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基于条件随机场的中医临床病历命名实体抽取
被引量:
33
1
作者
刘凯
周雪忠
+1 位作者
于剑
张润顺
《计算机工程》
CAS
CSCD
2014年第9期312-316,共5页
中医临床病历是中医重要的科研数据资源,但目前临床病历仍以文本为主要表达形式,对病历数据深入分析的前提是进行结构化信息抽取,而命名实体抽取是其基础性步骤。针对中医临床病历的命名实体,如症状、疾病和诱因等的抽取问题,通过手工...
中医临床病历是中医重要的科研数据资源,但目前临床病历仍以文本为主要表达形式,对病历数据深入分析的前提是进行结构化信息抽取,而命名实体抽取是其基础性步骤。针对中医临床病历的命名实体,如症状、疾病和诱因等的抽取问题,通过手工标注的413份病历数据(以中文字为特征)与4类特征模版,将条件随机场(CRF)、隐马尔科夫模型(HMM)和最大熵马尔科夫模型(MEMM)用于中医病历命名实体抽取的实验,并进行比较分析。结果表明,结合合适的特征模版,CRF命名实体抽取方法取得了较好的性能,F1值的症状达到0.80,疾病名称达到0.74,诱因0.74。与HMM和MEMM相比,CRF有最高的准确率和召回率,是一种较为适用的中医临床病历命名实体抽取方法。
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关键词
中医临床病历
命名实体抽取
语料库标注系统
条件随机场
特征模板
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职称材料
基于真实世界突发性聋中医临床电子病历数据结构化采集系统的设计和构建
被引量:
10
2
作者
宋红梅
陈燕
+4 位作者
徐芳
林俞利
刘露
谭汝婷
熊大经
《中国卫生事业管理》
北大核心
2020年第6期426-428,共3页
针药结合治疗突发性聋具有独特优势,研究真实世界中医药防治突发性聋的临床疗效评价方法有积极意义。通过论述突发性聋的临床病历采集模板制作的思路和设计理念,同时根据医院信息化水平程度,实现与医院信息系统、医院检验管理系统、医...
针药结合治疗突发性聋具有独特优势,研究真实世界中医药防治突发性聋的临床疗效评价方法有积极意义。通过论述突发性聋的临床病历采集模板制作的思路和设计理念,同时根据医院信息化水平程度,实现与医院信息系统、医院检验管理系统、医院影像管理系统等的无缝对接,实现突发性聋诊疗数据的交互共享,建立高度结构化的突发性聋病历数据采集平台。旨在规范采集突发性聋真实世界中医临床“四诊”信息,并建立相应数据库,为后续数据的挖掘和分析研究奠定基础。
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关键词
真实世界
中医
临床
电子
病历
数据
结构化采集
突发性聋
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职称材料
面向中医临床现病史文本的命名实体抽取方法研究
被引量:
11
3
作者
袁玉虎
周雪忠
+1 位作者
张润顺
李晓东
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
2017年第1期70-77,共8页
目的:中医临床病历作为重要的临床数据,以文本的形式记录了医生和患者交互的整个过程。目前,在大数据的背景下,针对临床病历所涵盖的主体问题信息如现病史的分析利用相关研究仍有所欠缺。因此,本文针对中医临床病历中的现病史部分展开...
目的:中医临床病历作为重要的临床数据,以文本的形式记录了医生和患者交互的整个过程。目前,在大数据的背景下,针对临床病历所涵盖的主体问题信息如现病史的分析利用相关研究仍有所欠缺。因此,本文针对中医临床病历中的现病史部分展开症状术语抽取方法研究,为临床病历的进一步使用奠定基础。方法:首先通过随机挑选与专家审核的方式获得了12 367份现病史数据,按照疾病种类分成了两组实验,其中糖尿病组包含了4 838份数据,脾胃病组7 529份数据,以及合并后的混合组12 367份数据。并整理出了一份涵盖22 996个词的症状术语字典。然后选取滑动窗口特征、词的前后缀特征、词典特征等5种特征模板,使用CRFs模型开展症状术语命名实体抽取实验。结果:在实验结果评价标准(准确率、召回率和F1值)上的表现:在开放测试上的评价结果为(0.83、0.8、0.82)、(0.9、0.9、0.89)和(0.88、0.87、0.87);在十重交叉验证上的评价结果为(0.83、0.82、0.83)、(0.95、0.95、0.95)和(0.93、0.92、0.92)。结论:CRFs模型作为一种优秀的序列标注算法,适用于现病史文本的症状术语命名实体抽取任务。
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关键词
中医临床病历
现病史
条件随机场
特征模板
命名实体抽取
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职称材料
题名
基于条件随机场的中医临床病历命名实体抽取
被引量:
33
1
作者
刘凯
周雪忠
于剑
张润顺
机构
北京交通大学计算机与信息技术学院
北京交通大学交通数据分析与挖掘北京市重点实验室
中国中医科学院广安门医院
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
2014年第9期312-316,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(61105055
81230086)
+1 种基金
国家"863"计划基金资助项目(2012AA02A609)
中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(K13JB00140)
文摘
中医临床病历是中医重要的科研数据资源,但目前临床病历仍以文本为主要表达形式,对病历数据深入分析的前提是进行结构化信息抽取,而命名实体抽取是其基础性步骤。针对中医临床病历的命名实体,如症状、疾病和诱因等的抽取问题,通过手工标注的413份病历数据(以中文字为特征)与4类特征模版,将条件随机场(CRF)、隐马尔科夫模型(HMM)和最大熵马尔科夫模型(MEMM)用于中医病历命名实体抽取的实验,并进行比较分析。结果表明,结合合适的特征模版,CRF命名实体抽取方法取得了较好的性能,F1值的症状达到0.80,疾病名称达到0.74,诱因0.74。与HMM和MEMM相比,CRF有最高的准确率和召回率,是一种较为适用的中医临床病历命名实体抽取方法。
关键词
中医临床病历
命名实体抽取
语料库标注系统
条件随机场
特征模板
Keywords
Traditional Chinese Medicine(TCM)medical records
named entity extraction
corpus annotation system
Conditional Random Field(CRF)
feature template
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于真实世界突发性聋中医临床电子病历数据结构化采集系统的设计和构建
被引量:
10
2
作者
宋红梅
陈燕
徐芳
林俞利
刘露
谭汝婷
熊大经
机构
成都中医药大学附属医院
成都中医药大学
出处
《中国卫生事业管理》
北大核心
2020年第6期426-428,共3页
基金
四川省科技厅应用技术与研发项目“深刺少阳经腧穴治疗难治性突发性聋的多中心对照研究”(2017SZ0114)
成都中医药大学2018年度信息化研究专项“突发性耳聋临床病历模板的设计和开发”(02004907)
成都中医药大学附属医院院基金课题“医患共同参与决策模式对针药结合治疗突发性聋患者听力康复的影响”(2017-D-YY-1)。
文摘
针药结合治疗突发性聋具有独特优势,研究真实世界中医药防治突发性聋的临床疗效评价方法有积极意义。通过论述突发性聋的临床病历采集模板制作的思路和设计理念,同时根据医院信息化水平程度,实现与医院信息系统、医院检验管理系统、医院影像管理系统等的无缝对接,实现突发性聋诊疗数据的交互共享,建立高度结构化的突发性聋病历数据采集平台。旨在规范采集突发性聋真实世界中医临床“四诊”信息,并建立相应数据库,为后续数据的挖掘和分析研究奠定基础。
关键词
真实世界
中医
临床
电子
病历
数据
结构化采集
突发性聋
Keywords
real world
TCM clinical electronic medical record data
structured collection
sudden deafness
分类号
R276.1 [医药卫生—中医五官科学]
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职称材料
题名
面向中医临床现病史文本的命名实体抽取方法研究
被引量:
11
3
作者
袁玉虎
周雪忠
张润顺
李晓东
机构
北京交通大学计算机与信息技术学院
中国中医科学院中医药数据中心
中国中医科学院广安门医院
湖北省中医院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
2017年第1期70-77,共8页
基金
国家中医药管理局2015年度国家中医临床研究基地业务建设第二批科研专项(JDZX2015171):肝病回顾性病例表型信息抽取方法与分析研究
负责人:周雪忠
+4 种基金
国家中医药管理局2015年度国家中医临床研究基地业务建设第二批科研专项(JDZX2015170):慢性肝病病案资料数据审编方案设计
质量控制关键技术研究
负责人:张润顺
国家自然科学基金委青年科学基金项目(61105055):表型与基因型功能关联的数据整合和网络分析方法研究
负责人:周雪忠
文摘
目的:中医临床病历作为重要的临床数据,以文本的形式记录了医生和患者交互的整个过程。目前,在大数据的背景下,针对临床病历所涵盖的主体问题信息如现病史的分析利用相关研究仍有所欠缺。因此,本文针对中医临床病历中的现病史部分展开症状术语抽取方法研究,为临床病历的进一步使用奠定基础。方法:首先通过随机挑选与专家审核的方式获得了12 367份现病史数据,按照疾病种类分成了两组实验,其中糖尿病组包含了4 838份数据,脾胃病组7 529份数据,以及合并后的混合组12 367份数据。并整理出了一份涵盖22 996个词的症状术语字典。然后选取滑动窗口特征、词的前后缀特征、词典特征等5种特征模板,使用CRFs模型开展症状术语命名实体抽取实验。结果:在实验结果评价标准(准确率、召回率和F1值)上的表现:在开放测试上的评价结果为(0.83、0.8、0.82)、(0.9、0.9、0.89)和(0.88、0.87、0.87);在十重交叉验证上的评价结果为(0.83、0.82、0.83)、(0.95、0.95、0.95)和(0.93、0.92、0.92)。结论:CRFs模型作为一种优秀的序列标注算法,适用于现病史文本的症状术语命名实体抽取任务。
关键词
中医临床病历
现病史
条件随机场
特征模板
命名实体抽取
Keywords
Traditional Chinese medical clinical data
medical history of present illness
conditional random field
feature template
named entity recognition
分类号
R29 [医药卫生—民族医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于条件随机场的中医临床病历命名实体抽取
刘凯
周雪忠
于剑
张润顺
《计算机工程》
CAS
CSCD
2014
33
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于真实世界突发性聋中医临床电子病历数据结构化采集系统的设计和构建
宋红梅
陈燕
徐芳
林俞利
刘露
谭汝婷
熊大经
《中国卫生事业管理》
北大核心
2020
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
面向中医临床现病史文本的命名实体抽取方法研究
袁玉虎
周雪忠
张润顺
李晓东
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
2017
11
在线阅读
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