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求解非格点模型的蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法
1
作者
刘景发
黄文奇
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2006年第10期1889-1892,共4页
本文研究了一个具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型.受物理世界的物体间相互作用的规律和人类社会生活经验的启发,给出了该模型蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法.计算结果表明被提出的方法在非格点的蛋...
本文研究了一个具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型.受物理世界的物体间相互作用的规律和人类社会生活经验的启发,给出了该模型蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法.计算结果表明被提出的方法在非格点的蛋白质模型上是有效的.与文献中给出的所有算例的结果相比,无论是在最低能量值还是在计算时间上,本文算法都要好.对于这些算例中规模最大的3个,还找到了与文献中结构完全不同的最低能量构形.
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关键词
蛋白质结构预测
三维非格点模型
拟物拟人算法
NP难度问题
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职称材料
预测蛋白质结构拟物算法的研究与改进
2
作者
李明
苏显中
于敏
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2010年第26期209-211,共3页
研究了具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型。给出了该模型蛋白质结构预测问题改进的拟物算法。氨基酸链的初始设置由完全随机改为随机线形结构,并找到了更优的计算参数。结果对于三个氨基酸链都找到了更...
研究了具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型。给出了该模型蛋白质结构预测问题改进的拟物算法。氨基酸链的初始设置由完全随机改为随机线形结构,并找到了更优的计算参数。结果对于三个氨基酸链都找到了更好的最低势能值。
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关键词
蛋白质结构预测
拟物算法
三维非格点模型
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职称材料
题名
求解非格点模型的蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法
1
作者
刘景发
黄文奇
机构
华中科技大学计算机学院
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2006年第10期1889-1892,共4页
基金
国家"九七三"项目(2004CB318000)资助
国家自然科学基金项目(10471051)资助.
文摘
本文研究了一个具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型.受物理世界的物体间相互作用的规律和人类社会生活经验的启发,给出了该模型蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法.计算结果表明被提出的方法在非格点的蛋白质模型上是有效的.与文献中给出的所有算例的结果相比,无论是在最低能量值还是在计算时间上,本文算法都要好.对于这些算例中规模最大的3个,还找到了与文献中结构完全不同的最低能量构形.
关键词
蛋白质结构预测
三维非格点模型
拟物拟人算法
NP难度问题
Keywords
protein structure prediction
3D off-lattice model
quasi-physical and quasi-human algorithm
NP hard problem
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
预测蛋白质结构拟物算法的研究与改进
2
作者
李明
苏显中
于敏
机构
中国矿业大学化工学院生物工程系
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2010年第26期209-211,共3页
基金
教育部留学回国人员科研启动基金
徐州市科技计划项目No.XM08C094~~
文摘
研究了具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型。给出了该模型蛋白质结构预测问题改进的拟物算法。氨基酸链的初始设置由完全随机改为随机线形结构,并找到了更优的计算参数。结果对于三个氨基酸链都找到了更好的最低势能值。
关键词
蛋白质结构预测
拟物算法
三维非格点模型
Keywords
protein structure prediction
quasi-physical algorithm
3D off-lattice model
分类号
Q518.2 [生物学—生物化学]
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
求解非格点模型的蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法
刘景发
黄文奇
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2006
0
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职称材料
2
预测蛋白质结构拟物算法的研究与改进
李明
苏显中
于敏
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2010
0
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职称材料
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