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牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
1
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作者
付东海
吴晓云
+7 位作者
王宏博
褚敏
郭宪
裴杰
包鹏甲
丁学智
阎萍
梁春年
《中国草食动物科学》
CAS
2018年第3期1-6,共6页
为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码...
为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 k D,理论等电点(p I)为9.23,消光系数83 895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30 h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构。
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关键词
牦牛
不饱和脂肪酸合成酶
基因克隆
生物信息学分析
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职称材料
题名
牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
付东海
吴晓云
王宏博
褚敏
郭宪
裴杰
包鹏甲
丁学智
阎萍
梁春年
机构
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
甘肃省牦牛繁育重点实验室
出处
《中国草食动物科学》
CAS
2018年第3期1-6,共6页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1610322017002)
甘肃省草食畜产业技术体系
+1 种基金
现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)
中国农业科学院牦牛资源与育种创新团队(CAAS-ASTIP-2014-LIHPS)
文摘
为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 k D,理论等电点(p I)为9.23,消光系数83 895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30 h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构。
关键词
牦牛
不饱和脂肪酸合成酶
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
yak
SCD
gene cloning
bioinformatics analysis
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析
付东海
吴晓云
王宏博
褚敏
郭宪
裴杰
包鹏甲
丁学智
阎萍
梁春年
《中国草食动物科学》
CAS
2018
1
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