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水稻丝氨酸羟甲基转移酶基因OsSHMT5克隆与功能分析
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作者 陈杰 杨天宇 黄新元 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第2期209-220,共12页
水稻中已克隆到OsSHMT4(OsCADT1),该基因编码丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT),可调控硫酸盐/硒酸盐吸收和同化,其高度同源基因OsSHMT5的功能尚不清楚。本研究基于反向遗传学研究方法,对水稻OsSHMT5基因进行分子克隆,发现OsSHMT5与OsSHMT4(OsCA... 水稻中已克隆到OsSHMT4(OsCADT1),该基因编码丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT),可调控硫酸盐/硒酸盐吸收和同化,其高度同源基因OsSHMT5的功能尚不清楚。本研究基于反向遗传学研究方法,对水稻OsSHMT5基因进行分子克隆,发现OsSHMT5与OsSHMT4(OsCADT1)的同源性高达84%。亚细胞定位结果表明,OsSHMT5蛋白定位于细胞核。利用CRISPR/Cas9技术构建OsSHMT5基因敲除突变体,发现OsSHMT5基因敲除突变体的地上部或地下部中总硫/总硒及各形态硒含量与野生型相比无显著差异。基于转录组水平分析发现,OsSHMT5对水稻硫酸盐/硒酸盐吸收和同化相关基因的表达无显著调控作用。在水稻地下部,OsSHMT5可能具有四吡咯结合、血红素结合、氧化还原酶活性、电子转移活性和铁离子结合等分子功能;在地上部,OsSHMT5可能具有转录调节因子活性、分子功能调节因子、内肽酶调节活性、肽酶抑制剂活性、铜离子结合等分子功能。本研究结果为水稻中OsSHMT家族功能的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 丝氨酸羟甲基转移酶 OsSHMT5基因 硫元素 硒元素
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植物丝氨酸羟甲基转移酶及其生理作用研究进展 被引量:5
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作者 马莉 陈丽梅 +1 位作者 刘迪秋 李昆志 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第4期1357-1359,1404,共4页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在自然界中普遍存在,它的生理学功能是催化丝氨酸和甘氨酸之间可逆的互换。SHMT的催化反应是氨基酸和核酸代谢的连接点,在氨基酸的工业生产和植物的光呼吸过程中,SHMT也是一个关键酶。最近通过使用核磁共振(NMR... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在自然界中普遍存在,它的生理学功能是催化丝氨酸和甘氨酸之间可逆的互换。SHMT的催化反应是氨基酸和核酸代谢的连接点,在氨基酸的工业生产和植物的光呼吸过程中,SHMT也是一个关键酶。最近通过使用核磁共振(NMR)技术和基因工程技术阐明了SHMT的很多酶学性质以及它在植物不同组织中的生理作用,对这些研究成果进行了总结。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 一碳代谢 光呼吸 学性质 生理作用
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植物丝氨酸羟甲基转移酶基因研究进展 被引量:12
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作者 马莉 陈丽梅 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第2期15-19,共5页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是一个含有磷酸吡哆醛(PLP)的四聚体的蛋白质,在亚甲基四氢叶酸(CH2-THF)存在时催化丝氨酸和四氢叶酸生成甘氨酸和N5,N10-亚甲基四氢叶酸的可逆反应。SHMT在高等植物的一碳代谢和光呼吸中起着非常重要的作用,... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是一个含有磷酸吡哆醛(PLP)的四聚体的蛋白质,在亚甲基四氢叶酸(CH2-THF)存在时催化丝氨酸和四氢叶酸生成甘氨酸和N5,N10-亚甲基四氢叶酸的可逆反应。SHMT在高等植物的一碳代谢和光呼吸中起着非常重要的作用,最近随着植物SHMT纯化技术的进步和重要模式植物基因组测序的完工,使很多植物SHMT基因被克隆出来,并对它们的结构和功能及表达调控进行研究。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 基因克隆 光呼吸 基因表达调控
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苹果实生树阶段转变过程中丝氨酸羟甲基转移酶的变化 被引量:2
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作者 曾广娟 张新忠 李春敏 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期254-257,311,共5页
用酶联免疫(ELISA)法和免疫组织化学方法(IHC)检测5年生苹果实生树不同节位的丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的变化。结果表明,此酶只存在苹果实生树营养生长期的叶片中,而在童期的叶片和生殖生长期的叶片中含量极低或检测不到。SHMT在苹果... 用酶联免疫(ELISA)法和免疫组织化学方法(IHC)检测5年生苹果实生树不同节位的丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的变化。结果表明,此酶只存在苹果实生树营养生长期的叶片中,而在童期的叶片和生殖生长期的叶片中含量极低或检测不到。SHMT在苹果实生树阶段转变过程中存在差异表达。 展开更多
关键词 苹果 阶段转变 丝氨酸羟甲基转移酶 联免疫(ELISA) 免疫组织化学(IHC)
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丝氨酸羟甲基转移酶基因的功能表达及其活性鉴定 被引量:2
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作者 刘万红 刘爱福 +1 位作者 李文鑫 王君英 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期5-8,共4页
从大肠杆菌染色体DNA中成功克隆到丝氨酸羟甲基转移酶基因 ,并将其插入表达载体 pET15b中 ,在大肠杆菌中得到了高表达。
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 基因克隆 原核表达 活性鉴定 L-
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丝氨酸羟甲基转移酶2在小鼠肝再生过程中的变化规律及作用
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作者 袁方超 龚建平 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期675-679,共5页
目的探索丝氨酸羟甲基转移酶2(serine hydroxymethyl transferase 2,SHMT2)在小鼠肝再生过程中的表达规律,以及其对小鼠肝再生是否有促进作用。方法 SPF级C57BL/6小鼠120只分为肝切除组(2/3PH)、假手术组(SHAM)、腺病毒干扰组(si SHMT2... 目的探索丝氨酸羟甲基转移酶2(serine hydroxymethyl transferase 2,SHMT2)在小鼠肝再生过程中的表达规律,以及其对小鼠肝再生是否有促进作用。方法 SPF级C57BL/6小鼠120只分为肝切除组(2/3PH)、假手术组(SHAM)、腺病毒干扰组(si SHMT2)及注射生理盐水对照组(Control),每组30只;肝切除组下设1、3、5、7、9 d 5个时相点,每个时相点6只。小鼠肝切除之后分别取1、3、5、7、9 d的肝脏组织及血清,采用q PCR、Western blot和免疫组化检测SHMT2及其下游分子甘氨酸脱氢酶(glycine dehydrogenase,GLDC)的变化规律、血清中丙氨酸转氨酶(alanine transaminase,ALT)和谷草转氨酶(aspartate transaminase,AST)的浓度。取注射腺病毒干扰SHMT2第5天的肝脏组织,通过Western blot和观察荧光强度,确定转染效果,并检测血浆中ALT和AST水平,免疫组化检测增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)。结果 SHMT2及其下游分子GLDC在小鼠肝再生的后第5、7天表达最高,q PCR检测结果显示,SHMT2第5天的表达量是第1天的1.63倍(P<0.05)。在干扰SHMT2之后,小鼠第5天再生肝脏的质量由(0.79±0.13)g降低至(0.63±0.11)g(P<0.05),再生度由(36.37±2.21)%降低至(31.33±1.92)%,肝指数由(3.76±0.44)%降低至(3.13±0.29)%,并且肝功能指标ALT由(70.00±9.52)U/L升高至(154.15±16.49)U/L,AST由(140.09±32.85)U/L升高至(403.41±68.63)U/L(P<0.05),PCNA阳性率从(53.6±2.3)%降低至(39.0±3.2)%(P<0.05)。结论 SHMT2在肝脏再生的后期高表达,促进残肝的再生,其机制可能与增强肝脏对缺血、缺氧的耐受,提高三磷酸腺苷水平有关。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶2 肝再生 肝大部切除 腺病毒受体
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坛紫菜丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及表达特征 被引量:7
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作者 林颖辉 王文磊 +3 位作者 徐燕 纪德华 陈昌生 谢潮添 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2018年第5期122-129,共8页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在植物应答逆境胁迫中发挥着重要作用。本研究以坛紫菜(Pyropia haitanensis)为研究材料,采用普通PCR技术克隆得到2条坛紫菜的SHMT全长基因序列,分别命名为PhSHMT-1(GenBank收录号:MF687405)和PhSHMT-2(GenBan... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在植物应答逆境胁迫中发挥着重要作用。本研究以坛紫菜(Pyropia haitanensis)为研究材料,采用普通PCR技术克隆得到2条坛紫菜的SHMT全长基因序列,分别命名为PhSHMT-1(GenBank收录号:MF687405)和PhSHMT-2(GenBank收录号:MF687406)。其中,PhSHMT-1序列全长1710 bp,包含一个1491 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含497个氨基酸,分子量为121.443 kDa,等电点为4.93;PhSHMT-2序列全长1957 bp,包含一个1395 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含465个氨基酸,分子量为113.969 k Da,等电点为4.95。多序列比对和系统进化树分析结果确认PhSHMT-1和PhSHMT-2基因属于SHMT基因家族。qRT-PCR定量分析结果表明,高温胁迫条件下,2条PhSHMT基因的表达模式基本一致,均表现为先上调后下调再上调的趋势,这说明SHMT基因可能在坛紫菜应答高温胁迫过程中发挥作用。 展开更多
关键词 坛紫菜 高温胁迫 丝氨酸羟甲基转移酶 活性氧 基因克隆
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1株产丝氨酸羟甲基转移酶菌株的分离鉴定及其培养条件优化 被引量:3
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作者 马立周 李江华 +4 位作者 房峻 宁健飞 蔡立明 曹钰 陆健 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期18-23,共6页
从甲醇污染土壤中分离得到1株能在含2%甲醇的培养基上生长且产丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的菌株,ML206,酶活达到0.030 U/mL。将ML206菌株的16S rDNA序列(No.EF612770)和GenBank数据库中已报道的16S rDNA序列进行Blast比对和系统发育分析... 从甲醇污染土壤中分离得到1株能在含2%甲醇的培养基上生长且产丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的菌株,ML206,酶活达到0.030 U/mL。将ML206菌株的16S rDNA序列(No.EF612770)和GenBank数据库中已报道的16S rDNA序列进行Blast比对和系统发育分析,结合形态学和生理生化鉴定结果,确定ML206为嗜胺甲基杆菌(M.aniovorans)。经过对产酶条件的优化确定最佳氮源、碳源及培养件为:(NH_4)_2 HPO_4 0.8%,CH_3OH 2%,pH 7.0,温度30℃;采用分批的方式添加甲醇,培养时间由72 h缩短至48 h,节省了33%的培养时间。在优化的培养条件基础上进行实验,菌体浓度比原来提高了50%,SHMT活力提高了20%。经过对该菌的各种特性的研究确定了其为1株良好的产SHMT的新型出发菌。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 系统发育分析 嗜胺甲基杆菌 条件优化
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燕麦生物碱A通过调控丝氨酸羟甲基转移酶2重塑丝氨酸代谢抑制结肠癌生长 被引量:3
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作者 付荣 王珏 +1 位作者 王海龙 杨鹏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期715-723,共9页
流行病学研究表明,燕麦类全谷食品可有效降低结肠癌的发病风险。丝氨酸/甘氨酸代谢途径对于维持肿瘤生长十分重要,能为肿瘤细胞核苷酸等生物大分子的合成提供底物,并保障肿瘤细胞免受氧化损伤。我们的前期研究表明,燕麦生物碱A(avenanth... 流行病学研究表明,燕麦类全谷食品可有效降低结肠癌的发病风险。丝氨酸/甘氨酸代谢途径对于维持肿瘤生长十分重要,能为肿瘤细胞核苷酸等生物大分子的合成提供底物,并保障肿瘤细胞免受氧化损伤。我们的前期研究表明,燕麦生物碱A(avenanthramide A,AVN A)具有抑制小鼠原位结肠癌生长的作用。本研究通过对氧化偶氮甲烷/葡聚糖硫酸钠(azoxymethane/dextran sulphate sulfate,AOM/DSS)小鼠结肠癌模型进行血液代谢组学研究,发现AVN A处理后,丝氨酸/甘氨酸代谢途径的变化最为显著(P<0.01)。丝氨酸、甘氨酸饥饿条件下,AVN A对结肠癌的杀伤效果显著增强(P<0.05),表明AVN A靶向丝氨酸代谢从而发挥抗结肠癌作用。随后,对丝氨酸代谢关键酶SHMT1、SHMT2、PHGDH、PSAT1及PSPH的mRNA及蛋白质表达水平进行检测,发现AVN A明显抑制SHMT2的表达(P<0.01或P<0.001)。过表达SHMT2后,由AVN A介导的对结肠癌细胞的生长、增殖、GSH/GSSG以及NADPH/NADP+的抑制作用均被逆转。综上所述,AVN A通过下调SHMT2的表达,阻遏丝氨酸/甘氨酸代谢途径,从而发挥抑制结肠癌进展的作用。本研究为燕麦生物碱的深度利用及结肠癌的营养干预提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 燕麦生物碱A 丝氨酸羟甲基转移酶2 代谢 结肠癌
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甘薯、番茄和拟南芥中丝氨酸羟甲基转移酶基因家族功能研究 被引量:3
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作者 赵玉琪 周志林 +3 位作者 唐君 姚改芳 胡康棣 张华 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第12期1705-1714,共10页
丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)普遍存在于植物中,在高等植物的一碳代谢和光呼吸过程中起着重要作用,然而该家族在甘薯中的功能尚不清楚。文章通过同源比对获取甘薯、番茄、拟南芥中21个SHMT基因家族的信息... 丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)普遍存在于植物中,在高等植物的一碳代谢和光呼吸过程中起着重要作用,然而该家族在甘薯中的功能尚不清楚。文章通过同源比对获取甘薯、番茄、拟南芥中21个SHMT基因家族的信息,通过系统进化树分析,发现21个SHMT蛋白形成4个分支;利用蛋白motif分析、蛋白结构域分析、基因外显子内含子结构分析、蛋白的二级结构和三级结构预测、蛋白质理化性质分析、核定位序列(nuclear localization sequence,NLS)、亚细胞定位分析预测,发现蛋白高级结构和基因结构在同一分支内更为保守,即同源性越高的蛋白,其结构、性质更为接近。通过对番茄中SHMT基因进行表达量分析,发现SHMT基因可能在番茄种子发育、开花、果实成熟方面发挥作用。另外,通过对拟南芥SHMT(AtSHMT)家族在胁迫条件下的表达水平进行分析,推断多个AtSHMT基因对胁迫尤其是盐胁迫、冷胁迫、热胁迫产生应答,表明SHMT基因家族在胁迫应答中起到调控作用。综上,文章将甘薯、番茄、拟南芥中SHMT基因家族的生物信息学分析及基因表达数据进行了挖掘,对深入研究SHMT基因在甘薯、番茄、拟南芥中的作用具有重要意义。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT) 生物信息学分析 甘薯 拟南芥 番茄
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白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析 被引量:2
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作者 沈访 李林 +3 位作者 潘胤池 张社波 马激 徐德林 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期543-550,共8页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行序列分析。结果显示:该基因长度为1 953 bp,编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 k D、理论等电点为7.17,SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成,核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高,达93%,结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域,三级结构预测为四聚体结构,跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽,亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置。本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据,也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。 展开更多
关键词 白及 丝氨酸羟甲基转移酶 序列分析 结构预测
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一株高产丝氨酸羟甲基转移酶基因工程菌的构建及发酵产酶条件优化 被引量:1
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作者 喻放 左振宇 +1 位作者 杨忠华 周卫 《武汉科技大学学报》 CAS 2013年第3期219-224,共6页
以E.coli AB90054基因组中DNA为模板,采用PCR方法扩增得到glyA基因,将该基因克隆到表达载体pET28a(+)中,转化表达菌株BL21(DE3)后筛选阳性重组子,并对筛选所得高表达基因工程菌G16进行培养条件和表达条件的优化。结果表明,当培养条件为3... 以E.coli AB90054基因组中DNA为模板,采用PCR方法扩增得到glyA基因,将该基因克隆到表达载体pET28a(+)中,转化表达菌株BL21(DE3)后筛选阳性重组子,并对筛选所得高表达基因工程菌G16进行培养条件和表达条件的优化。结果表明,当培养条件为38℃、pH为7.0、转速为150r/min时,基因工程菌的生长速度和菌液浓度最佳;当表达条件的诱导温度为30℃、诱导剂浓度为0.5mmol/L、诱导时间为5h时,基因工程菌诱导目的蛋白表达效果最好。通过SDS-PAGE分析和酶活测定后发现,在优化条件下基因工程菌G16发酵产丝氨酸羟甲基转移酶能力占菌体总蛋白的60%左右,且蛋白活性正常。 展开更多
关键词 glyA基因 丝氨酸羟甲基转移酶 基因工程 发酵产
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丝氨酸羟甲基转移酶活性测定及酶学性质研究 被引量:1
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作者 郑桂花 赵倩 +2 位作者 汪璨 陶涛 余龙江 《湖北农业科学》 2016年第7期1788-1791,共4页
通过测定苯甲醛在279 nm处的吸光度来确定丝氨酸羟甲基转移酶的活性,利用单因素试验分析Escherichia coli SRZ018菌株最适产丝氨酸羟甲基转移酶的条件。结果表明,最适产酶条件为p H 8.0,反应温度50℃,CTAB为0.03 g/L,DL-β-苯基丝氨酸... 通过测定苯甲醛在279 nm处的吸光度来确定丝氨酸羟甲基转移酶的活性,利用单因素试验分析Escherichia coli SRZ018菌株最适产丝氨酸羟甲基转移酶的条件。结果表明,最适产酶条件为p H 8.0,反应温度50℃,CTAB为0.03 g/L,DL-β-苯基丝氨酸浓度为200μmol/L,PLP浓度为50μmol/L,该条件下丝氨酸羟甲基转移酶的活性最高达到0.881 U/mg。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 单因素分析 DL-β-苯基 L- ESCHERICHIA COLI SRZ018
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脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析 被引量:5
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作者 孙金秋 徐莞媛 +4 位作者 马杭柯 高威 欧阳乐飞 高焕 阎斌伦 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2020年第1期127-134,共8页
本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5′端非编码区为39 bp,3′端非编码区为409 bp... 本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5′端非编码区为39 bp,3′端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd^2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd^2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd^2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd^2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。 展开更多
关键词 脊尾白虾 丝氨酸羟甲基转移酶基因 基因克隆 组织表达 Cd^2+胁迫
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鸡柔嫩艾美耳球虫丝氨酸羟甲基转移酶DNA疫苗免疫保护效果研究
15
作者 包梦莹 邹志萱 +3 位作者 樊慧琴 黄媛媛 王佃云 刘立恒 《中兽医学杂志》 2021年第4期6-7,共2页
鸡球虫病是一种严重危害养鸡业的原虫病。为了检验pVAX-DNA疫苗的保护效果,采用大提质粒和纯化质粒的方法大量制备目的基因疫苗。试验设为4组,分别为:感染非免疫组、非感染非免疫组、pVAX-丝氨酸羟甲基转移酶DNA组、pVAX空质粒组,14日... 鸡球虫病是一种严重危害养鸡业的原虫病。为了检验pVAX-DNA疫苗的保护效果,采用大提质粒和纯化质粒的方法大量制备目的基因疫苗。试验设为4组,分别为:感染非免疫组、非感染非免疫组、pVAX-丝氨酸羟甲基转移酶DNA组、pVAX空质粒组,14日龄首免,21日龄二免,28日龄攻虫5×104/只,35日龄扑杀鸡只后通过相对增重率、鸡只死亡率、克盲肠卵囊值(OPG)、盲肠病变计分等指标,综合计算疫苗抗球虫指数(ACI),进而判断疫苗的保护效果。结果表明:该疫苗ACI值为146.99,具有一定的的免疫保护效果。 展开更多
关键词 鸡柔嫩艾美耳球虫 丝氨酸羟甲基转移酶 DNA疫苗 ACI 免疫保护效果
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丝氨酸羟甲基转移酶对小鼠肝脏缺血再灌注的影响
16
作者 蒋禹 王安康 +1 位作者 白赫 叶明新 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期506-512,共7页
目的探索丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)在小鼠肝脏缺血再灌注损伤的表达及作用。方法 SPF级C57BL/6小鼠60只,分为正常组(sham)、生理盐水对照组(NS)、空载腺相关病毒组(AVV-GFP)、及腺相关病毒沉默组(AAV-SHMT2),每组15只。建模前2周尾静... 目的探索丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)在小鼠肝脏缺血再灌注损伤的表达及作用。方法 SPF级C57BL/6小鼠60只,分为正常组(sham)、生理盐水对照组(NS)、空载腺相关病毒组(AVV-GFP)、及腺相关病毒沉默组(AAV-SHMT2),每组15只。建模前2周尾静脉给予注射腺相关病毒及生理盐水,建立小鼠肝脏70%缺血再灌注模型。收集缺血再灌注模型小鼠的血清及肝组织。采用qPCR、Western blot、免疫荧光和免疫组化检测各组AST/ALT的浓度、SHMT2、JNK、NF-κB、Caspase-3及下游炎症因子表达水平的变化。并利用HE染色观察各组肝组织病理损伤,TUNEL法检测细胞凋亡。结果肝脏缺血再灌注后SHMT2表达随时间升高,在24 h达最高(相对表达量为1.5,P<0.05)。肝脏缺血再灌注24 h后,AAV-SHMT2组AST/ALT水平含量(588/416 U/L)均明显高于对照组(416/345 U/L),空载组(387/321 U/L)(P<0.05)。AAV-SHMT2组与对照组和空载组相比,SHMT2水平明显降低(相对表达量为0.24,P<0.05),p-JNK,p-p65水平明显升高(相对表达量为0.80,0.97,P<0.05),炎症因子水平TNF-α、IL-1β与其保持一致升高(相对表达量为1.6,1.2,P<0.05)。空载组和对照组比较无统计性差异(P>0.05)。结论SHMT2在肝脏缺血再灌注中有可能通过抑制JNK通路激活来缓减肝细胞的凋亡以及抑制NF-κB通路过度激活来减轻肝脏缺血再灌注的损伤。 展开更多
关键词 肝脏缺血再灌注 丝氨酸羟甲基转移酶 JNK NF-ΚB
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叶酸代谢相关基因与非综合征性唇腭裂的关系 被引量:7
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作者 陈尔军 陈仁吉 +2 位作者 穆玥 李金陆 胡颖 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期209-213,共5页
目的:研究叶酸代谢相关基因在中国华北人群中与非综合征性唇腭裂的关系。方法:利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,在115例非综合征性唇腭裂患者和192名正常对照个体中,对CBS和SHMT1基因2个单核苷酸多态性(SNP)rs397589和rs1979... 目的:研究叶酸代谢相关基因在中国华北人群中与非综合征性唇腭裂的关系。方法:利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,在115例非综合征性唇腭裂患者和192名正常对照个体中,对CBS和SHMT1基因2个单核苷酸多态性(SNP)rs397589和rs1979276进行检测。利用拟合优度卡方检验,分析基因型分布频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;应用UNPHASED软件包分析单个基因多态性位点以及基因-基因相互作用与非综合征性唇腭裂的相关性。结果:2个基因上的SNP位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡;等位基因分布在NSCL/P组与对照组之间无显著性差异;rs397589TT和rs1979276TT基因型能增加NSCL/P患病风险(OR=2.60,95%CI=0.43-15.87;OR=1.62,95%CI=0.22-11.70);携带rs397589GT-rs1979276CT个体在患者中的频率高于对照组(χ2=4.780,P=0.029)。结论:CBS和SHMT1基因相互作用可能参与非综合征性唇腭裂的发生。 展开更多
关键词 胱硫醚Β合成 丝氨酸羟甲基转移酶1 非综合征性唇腭裂
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超声内镜联合SHMT2、Prox-1检测在结肠癌患者中的诊断价值
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作者 杨松 蒋远建 刘维平 《医学研究与战创伤救治》 北大核心 2024年第11期1158-1162,共5页
目的 分析超声内镜联合丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)、同源盒蛋白1(Prox-1)检测在结肠癌患者中的诊断价值。方法 选取2021年1月至2023年10月贵州省人民医院120例因疑似结肠癌症状或体征到院检查者为研究对象,根据病理活组织检查(活检)结... 目的 分析超声内镜联合丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)、同源盒蛋白1(Prox-1)检测在结肠癌患者中的诊断价值。方法 选取2021年1月至2023年10月贵州省人民医院120例因疑似结肠癌症状或体征到院检查者为研究对象,根据病理活组织检查(活检)结果分为良性组37例、恶性组83例。超声内镜下检查病变情况,免疫组织化学法检测病理组织的SHMT2、Prox-1表达;比较临床特征下的SHMT2、Prox-1表达差异;Logistic回归分析影响结肠癌的因素;Kappa检验分析超声内镜、SHMT2、Prox-1、联合指标诊断与活检诊断的一致性;ROC曲线分析超声内镜、SHMT2、Prox-1、联合指标诊断的价值。结果恶性组组织中SHMT2、Prox-1阳性表达的比例高于良性组(83.13%vs 24.32%、80.72%vs 18.92%,P<0.05),SHMT2、Prox-1阴性表达的比例低于良性组(16.87%vs 75.68%、19.28%vs 81.08%,P<0.05)。恶性组中,SHMT2、Prox-1在肿瘤最大径≥3 cm(69.57%vs 35.17%、74.63%vs 18.75%)、Ⅲ+Ⅳ期(63.77%vs 50.00%、67.16%vs 37.50%)、远处转移(71.01%vs 28.57%、73.13%vs25.00%)、深层浸润(53.62%vs 21.43%、56.72%vs 12.50%)、低分化组织下的阳性比例(63.77%vs 21.43%、62.69%vs 31.25%)高于阴性比例(P<0.05)。Ⅲ+Ⅳ期、远处转移、深层浸润、SHMT2阳性、Prox-1阳性为结肠癌发生的危险因素(P<0.05)。超声内镜、SHMT2、Prox-1在诊断结肠癌方面与活检有中等一致性(P<0.05),联合指标诊断与活检的一致性略高于超声内镜、SHMT2、Prox-1诊断。联合指标诊断恶性结肠癌的特异度、准确度、AUC高于单一指标诊断(P<0.05)。结论 结肠癌组织中SHMT2、Prox-1强烈表达,与结肠癌患者的不良病理特征相关,结合超声内镜、SHMT2、Prox-1可提高结肠癌诊断的特异度和准确度。 展开更多
关键词 结肠癌 诊断 超声内镜 丝氨酸羟甲基转移酶2 同源盒蛋白1
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SHMT1多态性与ALL儿童HD-MTX不良反应的关系 被引量:6
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作者 丁慧 岳丽杰 +4 位作者 于洁 谢偲 杨春兰 任艳飞 刘畅 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期162-165,共4页
研究丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase 1,SHMT 1)基因多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphocytic leukemia,ALL)儿童大剂量甲氨蝶呤(high-dosemethotrexate,HD-MTX )不良反应的相关性。方法:本研究... 研究丝氨酸羟甲基转移酶1(serine hydroxymethyltransferase 1,SHMT 1)基因多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphocytic leukemia,ALL)儿童大剂量甲氨蝶呤(high-dosemethotrexate,HD-MTX )不良反应的相关性。方法:本研究以51例接受HD-MTX 化疗的ALL 患儿为研究对象,统计分析其应用HD-MTX 后产生的临床表现;提取mRNA 后逆转录为cDNA ,利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis ,DGGE)结合DNA测序检测SHMT 1 多态性(rs 1979277、rs 3783、rs 1979276、rs 12952556),并分析其与HD-MTX 不良反应的关系。结果:接受HD-MTX 化疗的ALL 患儿产生的严重不良反应主要表现为中性粒细胞减少和肝功能损害。rs 3783(C〉G )、rs 1979276(C〉T)、rs 12952556(A〉G )及rs 1979277(C〉T)的基因型分布情况相同,rs 1979277 多态性与中性粒细胞减少的发生风险无关(P〉0.05),但其CT及TT基因型可以降低肝功能损害的发生风险(CT:OR= 0.129,95%CI:0.020~0.817,P=0.03;TT:OR= 0.103,95%CI:0.017~0.620,P=0.013)。 结论:rs 1979277、rs 3783、rs 1979276 及rs 12952556的联合作用与中性粒细胞减少的发生无关,但它们之中一个或多个位点可能降低肝功能损害的发生。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶1 多态性 急性淋巴细胞白血病 蝶呤 不良反应
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植物SHMT基因家族研究进展 被引量:2
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作者 倪弦之 柏浩东 +4 位作者 韩进财 罗丁峰 李祖任 胡一鸿 金晨钟 《湖南农业科学》 2021年第1期102-106,共5页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞代谢和光呼吸作用的关键酶,对丝氨酸和甘氨酸反应起着催化作用。SHMT基因家族是存在于胞质和线粒体中结构和功能上非常相似的编码SHMT蛋白的一类基因。对SHMT基因在植物体中的分类及表达、SHMT基因... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞代谢和光呼吸作用的关键酶,对丝氨酸和甘氨酸反应起着催化作用。SHMT基因家族是存在于胞质和线粒体中结构和功能上非常相似的编码SHMT蛋白的一类基因。对SHMT基因在植物体中的分类及表达、SHMT基因的克隆、SHMT基因逆境表达机理及其在植物保护领域中的应用等研究进展进行了综述,旨在为植物SHMT基因家族的功能及其相关应用研究提供参考。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT) 基因克隆 逆境表达 植物保护 综述
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