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三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析
1
作者
熊霜
周富琴
+3 位作者
王仕东
李锐
王树宝
黄媛
《广西植物》
北大核心
2025年第5期855-871,共17页
三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)是金缕梅科(Hamamelidaceae)水丝梨属(Sycopsis)的一种常绿灌木。水丝梨属的系统发育地位仍存在争议且与假蚊母属(Distyliopsis)、蚊母树属(Distylium)等近缘属之间的亲缘关系尚不明确。该研究对三脉...
三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)是金缕梅科(Hamamelidaceae)水丝梨属(Sycopsis)的一种常绿灌木。水丝梨属的系统发育地位仍存在争议且与假蚊母属(Distyliopsis)、蚊母树属(Distylium)等近缘属之间的亲缘关系尚不明确。该研究对三脉水丝梨的叶绿体基因组进行测序与组装,结合公共数据库中金缕梅科其他物种的叶绿体基因组数据,开展比较基因组分析和叶绿体基因组系统发育分析。结果表明:(1)三脉水丝梨基因组大小为159375 bp,共编码133个基因,包括8个rRNA基因、37个tRNA基因、87个蛋白编码基因和1个假基因。(2)共检测到33个散在重复序列、39个串联重复序列和82个简单重复序列(SSRs)。(3)密码子偏好以A/U结尾,共包含9个最优密码子且密码子偏好主要受自然选择的影响。(4)与近缘种相比,三脉水丝梨的叶绿体基因组整体较为保守,从水丝梨属中筛选到的15个高变异区域具有潜在用于分子鉴定的价值。(5)系统发育分析显示,金缕梅科为单系类群,金缕梅属(Hamamelis)、白缕梅属(Parrotiopsis)、水丝梨属、假蚊母属、波斯铁木属(Parrotia)和蚊母树属形成了一个强力支持的单系分支,6个属之间具有较近的亲缘关系,其中三脉水丝梨与该分支中的其他类群互为姐妹群,而水丝梨属、波斯铁木属、假蚊母属和蚊母树属均非单系。该研究结果为金缕梅科的系统发育研究提供了重要的基础数据和参考。
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关键词
三脉水丝梨
叶绿体基因组
水
丝
梨
属
金缕梅科
基因组系统学
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职称材料
乌蒙山保护区峨眉栲、三脉水丝梨群落结构及物种多样性
被引量：
1
2
作者
古朝山
陈娜
+2 位作者
杨科
刘恩德
李伟
《贵州林业科技》
2024年第2期50-55,62,共7页
以乌蒙山保护区中山湿性常绿阔叶林峨眉栲(Castanopsis platyacantha)、三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)群落为研究对象,采用群落生态学方法分析群落结构及物种多样性。结果表明:(1)样地内调查到维管束植物175种,隶属64个科103个属,...
以乌蒙山保护区中山湿性常绿阔叶林峨眉栲(Castanopsis platyacantha)、三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)群落为研究对象,采用群落生态学方法分析群落结构及物种多样性。结果表明:(1)样地内调查到维管束植物175种,隶属64个科103个属,种子植物科、属的分布区划为12个类型,总体上可分为广布型、热带型、温带型;(2)群落乔木层、灌木层、草本层优势种分别为峨眉栲和三脉水丝梨、筇竹(Chimonobambusa tumidissinoda)、骤尖楼梯草(Elatostema cuspidatum),物种重要值与数量呈现出不同程度的正相关,相关强度表现为灌木层>草本层>乔木层;(3)群落Shannon-Weiner多样性指数和Pielou均匀度指数呈现出灌木层>草本层>乔木层,Margalef丰富度指数和Simpson优势度指数表现为乔木层>草本层>灌木层;(4)整个群落以第Ⅰ龄级和高度Ⅰ级树木占优势,而乔木层则以第Ⅱ龄级和高度Ⅱ级树木占优势。群落物种丰富,优势种明显,生长稳定,有利于维持保护区生态系统稳定和生物多样性安全。
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关键词
乌蒙山保护区
中山湿性常绿阔叶林
峨眉栲
三脉水丝梨
群落结构
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职称材料
题名
三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析
1
作者
熊霜
周富琴
王仕东
李锐
王树宝
黄媛
机构
云南师范大学生命科学学院
出处
《广西植物》
北大核心
2025年第5期855-871,共17页
基金
国家自然科学基金(32360065)。
文摘
三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)是金缕梅科(Hamamelidaceae)水丝梨属(Sycopsis)的一种常绿灌木。水丝梨属的系统发育地位仍存在争议且与假蚊母属(Distyliopsis)、蚊母树属(Distylium)等近缘属之间的亲缘关系尚不明确。该研究对三脉水丝梨的叶绿体基因组进行测序与组装,结合公共数据库中金缕梅科其他物种的叶绿体基因组数据,开展比较基因组分析和叶绿体基因组系统发育分析。结果表明:(1)三脉水丝梨基因组大小为159375 bp,共编码133个基因,包括8个rRNA基因、37个tRNA基因、87个蛋白编码基因和1个假基因。(2)共检测到33个散在重复序列、39个串联重复序列和82个简单重复序列(SSRs)。(3)密码子偏好以A/U结尾,共包含9个最优密码子且密码子偏好主要受自然选择的影响。(4)与近缘种相比,三脉水丝梨的叶绿体基因组整体较为保守,从水丝梨属中筛选到的15个高变异区域具有潜在用于分子鉴定的价值。(5)系统发育分析显示,金缕梅科为单系类群,金缕梅属(Hamamelis)、白缕梅属(Parrotiopsis)、水丝梨属、假蚊母属、波斯铁木属(Parrotia)和蚊母树属形成了一个强力支持的单系分支,6个属之间具有较近的亲缘关系,其中三脉水丝梨与该分支中的其他类群互为姐妹群,而水丝梨属、波斯铁木属、假蚊母属和蚊母树属均非单系。该研究结果为金缕梅科的系统发育研究提供了重要的基础数据和参考。
关键词
三脉水丝梨
叶绿体基因组
水
丝
梨
属
金缕梅科
基因组系统学
Keywords
Sycopsis triplinervia
chloroplast genome
Sycopsis
Hamamelidaceae
phylogenomic phylogenetics
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
乌蒙山保护区峨眉栲、三脉水丝梨群落结构及物种多样性
被引量：
1
2
作者
古朝山
陈娜
杨科
刘恩德
李伟
机构
云南乌蒙山国家级自然保护区管护局
中国科学院昆明植物研究所
出处
《贵州林业科技》
2024年第2期50-55,62,共7页
基金
云南乌蒙山国家级自然保护区2020年中央财政林业改革发展资金项目。
文摘
以乌蒙山保护区中山湿性常绿阔叶林峨眉栲(Castanopsis platyacantha)、三脉水丝梨(Sycopsis triplinervia)群落为研究对象,采用群落生态学方法分析群落结构及物种多样性。结果表明:(1)样地内调查到维管束植物175种,隶属64个科103个属,种子植物科、属的分布区划为12个类型,总体上可分为广布型、热带型、温带型;(2)群落乔木层、灌木层、草本层优势种分别为峨眉栲和三脉水丝梨、筇竹(Chimonobambusa tumidissinoda)、骤尖楼梯草(Elatostema cuspidatum),物种重要值与数量呈现出不同程度的正相关,相关强度表现为灌木层>草本层>乔木层;(3)群落Shannon-Weiner多样性指数和Pielou均匀度指数呈现出灌木层>草本层>乔木层,Margalef丰富度指数和Simpson优势度指数表现为乔木层>草本层>灌木层;(4)整个群落以第Ⅰ龄级和高度Ⅰ级树木占优势,而乔木层则以第Ⅱ龄级和高度Ⅱ级树木占优势。群落物种丰富,优势种明显,生长稳定,有利于维持保护区生态系统稳定和生物多样性安全。
关键词
乌蒙山保护区
中山湿性常绿阔叶林
峨眉栲
三脉水丝梨
群落结构
Keywords
Wumeng Mountains Reserve
mid-montane humid ever-green broad-leaved forest
Castanopsis platyacantha
Sycopsis triplinervia
community structure
分类号
S718.542 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析
熊霜
周富琴
王仕东
李锐
王树宝
黄媛
《广西植物》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
乌蒙山保护区峨眉栲、三脉水丝梨群落结构及物种多样性
古朝山
陈娜
杨科
刘恩德
李伟
《贵州林业科技》
2024
1
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职称材料
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