籽粒百粒重是大豆产量构成三要素之一,百粒重大小决定大豆产量并影响其商品性,百粒重也是大豆遗传改良关键性状。为进一步挖掘籽粒大小相关基因,解析籽粒大小的调控机制。利用碳离子束(Carbon Ion Beam,CIB)辐射野生大豆(ZYD7068),构建...籽粒百粒重是大豆产量构成三要素之一,百粒重大小决定大豆产量并影响其商品性,百粒重也是大豆遗传改良关键性状。为进一步挖掘籽粒大小相关基因,解析籽粒大小的调控机制。利用碳离子束(Carbon Ion Beam,CIB)辐射野生大豆(ZYD7068),构建了200份百粒重变异丰富的野生大豆突变群体。结果表明,群体籽粒百粒重在4.37~16.74 g之间,平均值为7.13 g,突变群体百粒重较野生大豆百粒重提高了4.98倍。对200个突变体采用全基因组测序,共获得184.1亿bp的测序数据,基因组覆盖率68.10%~70.96%。突变主要是单碱基突变(SNP),其中C到T突变占突变总数的40%。对候选SNP基因进行富集分析,突变基因主要富集在Go:0009626(植物超敏反应)、Go:0034050(共生体诱导宿主程序性细胞死亡)、Go:0012501(程序性细胞死亡)、Go:0043680(丝状器)以及Go:0045087(先天免疫反应)等途径。利用全基因组测序获得的SNPs标记,采用MLM模型,对突变群体籽粒百粒重进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association GWAS),共检测到71个关联SNPs(-lgP>11),分别位于大豆2、3、5、6、9、10、14、16、18号染色体上,其中5、10号染色体和14号染色体以及18号染色体分别检测到9、21、9、23个SNPs,71个关联SNPs位点涉及33个基因。展开更多
文摘籽粒百粒重是大豆产量构成三要素之一,百粒重大小决定大豆产量并影响其商品性,百粒重也是大豆遗传改良关键性状。为进一步挖掘籽粒大小相关基因,解析籽粒大小的调控机制。利用碳离子束(Carbon Ion Beam,CIB)辐射野生大豆(ZYD7068),构建了200份百粒重变异丰富的野生大豆突变群体。结果表明,群体籽粒百粒重在4.37~16.74 g之间,平均值为7.13 g,突变群体百粒重较野生大豆百粒重提高了4.98倍。对200个突变体采用全基因组测序,共获得184.1亿bp的测序数据,基因组覆盖率68.10%~70.96%。突变主要是单碱基突变(SNP),其中C到T突变占突变总数的40%。对候选SNP基因进行富集分析,突变基因主要富集在Go:0009626(植物超敏反应)、Go:0034050(共生体诱导宿主程序性细胞死亡)、Go:0012501(程序性细胞死亡)、Go:0043680(丝状器)以及Go:0045087(先天免疫反应)等途径。利用全基因组测序获得的SNPs标记,采用MLM模型,对突变群体籽粒百粒重进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association GWAS),共检测到71个关联SNPs(-lgP>11),分别位于大豆2、3、5、6、9、10、14、16、18号染色体上,其中5、10号染色体和14号染色体以及18号染色体分别检测到9、21、9、23个SNPs,71个关联SNPs位点涉及33个基因。
