
Q938. [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
安徽铜陵水木冲尾矿库不同分层铜尾矿细菌群落特征研究
2
作者
蔡思思
张明珠
董玉飞
张琴
肖紫文
田胜尼
机构
安徽农业大学生命科学学院
合肥工业大学食品与生物工程学院
出处
《环境科学与技术》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1-10,共10页
基金
安徽省教育厅重点项目(KJ2021A0168)。
文摘
为研究铜尾矿剖面的氧化酸化过程中形成的不同分层细菌群落特征及其驱动因素,文章选择安徽铜陵水木冲尾矿库剖面氧化酸化程度不同的3个深度分层,对其理化性质、重金属含量及细菌群落结构进行研究。结果表明,尾矿pH值随深度递增,氮、磷元素分别在表、底层集中,重金属Cu、Pb含量随深度递减,Zn、Mn含量随深度递增,低重金属、高有机质含量提高了中层尾矿细菌多样性。良好的重金属抗性使变形菌门、厚壁菌门与绿弯菌门在尾矿中占主导地位,假单孢杆菌属、不动杆菌属、厌氧芽孢杆菌属作为营养循环的重要组成部分而成为优势菌属。尾矿表层各类群菌属分布均衡,稀有类群菌属富集在中层,稀有、普通类群菌属富集底层。pH驱动细菌稀有类群变化,而Mn和总磷则主导了普通类群变化。
关键词
酸化氧化尾矿
深层尾矿剖面
尾矿分层
丰富和稀有类群
重金属
Keywords
acidified oxidation tailings
deep-layer tailings profile
tailing stratification
abundant and rare taxa
heavy metal
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高原鼠兔肠道微生物中丰富及稀有类群的季节性特征
范超
张良志
付海波
刘传发
李文靖
张贺
唐显江
程琪
沈文娟
张堰铭
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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职称材料
2
安徽铜陵水木冲尾矿库不同分层铜尾矿细菌群落特征研究
蔡思思
张明珠
董玉飞
张琴
肖紫文
田胜尼
《环境科学与技术》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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