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猪转录因子SOX2下游调控蛋白筛选及调控网络建立
1
作者
吕嘉伟
尹智
+4 位作者
李妍
王加强
赵剑超
伟人悦
刘忠华
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期44-57,共14页
SOX2是早期胚胎发育与干细胞多能性维持相关的重要转录因子。从猪孤雌囊胚中克隆获得猪SOX2基因并构建对应过表达体系。通过猪pEF细胞系与PK15细胞系中过表达SOX2基因及qPCR技术,检测89个下游调控候选基因表达情况,建立猪SOX2下游调控...
SOX2是早期胚胎发育与干细胞多能性维持相关的重要转录因子。从猪孤雌囊胚中克隆获得猪SOX2基因并构建对应过表达体系。通过猪pEF细胞系与PK15细胞系中过表达SOX2基因及qPCR技术,检测89个下游调控候选基因表达情况,建立猪SOX2下游调控网络。结果发现,GATA4、MSC、GSC、FGF4、STELLA、ACACA、FN1、KLF4以及MEK基因在pEF细胞系与PK15细胞系间呈差异性调控表达。BMP4、FGFR2、ACAA2、ACSL3、β-CATENIN、c-MYC、MYST3、GSK3β、ALDH3A2、STAT3、SMAD2、KDM6A、ACADL、PI3K与WDR3基因在两种细胞系中呈同趋势性调控表达;经JASPAR数据库预测发现,WDR3、β-CATENIN、ACAA2、KDM6A、STAT3、ACADL、GSK3β与ALDH3A2基因启动子区域存在高相关性的SOX2蛋白结合位点,推测这些基因受SOX2蛋白直接调控;同时构建针对猪SOX2基因的高效敲除体系。研究结果为建立物种特异性的猪SOX2调控网络提供数据基础。
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关键词
猪SOX2基因
转录因子
下游
调控
蛋白
调控网络
基因敲除
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职称材料
嫁接于3个枣园病砧的抗病接穗枣疯植原体检测及分子变异
被引量：
2
2
作者
张文鑫
于少帅
+6 位作者
田国忠
王合
任争光
王圣洁
孔德治
李永
林彩丽
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期49-58,共10页
【目的】检测3个枣园不同抗性枣树材料嫁接传毒后携带植原体状况,分析不同植原体株系传播流行、遗传变异和系统发育及其与枣树品种抗性之间的关系,揭示枣疯植原体群体遗传变异特性,为抗病品系合理利用与病害防控提供依据。【方法】4月...
【目的】检测3个枣园不同抗性枣树材料嫁接传毒后携带植原体状况,分析不同植原体株系传播流行、遗传变异和系统发育及其与枣树品种抗性之间的关系,揭示枣疯植原体群体遗传变异特性,为抗病品系合理利用与病害防控提供依据。【方法】4月采集不同抗性枣树材料嫁接到北京玉泉山枣树资源圃、北京昌平王家园和河北唐县军城镇三地枣园的发病砧木上,当年8—10月分别提取接穗和砧木组织样品总DNA,利用植原体16S rDNA、16S-23S间区(SR)、secA、tuf、fusA-tuf间区、himA及其下游假定蛋白基因等片段进行PCR和LAMP检测,并对PCR产物进行测序,分析遗传变异和系统进化。【结果】抗病品系的接穗材料症状严重度大都低于感病砧木;表现无症接穗T30通过直接和巢式PCR与LAMP均未检测到植原体;3个枣园枣树样品中的植原体16S rDNA、SR、tuf和secA基因序列同源性为100%;根据所测38份样品中himA及其下游假定蛋白基因序列在117、154和190 bp位点的碱基变异,军城镇样品序列聚于T-A型,玉泉山样品和河北唐县梁家沟枣疯序列聚于C-A型,而昌平样品和泗洪、泰安、通州枣疯序列聚于C-C型;根据所测29份样品中fusA-tuf基因间区序列在第39 bp位置有碱基A插入或缺失,将玉泉山和军城镇样品归于TJ2型,而国内其他地区各株系和昌平样品为TJ1型;himA及其下游假定蛋白基因序列及fusA-tuf基因间区序列在3个枣园各有优势菌株序列,序列分型对应且互相佐证。【结论】本研究首次测定枣树‘骏优2号’(Z18)优良品系具有高抗病性,并首次检测到3个枣园内枣疯植原体株系的himA及其下游假定蛋白基因与fusA-tuf基因间区存在明显地域差异,且与样品抗病性强弱无关联;初步排除玉泉山枣园植原体来源于江苏泗洪大枣移栽苗传病的假设。
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关键词
嫁接
抗病性
枣疯病
植原体
16S
rDNA
himA及其
下游
假定
蛋白
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职称材料
题名
猪转录因子SOX2下游调控蛋白筛选及调控网络建立
1
作者
吕嘉伟
尹智
李妍
王加强
赵剑超
伟人悦
刘忠华
机构
东北农业大学生命科学学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期44-57,共14页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFA0100200)
文摘
SOX2是早期胚胎发育与干细胞多能性维持相关的重要转录因子。从猪孤雌囊胚中克隆获得猪SOX2基因并构建对应过表达体系。通过猪pEF细胞系与PK15细胞系中过表达SOX2基因及qPCR技术,检测89个下游调控候选基因表达情况,建立猪SOX2下游调控网络。结果发现,GATA4、MSC、GSC、FGF4、STELLA、ACACA、FN1、KLF4以及MEK基因在pEF细胞系与PK15细胞系间呈差异性调控表达。BMP4、FGFR2、ACAA2、ACSL3、β-CATENIN、c-MYC、MYST3、GSK3β、ALDH3A2、STAT3、SMAD2、KDM6A、ACADL、PI3K与WDR3基因在两种细胞系中呈同趋势性调控表达;经JASPAR数据库预测发现,WDR3、β-CATENIN、ACAA2、KDM6A、STAT3、ACADL、GSK3β与ALDH3A2基因启动子区域存在高相关性的SOX2蛋白结合位点,推测这些基因受SOX2蛋白直接调控;同时构建针对猪SOX2基因的高效敲除体系。研究结果为建立物种特异性的猪SOX2调控网络提供数据基础。
关键词
猪SOX2基因
转录因子
下游
调控
蛋白
调控网络
基因敲除
Keywords
porcine SOX2 gene
transcription factor
downstream regulatory protein
regulatory network
gene knockout
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
嫁接于3个枣园病砧的抗病接穗枣疯植原体检测及分子变异
被引量：
2
2
作者
张文鑫
于少帅
田国忠
王合
任争光
王圣洁
孔德治
李永
林彩丽
机构
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
中国热带农业科学院椰子研究所
北京市林业保护站
北京农学院植物科学技术学院
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期49-58,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31370644)
国家微生物资源平台(NIMR 2017-7)。
文摘
【目的】检测3个枣园不同抗性枣树材料嫁接传毒后携带植原体状况,分析不同植原体株系传播流行、遗传变异和系统发育及其与枣树品种抗性之间的关系,揭示枣疯植原体群体遗传变异特性,为抗病品系合理利用与病害防控提供依据。【方法】4月采集不同抗性枣树材料嫁接到北京玉泉山枣树资源圃、北京昌平王家园和河北唐县军城镇三地枣园的发病砧木上,当年8—10月分别提取接穗和砧木组织样品总DNA,利用植原体16S rDNA、16S-23S间区(SR)、secA、tuf、fusA-tuf间区、himA及其下游假定蛋白基因等片段进行PCR和LAMP检测,并对PCR产物进行测序,分析遗传变异和系统进化。【结果】抗病品系的接穗材料症状严重度大都低于感病砧木;表现无症接穗T30通过直接和巢式PCR与LAMP均未检测到植原体;3个枣园枣树样品中的植原体16S rDNA、SR、tuf和secA基因序列同源性为100%;根据所测38份样品中himA及其下游假定蛋白基因序列在117、154和190 bp位点的碱基变异,军城镇样品序列聚于T-A型,玉泉山样品和河北唐县梁家沟枣疯序列聚于C-A型,而昌平样品和泗洪、泰安、通州枣疯序列聚于C-C型;根据所测29份样品中fusA-tuf基因间区序列在第39 bp位置有碱基A插入或缺失,将玉泉山和军城镇样品归于TJ2型,而国内其他地区各株系和昌平样品为TJ1型;himA及其下游假定蛋白基因序列及fusA-tuf基因间区序列在3个枣园各有优势菌株序列,序列分型对应且互相佐证。【结论】本研究首次测定枣树‘骏优2号’(Z18)优良品系具有高抗病性,并首次检测到3个枣园内枣疯植原体株系的himA及其下游假定蛋白基因与fusA-tuf基因间区存在明显地域差异,且与样品抗病性强弱无关联;初步排除玉泉山枣园植原体来源于江苏泗洪大枣移栽苗传病的假设。
关键词
嫁接
抗病性
枣疯病
植原体
16S
rDNA
himA及其
下游
假定
蛋白
Keywords
graft
disease resistance
jujube witches’-broom disease
phytoplasma
16S rDNA
himA and its downstream hypothetical protein
分类号
S763.7 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪转录因子SOX2下游调控蛋白筛选及调控网络建立
吕嘉伟
尹智
李妍
王加强
赵剑超
伟人悦
刘忠华
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
嫁接于3个枣园病砧的抗病接穗枣疯植原体检测及分子变异
张文鑫
于少帅
田国忠
王合
任争光
王圣洁
孔德治
李永
林彩丽
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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