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鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2效应蛋白基因分布研究
被引量：
1
1
作者
殷俊磊
程瞾
+3 位作者
夏静
李求春
耿士忠
焦新安
《中国家禽》
北大核心
2015年第19期14-19,共6页
为了解鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2（T3SS2）效应蛋白基因的分布情况。本研究采用PCR方法检测了在1962~2013年间从我国分离的237株鸡白痢沙门菌中25个T3SS2效应蛋白基因的分布特征;同时,通过序列比对分析了这25个基因在18株不同血清...
为了解鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2（T3SS2）效应蛋白基因的分布情况。本研究采用PCR方法检测了在1962~2013年间从我国分离的237株鸡白痢沙门菌中25个T3SS2效应蛋白基因的分布特征;同时,通过序列比对分析了这25个基因在18株不同血清型沙门菌中的流行特征,它们的全基因组序列来自GenBank。PCR结果显示,在这237株菌株中,cigR、pipB、pipB2、slrP、sopD、sopD2、spiC、sseF、sseG、sseJ、sseK1、sseL、steA、steB、steC和steD均存在,gogB和sspH1均缺失,其它基因分布水平在5.9%~99.6%之间。序列比对分析结果显示,有15个基因在这18株菌株中均存在,sifB、sseK1、sspH2和steC在一些菌株中是假基因。结果表明,gtgE、sseI和sseK2在这237株菌株中分布具有一定的年代规律性;大部分被检测基因在鸡白痢沙门菌中具有广泛分布;一些基因在微进化过程中形成了假基因。
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关键词
鸡白痢沙门菌
三型分泌系统-2
假基因
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题名
鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2效应蛋白基因分布研究
被引量：
1
1
作者
殷俊磊
程瞾
夏静
李求春
耿士忠
焦新安
机构
扬州大学江苏省人兽共患病学重点实验室
出处
《中国家禽》
北大核心
2015年第19期14-19,共6页
基金
国家自然科学基金(31230070
31201905)
+2 种基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201403054)
江苏省普通高校研究生科研创新计划项目(CXZZ13_0917)
江苏省优势学科项目
文摘
为了解鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2（T3SS2）效应蛋白基因的分布情况。本研究采用PCR方法检测了在1962~2013年间从我国分离的237株鸡白痢沙门菌中25个T3SS2效应蛋白基因的分布特征;同时,通过序列比对分析了这25个基因在18株不同血清型沙门菌中的流行特征,它们的全基因组序列来自GenBank。PCR结果显示,在这237株菌株中,cigR、pipB、pipB2、slrP、sopD、sopD2、spiC、sseF、sseG、sseJ、sseK1、sseL、steA、steB、steC和steD均存在,gogB和sspH1均缺失,其它基因分布水平在5.9%~99.6%之间。序列比对分析结果显示,有15个基因在这18株菌株中均存在,sifB、sseK1、sspH2和steC在一些菌株中是假基因。结果表明,gtgE、sseI和sseK2在这237株菌株中分布具有一定的年代规律性;大部分被检测基因在鸡白痢沙门菌中具有广泛分布;一些基因在微进化过程中形成了假基因。
关键词
鸡白痢沙门菌
三型分泌系统-2
假基因
Keywords
Salmonella Pullorum
type Ⅲ secretion system
-
2
pseudogenes
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
鸡白痢沙门菌中三型分泌系统-2效应蛋白基因分布研究
殷俊磊
程瞾
夏静
李求春
耿士忠
焦新安
《中国家禽》
北大核心
2015
1
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