三维全息原子场作用矢量用于HEPT类抗艾滋病药物的QSAR研究 被引量：11

1

作者 仝建波 周鹏 +4 位作者 张生万 梁桂兆 田菲菲 李美萍 李声时 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第6期721-725,共5页

采用本实验室新近提出的三维全息原子场作用矢量表征34个1-[(2-羟乙氧)甲基]-6-苯硫基胸腺嘧啶(HEPT)类抗艾滋病药物结构并与其活性建立定量构效关系模型.采用逐步回归对变量进行筛选后,运用多元线性回归(multiplelinearregression,MLR... 采用本实验室新近提出的三维全息原子场作用矢量表征34个1-[(2-羟乙氧)甲基]-6-苯硫基胸腺嘧啶(HEPT)类抗艾滋病药物结构并与其活性建立定量构效关系模型.采用逐步回归对变量进行筛选后,运用多元线性回归(multiplelinearregression,MLR)建模的复相关系数(Rcu2m)、交互校验的复相关系数(Qcu2m)和模型的标准偏差(SD)分别为Rcu2m=0.928、Qcu2m=0.883与SD=0.43,均优于Hancsh报道的值(Rcu2m=0.911、Qcu2m=0.863与SD=0.45).模型具有良好的稳定性和预测能力,表明三维全息原子场作用矢量能较好表征该类分子结构信息,值得进一步推广应用. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 1-[(2-羟乙氧基)甲基]-6-(苯巯基)胸腺嘧啶 定量构效关系 抗艾滋病药物

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维全息原子场作用矢量用于吡咯类抗艾滋病药物QSAR研究 被引量：11

2

作者 仝建波 刘淑玲 +3 位作者 刘玉婷 李仲谨 韩玉英 王先锋 《分析科学学报》 CAS CSCD 2008年第3期275-279,共5页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对32个吡咯类抗艾滋病药物进行结构参数化表征,并与其活性建立定量构效关系。分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘(PLS)进行建模,建模的复相关系数(R2cum)、交互校验复相关系数(Q2cum)和模型... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对32个吡咯类抗艾滋病药物进行结构参数化表征,并与其活性建立定量构效关系。分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘(PLS)进行建模,建模的复相关系数(R2cum)、交互校验复相关系数(Q2cum)和模型的标准偏差(SD)分别为R2cum=0.914、Q2cum=0.812、SD=0.236(MLR);R2cum=0.836、Q2cum=0.719、SD=0.314(PLS),结果均优于文献值(R2cum=0.667,Q2cum=0.581,SD=0.420)。所建模型具有良好的稳定性和预测能力,表明3D-HoVAIF能够较好地表征该类分子的结构,值得进一步推广应用。 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 吡咯衍生物 抗艾滋病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维全息原子场作用矢量用于5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂的定量结构-活性相关研究 被引量：2

3

作者 李美萍 张生万 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期566-572,共7页

采用三维全息原子场作用矢量(Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field,3D-HoVAIF)对33个5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂进行结构表征并与其抑制活性建立定量结构-活性相关(Quantitative Structure Activity Relat... 采用三维全息原子场作用矢量(Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field,3D-HoVAIF)对33个5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂进行结构表征并与其抑制活性建立定量结构-活性相关(Quantitative Structure Activity Relationship,QSAR)模型。分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)进行建模,同时采用内部及外部双重验证的方法对所建模型稳定性能进行分析和验证,建模计算值、留一法交互检验预测值和外部样本预测值的复相关系数R、Rcv、Qext分别为0.874,0.773,0.953(MLR);0.873,0.727,0.952(PLS)。表明三维全息原子场作用矢量能较好地表征该类分子的结构信息,所建QSAR模型具有良好的稳定性和预测能力;同时也指出了sp3杂化的C原子与sp2杂化的N原子,以及sp3杂化的C原子与sp3杂化的O/S原子的静电作用是影响5′-甲硫腺苷(MTA)类似物抑制5′-甲硫腺苷核苷酶(MTAN)活性的重要因素,有望对其它5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂的抑制活性预测及合成MTA类似物提供有效的理论依据。 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂 定量结构-活性相关

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维全息原子场作用矢量用于脂肪酸的QSRR研究 被引量：2

4

作者 景举华 张巧霞 李志良 《化学分析计量》 CAS 2008年第2期13-15,33,共4页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)进行结构表征,研究脂肪酸定量结构保留指数关系(QS-RR),通过逐步回归(SMR)进行变量筛选,多元线性回归(MLR)建立定量构效关系模型。结果表明,所建模型的复相关系数r为0.998,留一法交互校验(LOO-CV... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)进行结构表征,研究脂肪酸定量结构保留指数关系(QS-RR),通过逐步回归(SMR)进行变量筛选,多元线性回归(MLR)建立定量构效关系模型。结果表明,所建模型的复相关系数r为0.998,留一法交互校验(LOO-CV)复相关系数rcv为0.983。3D-HoVAIF能较好地表征脂肪酸的结构信息,且所建模型具有较好的稳定性和预测能力。 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 脂肪酸 定量结构保留指数关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维全息原子场作用矢量用于苦味二肽QSAR研究 被引量：2

5

作者 仝建波 李康楠 +1 位作者 吴英纪 占培 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2017年第1期155-160,共6页

本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-Ho VAIF)对苦味二肽分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立苦味二肽定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(R_(cum)... 本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-Ho VAIF)对苦味二肽分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立苦味二肽定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(R_(cum)~2)、留一法(LOO)交互验证相关系数(R_(cv)~2)、外部样本验证相关系数(Q_(ext)~2)和均方根误差(RMSE)分别为0.983、0.934、0.876和0.145.结果表明,3D-VAIF能较好地表征苦味二肽结构,优于传统的氨基酸描述子.为强活性肽类药物分子设计和改造提供指导. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 苦味二肽 多元线性回归 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维全息原子场作用矢量用于均三氮苯类衍生物除草活性的QSAR研究 被引量：1

6

作者 李美萍 张生万 《原子与分子物理学报》 北大核心 2017年第6期997-1002,共6页

本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对均三氮苯类衍生物分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立均三氮苯类衍生物除草活性的定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计量... 本文利用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对均三氮苯类衍生物分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立均三氮苯类衍生物除草活性的定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计量如下:建模相关系数(R)、留一法(LOO)交互验证相关系数(R_(cv))、外部样本验证相关系数(Q_(ext))和标准偏差(SD)分别为0.897、0.818、0.856和0.470.结果表明,3D-HoVAIF能较好地表征均三氮苯类衍生物分子的结构信息,所建模型具有良好的稳定性和预测能力;同时也指出了SP^3杂化的C之间的立体作用、SP^2杂化的N与SP^3杂化的C之间的立体作用、SP^2杂化C与SP^3杂化的N原子之间的静电作用以及SP^3杂化的C与X(卤素)之间的静电作用是影响该类化合物除草活性的重要因素.为高活性除草剂类分子设计和改造提供理论指导. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF) 均三氮苯类衍生物 多元线性回归 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

三维原子场作用全息矢量用于二氢叶酸还原酶抑制剂及苦味二肽QSAR研究 被引量：6

7

作者 梁桂兆 梅虎 +2 位作者 周鹏 周原 李志良 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第3期388-390,共3页

将三维原子场作用全息矢量用于表征68个二氢叶酸还原酶抑制剂和48个苦味二肽结构,分别以多元线性回归和偏最小二乘建模,取得优良结果.对前者建模得复相关系数Rm2m=0.893,交互检验相关系数RC2V=0.853,对后者建模得Rm2m=0.936,RC2V=0.849... 将三维原子场作用全息矢量用于表征68个二氢叶酸还原酶抑制剂和48个苦味二肽结构,分别以多元线性回归和偏最小二乘建模,取得优良结果.对前者建模得复相关系数Rm2m=0.893,交互检验相关系数RC2V=0.853,对后者建模得Rm2m=0.936,RC2V=0.849.结果表明3D-HoVAIF能够较好表征两类分子结构,具有物化意义明确及结果易解释特点,值得进一步应用推广. 展开更多

关键词 三维原子场作用全息矢量 定量构效关系 二氢叶酸还原酶 苦味二肽 多元线性回归

在线阅读 下载PDF 职称材料

新型三维原子场全息相互作用矢量用于几类典型药物体系的QSAR研究 被引量：9

8

作者 周鹏 梅虎 +1 位作者 田菲菲 李志良 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1027-1030,共4页

将有机化合物中常见原子按元素周期表的族和杂化状态进行分类,基于药物与受体相互作用的3类非键效应,从分子空间立体结构出发得到了一种新型三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF).利用该矢量对几类典型药物体系进行了系统的QSAR研究,结果... 将有机化合物中常见原子按元素周期表的族和杂化状态进行分类,基于药物与受体相互作用的3类非键效应,从分子空间立体结构出发得到了一种新型三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF).利用该矢量对几类典型药物体系进行了系统的QSAR研究,结果表明,3D-HoVAIF能够有效地提取药物分子的立体结构信息并与其生物活性呈良好线性关联. 展开更多

关键词 三维原子场全息作用矢量 分子结构表征 定量构效关系 偏最小二乘回归

在线阅读 下载PDF 职称材料

TIBO衍生物类抗艾滋病药物三维定量结构活性关系研究 被引量：2

9

作者 仝建波 钟黎 +2 位作者 赵翔 王平 程芳玲 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期655-659,共5页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对20个TIBO类衍生物抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究。运用偏最小二乘回归(Partial Least Square Regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对20个TIBO类衍生物抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究。运用偏最小二乘回归(Partial Least Square Regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验。PLS建模的复相关系数(Rcum)、留一法(Leave-one-out,LOO)交互校验(Cross-validation,CV)复相关系数(QCV)和外部样本校验复相关系数(Qext)分别为0.837、0.804、0.812。结果表明,3D-HoVAIF能较好表征TIBO类衍生物抗艾滋病药物分子结构信息, 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 抗艾滋病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

咪唑衍生物类抗艾滋病药物3D-QSAR研究 被引量：14

10

作者 仝建波 王平 +2 位作者 李云飞 刘淑玲 孟元亮 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期41-46,共6页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对42个咪唑衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验.PLS建模的复相关系数、留一... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对42个咪唑衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验.PLS建模的复相关系数、留一法交互校验复相关系数和外部样本校验复相关系数分别为0.912、0.847、0.931.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征咪唑衍生物类抗艾滋病药物分子结构信息,所建QSAR模型具有良好稳定性和预测能力,为抗艾滋病药物的研发提供一定的理论基础. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 抗艾滋病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

酰肼类抗结核病药物的3D-QSAR研究 被引量：3

11

作者 仝建波 陈洋 +2 位作者 车挺 徐夏梦 程芳玲 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期382-386,共5页

采用三维全息原子场作用矢量（3D-HoVAIF）对115个酰肼类抗结核病药物进行定量构效关系（QSAR）研究．运用多元线性回归（MLR）和偏最小二乘回归（PLS）建模，同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验... 采用三维全息原子场作用矢量（3D-HoVAIF）对115个酰肼类抗结核病药物进行定量构效关系（QSAR）研究．运用多元线性回归（MLR）和偏最小二乘回归（PLS）建模，同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验．MLR建模和PLS建模的复相关系数（R^2ext）、留一法交互校验复相关系数（Qk）以及外部样本校验复相关系数（Q^2ext）分别为0．766、0．663、0．748和0．733、0．614、0．715．结果表明，3D-HoVAIF能较好表征抗结核药物分子结构信息，所建QSAR模型具有良好稳定性和预测能力，为抗结核病药物的研发提供一定的理论基础． 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 酰肼类抗结核病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物3D-QSAR研究 被引量：2

12

作者 仝建波 王平 +1 位作者 车挺 程芳玲 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期777-782,共6页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对36个苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(partialleast square regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对36个苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(partialleast square regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验.PLS建模的复相关系数(R_(cum))、留一法(leave-one-out,LOO)交互校验(cross-validation,CV)复相关系数(Q_(CV))和外部样本校验复相关系数(Q_(ext))分别为0.906、0.865、0.815.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征苯并噁嗪酮衍生物类抗艾滋病药物分子结构信息,因而能建立具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型,为抗艾滋病药物的研发提供一定的理论基础. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 抗艾滋病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

1,2-二芳基环戊烯类环氧合酶-2抑制剂的3D-QSAR研究 被引量：2

13

作者 杨国臣 仝建波 刘淑玲 《石油化工高等学校学报》 EI CAS 2008年第3期32-37,共6页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对26个1,2-二芳基环戊烯类环氧合酶-2抑制剂进行结构参数化表征并与其活性建立定量构效关系(QSAR)模型。运用偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部和外部双重验证的方法对所得模型稳定性进行分... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对26个1,2-二芳基环戊烯类环氧合酶-2抑制剂进行结构参数化表征并与其活性建立定量构效关系(QSAR)模型。运用偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部和外部双重验证的方法对所得模型稳定性进行分析和检验。所得模型的复相关系数(R2cum)、留一法(LOO)交互校验(CV)复相关系数(Q2cum)和外部样本校验复相关系数(Q2ext)分别为0.820,0.734和0.749。结果表明,3D-HoVAIF能较好地表征1,2-二芳基环戊烯类环氧合酶-2抑制剂分子结构信息,所建模型具有较好稳定性能和预测能力。 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 1 2-二芳基环戊烯类环氧合酶-2抑制剂 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物3D-QSAR研究 被引量：1

14

作者 仝建波 王平 +2 位作者 车挺 程芳玲 杨军胜 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期960-964,共5页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对61个苯乙基噻唑硫脲衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(partial 1east square regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对61个苯乙基噻唑硫脲衍生物类抗艾滋病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用偏最小二乘回归(partial 1east square regression,PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验.PLS建模的复相关系数(R_(cum))、留一法交互校验复相关系数(Q_(CV))和外部样本校验复相关系数(Q_(ext))分别为0.907、0.878、0.913.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征苯乙基噻唑硫脲衍生物抗艾滋病药物分子结构信息,因而能建立具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型,为抗艾滋病药物的研发提供一定的理论基础. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 抗艾滋病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料

磺胺类药物pKa值的QSPR研究 被引量：3

15

作者 李美萍 张生万 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期61-64,共4页

采用三维全息原子场作用矢量(three-dimensional holographic vector of atomic interaction field,3DHo VAIF)对31种磺胺类药物进行结构表征,分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立磺胺类药物与其p Ka值的定量结构-性质... 采用三维全息原子场作用矢量(three-dimensional holographic vector of atomic interaction field,3DHo VAIF)对31种磺胺类药物进行结构表征,分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立磺胺类药物与其p Ka值的定量结构-性质相关(Quantitative Structure-Property Relationship,QSPR)模型.以R(建模相关系数),Rcv(交互检验相关系数),RMSEF(拟合误差)和RMSEP(预测误差)作为衡量模型预测能力的标准,其值分别为0.950,0.926,0.547,1.18(MLR);0.896,0.783,0.595,0.919(PLS).结果表明三维全息原子场作用矢量能较好地表征该类分子的结构信息,所建模型具有良好的稳定性和预测能力;同时也指出了sp3杂化的N原子与sp2杂化的S原子之间的静电作用是影响磺胺类药物p Ka值的重要因素. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 磺胺类药物 定量结构-性质相关

在线阅读 下载PDF 职称材料

香豆素-4-乙酰苄肼类抗结核病药物的3D-QSAR研究 被引量：1

16

作者 仝建波 陈洋 +2 位作者 徐夏梦 杜经武 程芳玲 《陕西科技大学学报（自然科学版）》 2012年第6期57-60,共4页

采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对25个香豆素-4-乙酰苄肼类抗结核病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检... 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对25个香豆素-4-乙酰苄肼类抗结核病药物进行定量构效关系(QSAR)研究.运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验.MLR建模和PLS建模的复相关系数(Rcum)、留一法交互校验复相关系数(QLOO)以及外部样本校验复相关系数(Qext)分别为0.926、0.819、0.805和0.919、0.828、0.836.结果表明,3D-HoVAIF能较好表征抗结核药物分子结构信息,所建QSAR模型具有良好稳定性和预测能力,为抗结核病药物的研发提供一定的理论基础. 展开更多

关键词 三维全息原子场作用矢量 香豆素-4-乙酰苄肼类抗结核病药物 定量构效关系

在线阅读 下载PDF 职称材料