一次分枝角度是构建甘蓝型油菜理想株型的重要性状之一.本研究以分枝角度大的纯系黄花亲本62与分枝角度小的纯系粉花亲本77为亲本构建114个双单倍体(Double Haploid,DH)群体株系,通过基于测序的基因分型(Genotyping by Sequence,GBS)技...一次分枝角度是构建甘蓝型油菜理想株型的重要性状之一.本研究以分枝角度大的纯系黄花亲本62与分枝角度小的纯系粉花亲本77为亲本构建114个双单倍体(Double Haploid,DH)群体株系,通过基于测序的基因分型(Genotyping by Sequence,GBS)技术简化测序获得单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)数据,考察DH群体一次分枝角度表型,利用一般线性模型(General Linear Model,GLM)进行全基因组关联分析.结果表明:该群体GLM模型检测到8个显著SNP位点都分布在A07染色体,解释了25.21%~35.05%的表型变异.定位区间内分析和注释了49个基因,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析推测甘蓝型油菜一次分枝角度主效基因为编码GH3家族蛋白的BnaA07g01910D基因,此基因负责细胞繁殖扩增可能影响分枝角度表型.该研究结果有助于解析甘蓝型油菜分枝角度的遗传基础和调控机制,为指导分枝角度遗传改良奠定了基础.展开更多
文摘一次分枝角度是构建甘蓝型油菜理想株型的重要性状之一.本研究以分枝角度大的纯系黄花亲本62与分枝角度小的纯系粉花亲本77为亲本构建114个双单倍体(Double Haploid,DH)群体株系,通过基于测序的基因分型(Genotyping by Sequence,GBS)技术简化测序获得单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)数据,考察DH群体一次分枝角度表型,利用一般线性模型(General Linear Model,GLM)进行全基因组关联分析.结果表明:该群体GLM模型检测到8个显著SNP位点都分布在A07染色体,解释了25.21%~35.05%的表型变异.定位区间内分析和注释了49个基因,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析推测甘蓝型油菜一次分枝角度主效基因为编码GH3家族蛋白的BnaA07g01910D基因,此基因负责细胞繁殖扩增可能影响分枝角度表型.该研究结果有助于解析甘蓝型油菜分枝角度的遗传基础和调控机制,为指导分枝角度遗传改良奠定了基础.
