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决明苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因家族的全基因组分析
1
作者
赵咏洋
陈维嘉
+3 位作者
丁静峰
敖以恒
冯傲
周嘉裕
《湖北农业科学》
2023年第6期181-187,共7页
利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从决明(Senna tora)等不同物种中筛选获得26条PAL(苯丙氨酸解氨酶)序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,决明PAL基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成,且6个PAL成员被分为3个亚类。决明...
利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从决明(Senna tora)等不同物种中筛选获得26条PAL(苯丙氨酸解氨酶)序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,决明PAL基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成,且6个PAL成员被分为3个亚类。决明PAL基因家族成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;含有较高的Ala、Ser和Leu残基;存在16种不同的保守基序,其中motif12(含有催化关键序列Ala-Ser-Gly)在所有PAL成员中均出现;启动子区含有较多的光反应、植物激素响应与逆境胁迫响应元件。进一步的GO、转录组与Pearson分析也强化了以上分析结果,即决明PAL基因家族成员多集中在叶、茎和花等易感受光的组织,参与抗旱与抗菌等生物学过程呈现多样化的特点。以上分析结果将为决明PAL基因的后续功能研究及抗逆功能基因筛选提供理论基础。
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关键词
决明(Senna
tora)
丙氨酸解氨酶
(PAL)
基因家族
生物信息学
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职称材料
噻二唑苯基脲在平贝母脱分化过程中引起的生理生化变化
被引量:
3
2
作者
刘亚菊
殷红
朱四易
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003年第3期433-437,共5页
平贝母(Fritillaria ussuriensis Maxim)鳞茎切块分别在含噻二唑苯基脲(TDZ)或激动素(Kin)的培养基上脱分化过程中的苯丙氨酸解氨酶、淀粉酶、吲哚乙酸氧化酶和过氧化物酶活性均增强,在外植体脱分化前达到峰值,随后下降。TDZ处理下这些...
平贝母(Fritillaria ussuriensis Maxim)鳞茎切块分别在含噻二唑苯基脲(TDZ)或激动素(Kin)的培养基上脱分化过程中的苯丙氨酸解氨酶、淀粉酶、吲哚乙酸氧化酶和过氧化物酶活性均增强,在外植体脱分化前达到峰值,随后下降。TDZ处理下这些酶的活性均高于Kin处理。可溶性蛋白含量的变化趋势与酶活性变化相同,只是TDZ作用下蛋白含量增加的相对水平较低。说明TDZ具有比Kin更强的细胞分裂素活性。
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关键词
平贝母
脱分化过程
噻二唑苯基脲
培养基
丙氨酸解氨酶
淀粉
酶
吲哚乙
酸
氧化
酶
过氧化物
酶
酶
活性
可溶性蛋白含量
组织培养
细胞分裂素
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职称材料
茶树叶片感染茶饼病菌后诱导的生化反应
3
作者
陈宗懋
《中国茶叶》
2003年第6期39-39,共1页
关键词
茶树
叶片
茶饼病菌
生化反应
丙
氨
酸
氨
裂
解
酶
多酚氧化
酶
过氧化物
酶
蛋白质
脯
氨
酸
酚类化合物
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职称材料
题名
决明苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因家族的全基因组分析
1
作者
赵咏洋
陈维嘉
丁静峰
敖以恒
冯傲
周嘉裕
机构
西南交通大学生命科学与工程学院
出处
《湖北农业科学》
2023年第6期181-187,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31500276)
四川省中医药管理局项目(2021MS116)
+2 种基金
中央高校基本科研业务费医工结合项目(2682021ZTPY017)
国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202110613083)
西南交通大学个性化实验项目(GX20211600310001)。
文摘
利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从决明(Senna tora)等不同物种中筛选获得26条PAL(苯丙氨酸解氨酶)序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,决明PAL基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成,且6个PAL成员被分为3个亚类。决明PAL基因家族成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;含有较高的Ala、Ser和Leu残基;存在16种不同的保守基序,其中motif12(含有催化关键序列Ala-Ser-Gly)在所有PAL成员中均出现;启动子区含有较多的光反应、植物激素响应与逆境胁迫响应元件。进一步的GO、转录组与Pearson分析也强化了以上分析结果,即决明PAL基因家族成员多集中在叶、茎和花等易感受光的组织,参与抗旱与抗菌等生物学过程呈现多样化的特点。以上分析结果将为决明PAL基因的后续功能研究及抗逆功能基因筛选提供理论基础。
关键词
决明(Senna
tora)
丙氨酸解氨酶
(PAL)
基因家族
生物信息学
Keywords
Senna tora
alanine ammonia lyase(PAL)
gene family
bioinformatics
分类号
S567.219 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
噻二唑苯基脲在平贝母脱分化过程中引起的生理生化变化
被引量:
3
2
作者
刘亚菊
殷红
朱四易
机构
江苏徐州甘薯研究中心国家甘薯改良中心
西北大学生命科学学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003年第3期433-437,共5页
基金
国家自然科学基金(37170097)
文摘
平贝母(Fritillaria ussuriensis Maxim)鳞茎切块分别在含噻二唑苯基脲(TDZ)或激动素(Kin)的培养基上脱分化过程中的苯丙氨酸解氨酶、淀粉酶、吲哚乙酸氧化酶和过氧化物酶活性均增强,在外植体脱分化前达到峰值,随后下降。TDZ处理下这些酶的活性均高于Kin处理。可溶性蛋白含量的变化趋势与酶活性变化相同,只是TDZ作用下蛋白含量增加的相对水平较低。说明TDZ具有比Kin更强的细胞分裂素活性。
关键词
平贝母
脱分化过程
噻二唑苯基脲
培养基
丙氨酸解氨酶
淀粉
酶
吲哚乙
酸
氧化
酶
过氧化物
酶
酶
活性
可溶性蛋白含量
组织培养
细胞分裂素
Keywords
thidiazuron
Fritillaria ussuriensis
dedifferentiation
enzyme activity
soluble protein content
分类号
S567.231 [农业科学—中草药栽培]
S336 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
茶树叶片感染茶饼病菌后诱导的生化反应
3
作者
陈宗懋
出处
《中国茶叶》
2003年第6期39-39,共1页
关键词
茶树
叶片
茶饼病菌
生化反应
丙
氨
酸
氨
裂
解
酶
多酚氧化
酶
过氧化物
酶
蛋白质
脯
氨
酸
酚类化合物
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
决明苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因家族的全基因组分析
赵咏洋
陈维嘉
丁静峰
敖以恒
冯傲
周嘉裕
《湖北农业科学》
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
噻二唑苯基脲在平贝母脱分化过程中引起的生理生化变化
刘亚菊
殷红
朱四易
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
茶树叶片感染茶饼病菌后诱导的生化反应
陈宗懋
《中国茶叶》
2003
0
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