Per a 9是美洲大蠊主要过敏原蛋白之一。通过生物信息学方法了解美洲大蠊过敏原蛋白Per a 9的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索。BLAST得到Per a 9相似序列,构建同源进化树,结果显示美洲大蠊Per a 9与德国小蠊精氨酸...Per a 9是美洲大蠊主要过敏原蛋白之一。通过生物信息学方法了解美洲大蠊过敏原蛋白Per a 9的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索。BLAST得到Per a 9相似序列,构建同源进化树,结果显示美洲大蠊Per a 9与德国小蠊精氨酸激酶在进化上具有较近的亲缘关系。Per a 9主要为α+β结构的亲水性蛋白,其主要抗原表位集中于33—46、55—74、89—117、123—135、199—217、235—243、251—266、286—354区域。Motif预测其具有1个鸟嘌呤磷酸转移酶活性位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,7个酪氨酸激酶II磷酸化位点和2个N豆蔻酰化位点。其预测的三维结构基本能反应Per a 9真实的空间构象,这将为今后进一步了解和掌握Per a 9结构和功能的关系打下理论基础。展开更多
联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个...联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个主要为α+β结构的亲水性蛋白,预测其具有一个蛋白激酶C的磷酸化位点,一个N豆蔻酰化位点和三个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。Pla a 1具有较强的信号转导作用,且与拟南芥的果胶(甲)酯酶抑制剂在进化上具有较近的亲缘关系;所预测的三维结构基本能反映出Pla a 1真实的空间构象,这将为今后进一步理解和掌握Pla a 1结构和功能上的关系打下理论基础。展开更多
文摘Per a 9是美洲大蠊主要过敏原蛋白之一。通过生物信息学方法了解美洲大蠊过敏原蛋白Per a 9的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索。BLAST得到Per a 9相似序列,构建同源进化树,结果显示美洲大蠊Per a 9与德国小蠊精氨酸激酶在进化上具有较近的亲缘关系。Per a 9主要为α+β结构的亲水性蛋白,其主要抗原表位集中于33—46、55—74、89—117、123—135、199—217、235—243、251—266、286—354区域。Motif预测其具有1个鸟嘌呤磷酸转移酶活性位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,7个酪氨酸激酶II磷酸化位点和2个N豆蔻酰化位点。其预测的三维结构基本能反应Per a 9真实的空间构象,这将为今后进一步了解和掌握Per a 9结构和功能的关系打下理论基础。
文摘联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模。该蛋白是一个主要为α+β结构的亲水性蛋白,预测其具有一个蛋白激酶C的磷酸化位点,一个N豆蔻酰化位点和三个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。Pla a 1具有较强的信号转导作用,且与拟南芥的果胶(甲)酯酶抑制剂在进化上具有较近的亲缘关系;所预测的三维结构基本能反映出Pla a 1真实的空间构象,这将为今后进一步理解和掌握Pla a 1结构和功能上的关系打下理论基础。
