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两样本孟德尔随机化分析血浆磷脂酰乙醇胺水平与结直肠腺癌发病风险的关系
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作者 徐苓 皇甫昱婵 +1 位作者 沈立松 马妍慧 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第5期605-613,共9页
目的·采用两样本孟德尔随机化(two-sample Mendelian randomization,TSMR)方法,以遗传变异作为工具变量,评估血浆磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE)水平与结直肠腺癌发病风险之间的因果关系。方法·PE与结直肠癌相关... 目的·采用两样本孟德尔随机化(two-sample Mendelian randomization,TSMR)方法,以遗传变异作为工具变量,评估血浆磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE)水平与结直肠腺癌发病风险之间的因果关系。方法·PE与结直肠癌相关的单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)数据分别来自布里斯托大学MRC综合流行病学小组(The Medical Research Council Integrative Epidemiology Unit,MRC-IEU)和芬兰生物银行。对基于全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,选择与PE密切关联的遗传位点作为工具变量,采用4种孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法,包括逆方差加权法(inverse-variance weighted,IVW)、孟德尔随机化Egger回归法(Mendelian randomization-Egger,MR-Egger回归)、加权中位数法(weighted median,WME)和加权众数法(weighted mode,WM)分析评估因果效应。IVW作为主要统计方法,MR-Egger、WME和WM作为辅助方法。采用MR-Egger回归截距和MR-PRESSO检验评估水平多效性全局检验是否违反MR假设。Cochran′s Q检验用于评估异质性。结果·筛选出10个工具变量,Steiger检验显示全部PE相关SNP对结直肠癌因果关系方向一致。10个SNP中rs102275和rs9393903位点与结直肠癌风险正相关,关联度分别为0.45(P=8.01×10^(-5))和0.82(P=2.31×10^(-2))。4种MR分析的结果一致,均显示血浆PE水平与结直肠腺癌的发病风险存在正向关联。IVW中OR为1.36,95%CI 1.17~1.59,P=7.24×10^(-5);MR-Egger回归OR为1.44,95%CI 0.97~2.14,P=1.12×10^(-1);WME中OR为1.33,95%CI 1.07~1.65,P=8.81×10^(-3);WM中OR为1.41,95%CI 1.12~1.77,P=1.70×10^(-2)。Cochran′s Q检验结果显示10个SNP对结直肠腺癌估计值无异质性。MR-Egger回归截距和MR-PRESSO检验表明全部SNP无水平多效性。采用留一法在剔除任一个SNP后,总体置信区间重叠,表明结果对单个SNP不敏感,具有较高的稳健性。结论·血浆PE水平与结直肠腺癌风险之间存在因果关联,遗传预测的血浆PE每增加1个标准差,结直肠腺癌发生风险就会增加0.36倍(95%CI 1.17~1.59,P=7.24×10^(-5))。 展开更多
关键词 结直肠腺癌 磷脂酰乙醇胺 两样本孟德尔随机化 因果关联 全基因组关联研究
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两样本孟德尔随机化探讨欧洲类风湿关节炎人群与缺铁性贫血的因果关系 被引量:2
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作者 王勇 姚晓玲 +3 位作者 杨豫正 凌益 姚血明 马武开 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第7期1251-1256,共6页
目的通过两样本孟德尔随机化法探讨欧洲类风湿关节炎(RA)人群与缺铁性贫血(IDA)的因果关系。方法RA与IDA的单核苷酸多态性(SNPs)均使用公开的全基因组关联研究(GWAS)数据进行汇总分析。使用逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法评估RA对ID... 目的通过两样本孟德尔随机化法探讨欧洲类风湿关节炎(RA)人群与缺铁性贫血(IDA)的因果关系。方法RA与IDA的单核苷酸多态性(SNPs)均使用公开的全基因组关联研究(GWAS)数据进行汇总分析。使用逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法评估RA对IDA的因果效应。以MR-Egger回归法、加权中位数法(WM)、加权模式和简单模式作为回归补充说明,进而评估敏感性分析结果的稳健性。用Heterogeneity函数计算P值检验异质性、用截距项Intercept检验水平多效性。结果在全基因组水平FINNGEN数据库中选择出了经孟德尔随机分析去除连锁不平衡且满足P<5.0×10^(-8)的强相关SNPs,整合暴露与结局数据后获得31个SNPs作为最终的有效工具变量。IVW法显示RA是IDA的风险因素(在RA的患病人群中,发生IDA的风险是无RA人群的1.064倍,OR=1.064,95%CI:1.028~1.103);WM和MR-Egger回归结果支持RA对IDA存在正向关联;截距项数值趋近于0,表明暴露与结局不存在水平多效性;Heterogeneity函数P<0.05,表明暴露与结局存在异质性,但经随机效应模型检验,P<0.05,表明因果关系即使存在异质性,但总体趋于稳健。结论RA是IDA的危险因素,RA与IDA存在正向关联。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 缺铁性贫血 两样本孟德尔随机化 因果关联
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两样本孟德尔随机化中工具变量对因果估计的性别特异性影响——人体测量学性状与乳腺癌关系的实证研究 被引量:1
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作者 高一欣 曾平 赵华硕 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2021年第2期198-203,共6页
目的研究两样本孟德尔随机化(mendelian randomization, MR)分析中性别特异工具变量对因果效应估计的影响。方法利用全基因组关联数据以乳腺癌作为结局,以人体测量学性状(身体质量指数(BMI)、腰臀比(WHR)、腰围(WC)和臀围(HIP))作为暴露... 目的研究两样本孟德尔随机化(mendelian randomization, MR)分析中性别特异工具变量对因果效应估计的影响。方法利用全基因组关联数据以乳腺癌作为结局,以人体测量学性状(身体质量指数(BMI)、腰臀比(WHR)、腰围(WC)和臀围(HIP))作为暴露,采用两样本MR逆方差加权法估计因果效应;通过差异检验比较使用女性特异工具变量与性别合并工具变量的因果效应(OR值);进一步通过敏感性分析验证结果的稳健性。结果使用性别合并工具变量的MR结果表明BMI/WC与乳腺癌风险存在因果关联(OR值分别为0.85(P=0.003)和0.87(P=0.020));剔除性别差异的工具变量后,每组OR值与未剔除前基本一致,但WC与乳腺癌的因果关联不再显著(P=0.069);使用女性特异工具变量的MR结果与使用性别合并工具变量结果相比,每组OR值均呈下降趋势;其中BMI/HIP与乳腺癌的因果关联效应大小发生了明显改变(P<0.05);例如BMI与乳腺癌因果关联的OR值由0.85下降至0.76。结论工具变量的性别异质会对MR的因果效应估计产生实质影响,使用性别合并的工具变量可能导致有偏的因果关联。 展开更多
关键词 两样本孟德尔随机化 工具变量 性别异质性 因果效应估计 乳腺癌
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循环氨基酸与重症肌无力的因果关联评估:一项双向孟德尔随机化研究
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作者 臧虎 汲晓宇 +3 位作者 祝畅 姚文龙 万里 刘彤彤 《医药导报》 北大核心 2025年第3期440-445,共6页
目的利用孟德尔随机化方法探讨循环氨基酸水平与重症肌无力(MG)风险之间的双向因果关联。方法使用公开的全基因组关联研究(GWASs)遗传数据进行两样本孟德尔随机化分析,利用不同来源的GWASs数据进行验证以评估结果稳健性。运用5种模型进... 目的利用孟德尔随机化方法探讨循环氨基酸水平与重症肌无力(MG)风险之间的双向因果关联。方法使用公开的全基因组关联研究(GWASs)遗传数据进行两样本孟德尔随机化分析,利用不同来源的GWASs数据进行验证以评估结果稳健性。运用5种模型进行两样本双向孟德尔随机化分析,采用比值比(OR)评价循环中9种氨基酸水平与MG风险之间的因果关系。采用敏感性分析、异质性检验和多效性检验评估结果的稳健性。以逆方差加权法(IVW)估算的因果效应为主要结果,使用不同GWASs来源的数据对IVW估算的因果效应进行验证,以进一步评估结果稳健性。结果遗传预测较高的循环谷氨酰胺水平与较低的MG风险显著相关[OR(95%CI)=0.696(0.524,0.926),P=0.0127,IVW]。采用不同GWASs验证分析表明,遗传预测的较高循环谷氨酰胺水平与MG风险显著负相关[OR(95%CI)=0.321(0.178,0.581),P=1.67×10^(-1),IVW]。此外,遗传预测较高MG风险与较低循环谷氨酰胺和丙氨酸水平相关(分别为-0.178±0.009,P=0.049;-0.013±0.007,P=0.048,IVW)。结论通过遗传学方法揭示循环氨基酸水平与MG患病风险之间具有潜在双向因果关系。需要进一步研究来阐明循环氨基酸水平与MG之间的作用机制。 展开更多
关键词 重症肌无力 样本双向孟德尔随机化 循环氨基酸水平 因果关系
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内在情感对癌症发生风险的影响:基于孟德尔随机化研究 被引量:2
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作者 杜钦 朱雨萱 +2 位作者 郭一泽 许楠馨 刘棣 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期376-382,共7页
目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为... 目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为主要结局指标,加权中值法(WM)、MR-Egger法作为补充结果,评价指标为比值比(OR),并进行敏感性分析。结果对于抑郁情绪,提示与肺癌(OR=1.005,95%CI:1.001~1.009,P=0.015)显著相关。对于忧虑,提示与乳腺癌(OR=1.199,95%CI:1.011~1.423,P=0.038)显著相关。对于内疚感,提示与甲状腺癌(OR=2.083,95%CI:1.080~4.017,P=0.029)显著相关。在去除MR-PRESSO检测到的所有潜在多效性SNPs后,忧虑与乳腺癌的关联无统计学差异(P=0.064),忧虑与结直肠癌显著相关(OR=0.739,95%CI:0.571~0.956,P=0.021)。癌症与内在情感之间的关联未发现存在因果关系。结论抑郁情绪与肺癌发生风险增加相关,内疚感与甲状腺癌发生风险增加相关,忧虑可能与结直肠癌发生风险降低相关。 展开更多
关键词 样本双向孟德尔随机化 内在情感 癌症 全基因组关联研究 因果效应
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孟德尔随机化探究白细胞介素与便秘的因果效应 被引量:3
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作者 滕梦豪 苏啸尘 +1 位作者 郭梦 张银刚 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期737-745,共9页
目的采用两样本孟德尔随机化探讨白细胞介素(interleukin,IL)水平与便秘的因果关系。方法基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据进行分析。白细胞介素与便秘数据均来自欧洲人群。其中IL作为暴露变量,来自两个GWAS汇总数据:①从人类血浆蛋白... 目的采用两样本孟德尔随机化探讨白细胞介素(interleukin,IL)水平与便秘的因果关系。方法基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据进行分析。白细胞介素与便秘数据均来自欧洲人群。其中IL作为暴露变量,来自两个GWAS汇总数据:①从人类血浆蛋白质组的遗传图谱中获得,包含3301例样本;②来自一项关于90种循环蛋白的GWAS数据,包含30931例样本。便秘作为结局变量纳入两个GWAS汇总数据:①来自芬恩数据库(Finngene),共包含26919例病例和282235例对照;②来自英国生物银行(UKBiobank),共包含3328例病例和459682例对照。将与暴露变量强相关的单核苷酸多态性作为工具变量,以逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法,MR-egger回归和加权中位数法作为IVW结果的补充证据,同时进行水平多效性和异质性的检验保证结果的稳定性。结果在两个不同的结局变量GWAS数据中,IVW分析结果均表明IL-17受体C水平的降低与便秘风险增加有关,OR值分别为0.956(95%CI:0.916~0.997,P=0.036‖Finngene)和0.998(95%CI:0.997~0.999,P=0.040‖ukb),IL-18水平的升高与便秘风险增加有关,OR值分别为1.055(95%CI:1.008~1.104,P=0.022‖Finngene)和1.001(95%CI:1.000~1.002,P=0.044‖ukb);而在Finngene数据中,IVW结果还提示IL-2受体α亚单位水平的增加、IL-10和IL-17水平的降低与便秘风险增加有关,OR值分别为1.054(95%CI:1.001~1.110,P=0.049)、0.945(95%CI:0.896~0.996,P=0.035)、0.934(95%CI:0.896~0.997,P=0.040)。结论IL-17受体C、IL-18、IL-2受体α亚单位、IL-10和IL-17与便秘风险存在因果关联。 展开更多
关键词 两样本孟德尔随机化 白细胞介素 便秘 GWAS
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