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题名数量性状基因的完备区间作图方法
被引量：125
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作者
王建康
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机构
中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程
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出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期239-245,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(30771351)
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z1B1)资助
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文摘
结合分子标记和表型数据的QTL作图已成为数量性状遗传分析的常规方法。复合区间作图是近10多年来广泛应用的一种QTL定位方法,但它在算法上有一些缺陷,致使QTL效应可能会被侧连标记区间之外的标记变量吸收,同时不同的背景标记选择方法对作图结果的影响较大,并且难以推广到上位型互作QTL的定位。针对这些问题,笔者提出完备区间作图方法。本文介绍了该方法的遗传和统计原理,并通过一个大麦加倍单倍体群体说明其在定位加性QTL和加性×加性互作QTL中的应用。完备区间作图包含两个步骤:首先利用所有标记的信息,通过逐步回归选择重要的标记变量并估计其效应;然后利用逐步回归得到的线性模型校正表型数据,通过一维扫描定位加(显)性效应QTL,通过二维扫描定位上位型互作QTL。这种作图策略简化了复合区间作图中控制背景遗传变异的过程,提高了对QTL的检测功效。
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关键词
数量性状
QTL作图
完备区间作图
加显性效应
上位型互作
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Keywords
Quantitative trait
QTL mapping
Inclusive composite interval mapping
Additive and dominance effects
Epistatic interaction
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分类号
S336
[农业科学—作物遗传育种]
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