-
题名禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白的找寻
被引量：3
- 1
-
-
作者
喻红稠
韩长志
-
机构
西南林业大学生物多样性保护学院
云南省森林灾害预警与控制重点实验室
-
出处
《科学技术与工程》
北大核心
2022年第1期103-109,共7页
-
基金
云南省高层次人才培养支持计划“青年拔尖人才”专项(YNWR-QNBJ-2020-188)
国家自然科学基金(31960314)
云南省应用基础研究计划(2018FG001-028)。
-
文摘
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是生物中一类具有典型七跨膜结构域的重要细胞表面受体,对细胞信号转导过程具有重要作用。禾谷炭疽菌严重危害着玉米、高粱等禾本科植物的产业发展,然而,对于该菌中GPCR蛋白数量及功能尚未有系统性报道。基于典型GPCR蛋白序列所具有的七跨膜保守结构域特征,通过TMHMM、Philius和TOPCONS 3种常用软件进行在线分析,明确全部蛋白的预测功能与蛋白数量、跨膜结构域数量与蛋白数量、氨基酸序列长度与蛋白数量之间的关系。结果表明,禾谷炭疽菌中含有243个具有七跨膜结构域蛋白(涉及含有7个跨膜结构域但不含有信号肽序列蛋白或者含有信号肽序列的具有8个跨膜结构域的蛋白),进一步通过SMART保守结构域分析,可知该菌中存在220个候选GPCR蛋白。该研究为进一步开展禾谷炭疽菌候选GPCR蛋白的理化性质解析提供了重要的数据支撑,也为进一步明确GPCR蛋白及其功能的研究奠定重要的理论基础。
-
关键词
禾谷炭疽菌
七跨膜结构域
候选GPCR
生物信息学
-
Keywords
Colletotrichum graminicola
seven transmembrane domain
candidate GPCR
bioinformatics
-
分类号
S763.1
[农业科学—森林保护学]
S435.1
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
-
