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桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因鉴定和表达分析
1
作者
张春华
沈志军
+4 位作者
马瑞娟
张圆圆
郭绍雷
蔡志翔
俞明亮
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第4期1049-1061,共13页
Ⅱ型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(TypeⅡNADH dehydrogenase)在所有已全基因组测序的植物中均存在,具有多种功能,尤其在大多数植物呼吸链中起重要作用。本研究对桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因进行了鉴定,确定了桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族成...
Ⅱ型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(TypeⅡNADH dehydrogenase)在所有已全基因组测序的植物中均存在,具有多种功能,尤其在大多数植物呼吸链中起重要作用。本研究对桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因进行了鉴定,确定了桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族成员数目、亚家族分类,并分别进行了克隆,同时分析了它的进化关系、在基因组骨架上分布、启动子区域、基因结构、不同组织表达水平及其编码的蛋白质结构。结果显示,桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族共有6个成员,分布在3~6号染色体上,被分为3个亚家族:NDA、NDB、NDC。桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族成员,脂肪族氨基酸指数范围是80.63~95.75,等电点预测结果表明Prupe.3G231400.1和Prupe.5G076700.1是酸性蛋白质,其余4个是碱性蛋白质;NDA和NDC亚家族成员二级结构均以无规则卷曲为主要构成元件,NDB亚家族成员二级结构均以α-螺旋为主要构成元件。Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因在桃不同组织中的表达水平差异较大,5个基因在老叶中表达量相对较高,在成熟果肉中表达量低。这些结果为下一步进行Ⅱ型NADH脱氢酶基因功能验证奠定了重要基础。
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关键词
桃
ⅱ型nadh脱氢酶
基因家族
基因表达
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题名
桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因鉴定和表达分析
1
作者
张春华
沈志军
马瑞娟
张圆圆
郭绍雷
蔡志翔
俞明亮
机构
江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第4期1049-1061,共13页
基金
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-30)
江苏省基础研究计划(自然科学基金)面上项目(BK20201237)。
文摘
Ⅱ型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(TypeⅡNADH dehydrogenase)在所有已全基因组测序的植物中均存在,具有多种功能,尤其在大多数植物呼吸链中起重要作用。本研究对桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因进行了鉴定,确定了桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族成员数目、亚家族分类,并分别进行了克隆,同时分析了它的进化关系、在基因组骨架上分布、启动子区域、基因结构、不同组织表达水平及其编码的蛋白质结构。结果显示,桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族共有6个成员,分布在3~6号染色体上,被分为3个亚家族:NDA、NDB、NDC。桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族成员,脂肪族氨基酸指数范围是80.63~95.75,等电点预测结果表明Prupe.3G231400.1和Prupe.5G076700.1是酸性蛋白质,其余4个是碱性蛋白质;NDA和NDC亚家族成员二级结构均以无规则卷曲为主要构成元件,NDB亚家族成员二级结构均以α-螺旋为主要构成元件。Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因在桃不同组织中的表达水平差异较大,5个基因在老叶中表达量相对较高,在成熟果肉中表达量低。这些结果为下一步进行Ⅱ型NADH脱氢酶基因功能验证奠定了重要基础。
关键词
桃
ⅱ型nadh脱氢酶
基因家族
基因表达
Keywords
peach
type
ⅱ
nadh
dehydrogenase
gene family
gene expression
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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被引量
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1
桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因鉴定和表达分析
张春华
沈志军
马瑞娟
张圆圆
郭绍雷
蔡志翔
俞明亮
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
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