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HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团的构建
被引量：
18
1
作者
鲍红娟
张燕玲
乔延江
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期301-306,共6页
以作用于鼠肝脏细胞的21个3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制剂(RI)为训练集,训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值IC50范围在0.3-8000nmol·L-1.利用Catalyst计算HMG-CoA还原酶抑制剂最优药效团由一...
以作用于鼠肝脏细胞的21个3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制剂(RI)为训练集,训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值IC50范围在0.3-8000nmol·L-1.利用Catalyst计算HMG-CoA还原酶抑制剂最优药效团由一个氢键受体,一个氢键给体,一个疏水基团和一个芳香环特征组成.药效团模型Fixedcost值,Totalcost值和Configurationcost值分别为88.75、111.5和16.98.训练集化合物活性计算值与实测值相关系数为0.8883,偏差值为1.269,交叉验证结果表明,药效团模型具有较高的置信度,对测试集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索发现新的具有该活性的化合物,也可用于中药或天然产物药物的研究开发.
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关键词
HMG-COA还原酶抑制剂
三维药效团
数据库搜索
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职称材料
ET_B受体拮抗剂三维药效团的构建
被引量：
3
2
作者
杨珍
张燕玲
乔延江
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2012年第4期1786-1792,共7页
本文以对在CHO细胞中表达的人类ETB受体有拮抗作用的28个化合物为训练集,利用Catalyst计算所得ETB受体拮抗剂的最优药效团模型由两个氢键受体、一个芳环基团和一个疏水基团组成。最优模型的Fixed cost、Total cost和△Cost值分别为114....
本文以对在CHO细胞中表达的人类ETB受体有拮抗作用的28个化合物为训练集,利用Catalyst计算所得ETB受体拮抗剂的最优药效团模型由两个氢键受体、一个芳环基团和一个疏水基团组成。最优模型的Fixed cost、Total cost和△Cost值分别为114.792、136.967和38.081。训练集化合物活性的实测值与预测值相关系数为0.870,偏差值为1.198,有效活性命中率A%和综合评价指数CAI值分别为84%和2.389。该模型对测试集化合物也有较好的预测能力,所命中测试集化合物的实际活性值和预测活性值的线性相关系数为0.736。研究结果表明所构建的药效团模型具有一定的可靠性,可以用来进行数据库的搜索,寻找新型的ETB受体拮抗剂。
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关键词
心血管疾病
ETB拮抗剂
三维药效团
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职称材料
5-HT_3受体拮抗剂药效团模型的构建
被引量：
10
3
作者
鲍红娟
张燕玲
乔延江
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期1125-1132,共8页
以31个来源于MDDR数据库中具有抑制鼠Bezold-Jarisch反射作用的5-HT3受体拮抗剂作为训练集化合物,构建5-HT3受体拮抗剂药效团模型.训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值ED50范围为0.05～320μg/kgi.v..利用Catalyst计...
以31个来源于MDDR数据库中具有抑制鼠Bezold-Jarisch反射作用的5-HT3受体拮抗剂作为训练集化合物,构建5-HT3受体拮抗剂药效团模型.训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值ED50范围为0.05～320μg/kgi.v..利用Catalyst计算5-HT3受体拮抗剂的最优药效团由一个氢键受体、一个疏水基团、一个正电离子化基团、一个芳香环特征和6个排除体积组成;Fixedcost值、Nullcost值、Δcost值和Configurationcost值分别为112.6,172.0,59.4和7.248.训练集化合物活性的计算值与实测值相关系数为0.9031,偏差值为0.8976,基于Fischer的交叉验证结果表明药效团模型具有较高的置信度,所得药效团对训练集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索指导发现新的具有该活性的先导化合物,也可用于中药或天然产物药物研究开发.
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关键词
5-HT3受体拮抗剂
三维药效团
数据库搜索
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职称材料
题名
HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团的构建
被引量：
18
1
作者
鲍红娟
张燕玲
乔延江
机构
北京中医药大学中药学院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期301-306,共6页
基金
国家自然科学基金(30472180)
国家重点基础研究发展规划项目(973)(2006CB504703)
国家中医药管理局项目(04-05ZP03)
文摘
以作用于鼠肝脏细胞的21个3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制剂(RI)为训练集,训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值IC50范围在0.3-8000nmol·L-1.利用Catalyst计算HMG-CoA还原酶抑制剂最优药效团由一个氢键受体,一个氢键给体,一个疏水基团和一个芳香环特征组成.药效团模型Fixedcost值,Totalcost值和Configurationcost值分别为88.75、111.5和16.98.训练集化合物活性计算值与实测值相关系数为0.8883,偏差值为1.269,交叉验证结果表明,药效团模型具有较高的置信度,对测试集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索发现新的具有该活性的化合物,也可用于中药或天然产物药物的研究开发.
关键词
HMG-COA还原酶抑制剂
三维药效团
数据库搜索
Keywords
HMG-CoA reductase inhibitor
Pharmacophore
Database searching
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
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职称材料
题名
ET_B受体拮抗剂三维药效团的构建
被引量：
3
2
作者
杨珍
张燕玲
乔延江
机构
北京中医药大学中药信息工程研究中心/北京市"中药基础与新药研究重点实验室"
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2012年第4期1786-1792,共7页
基金
科学技术部国家支撑计划项目(2008BAI51B01):中药有效成分群辨识技术研究
负责人:张宏桂
+5 种基金
国家自然基金项目(81173522):点线面三维模拟活血化瘀中药防治冠心病的作用机制研究
负责人:乔延江
北京中医药大学自主课题(2011-CXTD-11):中药信息工程
负责人:乔延江
北京中医药大学自主课题(2011-JDJS-12):活血化瘀中药治疗冠心病的作用机制研究
负责人:张燕玲
文摘
本文以对在CHO细胞中表达的人类ETB受体有拮抗作用的28个化合物为训练集,利用Catalyst计算所得ETB受体拮抗剂的最优药效团模型由两个氢键受体、一个芳环基团和一个疏水基团组成。最优模型的Fixed cost、Total cost和△Cost值分别为114.792、136.967和38.081。训练集化合物活性的实测值与预测值相关系数为0.870,偏差值为1.198,有效活性命中率A%和综合评价指数CAI值分别为84%和2.389。该模型对测试集化合物也有较好的预测能力,所命中测试集化合物的实际活性值和预测活性值的线性相关系数为0.736。研究结果表明所构建的药效团模型具有一定的可靠性,可以用来进行数据库的搜索,寻找新型的ETB受体拮抗剂。
关键词
心血管疾病
ETB拮抗剂
三维药效团
Keywords
Cardiovascular disease, ETB inhibitors, three-dimensional pharmacophore model
分类号
R972.4 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
5-HT_3受体拮抗剂药效团模型的构建
被引量：
10
3
作者
鲍红娟
张燕玲
乔延江
机构
北京中医药大学中药学院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期1125-1132,共8页
基金
国家自然科学基金(批准号:30472180)
国家'九七三'计划(批准号:2005CB523401
2006CB504703)资助
文摘
以31个来源于MDDR数据库中具有抑制鼠Bezold-Jarisch反射作用的5-HT3受体拮抗剂作为训练集化合物,构建5-HT3受体拮抗剂药效团模型.训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值ED50范围为0.05～320μg/kgi.v..利用Catalyst计算5-HT3受体拮抗剂的最优药效团由一个氢键受体、一个疏水基团、一个正电离子化基团、一个芳香环特征和6个排除体积组成;Fixedcost值、Nullcost值、Δcost值和Configurationcost值分别为112.6,172.0,59.4和7.248.训练集化合物活性的计算值与实测值相关系数为0.9031,偏差值为0.8976,基于Fischer的交叉验证结果表明药效团模型具有较高的置信度,所得药效团对训练集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索指导发现新的具有该活性的先导化合物,也可用于中药或天然产物药物研究开发.
关键词
5-HT3受体拮抗剂
三维药效团
数据库搜索
Keywords
5-HT3 receptor antagonists
Three-dimensional pharmacophore
Database searching
分类号
O629 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团的构建
鲍红娟
张燕玲
乔延江
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008
18
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
ET_B受体拮抗剂三维药效团的构建
杨珍
张燕玲
乔延江
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2012
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
5-HT_3受体拮抗剂药效团模型的构建
鲍红娟
张燕玲
乔延江
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
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