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副溶血性弧菌不耐热溶血素的生物信息学分析与分子动力学模拟
1
作者
张德福
于振兴
+4 位作者
张明
吕欣然
张永勤
张国清
励建荣
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期251-257,I0009-I0012,共11页
副溶血性弧菌是一种革兰氏阴性人畜共患致病菌,可引发人类胃肠炎等食源性疾病。副溶血性弧菌具有多种毒力因子,热不稳定溶血素(thermolabile hemolysin,TLH)即是其中之一。该研究对副溶血性弧菌的tlh基因进行了克隆及测序,对tlh基因编码...
副溶血性弧菌是一种革兰氏阴性人畜共患致病菌,可引发人类胃肠炎等食源性疾病。副溶血性弧菌具有多种毒力因子,热不稳定溶血素(thermolabile hemolysin,TLH)即是其中之一。该研究对副溶血性弧菌的tlh基因进行了克隆及测序,对tlh基因编码的TLH蛋白进行了生物信息学分析及结构和功能预测。结果表明,TLH蛋白由418个氨基酸组成,预测分子质量为47.36 kDa。在TLH蛋白中确定了几个保守的结构域和基序,包括SGNH水解酶结构域和GDSL基序;对TLH蛋白的三维结构进行了同源建模及验证,在此基础上通过分子动力学模拟分析其稳定性、与4-硝基苯基月桂酸酯(p-nitrophenylaurate,PNPL)的相互作用能力及结合底物对结构紧密度和残基灵活性的影响,揭示了催化三联体Ser153-His390-Asp393周边是一个重要的药物靶点活性口袋,具有高度保守的残基序列,并在底物结合后表现出残基灵活性差异。该研究分析了副溶血性弧菌TLH蛋白的性质和结构,可以为保障水产品的安全性、提高水产品原料安全评价水平提供理论支持。
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关键词
基因克隆
副
溶
血性弧菌
不耐热溶血素
(tlh)
生物信息学分析
分子动力学模拟
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职称材料
双重PCR检测携带有tl和tdh基因的副溶血弧菌毒力菌株
被引量：
14
2
作者
吴彩云
蔡俊鹏
+4 位作者
杨汝德
陈清
罗立新
吴后波
俞守义
《水产科学》
CAS
北大核心
2004年第5期5-9,共5页
在常规PCR技术的基础上优化条件 ,建立并完善双重PCR技术 ,并通过检测阳性对照和待检样品 ,进一步确定其检测的可行性。结果表明在常规PCR方法中为阳性的样品 ,包括阳性对照以及待检样品 ,在双重PCR方法中也呈现阳性 ,为阴性的样品在本...
在常规PCR技术的基础上优化条件 ,建立并完善双重PCR技术 ,并通过检测阳性对照和待检样品 ,进一步确定其检测的可行性。结果表明在常规PCR方法中为阳性的样品 ,包括阳性对照以及待检样品 ,在双重PCR方法中也呈现阳性 ,为阴性的样品在本方法中则也呈现阴性 ;能在血平板中出现溶血圈的在本法中也被印证含有tdh基因。由此证实本方法确实能对tl和tdh两种基因同时进行检测 ,成功地证明了同时检测tl和tdh两种基因的双重PCR方法的可行性。该法不但具有常规PCR的优点 ,而且还能节省耗材和时间 。
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关键词
双重PCR
副
溶
血弧菌
不耐热溶血素
水产食品
毒力
菌株
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职称材料
题名
副溶血性弧菌不耐热溶血素的生物信息学分析与分子动力学模拟
1
作者
张德福
于振兴
张明
吕欣然
张永勤
张国清
励建荣
机构
渤海大学食品科学与工程学院
山东美佳集团有限公司
锦州市农业农村综合服务中心水产技术推广站
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期251-257,I0009-I0012,共11页
基金
渤海大学海洋研究院开放课题(BDHYYJY2024003)
渤海大学食品科学与工程学院预研项目。
文摘
副溶血性弧菌是一种革兰氏阴性人畜共患致病菌,可引发人类胃肠炎等食源性疾病。副溶血性弧菌具有多种毒力因子,热不稳定溶血素(thermolabile hemolysin,TLH)即是其中之一。该研究对副溶血性弧菌的tlh基因进行了克隆及测序,对tlh基因编码的TLH蛋白进行了生物信息学分析及结构和功能预测。结果表明,TLH蛋白由418个氨基酸组成,预测分子质量为47.36 kDa。在TLH蛋白中确定了几个保守的结构域和基序,包括SGNH水解酶结构域和GDSL基序;对TLH蛋白的三维结构进行了同源建模及验证,在此基础上通过分子动力学模拟分析其稳定性、与4-硝基苯基月桂酸酯(p-nitrophenylaurate,PNPL)的相互作用能力及结合底物对结构紧密度和残基灵活性的影响,揭示了催化三联体Ser153-His390-Asp393周边是一个重要的药物靶点活性口袋,具有高度保守的残基序列,并在底物结合后表现出残基灵活性差异。该研究分析了副溶血性弧菌TLH蛋白的性质和结构,可以为保障水产品的安全性、提高水产品原料安全评价水平提供理论支持。
关键词
基因克隆
副
溶
血性弧菌
不耐热溶血素
(tlh)
生物信息学分析
分子动力学模拟
Keywords
gene cloning
Vibrio parahaemolyticus
thermolabile hemolysin(tlh)
bioinformatics analysis
molecular dynamics simulation
分类号
TS254.1 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
双重PCR检测携带有tl和tdh基因的副溶血弧菌毒力菌株
被引量：
14
2
作者
吴彩云
蔡俊鹏
杨汝德
陈清
罗立新
吴后波
俞守义
机构
华南理工大学食品与生物工程学院
第一军医大学流行病教研室
中国科学院南海海洋研究所
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2004年第5期5-9,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 3 0 0 70 5 91
40 1760 3 6)
教育部留学回国人员科研启动基金资助项目 ( 2 0 0 0 -3 67)
文摘
在常规PCR技术的基础上优化条件 ,建立并完善双重PCR技术 ,并通过检测阳性对照和待检样品 ,进一步确定其检测的可行性。结果表明在常规PCR方法中为阳性的样品 ,包括阳性对照以及待检样品 ,在双重PCR方法中也呈现阳性 ,为阴性的样品在本方法中则也呈现阴性 ;能在血平板中出现溶血圈的在本法中也被印证含有tdh基因。由此证实本方法确实能对tl和tdh两种基因同时进行检测 ,成功地证明了同时检测tl和tdh两种基因的双重PCR方法的可行性。该法不但具有常规PCR的优点 ,而且还能节省耗材和时间 。
关键词
双重PCR
副
溶
血弧菌
不耐热溶血素
水产食品
毒力
菌株
Keywords
double PCR(dPCR)
Vibrio parahaemolyticus(Vp)
thermolabile haemolysin(TL)
thermostable direct haemolysin(TDH)
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
副溶血性弧菌不耐热溶血素的生物信息学分析与分子动力学模拟
张德福
于振兴
张明
吕欣然
张永勤
张国清
励建荣
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
双重PCR检测携带有tl和tdh基因的副溶血弧菌毒力菌株
吴彩云
蔡俊鹏
杨汝德
陈清
罗立新
吴后波
俞守义
《水产科学》
CAS
北大核心
2004
14
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职称材料
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